research centers


Search results: Found 76

Listing 1 - 10 of 76 << page
of 8
>>
Sort by

Article
Sensitivity Study of Different Varieties of Tomato by Using PCR Technique
د ا رسة حساسية أصناف مختمفة من الطماطة باستعمال تقنية ال PC

Loading...
Loading...
Abstract

Polymerase chain reaction has been used to diagnose the tomato yellow leaf curl virus for the firsttime in different varieties of tomato in some tomato-growing areas in Iraq including Basrah, Maysan, Karbala,Baghdad Provinces to confirm the presence of the virus. It has been shown that there are dissimilaritiesamong varieties of tomato for infection by TYLCV. Besides,infected varieties Result also shown that this virus has recorded in some varieties of tomato for the first timein maysan Province.

استخدمت تقنية PCR لأول مرة في الكشف عن الفايروس TYLCV في أصناف مختمفة من الطماطة في بعض مناطق ز ا رعةالطماطة في الع ا رق، شممت محافظة البصرة وميسان وكربلاء وبغداد لمتأكد من وجود الفايروس اظير خلاليا الاختبار تفاوت الأصناف المختمفةفي إصابتيا بالفايروس TYLCV إذ لوحظ ظيور الحزم المتوقعة (~ 400) زوج قاعدي في الأصناف المصابة بالفايروس باستخدام بادئاتخاصة و سجل الفايروس لأول مرة في محافظة ميسان عمى أصناف من الطماطة.

Keywords

PCR ، TYLCV


Article
Comparative diagnostic study of Klebsiella usingApi20E System and the device vitek2 and PCR
دراسة تشخيصية مقارنة لجراثيم الكليبسيلا باستخدام نظام الـ Api20Eوجهاز الـvitek2 وجهاز الـ PCR

Loading...
Loading...
Abstract

The current Study included 273 samples colected from models of different clinical Samples (urine , Stool, blood , sputum, and swabs from the vagina ,wounds, ear and throat) which have been get on 30 (10.98% ) isolates of Klebsiella from total of various clinical samples. The rate of Klebsiella from urine samples was 26.6% of the total 30 samples and The isolation rate from stool and blood sampls was 16.6%, while in wound infection the rat was (13.3%). Klebsiella isolated from vaginal swabs with (10%), and with respect to ear infections the percentage of isolation that have emerged in this study are (3.33%) and isolated rate from the throat and sputum was (6.6%). After a Diagnosis results have shown the prevalence of K.pneumoniae with rate(23 with76.66%) followed by K.oxytoca rate (5with16.66%) and 2 K.terrigena isolates with( 6.66%) of the total 30 isolates. Twenty isolates were selected belonging to the species K.pneumoniae and K.oxytoca which diagnosed by Api20E for rediagnosing by(PCR and viteke2) , and the results of the diagnostic system Vitek2 showd that the Klebsiella which have been previously diagnosed byApi20E system (90%) K.pneumoniae and (10%) K.oxytoca while the genetic diagnosis results showed 80% of the isolates belonged to the type of the K.pneumoniae and 20% of isolates belonging to K.oxytoca

ضمـنت الـدراسة الحالية جـمع 273 عـينة من نماذج مرضية مخـتلـفة شملت (الإدرار، الـبراز، الدم، القشع ، مسحات من المهبل ‘الجروح، الأذن والحنجرة) ومن خلالها تم الحـصول عـلى 30عـزلة لجـراثـيم الـKlebsiella بنسبة )10.98%( من مجموع النماذج المرضية المختلفة إذ تم عزل جرثومة الـKlebsiella من عينات الإدرار بنسبة) 26.6% ( من مجموع 30 وكانت نسبة الجرثومة في البرازوالدم 16.6% اما بالنسبة لاخماج الجروح كانت نسبة العزل للجرثومة (13.3%(وتم عزل جرثومة الـKlebsiella من المسحات المهبلية بنسبة (10% ) وفيما يخص أخماج الأذن فإن النسبة المئوية لعزل الجرثومة التي ظهرت في هذه الدراسة كانت (3.33%) وعزلت الجرثومة من الحنجرة و القشع بنسبة (6.6%) . بينت نتائج التشخيص شيوع النوع K.pneumoniae بنسبة أعلى من بقية الأنواع إذ بلغ عددها 23 وبنسبة (76.66%) تليها عزلات الـK.oxytoca التي كانت عددها 5وبنسبة (16.66%) من ثم عزلات الـK.terrigenaالتي بلغ عددها 2 وبنسبة ( 6.66%) من مجموع 30عزلة . تم اختيار 20 عزلة تابعة لنوعي الـ K.pneumoniae و K.oxytoca والمشخصة مسبقا بنظام الـApi 20 E وتم تشخيصها بالطرائق التشخيصية (Vitek2،PCR) كانت نتائج التشخيص بنظام الـ2Vitek لعزلات الـKlebsiella التي تم تشخيصها مسبقا بنظام الـApi20E(90%)K.pneumoniae و(10%) K.oxytoca اما في التشخيص الجيني فقد أبدت النتائج أن( 80% ) من العزلات كانت تابعة لنوع الـ K.pneumoniae و)20% ) من العزلات تابعة لنوع الـK.oxytoca. وتم الاستنتاج بان نتيجة التشخيص بنظام الـPCR كانت اقرب لنتائج نظام الـ APi20E وابعد من نتائج نظام الـVitek2


