TY - JOUR ID - TI - RAPID DISCRIMINATION AMONG METHICILLIN RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS ISOLATES USING VARIABLE NUMBER TANDEM REPEAT ANALYSIS IN A SAMPLE OF IRAQI PATIENTS AND التميز السريع بين بكتيريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين باستخدام تحليل العدد المتغاير للتكرار الترادفي في عينات من مرضى عراقيين وبيئات المستشفيات AU - Zaid & Kandala زيد وقندلا PY - 2021 VL - 52 IS - 5 SP - 1185 EP - 1193 JO - Iraqi Journal of Agricultural Sciences مجلة العلوم الزراعية العراقية SN - 00750530 24100862 AB - There is so little information available in Iraq about genetic variability in methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA), so current study aimed to use six tandem repeat loci of multilocus variable number tandem repeat (MLVA) typing to discriminate among MRSA, so to achieve the aim of this study, six loci, clfA, clfB, sdrC, spa, sspa and sav1078 were selected for multiplex PCR. The PCR product were subjected to capillary electrophoresis by using ABI-Genetic analyzer, then the data were analyzed by using GeneMapper™ Software 5. Fragment sizes were converted into repeats number. The total number of repeats are used to generate allelic profile. The allelic profile used to draw the minimum spanning tree and dendrogram , all the 85 MRSA isolates are clustered into 54 MLVA type.

هناك معلومات قليلة جداً متوفرة في العراق حول التغاير الوراثي في بكتيريا المكورات العنقودية الذهبية (MRSA)، لذا هدفت الدراسة الحالية الى استخدام ستة من مواقع التكرار الترادفي من تنميط العدد المتغاير للتكرار الترادفي متعدد المواقع (MLVA) لغرض التميز بين بكتيريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين، لذا لغرض تحقيق الهدف من هذه الدراسة تم اختيار ستة مواقع (clfA, clfB, sdrC, spa, sspa and sav1078) لتفاعل البلمرة المتسلسل المتعدد. تم اخضاع ناتج البلمرة الى الترحيل الكهربائي الشعري باستخدام المحلل الجينيABI-، وبعد ذلك حُللت البيانات بواسطة برنامج GeneMapper™ Software 5. تم تحويل حجم القطع الى عدد التكرار. استخدم العدد الكلي للتكرار لانشاء الملف الاليلي الخاص بهذه المواقع. استخدم الملف الاليلي لغرض رسم الحد الأدنى من شجرة الامتداد والمخطط الشجري، ولوحظ تجمع الخمسة وثمانون عزلة الى أربعة وخمسون نمط MLVA. ER -