research centers


Search results: Found 53

Listing 1 - 10 of 53 << page
of 6
>>
Sort by

Article
Sensitivity Study of Different Varieties of Tomato by Using PCR Technique
د ا رسة حساسية أصناف مختمفة من الطماطة باستعمال تقنية ال PC

Loading...
Loading...
Abstract

Polymerase chain reaction has been used to diagnose the tomato yellow leaf curl virus for the firsttime in different varieties of tomato in some tomato-growing areas in Iraq including Basrah, Maysan, Karbala,Baghdad Provinces to confirm the presence of the virus. It has been shown that there are dissimilaritiesamong varieties of tomato for infection by TYLCV. Besides,infected varieties Result also shown that this virus has recorded in some varieties of tomato for the first timein maysan Province.

استخدمت تقنية PCR لأول مرة في الكشف عن الفايروس TYLCV في أصناف مختمفة من الطماطة في بعض مناطق ز ا رعةالطماطة في الع ا رق، شممت محافظة البصرة وميسان وكربلاء وبغداد لمتأكد من وجود الفايروس اظير خلاليا الاختبار تفاوت الأصناف المختمفةفي إصابتيا بالفايروس TYLCV إذ لوحظ ظيور الحزم المتوقعة (~ 400) زوج قاعدي في الأصناف المصابة بالفايروس باستخدام بادئاتخاصة و سجل الفايروس لأول مرة في محافظة ميسان عمى أصناف من الطماطة.

Keywords

PCR ، TYLCV


Article
Clinical Profile and Outcome of Pandemic Influenza A (H1N1) Virus in Child‘s Central Teaching Hospital
لمحة سريرية و حصيلة وباء فايروس الانفلونزا A (H1N1) في مستشفى الطفل المركزي التعليمي

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract:Background: Influenza virus infection (H1N1), although an old disease, gets a great concern in 2009 because of pandemic infection. Objectives: The aim of this study is to describe epidemiological, demographic, clinical and laboratory characteristics and outcome of children infected with 2009 H1N1 influenza virus and attended the Child‘s Central Teaching Hospital in Baghdad. Methods: The study was conducted on 90 patients with influenza-like illness aged 1mon to 16yr during time period from 1st of October till 31st of December 2009. Epidemiological, clinical and laboratory data were reported. For each patient 2 nasal and 2 throat swabs and a single blood sample were collected and sent to Central Health Laboratory for RT-PCR (Real Time Polymerase Chain Reaction).Results: The mean age of these children was 7.5±3.5 yr. The diagnosis of 2009 H1N1 Influenza were confirmed in 60 patients, of which 65% were >6yr old, 35% were <6yr old and no case reported below 1month. Male: female ratio in PCR positive group was 1.2:1, and was 1.3:1 in PCR negative group. Most of children were from urban area in both groups. Contact history was positive only in 3 cases in PCR positive group and 2 cases in PCR negative group. High grade fever was the most common symptom, followed by cough and rhinorrhea. Of the 42/60 patients of PCR positive group who underwent chest radiography during evaluation, 22 (56.3%) patients had findings consistent with lower respiratory tract infection. Antiviral therapy was initiated in 57/60 (95%) patients. Hospitalization was required in 42 (70%) of PCR positive patients. Mean length of hospitalization was 5.5±2.5 days. All PCR negative patients improved while in PCR positive patients only 2 (3.3%) children developed acute respiratory failure and died.Conclusions: Adolescents affected more by H1N1 Influenza followed by school age group. Both sexes equally affected. The H1N1/09 influenza was most common in urban area. Clinical features and routine laboratory investigations in children with swine origin influenza were passed as a simple influenza virus infection like symptoms. Severe co-morbid conditions, respiratory distress, vomiting, wheezing, diarrhea, and infiltrates/consolidation on chest radiograph were most criteria for admission.Key Words: H1N1 infection, PCR positive, PCR negative

