research centers


Search results: Found 11

Listing 1 - 10 of 11 << page
of 2
>>
Sort by

Article
Application of the Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers to Analyze the Genetic Variability in Species of the Fungus Alternaria
استخدام مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا (RAPD) لتحليل التباين الوراثي لانواع من الفطر Alternaria

Authors: Hadeel A. Omear هديل عبد الهادي عمير --- Akeel H. Al-Assie عقيل حسين العاصي --- Sahi J. Dhahi ساهي جواد ضاحي
Journal: Rafidain journal of science مجلة علوم الرافدين ISSN: 16089391 Year: 2011 Volume: 22 Issue: 1E Pages: 1-16
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The PCR-based technique of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to fingerprint and assess the genetic relatedness among nine species of the fungus Alternaria isolated from various crop plants showing the leaf spot disease in Mosul, Iraq. Genomic DNA of each species was extracted at a final concentration of 300 - 400 µg / 2-3 g of wet mycelium , and at a purity of 1.6-1.8. Each DNA sample was amplified with each of 22 primers and the products were resolved electrophoretically on 1.2% agarose gel, stained with ethidium bromide and photographed under UV. One Primer failed to support amplification but the remaining 21 (95.5%) primers produced a total of 112 bands (2-10 per primer) across the nine species. Of these bands, 100 (1-10 per primer ) were polymorphic. The least efficient primer was OP-H01 (1.79%), while the most efficient one weas OP-M05 (8.93 %). Primers OP-C05, OP-E20 and OP-T20 had the lowest (0.1%) discriminatory power while primer OP-M05 had the highest (10 %) power and identified all 9 species through unique patterns of banding. RAPD analysis fingerprinted eight of the nine isolates through marker bands with one or more of the 21 primers. Cluster analysis based on the genetic distances split the nine species into three distinct clusters with no obvious association between the pattern of clustering of the species and their host specificities.

لقد جرى استخدام تقنية RAPD المعتمدة على تفاعل PCR لايجاد البصمة الوراثية والعلاقة الوراثية بين تسعة انواع من الفطر Alternaria المعزولة من نباتات محاصيل مختلفة مصابة بمرض تبقع الاوراق في مدينة الموصل / العراق. وجرى استخلاص الدنا من كل نوع وبتركيز نهائي قدره 400-300 مايكروغرام لكل 3-2غرامات من الغزل الفطري الرطب وبنقاوة 1.8-1.6. وجرت مضاعفة كل عينة من عينات الدنا بواسطة 22 بادئا وفرزت النتائج بالترحيل كهربائيا خلال هلام الاكاروز ذي التركيز 1.2% والمصبغ بالمادة المتألقة بروميد الايثيديوم والتصوير تحت اشعة الــUV. وفيما اخفق احد البوادئ في دعم عملية التضاعف لاي دنا مجيني فقد افلح 21 بادئا اخر في ذلك وانتجت ما مجموعه 112 حزمة دنا ( بمعدل 10-2لكل بادئ) عبر الانواع الفطرية التسعة وكان 100 حزمة من هذه الحزم متباينا ( بمعدل 10-1 لكل بادئ ) وكان اقل البوادئ كفاءة في اسناد التضاعف هو البادئ OP-H01 (بكفاءة 1.79%)، و أكثرها كفاءة (10%) وهو البادئ OP-M05، إذ استطاع ان يميز جميع الانواع التسعة وذلك من خلال الانماط الفريدة من التحزيم في كل نوع. لقد استطاعت تقنية RAPD كذلك تحديد البصمة الوراثية لثمانية انواع من الانواع التسعة المدروسة وذلك من خلال ظهور حزم مؤشرة فريدة حين مضاعفة الدنا من كل نوع من هذه الانواع مع واحد او اكثر من البوادئ الواحد والعشرين أعلاه. كما أن التحليل العنقودي للمسافات الوراثية بين هذه الانواع التسعة قد وضع الانواع في ثلاث مجموعات رئيسة دون ملاحظة وجود علاقة بين توزيع الانواع على هذه العناقيد الثلاثة وتوزيعها على المضائف التي جمعت منها.