Article
PRODUCTION OF POLYGALACTURONASE FROM THERMOSTABLE MOLD ASPERGILLUS NIGER 1- ISOLATION AND SCREENING THE ENZYME PRODUCER THERMOSTABLE MOLDS AND IDENTIFYING THE PRODUCER ONE
إنتاج أنزيم POLGALACTYRONASE من العفن ASPERGILLUS NIGER المتحمل للحرارة1-عزل وغربلة الأعفان المتحملة للحرارة والمنتجة للأنزيم وتشخيص العزلة الأكثر إنتاجاً

Authors: Mohammed O. Muhyalddin محمد عمر محي الدين --- Rukaibaa A. Chechan رقيباء علي جيجان
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2013 Volume: 44 Issue: 1 Pages: 97-105
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 147 isolates of pectin hydrolysis enzymes producer molds were isolated from various sources(soil and decayed vegetables and fruit) using Czapek Dox Agar using 3% pectin as the sole carbon source by adding of 1M Hcl at PH5 and submitted to primary and secondary screening at 40 CO to select the best isolate that produces the highest level of polygalacturonase. It was found that 7 isolates were good producer but the isolate which designated TP4 was the highest producer one. The source of this isolate was deteriorated orange and identified as Aspergillus niger according to morphological, biochemical and molecular analysis which was achieved using PCR (Polymerase Chain Reactions) technique. This isolate was nominated as Aspergillus niger TP4 for distinguishing it from any other isolates used for production the same enzyme. This part of study was aimed to investigate the optimal condition of production the enzyme Polygalacturonase from Aspergillus niger TP4 by solid state fermentation using different wastes available locally. It was found that the higher level of production could be achieved on wheat bran and sunflower head extract moistened with water at a ratio 3:1 with an initial pH 5 inoculated with 107 spores/gm during an incubation time of 4 days at 4 C0.the polygalacturonase activity was assay by measuring reducing groups The productivity under these conditions was 325.45 unit/gm using wheat bran and 242.28 unit/gm using sunflower head with an increase estimated about 124.7% and 120.8% respectively in relationship with productivity before of the optimization.