مقدمة: رغم ان مرض فايروس الانفلونزا (H1N1) هو مرض قديم، الا انه قد حظي باهتمام كبير في العام 2009 بسبب الوباء الذي نتج عن هذا المرض.الهدف من الدراسة: ان الغرض من هذه الدراسة هو رسم الصفات الوبائية والديموغرافية والسريرية والمعملية والحصيلة الناتجة للاطفال الذين اصيبوا بفايروس الانفلونزا (H1N1) 2009 ممن راجعوا مستشفى الطفل المركزي التعليمي في بغداد.طرق البحث: تم إجراء الدراسة على 90مريضاً كانوا يعانون من اعراض مشابهه للانفلونزا، تتراوح اعمارهم ما بين شهر واحد الى 16سنة و ذلك للفترة الممتدة ما بين الاول من شهر تشرين الاول ولغاية الحادي والثلاثين من شهر كانون الثاني من عام 2009. تم توثيق المعلومات الوبائية و السريرية والمعملية لكل مريض كما اخذت مسحتين من الانف و مسحتين من البلعوم اضافة الى جمع عينة من الدم من كل مريض وتم ارسال العينات الى مختبر الصحة المركزي لغرض اجراء فحص RT-PCR ( تفاعل البلمرة التتابعي ذو الوقت الحقيقي Real Time Polymerase Chain Reaction)النتائج: كان معدل اعمار الاطفال موضوع البحث هو (7,5 ± 3,5 سنة) و قد تم تأكيد الاصابة بمرض الانفلونزا (H1N1) 2009 لدى 60 طفلاً منهم ، حيث كان 65٪ من المصابين هم اكبر من ست سنوات و35٪ منهم دون الست سنوات بينما لم تسجل أي حالة اصابة للاطفال دون عمر شهر واحد. وكانت نسبة اصابة الذكور للاناث هي 1,2: 1 في مجموعة PCR الموجب بينما كانت 1,3: 1 في مجموعة PCR السالب. معظم الاطفال موضوع البحث هم من سكنه المناطق الحضرية بالنسبة لكلتا المجموعتين. تم تسجيل 3حالات تماس مع اشخاص مصابين في مجموعة PCR الموجب وتسجيل حالتين في مجموعة PCR السالب، لقد وجد ان ارتفاع درجة حرارة الجسم هو العارض الأكثر شيوعاً و يليه في ذلك السعال ثم جريان الانف. من بين 42من اصل60 مصابا من مجموعة PCR الموجب و الذين اخذت لهم الفحوصات الشعاعية، وجد ان 22 (56٪) من المصابين كانت لديهم علامات تتفق مع اصابتهم بالتهاب المجاري التنفسية السفلى، اعطي العلاج المضاد للفايروسات الى 57(90٪) من المصابين واحتاج 42 (70٪) من المصابين الى ان يدخلوا الى المستشفى وكان معدل رقود المريض في المستشفى 5,5±2,5 ايام. جميع الاطفال ضمن مجموعة PCR السالب اكتسبوا الشفاء التام واخرجوا من المستشفى بينما توفي طفلان (3,3٪) من مجموعة PCR الموجب حيث اصيبوا بفشل التنفس الحاد ثم توفوا.الاستنتاجات: لقد جاءت الاعراض السريرية و النتائج المختبرية الروتينية للاطفال المصابين بالانفلونزا التي عرفت اصلا بانفلونزا الخنازير بصورة مشابهة للاطفال المصابين بالانفلونزا الاعتيادية البسيطة، المراهقون هم المجموعة الاكثر اصابة بانفلونزا (H1N1) يليهم في ذلك الاطفال في عمر المدرسة بينما تساوى كلا الجنسين في الاصابة. اكثر الاصابات بانفلونزا (H1N1) 2009 كانت في المناطق الحضرية. ان حالات المراضة المصاحبة و عسر التنفس و التقيؤ و الصفير و الاسهال و ظهور الترسبات/التماسكات على اشعة الصدر كانت من اكثر معايير الدخول الى المستشفى.