Article
Detection of Bovine Viral Diarrhea Virus by Conventional RT-PCR: A comparative Study
الكشف عن فيروس الاسهال البقري الفيروسي بواسطة (RT-PCR) التقليدي: دراسة مقارنة

Author: K. S. A. Al-Ajeeli كريم سعدون علي العجيلي
Journal: Al-Anbar Journal of Veterinary Sciences مجلة الانبار للعلوم البيطرية ISSN: 19996527/27070603 Year: 2011 Volume: 4 Issue: 2 Pages: 121-128
Publisher: University of Fallujah جامعة الفلوجة

Loading...
Loading...
Abstract

Fifty serum and buffy coat samples were collected from bovine from illegal abattoirs around Baghdad. RNA extraction was performed on buffy coat samples. These samples were subjected to conventional RT-PCR for the detection of BVDV. The result showed that the BVDV was detected by RT-PCR in three samples only. A comparison study was also conducted on the sensitivity of RNA extracted and non-extracted buffy coat and serum samples in conventional RT-PCR. The result showed that RNA extraction is the method of choice when conventional RT-PCR was performed on blood samples from BVDV infected animals. In a final conclusion, BVDV was detected by RT-PCR in local bovine. The findings suggested and proposed epidemiological studies on BVDV in Iraq in conjunction with isolation of the virus and identification of its genotype and biotype

جمع خمسون نموذجا من مصل وخلايا دم ابقار ذبحت في مجازر غير قانونية في المناطق المحيطة ببغداد. استخلص الحمض النووي الريبي من نماذج خلايا الدم ثم عرضت النماذج المستخلصة إلى اختبار(RT-PCR) التقليدي لغرض الكشف عن فيروس الإسهال البقري فيها. واظهرت النتائج وجود الفيروس في ثلاث نماذج فقط. ولغرض المقارنة في تقنية (PCR) لنماذج استخلص الحمض النووي منها وأخرى لم يستخلص الحمض النووي منها تم اختيار 10 نماذج من خلايا الدم تشتمل على الموجبة لوجود الفيروس و10 نماذج مصل لنفس نماذج خلايا الدم العشرة السابقة. استخدمت النماذج في نفس الاختبار ولكن بدون استخلاص الحمض النووي .ظهرت النتائج اكثر وضوحا في حالة استخلاص الحمض النووي مقارنة بنفس النماذج التي لم يستخلص الحمض النووي منها. يستنتج من هذه الدراسة ان فيروس الإسهال البقري موجود في الأبقار في العراق وان استخلاص الحمض النووي من نماذج المصل وخلايا الدم أفضل من عدم الاستخلاص في حالة استخدام (RT-PCR) التقليدي للكشف عن الفيروس. ان النتائج تظهر وجوب اجراء دراسات وبائية عن مدى انتشار مرض الاسهال الفيروسي في الابقار تقترن بعزل الفيروس ومعرفة نوعه البايولوجي والجيني

Keywords

BVDV --- RT-PCR --- bovine viral diarrhea


Article
comparison of the combination of recomline and ELISA with real- time polymerase chain reaction on the final diagnosis of toxoplasmosis

Authors: Maysoon M.jabir ميسون محمد جابر --- Jassim T. ALkhafaji جاسم الخفاجي --- Sami Y. Guirges سامي يوسف --- Suha A. ALfakhar سهى احمد
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: PISSN: 00419419 / EISSN: 24108057 Year: 2011 Volume: 53 Issue: 1 Pages: 72-76
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract


Article
Molecular Investigation of Genetic Polymorphisms in Type 2 Diabetic Patients Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD-PCR)
التحري الجزيئي عن التغايرات الوراثيه في مرضى السكري نوع 2 بأستخدام تضاعف الدنا متعدد الاشكال العشوائي لانزيم بلمرة الحامض النووي