تم الحصول على 146 من الأعفان المنتجة للأنزيمات المحللة للبكتين من مصادر متنوعة (التربة والخضروات والفواكه التالفة) باستخدام وسط العزل والمتمثل بوسط جابك دوكس المحور Czapek Dox Agar كوسط لعزل الاعفان باستبدال مصدر الكاربون فيه ببكتين التفاح وبتركيز 3 %, عدل الرقم الهيدروجيني للوسط على5 بمحلول 1 مولار حامض وأخضعت لعمليتي الغربلة الأولية والثانوية بغية انتقاء أكثرها مقدرة على أنتاج الأنزيم في 40 م0. فتبين أن سبع عزلات منها تميزت بقابليتها على إنتاج الأنزيم بنسبة تفوق غيرها. وأن العزلة التي رمز لهاTP4 ومصدرها ثمرة البرتقال التالفة، هي أكثرها إنتاجاً. و أظهرت فحوص التشخيص المورفولوجية والجزيئية وباستخدام سلسلة تفاعلات البلمرة الأنزيميةPCR (Polymerase Chain Reactions) أنها تعود الى العفن Aspergillus niger ورمز لها TP4) ) تمييزاً لها عن غيرها من العزلات المستخدمة لإنتاج الأنزيم نفسه كما استهدفت هــذه التجربة تعيين الظروف المثلى لإنتاج أنزيم Polygalacturonase من العفن Aspergillus niger TP4 وبطريقة تخمرات الحالة الصلبة تحققت أعلى إنتاجية باستخدام نخالة الحنطة ورؤوس زهرة الشمس المرطبة بنسبة 1:3 والملقحة بـمعدل 107 بوغ /غم من الوسط وبرقم هيدروجيني ابتدائي 5 بعد مدة حضن بلغت أربعة أيام عند 40 مº. جرى تقدير فعالية انزيم Polygalacturonase بولى كالاكتيورونيك باتباع طريقة 5,3 – ثنائى نايتروسالسليك حيث بلغت إنتاجية الأنزيم 325.45 وحدة /غم من وسط نخالة الحنطة و242.28 وحدة/غم من وسط زهرة الشمس وبزيادة قدرت بحوالي 124.7 % و120.8% نسبة الى الإنتاجية لما قبل تحديد الظروف المثلى ولكلا الوسطين على التوالي.


Article
أنتقال الجينات المشفرة لمقاومة المضاد الحياتي الفانكومايسين بين عزلات بكتريا Enterococcus spp. داخل وخارج الجسم الحي

Author: محمد فرج المرجاني
Journal: Al-Mustansiriyah Journal of Science مجلة علوم المستنصرية ISSN: 1814635X Year: 2014 Volume: 25 Issue: 3 Pages: 47-56
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Total of (33) Enterococcus isolates were taken from hospitalized patients. The highest number of Enterococcus isolates wers isolated from Urine (30 isolates) followed by blood (3 isolates ), 20 isolates belong to E. faecalis and 10 isolates belong to E. faecium . The Antimicrobials susceptibility test by using the discs method, it has been found that there is a clear variation in the resistance of isolates were studied for the used antibiotics , as it was found that the E. faecalis isolates were highly sensitive to Ampicillin and Imipenem, all isolates were resistant to Oxacillin. The Vancomycin susceptibility test for all isolates was done and results showed that (25)% of E. faecalis isolates and (40)% of E. faecium isolates were resistant to this antibiotic. Minimum Inhibitory concentrations(MICs) for vancomycin were determined, vancomycin resistant E. faecium isolates had MICs between (4-64) μg/ml, while vancomycin resistant E. faecalis isolates had MICs (4 -512) μg/ml. The detection of plasmid DNA in Vancomycin – Resistant Enterococcus (VRE) isolates by gel electrophoresis showed that some of these isolates had plasmid bands with different sizes. The bacterial conjugation experiments among Enterococcus isolates had gained success in transfer of vancomycin resistance among the isolates by in vitro and in vivo conjugation.The detection of van genes by Polymerase Chain Reaction showed that all isolates with MICs ≥ (64) μg/ml have vanA genotype, while Two isolates with MIC (32) μg/ml have vanB genotype .

حصلنا على (33) عزلة تعود لجنس Enterococcus من الراقدين بالمستشفيات بواقع (30) عزلة من عينات الإدرار و (3) عزلات من عينات الدم، أما على مستوى النوع فقد شخصت (20) عزلة تعود للنوع E. faecalis و(10) عزلات تعود للنوع E. faecium . أظهرت نتائج فحص الحساسية للمضادات المايكروبية فعالية كل من مضادي Imipenem و Ampicillin تجاه عزلات بكتريا E. faecalis، أما بكتريا E. faecium فقد أظهرت عزلاتها حساسية عالية تجاه مضاد Imipenem. فضلا عن ذلك فقد أظهرت العزلات جميعها مقاومة لمضاد Oxacillin. من جهه اخرى كانت (25)% من عزلات بكتريا E. faecalis مقاومة للفانكومايسين ، بينما بلغت نسبة المقاومة لهذا المضاد (40)% بين عزلات بكتريا E. faecium. حدد التراكيز المثبط الدنيا (MICs) للفانكومايسين بين العزلات المقاومة لهذا المضاد بطريقة التخفيف بالوسط السائل، أذ تراوحت قيم MIC لعزلات بكتريا E. faecalis بين (4-512) مايكروغراممل، أما بالنسبة لبكتريا E.faecium فتراوحت قيم MIC لعزلاتهــــا بين (4-64) مايكروغــراممـــل. بيَنت نتائج التحري عن الدنا البلازميدي بالترحيل الكهربائي في هلام الأكاروز لعدد من عزلات بكتريا المكورات المعوية المقاومة للفانكومايسين ((Vancomycin –resistant Enterococcus (VRE)) إحتواء بعض هذه العزلات على حزم بلازميدية مختلفة الأحجام. أجريت عمليات الإقتران البكتيري خارج الجسم الحي In vitro)) وداخل الجسم الحي In vivo) )، وأظهرت النتائج نجاح عمليات الإقتران، إذ لوحظ إنتقال صفة مقاومة الفانكومايسين بين الخلايا قيد الدراسة الامر الذي قد يعزى الى إحتمالية كون جينات هذه الصفة محمولة على بلازميدات إقترانية تُسهل إنتقالها عبر الإنتقال الأفقي من خلية لأخرى ضمن النوع نفسه أو الأنواع الأخرى


