TY - JOUR ID - TI - Some epidemiological features of BCoVs infection in Al-Qadisiya province by using real time-qPCR technique. دراسة بعض الصفات الوبائية للفايروس التاجي البقري في محافظة القادسية باستخدام خطوة واحدة في الوقت الحقيقي الكمي للفلورة - تفاعل البلمرة العاكس الناسخ AU - Khetam Qaid Mayee ختام قايد مايع الحمداوي AU - Mohsen Abid Nema Alrodhan محسن عبد نعمة الروضان PY - 2014 VL - 13 IS - 2 SP - 14 EP - 19 JO - Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري SN - 18185746 23134429 AB - This study was carried out to evaluate some epidemiological features of Bovine Coronavirus infection by using one-step real-time fluorogenic quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) assay based on SYBR Green I dye in detection. Coronaviruses detected by the same neocleocapsid (N) gene primers under 98% similarity with HECV-4408 (human enteric Coronavirus) in children according to NCBI with product size 124bp. 285 fecal samples has been examined by routine methods against pathogenic bacteria in the intestines (E.coli, Salmonella Spp.) and Cryptosporidium parvum, the samples positive for the parasite submitted to molecular testing because they may be mixed with coronavirus infections. 100 samples were screened for the presence of BCoVs antigens by using a immunochromatographic rapid test as a field fast test. Where 44% of samples showed positivity to BCoVs, out of 50 samples submitted to quantitative reverse transcription (RT-qPCR) assay. Out of 50 – 31 samples had been positive. We found, that distribution of BCoVs was significantly higher in rural areas 33.3%-87.5% as compare to cities 71.4%-75%, the infection in males reach to75% vas 53.5% in females, high infection rate 62.9% in < 1- 4 months age as compare with > 1 month age 62.9%. The results of infection rate showed high percentage during February 77.7% while the percentage on (January, December, March, and April) was (66.6%, 66.1%, 54.5% and 50%) respectively.

أجريت هذه الدراسة لتقييم بعض السمات الوبائية لعدوى الفايروس التاجي باستخدام خطوة واحدة في الوقت الحقيقي الكمي للفلورة- تفاعل البلمرة العاكس الناسخ Real Time RT-qPCR مقاس على أساس صبغة SYBR الخضراء في الكشف. تم كشف الفيروس من قبل نفس الجين التمهيدي تحت نسبة 98 % وفقا ل NCBI مع حجم المنتج 124 زوج قاعدي . كل العينات البرازية فحصت بالطرق الروتينية ضد البكتيريا الممرضة للأمعاء (الاشريشية القولونية، السالمونيلا) والابواغ الخبيئة, وقد تم استبعاد العينات الموجبة للنمو البكتيري في حين أن العينات إلموجبة للطفيلي قدمت إلى الاختبار الجزيئي لأنها قد تكون مختلطة مع الاصابة بالفايروس التاجي. تم فحص 100 عينة فقط لوجود مستضدات BCoVs باستخدام الاختبار الحقلي المناعي السريع . حيث أظهرت 44% من العينات إيجابية لBCoVs ، قدمت 50 عينة مفحوصة بالاختبار السريع للوقت الحقيقي لتفاعل سلسة البلمرة النسخ العكسي الكمي ( Real Time RT- qPCR). حيث ظهر BCoVs في 31 من أصل 50 عينة برازية سريرية من العجول. وجدنا, أن توزيع BCoVs أعلى بكثير في المناطق الريفية 33.3 -87.5 % بالمقارنة مع المدن 71.4 -75 %، و الإصابة في الذكور تصل 75 % بالمقارنة في الإناث 53.5 %. وزيادة الإصابة مع تقدم العمر < 1-4 62.9% مع انخفاض طفيف في عمر > 1 شهر 62.9 % , أظهرت النتائج أن معدل الإصابة العالية كانت خلال شهر شباط 77.7% في حين كانت النسبة في (يناير، كانون الأول وآذار، وإبريل) (66.6%، 66.1%، 54.5% و 50%) على التوالي. ER -