Loading...
Loading...
Abstract

To find DNA markers associated with Type 2 diabetes mellitus (T2D) using RAPD-PCR (Random amplified polymorphic DNA-Polymerase Chain Reaction). Peripheral blood samples were collected from 12 unrelated Iraqis with type 2 diabetes mellitus and 10 apparently healthy individuals (control subjects). DNA was extracted and amplified using RAPD-PCR. Out of the 16 primers used, 3 did not produce amplification patterns. Seven primers produced monomorphic bands while 6 primers namely A10, A18, C5, D20, R3 and R4 produced polymorphic DNA profiles. The highest discriminatory power was produced by primers A18 and D20 reaching 25%. Primer D20 produced the highest number of bands (16) and largest molecular weight band 2.470Kb whilst primer A10 produced the lowest number of bands (3) and primer R4 the smallest molecular weight band of 0.296Kb. Furthermore a band of 1.056 Kb was produced by primer R4 with frequency of 100% in diabetic patients and total absence in control subjects. The total length of the genome screened was approximately 118.661Kb, 40% of which represent polymorphisms. In conclusion Polymorphisms between diabetic patients and control subjects can be detected by RAPD-PCR and DNA markers associated with type 2 diabetes mellitus can be found using the same technique.

تهدف هذه الدراسه الى ايجاد مؤشرات وراثيه من الحامض النووي ذات علاقه بداء السكري من النوع الثاني بأستخدام تضاعف الحامض النووي متعدد الاشكال العشو ائي لانزيم بلمرة الحامض النووي. جمعت نماذج من الدم المحيطي لاثني عشر مريضا بداء السكري النوع الثاني لاتربط بينهم علاقه قربى و عشرة اشخاص اصحاء بالنسبه للمرض كنماذج سيطره بعد استخلاص الحامض النووي وتكثيره بتفاعل البلمره. من بين الـ 16 بادئا التي أستخدمت في هذه الدراسه, ثلاثه بادئات لم تعطي اي نتيجه تضاعف, فيمااعطت سبعة بادئات نمط تضاعفي غيرمتغايرفي حين اعطت ستة بادئات نمط تضاعفي متعدد الاشكال وهي 10A, 18A, 5C, 20D, 3R و 4R. سجلت اعلى قوه تمييزية بين البادئات للبادئ 18A و 20D حيث وصلت الى 25% و اعطى البادئ 20D اكبر عدد من الحزم (16حزمه) كذلك اعطى اكبر حجم بين الحزم المتضاعفه 2.470 كيلو قاعده بينما اعطى البادئ 10A اقل عدد من الحزم و سجلت للبادئ 4R اصغر حزمه متضاعفه بحجم 0.296 كيلو قاعده. اضافة الى ذلك انتجت حزمه من للبادئ 4R بتكرار 100% في مرضى السكري و غابت تماما في نماذج السيطره .تم التحري عن ما يقرب 118.661 كيلو قاعده من الحامض النووي الكلي للانسان مثلت 40% منها تغايرات وراثيه.نستنتج بانه يمكن التحري عن التغايرات الوراثيه في مرضى السكري نوع 2 باستخدام طريقه تضاعف الحامض النووي متعدد الاشكال العشوائي لانزيم بلمرة الحامض النووي كما وانه بالامكان ايجاد مؤشرات وراثية من الحامض النووي لمرضى السكري نوع 2 بأستخدام نفس التقنيه.