Article
Physiological and Molecular Study for Uromodulin Gene Effect and its Relation with Recurrent UTI in Sample of Anbar Province Females
دراسة فسلجية جزيئية لتأثير الجين Uromodulin وعلاقته بإلتهاب المجاري البولية المتكرر في عينة من نساء محافظة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

The current study Included (100) women suffering from recurrent infection of the urinary tract revisions for hospitals and civil laboratories in Anbar province, the category of age among women (10-50 years), in addition to (40) women do not have any history of infection in the same age group as a control sample for comparison. The study achieved in period between 03/09/2013 to 27/12/2014 .The highest recorded rate of infection in the age ranged between (21-35 years) (48%), also the high incidence observed were among married women (62%), and most infection were in women of villages and rural areas(67%). The current study involved measuring the level of concentration of Tamm horsfall protein (THP) the study showed a significant decrease at P≤0.05 in (43%) and the rate of individuals (6.2 ± 38.3) Ng / ml compared with control sample, which was (7.4 ± 256.2) Ng / ml. The study also included molecular tests (for women suffering from UTI and THP concentration disorders) using Polymerase Chain Reaction technique and using three specific primers for the detection of any trouble in Uromodulin gene and its relationship to UTI. The results showed a significant increase P≤0.05 for the study sample represents (24,19,18) absence time of primers bands in some cases to appear different bands from the expected size compared with the control sample that did not show any of the previous cases.

اشتملت الدراسة الحالية على (100) امرأة مصابة بالتهاب المجاري البولية المتكرر من المراجعات للمستشفيات والمختبرات الاهلية في محافظة الانبار بفئة عمرية بين(10- 50 )سنة ، بالإضافة الى (40) امرأة ليس لديهن اي تاريخ مرضي للإصابة بالتهاب المجاري البولية وبنفس الفئة العمرية كعينة سيطرة للمقارنة. امتدت الدراسة للفترة بين 3/9/ 2013ولغاية 27/12/2014 اذ سجلت اعلى نسبة للإصابة في الفئة العمرية (21-35) سنة (48%) ، كما لوحظ ارتفاع نسبة الاصابة لدى النساء المتزوجات (62%) ، وساكني القرى والارياف (67%).تضمنت الدراسة الحالية قياس مستوى تركيز بروتين (THP)Tamm horsfall proteinفي عينات الدراسة وقد اظهرت انخفاضا معنويا P≤0.05 في (43%) من افراد عينة الدراسة وبمعدل (6.2±38.3)Ng/ml مقارنة بعينة السيطرة التي بلغ فيها معدله (7.4±265.2)Ng/ml.كما اشتملت الدراسة اجراء اختبارات الكشف عن جين THP للنساء التي تعاني من التهاب المجاري البولية واضطراب في تركيز بروتين THP)) باستخدام تقنية تفاعل السلسلة المتبلمر Polymerase chain reaction(PCR) وبالاستعانة بثلاثة بادئات متخصصة Specific primers للكشف عن اي اضطرابات على الجينUromodulinوعلاقته بالتهاب المجاري البولية ، وقد أظهرت الدراسة وجود ارتفاع معنوي P≤0.05 لدى عينة الدراسة تمثل (24،19،18) حالة غياب للحزمة في البادئات المستخدمة وبعض حالات الظهور بحجم مختلف عن المتوقع مقارنة مع عينة السيطرة التي لم تظهر اي حالة من الحالات السابقة