Article
PRODUCTION OF POLYGALACTURONASE FROM THERMOSTABLE MOLD ASPERGILLUS NIGER 1- ISOLATION AND SCREENING THE ENZYME PRODUCER THERMOSTABLE MOLDS AND IDENTIFYING THE PRODUCER ONE
إنتاج أنزيم POLGALACTYRONASE من العفن ASPERGILLUS NIGER المتحمل للحرارة1-عزل وغربلة الأعفان المتحملة للحرارة والمنتجة للأنزيم وتشخيص العزلة الأكثر إنتاجاً

Authors: Mohammed O. Muhyalddin محمد عمر محي الدين --- Rukaibaa A. Chechan رقيباء علي جيجان
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2013 Volume: 44 Issue: 1 Pages: 97-105
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 147 isolates of pectin hydrolysis enzymes producer molds were isolated from various sources(soil and decayed vegetables and fruit) using Czapek Dox Agar using 3% pectin as the sole carbon source by adding of 1M Hcl at PH5 and submitted to primary and secondary screening at 40 CO to select the best isolate that produces the highest level of polygalacturonase. It was found that 7 isolates were good producer but the isolate which designated TP4 was the highest producer one. The source of this isolate was deteriorated orange and identified as Aspergillus niger according to morphological, biochemical and molecular analysis which was achieved using PCR (Polymerase Chain Reactions) technique. This isolate was nominated as Aspergillus niger TP4 for distinguishing it from any other isolates used for production the same enzyme. This part of study was aimed to investigate the optimal condition of production the enzyme Polygalacturonase from Aspergillus niger TP4 by solid state fermentation using different wastes available locally. It was found that the higher level of production could be achieved on wheat bran and sunflower head extract moistened with water at a ratio 3:1 with an initial pH 5 inoculated with 107 spores/gm during an incubation time of 4 days at 4 C0.the polygalacturonase activity was assay by measuring reducing groups The productivity under these conditions was 325.45 unit/gm using wheat bran and 242.28 unit/gm using sunflower head with an increase estimated about 124.7% and 120.8% respectively in relationship with productivity before of the optimization.

تم الحصول على 146 من الأعفان المنتجة للأنزيمات المحللة للبكتين من مصادر متنوعة (التربة والخضروات والفواكه التالفة) باستخدام وسط العزل والمتمثل بوسط جابك دوكس المحور Czapek Dox Agar كوسط لعزل الاعفان باستبدال مصدر الكاربون فيه ببكتين التفاح وبتركيز 3 %, عدل الرقم الهيدروجيني للوسط على5 بمحلول 1 مولار حامض وأخضعت لعمليتي الغربلة الأولية والثانوية بغية انتقاء أكثرها مقدرة على أنتاج الأنزيم في 40 م0. فتبين أن سبع عزلات منها تميزت بقابليتها على إنتاج الأنزيم بنسبة تفوق غيرها. وأن العزلة التي رمز لهاTP4 ومصدرها ثمرة البرتقال التالفة، هي أكثرها إنتاجاً. و أظهرت فحوص التشخيص المورفولوجية والجزيئية وباستخدام سلسلة تفاعلات البلمرة الأنزيميةPCR (Polymerase Chain Reactions) أنها تعود الى العفن Aspergillus niger ورمز لها TP4) ) تمييزاً لها عن غيرها من العزلات المستخدمة لإنتاج الأنزيم نفسه كما استهدفت هــذه التجربة تعيين الظروف المثلى لإنتاج أنزيم Polygalacturonase من العفن Aspergillus niger TP4 وبطريقة تخمرات الحالة الصلبة تحققت أعلى إنتاجية باستخدام نخالة الحنطة ورؤوس زهرة الشمس المرطبة بنسبة 1:3 والملقحة بـمعدل 107 بوغ /غم من الوسط وبرقم هيدروجيني ابتدائي 5 بعد مدة حضن بلغت أربعة أيام عند 40 مº. جرى تقدير فعالية انزيم Polygalacturonase بولى كالاكتيورونيك باتباع طريقة 5,3 – ثنائى نايتروسالسليك حيث بلغت إنتاجية الأنزيم 325.45 وحدة /غم من وسط نخالة الحنطة و242.28 وحدة/غم من وسط زهرة الشمس وبزيادة قدرت بحوالي 124.7 % و120.8% نسبة الى الإنتاجية لما قبل تحديد الظروف المثلى ولكلا الوسطين على التوالي.


