Fulltext

Detection of genotypes for Giardia lamblia in Iraqi patients feces by using PCR-RFLP techniques based on GDH gene characterization

التحري عن الطرز الوراثية لطفيلي Giardia lamblia في براز المرضى العراقيين بوساطة تقنية PCR-RFLP واستنادا الى خصائص جين GDH

Sabaa M. Al-Fahadawi سبأ محسن الفهداوي --- Sarab F. Al-Ani سراب فوزي العاني --- Yusra G. Yaseen يسرى غياث ياسين

Journal of university of Anbar for Pure science مجلة جامعة الانبار للعلوم الصرفة
ISSN: ISSN: 19918941 Year: 2017 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 18-24
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Abstract

This study was carried out during the period from March 2016 to January 2017 to detect of genotypes and subgenotypes of Giardia lamblia in human feces by PCR-Restriction fragment length polymorphism based on the detection of glutamate dehydrogenase gene and study the corralation between genotype and prescence of symptoms , a total of 101 stool samples were taken from patients(male and female), aged(2-72) years, who suffering from acute or persistent diarrhea and examined by microscope and molecular techniques , the gdh gene was amplified from 19 cases only by a conventional PCR assay by using a specific oligonucleotide sequence for coding region by gdh gene at size 432bp and typed by RFLP analysis, the results showed the total infection with Giardia lamblia was 84(83.1%) according to the results of microscopic examination, of the 19 positive samples, 2(1.98%) were infected with genotype AI , 3(2.97%) genotype AII , 5(4.95%) genotype BIII and 9(8.91%) infected with genotype BIV, with significance differences between the genotype and precence of symptoms

اجريت هذه الدراسة خلال المدة الواقعة بين اذار 2016 الى كانون الثاني 2017 كان الهدف منها التحري عن الطرز الوراثية لطفيلي Giardia lamblia في البراز البشري بوساطة تقنية تقييد اطوال القطع متعددة الاشكال PCR-RFLP وذلك من خلال الكشف عن جين gdh ، تم خلال هذه المدة جمع 101 عينة براز من مرضى يشكون من اسهال حاد واعراض الإصابة بداء الجيارديات و من عدد من عمال المطاعم وصالونات الحلاقة والفنادق بأعتبارهم مصدر للعدوى بالطفيليات، تم تضخيم جين gdh من 19عينة بوساطة تقنية PCR التقليدية وتم تنميطها جينيا بوساطة تقنية RFLP PCR-وذلك من خلال ادخال نوعين من الانزيمات القاطعة، من مجموع 19 عينة موجبة لفحص PCR وجد %)1.98)2 مصابين بالطراز الوراثي AI ،3(2.97%) مصابين بالطراز الوراثي AII ، 5(4.95%) مصابين بالطراز الوراثي BIII و 9(8.91%) مصابين بالطراز الوراثي BIV ، لاتوجد فروقات حقيقية بين نسبة الإصابة والعمر، الجنس،المهنة، التباين الفصلي،والمنطقة الجغرافية.

Keywords

Giardia lamblia --- GDH gene --- PCR-RFLP