Keywords

THP --- Uromodulin --- PCR --- UTI


Article
Detection of Porphyromonas gingivalis from Periodontal Pocket Infections by Microbial Cultivation and PCR Techniques
التحري عن جرثومة Porphyromonas gingivalis من إصابات جيوب ما حول الأسنان بطرق الزرع الجرثومي وبتقنية PCR

Author: Amera M. M. Al-Rawi أميرة محمود محمد الراوي
Journal: Rafidain journal of science مجلة علوم الرافدين ISSN: 16089391 Year: 2012 Volume: 23 Issue: 1A Pages: 39-55
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The study aimed to detect P. gingivalis from 49 patients with periodontitis at different ages and both sexes, after determination of pocket depth, types of infection whether chronic or progressive by dentists. Routine culture method was done using selective media and anaerobic condition and compared with species specific polymerase chain reaction (PCR) technique.DNA was extracted from samples and its concentration and purity were determined. The results showed domination of chronic infections and the pocket depths ranged between 3-9mm, as well as the results revealed that isolation percent of P.gingivalis by PCR was more higher than culture method, it was 65.3% and 28.5% respectively. The results also showed that phenol-chloroform was the efficient method for DNA extraction comparing with other methods. The study revealed that there are effects of age and sex on isolation rate and the results indicated that percentage of P.gingivalis was detected in 20-30 years old and males were more infected than females.

هدف البحث إلى عزل وتشخيص جرثومة P.gingivalis من 49 مريضاً مصاباً بالتهاب جيوب اللثة (ما حول الأسنان) و بأعمار مختلفة من كلا الجنسين بعد أن تم تحديد عمق الجيب Pocket depth ونوع الإصابة إما مزمنة Chronic أو متقدمة Progressive من قبل طبيب أسنان اختصاص بأمراض اللثة. تم استخدام الطرائق الروتينية بالزرع على الأوساط الانتخابية وتوفير ظروف لا هوائية وقورنت مع تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للنوع المتخصص (PCR)، إذ تم استخلاص الحامض النووي DNA وحدد تركيزه ونقاوته.بينت النتائج سيادة الاصابة المزمنة على المتقدمة وان عمق الجيب تراوح بين 3-9 ملم كما أظهرت النتائج أن نسبة الكشف عن الجرثومة بتقنية PCR اعلى بكثير مقارنة بنسبة عزلها والتحري عنها بالطرائق الزرعية إذ بلغت 65.3% و 28.5% على التوالي. كما ابدت النتائج ان طريقة الفينول-كلوروفورم الروتينية هي الاكفأ في استخلاص الـ DNA مقارنة بالطرق الأخرى.كما أظهرت الدراسة أن هناك تأثيراً لعاملي العمر والجنس على نسبة العزل فقد كانت اعلى نسبة عزل لجرثومة P.gingivalis عند الفئة العمرية 20-30 سنة وان الذكور اكثر اصابة من الإناث.


Article
Genetic relation between three morphological states of N2-fixing Cyanobacteria by using PCR technique
العلاقة الوراثية للاشكال المورفولوجيه الثلاثة من السيانوبكتريا المثبتة للنتروجين باستخدام تقنية الـPCR

Loading...
Loading...
Abstract

Three nitrogen fixing Cyanobacteria purified isolates were selected which express the three morphological states, first Oscillatoria chlorina as an example of filamentous non Heterocysts Cyanobacteria and second Microcystis rubusta as an example of Unicellular Cyanobactera and third Anabaena spiroides as an example of filamentous Cyanobacteria containing a Hetrocysis, these isolate were cultured on ASM-1 free nitrogen medium using light tension of lux (2500) and temperature of 25°C. Total DNA were isolated and found that its concentration varied between (1.3 to 1.8) the concentration was fixed in order to obtain that each 100 l contains 50 ng/l. Primers for RAPD-PCR were used to detect the genetic variation between the three genera of Cyanobacteria understudy and in order to diagnose the genetic relationship and to detect the genetic dimension between these isolates in order to use these results to found the genetic fingerprint. Eleven primers were used in RAPD-PCR reaction and 10 of them were positive. The OPC-05 gave the high number of bands (20 bands) while OPA-18 and OPJ-13 gave the lowest (9 bands).The genetic dimension between the three isolates were compatible with the morphological, microscopical and physiological results obtained as we found that Microcyctis rubusta and Anabaena spiroides were closely related and Oscillatoria chlorine was far genetically.