Article
Molecular Identification of Giardia duodenalis Parasite Isolates from Human by Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism Technique (PCR-RFLP) in Baghdad Province

Authors: Tural Yelderim Bakir --- Abdullah Mustafa Qader
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2011 Volume: 7 Issue: 4 Pages: 54-66
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

The present study was designed to determine the genotypes of Giardia duodenalis isolatesfrom human by using polymerase chain reaction – restriction fragment length polymorphismtechnique (PCR-RFLP) technique, by amplification of glutamate dehydrogenase (gdh) gene toprovide information about the genetic diversity and their epidemiological and clinicalcharacteristics in Baghdad province. Thirty isolates from children (1-12 years old) wereprocessed for (PCR-RFLP). Data corresponding to demographic, social and environmentalvariables and presence or absence of symptoms were collected. The glutamate dehydrogenase(gdh) gene was amplified by using specific primers (GDHiF and GDHiR), the PCRamplification was observed in 17/30 (56.6%) of the fecal samples, among these 5/17 (29.4%)samples belonged to genotype A and 12/17 (70.5%) samples belonged to genotype B. Geneticsubgenotypes identified from human fecal samples revealed that, 5/17 (29.4%) weresubgenotype AΙΙ, 9/17 (52.9%) subgenotype BΙΙΙ, and 3/17 (17.6%) subgenotype BΙV.Genotype B was detected in children with severe symptomatic giardiasis and many of themhad diarrhea while, subgenotype AΙΙ was detected in children with mild symptomaticgiardiasis and without diarrhoea.

خصصت الدراسة لتحديد البنية الوراثية لل Giardia duodenalis المعزولة عن البشر بأستخدام ردة فعل سلسلة البوليمرات المحددة بتقنية تعدد طول البوليمرات (PCR-RELP) عن طريق توسيع الجين الموروث لخميرة الجلوتيمات (gdh) لتجهيز معلومات حول التنوع الوراثي وخصائصهم الوبائية والسريرية في منطقة بغداد . وقد عزل 30 من الاطفال تتراوح اعمارهم بين 1 - 12 سنة PCR-RELP). جمعت حقائق مطابقة للديمغرافية وللتنوعات الاجتماعية والبيئية وحضور وغياب الاشارات .اطنبت الجينات الوراثيةلخميرة الجلوتيمات (gdh)بأستخدام بطانات معينة (GDHIFAND GDHIR). لوحظ زيادة ال (PCR) في 1730 (56,6%) في A وعينات 1217 (70,5%) العائدة للطراز الجيني B .عرف الطراز الجيني الثانوي في عينات برازية بشرية اظهرت بأن 175 (29,4%)كانت طراز جيني ثانوي ,917 (52,9%) طراز جيني ثانوي .BII 317 (17,6%) طراز جيني BIV استكشف الطراز الجيني B عند الاطفال مع SYMPTOMATIC JIARDIASIS عنيفة وعدة منهم كان لديهم اسهال بينما اكتشف الطراز الجيني AII عند الاطفال مع SYMPTOMATIC JIARDIASIS معتدل وبدون اسهال


Article
Evaluation of Random Amplified Polymorphic DNA as a Genetic Indicator of Salt Tolerance in Iraqi Wheat
تقييم التضاعف العشوائي متعدد الإشكال لسلسله الدنا للاستدلال على أصناف الحنطة المتحملة للملوحة في العراق

Author: Rawaa Ali Zahid رواء علي زاهد
Journal: Tikrit Journal of Pure Science مجلة تكريت للعلوم الصرفة ISSN: 18131662 Year: 2011 Volume: 16 Issue: 4 Pages: 12-18
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was utilized in order to generate information on polymorphism, genetic relatedness and diversity in two local salt tolerant wheat varieties Dijlah and Furat collected from different locations in Iraq( Latyfia, Twaitha and Hasoa) compared to three local non-salt tolerant varieties Tahdi, Tamose2 and Nakhoa for breeding purposes. Out of the 23 random decamer primers used, 15 primers produced monomorphic and polymorphic amplification patterns. Primers A11 and N16b showed the highest efficiency of 0.069, primer A11also showed the highest discriminatory power of 24.3%. Data obtained were used find the genetic distance and construct the dendogram. There was 26% polymorphism between the studied cultivars. In addition to that we were able to fingerprint seven cultivars.

