Fulltext

The genetic relationship for Klebsiella pneumoniae isolated from human urinary tract and beef

العلاقة الوراثية لجرثومة الكلبيسيلا الرئوية والمعزولة من الجهاز البولي في الإنسان والأبقار

S.F. Klaif صبا فلاح كليف --- H.H. Nasir حسن حاجم ناصر --- J.N. Sadeq وجنان ناظم صادق

Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية
ISSN: 16073894 Year: 2019 Volume: 33 Issue: 1 Pages: 75-80
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Abstract

The present study aimed to describe the genetic relationships of zoonotic characterization of Klebsiella pneumoniae isolated from Human urinary tract and beef. The study includes (50) urine samples from human and (50) beef samples. The isolation and identification of Klebsiella pneumonia were done by using enrichment culture method and Vitek 2, then confirmed by PCR technique based on 16S ribosomal RNA gene which designed in this study using NCBI-GenBank (LT599801.1) and DNA sequencing was done on some positive isolates. The results show that Klebsiella pneumoniae was isolated from beef at 38 (76%) and from human at 32 (64%) by vitek2. The PCR technique was show highly sensitive and specific confirmative detection of Klebsiella Pneumonia isolates at Clarify DNA sequencing of a partial sequence of 16S ribosomal RNA gene was shown homology sequence identity highly with NCBI-Blast Klebsiella pneumoniae isolates. The phylogenetic analysis was show clear genetic similarity at (0.5 genetic change) between human and beef in Klebsiella pneumoniae isolates. The gene sequence deposited into NCBI-GenBank accession numbers (MF314450.1, MF314451.1, MF314452.1, MF314453.1). In conclusion, the study presents the first report in Iraq of genetic relationship among K. pneumoniae isolates from beef and humans. Therefore, it is essential to define the role of animals as an important source for the distribution of pathogen related to public health.

الدراسة الحالة تهدف العلاقة الوراثية للأهمية المشتركة للكليبسلا الرئوية التي تصيب الجهاز البولي للانسان ولحوم الأبقار. تضمنت الدراسة جمع 50 عينة من إدرار الإنسان و50 عينة من لحوم الأبقار تم تشخيصها والكشف عنها بواسطة استخدام الصفات الزرعية والاختبارات الكيموحيوية باستخدام فحص الفايتك2و تقنية تفاعل سلسة البلمرة (بي سي ار). باستخدام الجين التشخيصي 16س رايبوسومال ار ان اي الذي صمم في هذه الدراسة باستخدام العترة العالمية التي أخذت من جين البنك العالمي يحمل رقم الانضمام LT599801.1. أظهرت النتائج أن نسبة الإصابة في الأبقار باستخدام فحص الفايتك 38 (76%) في الأبقار في حين نسبة الإصابة في الإنسان 32 (64%). تم استخدام التقنية الجزيئية للتحقق من النتائج وذلك عن طريق استخلاص الحامض النووي الرايبي DNA لبكتريا الكليبسلا الرئوية وقياس تركيزه ونقاوته بواسطة جهاز Nanodrop ليتسنى التحري عن قطعة الجين وذلك باستخدام بادئات primers لبكتريا الكليبسيلا الرئوية والعزلات تم إرسالها لغرض تتابع النيوكلوتيدات وتم الحصول على أرقام الانضمام لعزلتين من الإنسان وعزلتين من الأبقار (MF314450.1, MF314451.1, MF314452.1, MF314453.1) من بنك الجينات العالمي NCBI-Genbank. أظهرت الشجرة الوراثية تشابه بنسبة (99 % -100%) مع العزلات العالمية لكليبسلا الرئوية المعزولة من الإنسان والأبقار. الخلاصة ,الدراسة الحالية تسجل لأول مرة في العراق حيث سجلت العلاقة الوراثية للكليبسلا الرئوية بين الإنسان والأبقار لذلك من الضروري معرفة الدور الحقيقي لدور الأبقار كمصدر في نقل وانتشار الإصابة إلى الإنسان وخطرها على الصحة العامة.

Keywords

Klebsiella pneumonia --- 16s rRNA --- Polymerase change reaction --- phylogenetic tree