@Article{, title={Molecular Characterization and Genetic Variability of Trichoderma Harzianum Isolates by Using PCR-RAPD Markers}, author={Alaa Mohsen Al-Araji}, journal={Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم}, volume={19}, number={4}, pages={113-121}, year={2016}, abstract={The PCR-based technique of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) was used tocharacterize and assess the genetic relatedness of eight Trichoderma harzianum isolates. GenomicDNA of each species was extracted at a final concentration of 400 - 600 μg / 2-3 g of wet myceliumand at a purity of 1.6-1.8. Each DNA sample was amplified with each of 15 primers and theproducts were resolved electrophoretic ally on 1.2% agarose gel, stained with ethidium bromide andphotographed under UV. Six primers failed to support amplification while the remaining nineprimers produced a total of 128 main bands (11-20 per primer) across the eight isolates. Of thesebands, 120 (9-19 per primer) were polymorphic. The least efficient primer was OPY-19 (8.59),while the most efficient one was OP-B14 (15.63%). Primer OP-Y19 had the lowest (7.5%)discriminatory power while primer OP-B14 had the highest (15.8%). RAPD analysis fingerprintedsix of the eight isolates through unique bands with one or more of the 9 primers. Cluster analysisbased on the genetic distances split the eight isolates into two major group genotypes.

استعملت تقنية RAPD المعتمدة على تفاعل PCRللتوصيف الجزيئي وتقييم العلاقة الو ا رثية لثمانعزلات من الفطر Trichoderma harzianum . وجرىاستخلاص الدنا من كل عزلة وبتركيز نهائي قدره044 044 مايكروغ ا رم لكل 3 2 غم من الغزل الفطري - –الرطب وبنقاوة 6.1 6.0 . وجرى مضاعفة كل عينة من –عينات الدنا بواسطة 61 بادئا واظهرت النتائج بالترحيلكهربائيا خلال هلام الاكاروز ذي التركيز 6.2 % والمصبغبالمادة المتألقة بروميد الايثيديوم والتصوير تحت الاشعة فوقالبنفسجية U.V.) (. أخفقت ست بادئات في دعم عمليةالتضاعف لاي دنا مجيني بينما انتجت البادئات التسعةالمتبقية ما مجموعه 128 حزمة دنا رئيسية )بمعدل 6 1 - 20لكل بادئ( للعزلات الفطرية الثمانية. ومن هذه الحزم كانت624 حزمة متباينة )بمعدل 69 9 لكل بادئ(. وكان اقل -البادئات كفاءة في اسناد التضاعف هو البادئ OPY-19)بكفاءة 8.59 %(، بينما الاكثر كفاءة كان OP-B14)بكفاءة 15.63 %(. البادئ OP-Y19 حقق اقل قوةتمييزية ) 7.5 %( بينما البادئ OP-B14 حقق اعلى قوةتمييزية ) 15.8 %(. ساعدت تقنية RAPD من تحديدالبصمة الو ا رثية لستة عزلات من الثماني عزلات المدروسةمن خلال ظهور حزمة مؤشرة فريدة حين مضاعفة الدنا منكل عزلة من هذه العزلات مع واحد او اكثر من البوادئالتسعة اعلاه. التحليل العنقودي للمسافات الو ا رثية للعزلاتالثمانية قسمها الى مجموعتين رئيسيتين من الطرز العرقية.} }