TY - JOUR ID - TI - Modifying Plaque assay and Clearance test as tools in determination of phage typing for Escherichia coli bacterial interspecies AU - Mohammed Abdul Rahmman Mohammed PY - 2012 VL - 1 IS - المؤتمر العلمي الاول للتربية للعلوم الصرفة SP - 1 EP - 6 JO - journal of kerbala university مجلة جامعة كربلاء SN - 18130410 AB - Bacteriophage of Escherichia coliinterspecies from sewage samples were isolated , The phage particles were isolated from two different sewage samples , First sample was collected from sewage sample of Baghdad university and second sample was isolated from domestic sewage sample , first sample showed phages specialized for three E. Coli interspecies bacteria (first plate ) and two E. Coli interspecies bacteria (second plate ) , meanwhile second sample showed phage specialized for two E. Coli. interspeciesStudy of appearance of Escherichia coli phages from first sample showed three types of E. coli phages with different size of inhibition zone 2 , 1.5,1 mm respectively ( first plate ) , meanwhile E. Coli interspecies bacteria showed phages related with two interspecies with size of inhibition zone 1.5 ,1 mm respectively ( second plate ), on other hand , The second sample showed also two interspecies E. coli with inhibition zone (1,2)mm . We designed experimental method which showed the modifying method of phage assay to determine phage typing assay .We tested phage particles with different bacterial strains ( E. coli , shegilla and Serratia ) from different sources and the control was the host of each bacteriophages by taking the O.D for all the tests and controls , to setup new criteria for phage typing .:and this test is called ( Clearance Test ) The result showed that O.D for Test 1 , 2 , 3, was ( 1.6 , 1.2 . 1.7) for ( E. coli , shegilla and Serratia ) bacterial strains , meanwhile the control tests was ( 0.3 , 0.2, 0.4 ) for strains isolated from first sample (first and second plate ) and second samples with different interspecies respectively . This result can predict high specificity of phage strain and this method can be used to determine interspecies strains .So from this experimental we can identify only Clearance Test by measuring only O.D. of bacterial strain with different phages a instead of going through plaque assay .

فاجات بكتريا ال Escherichia coli تحت النوع من عينات مياه المجاري ، العينة الاولى جمعت من عينة مياه المجاري لجامعة بغداد والعينة الثانية اخذت من مياه مجاري منزلية ، العينة الاولى كانت تحتوي على ثلاث انواع فاجات خاصة للEscherichia coli لتحت انواع مختلفة ( الطبق الاول ) ونوعين لفاجات ال Escherichia coli لتحت النوع ( الطبق الثاني ) ، بينما العينة الثانية كانت تحتوي كذلك فاجين خاص للEscherichia coli دراسة مظهر فاجات بكتريا ال Escherichia coli من العينة الاولى كانت تحتوي على ثلاث انواع من الفاجات مع احجام مختلفة لحلقات تثبيط (1 , 1.5 , 2) ملمتر للطبق الاول ، بينما فاجات ال Escherichia coli كانت تحوي نوعين من حلقات التثبيط (1 , 2) ملمتر نحن صممنا تجربة والتي عرضت طريقة محورة لتحليل الفاج لتحدد (نوع البكتريا بأستخدام الفاج ) phage typing من مصادر مختلفة بينما المحلول القياسي تمثل بمضيف المتمثل ببكتريا التي عزل منها الفاج ومن خلال قياس الكثافة الضوئية لكل من الفحوصات والمحلول القياسي يتم تحديد نوع البكتريا وعائدتها الى فاج معين او لا وهذا الفحص سمي ( Clearancetest ) . النتائج عرضت الكثافة الضوئية لفحص 1,2,3 كانت (1.6 , 1.2 , 1.7 ) لبكتريا ال Escherichia coli و ال Serratia وال Shegilla على التوالي بينما فحص المحلول القياسي (0.3 , 0.2 , 0.4 ) للعينة الاولى للطبقيين الاول والثاني والعينة الثانية على التوالي . هذه النتائج اظهرت خصوصية عالية للعاثيات وهذه الطريقة ممكن استخدامها لتحديد تحت النوع باستخدام فحص (Clearance test ) فقط ER -