Article
Screening of Human Cytomegalovirus (CMV) in Diabetic Patients in Najaf Governorate

Authors: Zainab Hemeed Al-Heidery --- Heider H. Abbas --- Saif Jabbar Yasir
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2013 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 236-244
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of current study was to study the relationship between the virus and diabetes mellitus through detection of human cytomegalovirus (HCMV) infection in diabetic patients in Najaf governorate by screening of anti-human cytomegalovirus IgM antibodies in the serum of diabetic patients by using of ELISA technique and detection of human cytomegalovirus DNA in blood samples by using of PCR technique. Blood samples collected from 140 diabetic patients randomly. ELISA technique was used to know the activity of humeral immunity among patients through detection of anti-HCMV IgM antibodies, where the result showed that IgM profile was positive in 49 patients(35 %). Regarding PCR technique, the study showed that among 140 diabetic patients gave positive results in 27 patients(19.2%); In contrast, the results of control group were negative for anti-HCMV IgM antibodies in both ELISA and PCR technique. This study concluded that the higher prevalence of seropositivity for human CMV in diabetic patients comparing with normal individuals which means that cytomegalovirus patients with diabetic were at high risk for CMV infections. A higher prevalence of CMV antibodies was observed in diabetic patients of all age-groups as compared with control group.

لقد كان هدف الدراسة معرفة العلاقة بين فايــــــروس (سي أم في) و مرضى السكري(مجموعة الدراسة) من خــلال التحــــري عن وجود الاصابة بالفايــــــــروس في مرضى السكري في محافظة النجــــــف بواســـــطة اجراء مســح لوجود الاجسام المضادة نوع( آي جي أم) في مصول مرضـــــــى السكري باستخدام تقنيــــــــــة (الاليزا), وكذلك من خــلال اجراء مسـح لوجود الحامض النــــووي(دي أن أي) لفايروس (سي أم في) في عينات دم نفس المــرضى باستخدام تقنية (بي سي آر) . تم خلال الدراسة جمع 140عينة دم بصورة عشوائية من مرضى السكري في مدينة الصدر الطبية في النجـــف. لقد استخدمت تقنية (الالـــــيزا) لمعرفة فعالية المناعة الخلطية بين المرضى من خلال كشـف وجود الاجسام المضـادة نوع (آي جي أم) والتي كانت نتيجته وجود 49 حالة موجبة (35 %) بينما اظهرت نتائج الدراســــة باســتخدام تقنيــة (بي سي آر) وجود 27 حالة موجبة (19.2 %) بينما أظهرت نتائـــج الدراســـــــة عدم وجود أي حالة موجبـــة في مجموعة السيطرة باستخدام كلا التقنيتين. لقد اظهرت الدراسة أن انتشـــــــار فايروس (سي أم في) في مجموعة الدراسة (مرضى السكري) كان أعلى بالمقارنة بمجموعة السيطرة مما يعني أن مرضى السكري أكثر خطورة للإصابة بفايروس (سي أم في) كما لوحظ أن وجود الاجســام المضادة لفايروس في دم مرضى السكري( مجموعة الدراسة) كان أكثر انتشارا في جميع الفئات العمرية مقارنة بمجموعة السيطرة

Keywords

HCMV --- Diabetic --- ELISA --- PCR.


