TY - JOUR ID - TI - SEROLOGICAL AND MOLECULAR DETECTION OF COWPAE MOSAIC VIRUS INFECTING COWPAE IN IRAQ التشخيص المناعي والجزيئي لفايروس موزائيك اللوبياء الذي يصيب نبات اللوبياء في العراق AU - Nawres A. Al-Kuwaiti نورس عبدالاله الكويتي AU - Abd Al-Hakeem A. Al-Shamary عبدالحكيم علي الشمري PY - 2019 VL - 11 IS - 2 SP - 9 EP - 17 JO - Diyala Agricultural Sciences Journal مجلة ديالى للعلوم الزراعية SN - 20739524 23108746 AB - This study was conducted to detect CPMV in infecting cowpea plantes at Plant Protection Department/College of Agriculture, University of Baghdad. Symptomatic cowpea plants collected from fields in Baghdad and Diyala Provinces were tested by Emzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), reverse transcription- polymerase chain reaction RT-PCR and Immuno-capture reverse transcription-polymerase chain reaction (IC-RT-PCR) using commercial kits. ELISA approach could detect Cowpea mosaic virus CpMV in tested samples but with virus concentration lower than the positive control supplied with the kit, indicating a unique virus strain. RNA from samples showed the highest CpMV concentration were extracted by direct release and used in IC-PT-PCR using como2 a comovirus specific primer set. cDNA was synthetized using como2 revers primer. RT-PCR confirmed the detection of comoviruses when amplified 200 bp DNA fragments from CpMV infected samples. Sequence analysis confirmed CpMV detection when compared with equivalent GenBank sequences. The sequence obtained shared 94.1% maximum nucleotide identity with RNA dependent RNA polymerase (RdRp) gene of CpMV from Egypt (Acc. No. KT438619 and X00206). Both sequence analysis and IC-RT-PCR indicated that virus isolate detected could be an Iraq divergent strain of CpMV.

اجريت هذه الدراسة في قسم وقاية النبات/ كلية الزراعة–جامعة بغداد اذ جمعت عينات نباتات تظهر عليها اعراض موزائيك من حقول زراعة اللوبيا في مناطق مختلفة من ناحية كنعان في محافظة ديالى وقضاء المدائن في محافظة بغداد، ثم اختبرت مناعيا بوساطه تقانة اليزا (ELISA) Emzyme-linked immunosorbent assay وجزيئياً بوساطة تقانة النسخ الرجعي لانزيم تفاعل البلمرة المعتمده على التقييد المناعي Immuno-capture reverse transcription-polymerase chain reaction (IC-RT-PCR باستعمال عدة فحص مناعي متخصصة بفايروس موزائيك اللوبيا CPMV. أعطت نتائج الفحص المناعي قراءات مختلفة للعينات كانت اعلاها اقل من العينة الموجبة من عدة الاستخلاص والتي قد تكون سلالات مختلفة لنفس الفايروس، بعدها اختيرت العينات التي اعطت اعلى تركيز في تقانة اليزا وتم استخلاص الحامض النووي الفايروسي عن طريق تحريره مباشرة من جسيمات الفايروس المقيدة مناعياً وصناعه شريط CDNA من شريط RNA الفايروسية من خلال استعمال البادئ الخلفي من طقم بوادئ como2 المتخصص على مجموعة الكوموفايروس بعدها اجري تفاعل البلمرة التسلسلي باستعمال طقم بوادئ como2 وتم الحصول على قطع DNA ذات الوزن الجزيئي 200 زوج قاعدي دالة على تشخيص فايروس يعود الى مجموعة الكوموفايروس بعدها تم تحديد التتابع النيكلوتيدي للفايروس ومطابقته مع التتابعات النيوكليوتيدية المكافئة المسترجعة من بنك الجينات للتأكد من انه فايروس CpMV والذي اظهر تسلسله الجزئي تطابقاً نيوكليوتيدياً مقداره 94.1 % مع جين RdRp RNA dependent RNA polymerase لفايروس موزائيك اللوبياء والعائد للتسلسلات النيوكليوتيدية من مصر (رموزها البنكية KT438619 و X00206). اشارت النتائج الى ان عزلة الفايروس قيد الدراسة قد تكون سلالة عراقية متباعدة لفايروس موزائيك اللوبياء. ER -