استخدمت تقنيه التضاعف العشوائي متعدد الاشكال لسلسله الدنا للكشف عن التباينات الوراثيه و التقارب الوراثي و التنوع في صنفين متحملين للملوحه(دجله والفرات) والتي جمعت من مواقع مختلفه من جنوب وجنوب شرق بغداد (اللطيفيه,التويثه والحصوه) وقورنت بثلاثه اصناف محليه غير متحمله للملوحه (تحدي, تموز 2و نخوه ) و ذلك لاغراض التربيه. تم استخدام 23 بادئا عشوائيا مختلفا, 15منها انتجت انماط تكثير متجانسه و متغايره . البادئات 11А,b16N اظهرت اعلى كفاءة تكثير كما وان البادئ 11А أظهر اعلى قوه تمييزيه بلغت 24.3% . المعلومات التي تم الحصول عليها استخدمت لايجاد التباعد الوراثي وتركيب مخطط التحليل التجميعي حيث وجد ان هناك 26% تغاير وراثي بين الاصناف المدروسه كما وتم تحديد البصمه الوراثيه لسبعه اصناف من قبل عده بادئات.


Article
IDENTIFICATION OF LEAF RUST RESISTANCE GENE (LR10) IN SOME IRAQI WHEAT CULTIVARS USING DNA MARKER
تشخيص جين المقاومة Lr10 لصدأ الأوراق في بعض أصناف الحنطة العراقية بواسطة واسمات ألدنا المتخصص

Author: علي عماد محمد منير
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2011 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 33-41
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACT Leaf rust disease caused by the fungus Puccina recondita Rob.ex Desm. f.sp. Tritici infects both soft and hard wheat Triticum aestivum L., T. durum L., and causing significant economic losses. Genetic resistance is most successful method to reduce its impact. Molecular marker STS (Sequence Tagged Sites) were used for detection of resistance gene Lr10 in 13 local wheat cultivars by PCR technique, The results showed that the absence of Lr10 gene in cultivars: Al-Eiz and Entisar, and the presence of this gene in Al- Iraq, Abu Ghraib, Al-naaema, Faris, Eratom, Al- Mansour Belah, Tamuz 3, Tamuz 2, Cham 6, Ipa 99, Rabia.

مرض صدأ الأوراق المتسبب عن الفطر Puccina recondita Rob. ex Desm. f.sp. tritici يصيب محصول الحنطة بنوعيه الناعم والخشن Triticum aestivum L. ،T. durum L ويسبب خسائر إقتصادية كبيرة، وتعد المقاومة الوراثية انجح الطرق للحد من تأثيره. لذا أُستعمل الواسم الجزيئي STS (Sequence Tagged Sites)الخاص بتشخيص جين المقاومة Lr10 للكشف عن وجود هذا الجين في 13 صنف من أصناف الحنطة المحلية بواسطة تقنية مضاعفة الحامض النووي PCR، وكانت النتيجة عدم وجود الجين Lr10 في صنفي العز وإنتصار و وجودهُ في الأصناف العراق، أبو غريب، الناعمة، فارس، إيراتوم، المنصور بالله، تموز 3، تموز 2، شام 6، إباء99، ربيعة.


Article
Detection of Campylobacter spp. in children diarrhea by using Polymerase Chain Reaction PCR technique in Al-Diwanyiah Governorate.
كشف جرثومة المنحنيات Campylobacter في إسهال الأطفال باستخدام تقنية سلسلة التفاعل المتبلمرة PCR في محافظة الديوانية

