Fulltext

First phylogenetic characterization of Pseudocowpox virus from cattle in Al-Qadisiyah province-Iraq

دراسة نسبية لفايروس جدري الأبقار الكاذب المحدد في أبقار حلوب من محافظة القادسية، العراق

S.M. Karim صلاح مهدي كريم --- K.A. Mansour خليفة علي منصور --- A.H.D. Janabi علي حسن داغر جنابي --- N.K.M. Al-Nakeeb نورس كاظم النقيب

Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية
ISSN: 16073894 Year: 2019 Volume: 33 Issue: 1 Pages: 123-126
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Abstract

This study was initiated for the first time for identification, using sequencing and phylogenetic analyses, of pseudocowpox PCPV that inhabit dairy cows in Al-Qadisiyah province, Iraq. Scab sampling was performed to obtain specimens from udder and teats of 18 affected cows. Initially, a polymerase chain reaction (PCR) method was followed to target a 408-bp piece of the GM_CSF/IL-2 inhibition factor gene (GIF) that belongs to PCPV. Then, the PCR products were sent out to partial sequencing of the GIF gene. The results of the PCR have indicated the presence of the virus in only 3 out of 18 samples. When the sequences were studied using phylogeny, the results have revealed that one of our PCPV strains has a close matching with some of the world strains such as from New Zealand. While two of the current study strains have clustered together with a strain from Finland. The results of our study confirm the presence of the PCPV in dairy cows that induces milker’s nodules.

صممت هذه الدراسة لأول مرة في العراق لتحديد الإصابة بفيروس جدري الأبقار الكاذب، باستخدام تحاليل تعاقب النيوكليوتيدات والنسبية للأنواع الوراثية الموجودة من فيروس PCPV التي تستوطن في الأبقار الحلوب في محافظة القادسية/ العراق. تم جمع العينات (قشور) من آفات الضرع والحلمات لـ 18 بقرة مصابة. في البداية اتبعت طريقة تفاعل إنزيم البلمرة المتسلسل (PCR) لاستهداف قطعة بحجم 408 قاعدة مزدوجة من جين عامل تثبيط الـ GM_CSF/IL-2 (GIF) الذي يعود للـ PCPV. بعدها أرسلت نواتج تفاعل إنزيم البلمرة المتسلسل لإجراء دراسة التعاقب لجين GIF. أجريت تحليلات الدراسة النسبية لفهم النشوء والتطور لعتر الدراسة الحالية. أشارت نتائج الـ PCR إلى وجود الفايروس في 3 عينات فقط من أصل 18 عينة. أكدت نتائج تحليل دراسة التعاقب وجود الـ PCPV في الحيوانات المصابة. وعند دراسة التعاقبات باستخدام التحليل النسبي أظهرت النتائج أن واحد من 3 عتر لفيروس الـ PCP لديه تطابق قريب مع بعض العتر العالمية المعزولة في نيوزيلاندا. بينما تجمعت اثنان من عتر الدراسة الحالية معا مع عترة فلندا. أكدت نتائج هذه الدراسة وجود الـ PCPV في الأبقار الحلوب والذي يحدث الـ Milker’s nodules وهو مرض مشترك للإنسان والحيوان. هذه هي الدراسة الأولى التي تسجل معلومات نسبية لفايروس جدري الأبقار الكاذب والذي يصيب الأبقار الحلوب في العراق.

Keywords

Dairy cows --- GIF gene --- PCR --- Pseudocowpox virus --- Sequencing