أختيرت ثلاث عزلات نقية من السيانوبكتريا المثبتة للنتروجين الجوي تمثل الأشكال المورفولوجية الثلاث، الأولىOscillatoria chlorina كمثال للسيانوبكتريا الخيطية بدون حوصلة مغايرة، والثانية Microystis rubusta كمثال للسيانوبكتريا أحادية الخلية، والثالثة Anabaena spiroides مثال للسيانوبكتريا الخيطية الحاوية على الحوصلة المغايرة، وقد نميت هذه العزلات على وسط ASM-1 الخالي من النتروجين لمدة عشرون يوماً وتحت ظروف من شدة اضاءة lux (2500) ودرجة حرارة 25م. تم عزل الـــ DNA وتقدير تراكيزه ونقاوته التي تراوحت ما بين (1.3-1.8) وضبط تركيزه للحصول على حجم (100) مايكروليتر بتركيز 50 نانوغرام/مايكروليتر لكل عينة. استخدمت مؤشرات الـــ RAPD-PCR لتحليل التباين الوراثي بين الأنواع الثلاثة للسيانوبكتريا قيد الدراسة للكشف عن العلاقة الوراثية ولتحديد البعد الوراثي بين هذه الأنواع ومن ثم استخدام هذه النتائج لإيجاد البصمة الوراثية. استخدم (11) باديء في تفاعلات RAPD- PCRوأعطت (10) منها تضاعف وامتلك الباديءOPC-50 اعلى عدد من الحزم اذ بلغت (20) حزمة في حين امتلك كل من البادئين OPA-18 و OPJ-13 اقل عدد من الحزم وهي (9) حزمة. تم إيجاد البعد الوراثي بين الأنواع الثلاثة والتي تؤكد وتدعم نتائج الاختبارات المظهرية والمجهرية والفسلجية وأظهرت نتائج التحليل الوراثي أنّ النوعين rubustaMicrocystis وAnabaena spiroides هما الأقرب وراثياً في حين أنّ النوع Oscillatoriachlorina كان الأبعد وراثياً عنهما.


Article
A Study of Some Physiological and Molecular Variables for Infertility Women in Anbar Province-Iraq
دراسة بعض المتغيرات الفسلجية والجزيئية لعقم النساء في محافظة الأنبار- العراق

Loading...
Loading...
Abstract

Infertility is a global health problem and one of the major problems in many countries, including Middle East, this phenomenon grow in recent years, as the world has seen a rise in the rates of infertility, especially women infertility, so this study conducted to find some reasons of unexplained women infertility. The current study included (100) infertile women in Anbar province, the ages ranged from 20-45 years of revisions to Al-Ramadi Education Hospital for women and pediatric and some medical clinics in a number of cities and districts of Anbar province, through the period from September / 2013 to January / 2014, in addition to (40) healthy women who did not have any history or clinical signs of infertility and their ages matches of the study group, the results of the current study showed that the proportion of primary infertility in Anbar province, the highest of secondary infertility, amounting to 60% and 40% respectively. The study also included some hormonal tests to members of study and control samples included measurement of Luteal hormone concentration (LH), Follicle Stimulation hormone (FSH), Prolactin hormone (PRL) and Testosterone Hormone (Testo) to excluding any sample suffer from hormonal disorders the study showed a significant increase P≤0.05 in the concentrations of infertile women hormones as compared with the control group, and it was found among the (100) infertile women that 59 (59%)women have different hormonal disorders. A molecular study of 28 infertile woman (do not suffer from any hormonal disorders) in addition to (30) healthy women from the control samples for the detection of polymorphism and disorders that may occur to the aromatase gene CYP19A1 using a pair of specific primers designed throughout this study to determining its relationship with unexplained infertility in women, and showing that there disorders in 25 (89.3%) sample of infertile women ranged from the absence of the primers bands or appearance differs from the expected size while the control group did not show any disturbance.

