TY - JOUR ID - TI - Genotyping of Salmonella enterica strains from animal and human origin using three molecular techniques التوصيف الجزيئي ألنواع السالمونيال المعوية في الحيوانات واالنسان باستخدام ثالثة تقنيات جزيئية AU - Iang Schroniltgen Rondón-Barragán إيانك روندون-باراكا AU - Julián David Ortiz-Muñoz جوليان أورتيز-مونوز AU - Juan Sebastian Cruz-Méndez جوان كروز-ميندز PY - 2022 VL - 36 IS - 2 SP - 531 EP - 538 JO - Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية SN - 16073894 20711255 AB - This study aims to characterize different Salmonella enterica subsp molecularly. enterica strains (n=49) were isolated from human gastrointestinal cases in the Tolima region and poultry from Santander and Tolima regions using PCR-RFLP, PCR-ribotyping, and PCR-SSCP. The band patterns obtained with each technique were analyzed by building dendrograms based on the Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean (UPGMA) method and using the Dice coefficient. On the other hand, the discriminatory power of each technique was assessed using Simpson's discriminatory index. The genetic profiles of the gnd gene obtained with AciI restriction enzyme and the PCR-SSCP carried out with groEL gene allowed the inter-and intraserovar differentiation. Finally, the PCR-ribotyping method exhibited the highest discriminatory power (0.8571). In conclusion, we show three PCR-based genotyping methods providing an alternative for identifying similarities and differences within Salmonella enterica strains from different geographic and biological regions.

تهدف هذه الدراسة إلى توصيف جزيئي لمختلف أنواع السالمونيال المعوية باستخدام مؤشر تباين أطوال قطع التقييد ومؤشر التنميط الرايبي ومؤشر تباين أطوال الشريط المفرد للدنا لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل . عزلت السالالت المعوية )عددها = 49 ) من حاالت التهاب الجهاز الهضمي البشري في منطقة توليما وكذلك من الحاالت المرضية للدواجن في منطقة سانتاندير وتوليما في كولومبيا . تم تحليل أنماط الحزم التي تم الحصول عليها من كل مؤشرعن طريق بناء مخططات شجرية على طريقة مجموعة األزواج غير الموزونة بالمتوسط الحسابي وباستخدام معامل النرد للحصول على ارقام عشوائية . من ناحية أخرى ، تم تقييم القوة التمييزية لكل مؤشرباستخدام معامل سيمبسون التمييزي . اظهرت الصورة الجينية لجين gnd التي تم الحصول عليها باستخدام إنزيم التقييد AciI و مؤشرتباين أطوال الشريط المفرد للدنا لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل باستخدام جين groEL والتي سمحت بالتمايز بين وداخل االنماط المصلية . أخي ًرا ، أظهرمؤشر التنميط الرايبي لتقنية تفاعلالبلمرة المتسلسل أعلى قوة تمييزية )8571.0 .)نستنتج من هذه الدراسة بان هناك ثالث مؤشرات للتنميط الجيني المعتمدة على تقنية تفاعل لتحديد أوجه التشابه واالختالف ضمنالبلمرة المتسلسل والتي توفر بديالًسالالت السالمونيال المعوية المأخوذة من مناطق جغرافية وبيولوجية مختلفة ER -