Article
Identification And Diagnosis Of Cutaneous Leishmaninsis By Polymerase Chain Reaction Assay (Pcr) In Najaf Alashraf Province
تحدید وتشخیص اللشمانیا الجلدیة باستخدام تفاعل سلسلة انزیم البلمرة في محافظة النجف الأشرف

Authors: Haitham Mohammed Alawadi --- Ban Shakir Alshukur
Journal: kufa Journal for Nursing sciences مجلة الكوفة لعلوم التمريض ISSN: 22234055 Year: 2013 Volume: 3 Issue: 2 Pages: 1-6
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Objective: The present study aimed to determine the effectiveness of a polymerase chain reaction (PCR)technique for identification and differentiation of the cutaneous leishmaniasis parasite in clinical samplecollected from lesion exudates patients.Methodology: The (115) sample were examined by smear slid preparation culture on RPMI 1640 and NNNthen DNA isolation. The DNA of the promastigote were amplified by PCR including primers selected onrepetitive KDNA for identification of leishmania species.The data was analyzed by using frequency andpercentage.Results: The PCR result showed that two species of leishmania (L. major with 620 bp and L. tropica with 800bp) exist.Conclusion: It is concluded from the present study that the PCR technique has high specificity and sensitivityduring the differentiation between Cutaneous Leishmanial species in comparing with conventional methods.Recommendation: The PCR technique can be use it to diagnosis and differentiation between different type ofCutaneous Leishmaniasis.

في الكشف والتفریق بین أنواع طفیلیات PCR الھدف: تھدف الدراسة الحالیة إلى تحدید فعالیة استخدام تقنیة سلسلة تفاعل الإنزیم المتبلمراللشمانیا الجلدیة في العینات السریریة المأخوذة من المصابین بطفیلي اللشمانیا الجلدیة .المنھجیة: تم فحص العینات المأخوذة من ( 115 ) مریض مصابین بالآفة الجلدیة باستخدام المسحة الزجاجیة والزرع ألمختبري على الوسطوأستخدم الوسائل الاحصائیة من نسبة مئویة وتكرار . (RPMI والتكثیر على الوسط الزرعي( 1640 (NNN) ألزرعيفي الطور أمامي السوط من العینات المأخوذة من الأوساط الزرعیة بأستخدام بادئات خاصة للجین المشفر ال DNA النتائج: تم تضخیم اللطفیلي اللشمانیا . أظھرت الدراسة بأن ھناك نوعین لطفیلي اللشمانیا الجلدیة احدھما (Kinetoplast kDNA ) للبائنة الحركیة المسمى DNAووزنھا الجزیئي ( 800 ) زوجا قاعدیا في العینات المجمعة من (L. tropica) ووزنھا الجزیئي ( 620 ) زوجاً قاعدیا والأخرى (L. major)المصابین بھذا الطفیلي.ذا حساسیة وخصوصیة عالیة عند التفریق بین أنواع اللشمانیا الجلدیة عند PCR الاستنتاج: نستنتج من الدراسة الحالیة أن استخدام تقنیة المقارنتھا بالطرق التقلیدیة وقد بینت النتائج المستحصلة من ھذه التقنیة أن ھنالك نوعین من طفیلي اللشمانیا الجلدیة للمصابین تم التحري عنھا فيمحافظة النجف الاشرف .في التشخیص والتفریق بین انواع اللشمانیا الجلدیة .


Article
PCR in Comparison with Culture Methods for The Diagnosis of Candida albicans Responsible for Candidemia in Leukemic Patients
طريقة تفاعل البلمرة المتسلسل في تشخيص تعطن الدم بداء المبيضات البيضاء بالمقارنة مع طريقة الزرع لتشخيص فطر المبيضات البيضاء