يعد العقم مشكلة صحية عالمية وهي من المشاكل الرئيسية في العديد من البلدان بما في ذلك الشرق الاوسط التي اخذت بالازدياد في الآونة الاخيرة اذ شهد العالم ارتفاعاً في معدلات العقم ولاسيما العقم عند النساء لذا صممت الدراسة لمعرفة اسباب العقم. شملت الدراسة الحالية (100) امرأة مصابة بالعقم في محافظة الانبار تراوحت اعمارهن بين 20-45 سنة من المراجعات لمستشفى الرمادي التعليمي للنسائية والأطفال وبعض العيادات الطبية في عدد من مدن واقضية محافظة الانبار للفترة من أيلول/2013 ولغاية كانون الثاني/2014 بالإضافة الى (40) امرأة سليمة ليس لديهن تاريخ اصابة او دلائل سريرية على اصابة محتملة بالعقم ومطابقات عمرياً للمجموعة المرضية , أوضحت نتائج الدراسة الحالية بأن نسبة العقم الأولي في محافظة الانبار أعلى من العقم الثانوي اذ بلغت (60،40%) على التوالي. كما اشتملت الدراسة اجراء بعض الفحوصات الهرمونية لأفراد عينتي الدراسة تضمنت قياس تركيز هرمون Lotine hormone (LH) و Follicle Stimulation hormone (FSH) و Prolactin hormone (PRL)و Testosterone Hormone (Testo)لغرض استبعاد اي عينة تعاني من اضطرابات هرمونية وتبين حدوث ارتفاع معنوي P≤0.05 في تراكيز الهرمونات لدى النساء العقيمات مقارنة بمجموعة السيطرة ، اذ وجد انه من بين الـ(100) امرأة عقيمة 59 (59%) امرأة مصابة باضطرابات هرمونية مختلفة. تم اجراء الدراسة الجزيئية لـ(28) امرأة عقيمة (لا تعاني من اي اضطرابات هرمونية) بالإضافة الى (30) امرأة سليمة من عينة السيطرة كمجموعة مقارنة للكشف عن تعدد الاشكال والاضطرابات التي قد تطرأ على الجين اروماتيزCYP19A1 باستخدام زوج من البادئات المتخصصة المصممة اثناء الدراسة للجين المذكور لغرض تحديد علاقته بالعقم غير المفسر عند النساء وتبين حدوث الاضطرابات في 25 (89.3%) عينة من النساء العقيمات تراوحت بين غياب حزم البادئ او ظهورها بحجم يختلف عن الحجم المتوقع في حين لم تظهر مجموعة السيطرة اي اضطرابات للجين المذكور.


Article
Molecular investigation of the Parasite Entamoeba Spp. among children with diarrhea in Thi Qar Province
التحري الجزيئي لطفيلي المتحولة Entamoeba Spp. بين الاطفال المصابين بالإسهال في محافظة ذي قار

Authors: Fadhil Abbas Manshad أ.د فاضل عباس منشد العبادي --- Manar Kareem Kadhm منار كريم كاظم السعيدي
Journal: Univesity of Thi-Qar Journal مجلة جامعة ذي قار العلمية ISSN: 66291818 Year: 2017 Volume: 12 Issue: 4 Pages: 16-30
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

The purpose of the current study is the genetic diagnosis of the genus Entamoeba Using PCR technology and identify some of the species that infect humans using Nested PCR by 18S rRNA gene responsible for this genus discrimination. The current study included 300 Sample microscopically examined for a period for October 2015 to Septembre 2016 - turned out the presence total infection rate for Entamoba complex 26.86%. Eighty samples of microscopically positive were examined moleculary and affirmed the presence 35% of Entamoba spp. When Nested PCR examination was used to determine the species (Species Specific) the infection rate 39.29% appeared to Entamoeba histolytica and 39.29% for Entamoeba. The results of this study refer that the Nested PCR technique was efficiency in distinguishing and identifying species of the parasite with high accuracy and reliability, high-speed compared to microscopic examination is able to distinguish the species of Entamoeba and The high sensitivity of molecular ways help to reach the true prevalence of this genus and We can use these molecular methods in epidemiological studies.