Authors: A. H. AL-Hamadani عدنان حمد عبيد الحمداني --- Z.F.Saleh زينة فؤاد صالح
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2011 Volume: 10 Issue: 2 Pages: 45-54
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted in order to identify of Campylobacter spp. As a causative agent of diarrhea in children using routine laboratory diagnosis (direct and culture methods) in comparison with polymerase chain reaction (PCR) technique as a confirm diagnostic tool.A total of 100 children stool samples were collected from both sexes at ages less than two years olds suffering from diarrhea who admitted the maternity and Pediatric Teaching hospital in Al-Diwaniyiah Governorate from December 2007 to August 2008.Based on the clinical and laboratory diagnosis, results revealed that the percent of Campylobacter isolation was 8% included C. coli and C. jejuni for children samples. In addition, the results haven't revealed any statistically significant (P≥0.01) between the rate of infection and sexes, while there was a statistically significant (P≤0.01) between these rates and ages, where it noted that patients (>1) years old were more prone to infect with Campylobacter spp. exposure to infections.The results revealed that the PCR positive samples contained one band of amplified DNA with molecular weight (816 bp) after electrophoresis and examined under UV- transilluminator. The study also showed that the sensitivity and specificity of PCR technique were 40% and 100% respectively for examination children samples, when compared with direct examination, but were with culture method were 33% and 100%; respectively in children.

أجريت الدراسة لغرض تشخيص بكتريا Campylobacter spp. المسببة لحالات الإسهال في الأطفال باستخدام الطرق الروتينية (الفحص المباشر وطريقة الزرع والاختبارات الكيموحيوية) ومقارنتها مع تقنية تفاعل السلسلة المتبلمرة PCR كوسيلة تشخيصية.جمعت 100عينة براز أطفال من كلا الجنسين بعمر اقل من سنتين كانوا يعانون من الإسهال خلال مراجعتهم لمستشفى الأطفال التعليمي في الديوانية للفترة من كانون الأول 2007 إلى أب 2008. بالاعتماد على الفحوصات السريرية والمختبرية حيث أظهرت النتائج 8% و التي شملت C. coli و C. jejuni لعينات الاطفال النتائج لم تظهر أي فروق معنوية (0.01≤ P) في معدلات الإصابة في الأطفال حسب الجنس, بينما وجدت فروق معنوية 0.01) ≥P) بين معدلات الإصابة والفئات العمرية آذ لوحظ أن الفئات العمرية اقل من سنة هي الأكثر تعرضا للإصابة وبنسبة (100%). أظهرت العينات الموجبة لاختبار ال PCR وجود حزمة واحدة للدنا المضخم مقدارها 816 زوج قاعدي عند ترحيلها كهربائيا وفحصها تحت الأشعة فوق البنفسجية.وكذلك الدراسة أظهرت أن نسبة الحساسية (sensitivity) والنوعية specificity)) لاختبار تفاعل السلسلة المتبلمرة (PCR) كانت 40% و 100% على التوالي, عند مقارنتها مع التشخيص المباشر للأطفال .لكن كانت نسبة الحساسية و النوعية لاختبار تفاعل السلسة المتبلمرة (33%,100%) للأطفال على التوالي, المستخدمة مع الزرع ألمختبري


Article
CONVERSION OF MUCOID PHENOTYPE OF P.AERUGINOSA INTO NON MUCOID AND VISE VERSA AND ITS DETECTION MOLECULARLY
تحول النمط المظهري المخاطي لجرثومةPseudomonas aeruginosaالى غیر المخاطي وبالعكس والكشف عنه جزیئیاً

Author: غادة عبد الر ا زق محمد الطائي أمیرة محمود محمد الراوي
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2011 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 19-32
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACTStudy was performed by transformation of mucoid phenotype to non-mucoidphenotype anaerobically and vice versa was done by using 3 mmol. H2O2. Phenolicmethod was used for DNA extraction which was about 5.2-6.3 μg/μl and with highdegree of purity (1.7-2.0). After that, initial detection of DNA extract was donethrough agarose electrophoresis and showed clear DNA bands before and after theconversion from mucoid to nonmucoid phenotype and vice versa. PCR productsfor algT, mucA and mucB genes showed whether the mutation has occurred or notindicating on gene binding to its specific primer