إن الغرض من الدراسة الحالية هو التشخيص الجيني لجنس المتحولة Entamoeba spp. باستعمال تقنية PCR والتعرف على بعض الانواع التي تصيب الانسان باستعمال Nested PCR بواسطة الجين 18S rRNAالمسؤول عن تمييز هذا الجنس وانواعه وتضمنت الدراسة الحالية فحص 300 عينة مجهريا ً للمدة من شهر تشرين الثاني 2015 لغاية شهر ايلول 2016 فتبين وجود نسبة إصابة كلية بلغت 26.86 % وعندما اجري الفحص الجزيئي ثبُت وجود نسبة اصابه 35 % Entamoba spp، وعندما اجري فحصNested PCR لتحديد الانواع ظهر وجود نسبة إصابة % 39.29 Entamoeba histolytica و % 39.29 Entamoeba dispar تُشير نتائج هذه الدراسة الى كفاءة تقنية Nested PCR بتمييز وتحديد انواع الطفيلي بدقة عالية ومصداقية وسرعة عالية بالمقارنة بالفحص المجهري غير القادر على تمييز انواع جنس المتحولة وتساعد الحساسية العالية للطرق الجزيئية للوصول بشكل صحيح للانتشار الحقيقي لأنواع هذا الجنس ويمكن من استعمال هذه الطرق الجزيئية في الدراسات الوبائية


Article
DIAGNOSIS OF LEPTOSPIROSIS IN HUMAN SERUM AND URINE SAMPLES USING PCR TECHNIQUE
تشخيص داء البريميات في عينات مصل وإدرار الإنسان بإستخدام تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز

Author: نبيل محمد حسن أبو المعالي
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2010 Volume: 9 Issue: 3 Pages: 630-641
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study was focused on the using of PCR technique for diagnosis Leptospirosis as the the diagnosis of Leptospirosis using traditional methods is difficult because Leptospira is considered as fastidious bacteria. Therefore, Polymerase Chain Reaction (PCR) technique was used to diagnose leptospirosis using serum and urine of human. Samples were collected from human suspected with Leptospirosis (50 urine and 50 serum. DNA was extracted using a special kit, DNA purity and integrity was conducted. PCR was performed using specific primers.The product was electrophorised on agarose gel and detected using ultraviolet transillumination with DNA marker in addition to standard DNA for leptospira. The result was revealed that through the examination of the 100 samples, 7 cases of human urine samples were positive while human serum samples were negative results. The results have also revealed some positive cases in PCR of those gave negative results in extraction of DNA. This study proved that the validity of PCR technique for diagnosis of Leptospirosis. This technique was sensitive, accurate and achieved in short time and the possibility of using urine and serum of human for the diagnosis of the infected cases.

سلطت هذه الدراسة الضوء على استعمال تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز لتشخيص داء البريميات التي يصعب تشخيصه بالطرائق التقليدية؛ لكون المسبب جرثومة ذات متطلبات عالية النمو لذا أستعملت تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز في تشخيص داء البريميات في عينات مصل وإدرار الإنسان. لهذا الغرض جمعت 50 عينة إدرار و 50 عينة مصل من أشخاص يشتبه إصابتهم بداء البريميات. أستخلص الحامض النووي لجميع العينات بإستعمال عدة خاصة لذلك ثم أجري فحص النقاوة وسلامة الحامض النووي.أجريت تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز على الحامض النووي المستخلص لذا استعملت بوادئ خاصة بتشخيص جرثومة البريميات ، وتم مقارنة النتائج مع حامض نووي قياسي لجرثومة البريميات بعد ترحيله بهلام الاكاروز. أظهرت النتائج ومن خلال فحص العينات والبالغة 100 عينة الكشف عن 7 حالة لوجود جراثيم البريميات والتي فحصت بواسطة تقنية PCR بواقع 7 حالات موجبة لعينات إدرار الإنسان بينما كانت جميع عينات المصول سالبة النتيجة كما وأظهرت النتائج ظهور حالات موجبة في تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز للعينات التي كانت سالبة في استخلاص الحامض النووي. أثبتت هذه الدراسة فعالية استعمال تقنية التفاعل السلسلي للبوليميريز في تشخيص الإصابة بجرثومة البريميات اذ انجزت في وقت قصير ، وأثبتت حساسيتها ودقتها وإمكانية استعمال عينات الإدرار والمصل للإنسان في تشخيص الحالات المصابة.

Listing 1 - 10 of 76 << page
of 8
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (76)


Language

Arabic (76)


Year
From To Submit

2020 (1)

2018 (7)

2017 (16)

2016 (13)

2015 (16)

More...