الخلاصةالى النمط P.aeruginosa أجریت د ا رسة جزیئیة تم من خلالها تحویل النمط المظهري المخاطي لجرثومةالمظهري غیر المخاطي بإستعمال الظروف اللاهوائیة واستخدمت 4 عزلات لهذه التجربة، كما تم إستعمال 6عزلات لاحداث التحول العكسي بإستعمال 3 ملي مولر من بیروكسید الهیدروجین. وقد تم إستخلاص الحامض6.3 مایكروغ ا رم/مایكرولیتر وبنقاوة عالیة ت ا روحت - بإستعمال الطریقة الفینولیة وتراوح تركیزه 5.2 DNA النوويأولیاً بإج ا رء الترحیل الكهربائي على هلام الاكاروز وأبدت نتائج DNA 2.0 ، كشف عن وجود - بین 1.7المستخلص من الجرثومة قبل وبعد التحویل من النمط المظهري المخاطي DNA الترحیل ظهور حزم واضحة للalgT للجینات PCR الى النمط غیر المخاطي وبالعكس وأظهرت نواتج تضخیم تفاعل البلمرة المتسلسلعلى الحصول على طافرات بدلالة عدم تكون الحزم المضیئة نتیجة لفشل إرتباط البادئ mucB و mucA والمتخصص بمنطقة ذلك الجین في حین أظهرت بعض النتائج عدم الحصول على طافرات من خلال ظهور الحزمالمضیئة مشیرة الى إرتباط الجین ببادئه المتخصص


Article
DETERMINATION OF EPSTEIN-BARR VIRUS (EBV) DNA LOAD AS A BIOMARKER TO FOLLOW UP EBV RELATED HODGKIN’S AND NON HODGKIN’S LYMPHOMA PATIENTS USING QUANTITATIVE COMPETITIVE POLYMERASE CHAIN REACTION TECHNIQUE

Loading...
Loading...
Abstract

Background: The Epstein -Barr virus (EBV) is the first human virus implicated in the carcinogenesis. EBV contributes to the carcinogenesis like Hodgkin's Lymphoma (HL) and Non Hodgkin’s Lymphoma (NHL).Objective: Quantitative Competitive Polymerase Chain Reaction (QC-PCR) and ELISA was used to quantitate the EBV DNA load in blood samples of HL and NHL patients pre and post therapy.Methods: EBV DNA extracted from blood samples of 18 HL and NHL patients pre and post therapy, 9 apparently healthy controls used to quantify the EBV DNA load. Quantitative Competitive Polymerase Chain Reaction (QC-PCR) and ELISA were used to quantify EBV DNA load. Wild EBV DNA (WT) obtained by Transformation of Escherichia coli MM 294 with Wild type (WT) DNA plasmid pGEMBamHI-K.Results: EBV DNA load in controls was found to be 7-1.99 × 103 in HL and NHL patients, while in patients it's ranged from zero to 1.936×109 copy numbers per ml of blood. High EBV load with the range of 10715(1.071×104) to 1936421960 (1.936×109) above cut-off value was detected in 66.7% of HL and 5861(5.86×103)-50118(5.01×104) copies/ml blood in 44.5 % of NHL patients pretherapy. After chemotherapy, 60% of HL patients and 100% of HL patients with high EBV load showed significant response. Low viral load was found in 44.45% of patients. Only 55% of lymphoma patients with high EBV load, after chemotherapy 16.6% of them continue to have high EBV DNA load compared to the control group, 38.3% of the patients showed response to chemotherapy when their viral load decreased below cut off value. While 11.1 % continue to have high DNA load. One patient (5.5%) showed an elevated EBV load after completion of chemotherapy.Conclusions: EBV DNA load estimated by Quantitative Competitive Polymerase Chain Reaction considered as valuable promising tumor biomarker in the diagnosis and monitoring of EBV related HL and NHL patients.Key words: Quantitative Competitive Polymerase Chain Reaction (QC-PCR), Epstein-Barr virus (EBV), Viral DNA load, Hodgkin’s (HL) and non Hodgkin’s Lymphoma (NHL) Patients.

Listing 1 - 10 of 11 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (11)


Language

English (8)

Arabic (2)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2011 (11)