Authors: Saba Sabeeh صبا صبيح --- Azhar A. F. Al-Attraqhchi ازهار عبد الفتاح الاطرقجي --- Elham Al-Aswad الهام الاسود
Journal: Diyala Journal of Medicine مجلة ديالى الطبية ISSN: 97642219 Year: 2013 Volume: 5 Issue: 2 Pages: 29-35
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Currently, candidemia infections represent an increasing cause of morbidity and mortality in seriously ill hospitalized patients. Because the accurate diagnosis of candidiasis remains difficult, fast and reliable assay for characterization of fungal pathogens is critical for the early initiation of adequate antifungal therapy and/or for introduction of preventive measures.Objective: To detect candidemia in leukemic patients by molecular methods in comparing with golden standard method(culture method).Materials and methods: A total of 60 leukemic patients were included in this study. Clinical type and other demographic data were recorded. Blood samples were taken from each patient, culture; germ tube formation and carbohydrate fermentation were done for each sample. DNA extraction and polymerase chain reaction (PCR) were used for detection of Candida albicansin cultured bottles. This study was conducted on leukemic patients admitted to four different hospitals in Baghdad city from September 2010 to March 2011. Sixty patients suffering from acute lymphoid (ALL) and myeloid (AML) leukemia were included in this study. The age of patients were ranging between 3-46 years old. Twenty five apparently healthy individuals were enrolled in this study as control group. Three milliliters of blood were collected from each patient; 1.5 ml was inoculated in 20 ml Brain heart infusion broth (Cruikshank. 1975). The rest of blood (1.5ml) was stored in -20ᴼC for further analysis. Blood cultures were incubated at 37°C for 10 days, and examined daily for growth. DNA purification kit was purchased from QIAGENE®Company. This method was used for the purification of genomic DNA from fresh or frozen samples of 1 ml overnight yeast cultures by using the GentraPuregene Yeast/Bact. Kit. PCR was performed to detect Candida albicans species through the amplification of specific gene (αINT1) Results: Only one positive culture result out of 60 samples was obtained for Candida sp., (1.7%). PCR results showed that there were only three out of sixty were positive for C. albicans (5%). In this study we obtained only one positive sample according to culture, while three samples only gave positive results according to PCR method. These results suggest that molecular analysis of candidemia is more sensitive and less time consuming than culture and other conventional methods.Conclusions: From this study, we concluded the following:1.The rate of candidemia was 1.7% among leukemic patients, according to culture results.2.Only 5% of blood cultures was positive according to PCR.3.PCR results showed 100% sensitivity and 96.6% specificity and it is rapid, easy, reliable and also applicable in clinical laboratory for identification of medically important

حالياً الإصاباتَ بداء المبيضات منتشرةوبنسب متزايدةبالاخص للمرضى الراقدين في المستشفيات. ولأن التشخيصَ الدقيقَ لداءفطرالمبيّضاتِ يَبْقىصعبَ ,لذلك يتطلب اجراء فحوصات سريعة وموثوقة لمعرفة الأسباب المرضية الفطريةِ لغرض العلاج المبكر او لغرض الوقاية.لقد تم شمل 60 مريضا بسرطان الدم في هذه الدراسةِ. اخذت عينات دم مِنْ كُلّ مريض، وتم زراعته بوسط Sabourauds agar الفطري،وتم اختبار تشكيل الإنبوبِ الفطري وإختمارِ الكربوهيدراتِ. تم أستخلاص الحامض النووي الرايبي منقوص الاوكسجين وتفاعل البلمرةالمتسلسل (PCR) لفطر المبيضيات البيضاء.أظهرت النتائج بأنّ هنالك عينةِ دمّ وحيدةِ إيجابيةَ للزرع الفطري. وبواسطة عينات اخذت من القناني المزروعة، كان هنالك 3 عيناتَ ايجابية لأستخلاص الحامض النووي الرايبي منقوص الاوكسجين وتفاعل البلمرةالمتسلسل (PCR) لفطرِالمبيّضات البيضاء. وكانت الطريقة الاخيرة(PCR) هي الاكثر حساسية لكشف داء المبيضيات في الدم .نقترح استخدام طريقة البلمرة في تشخيص مرض اللوكيميا او اي مرض داخلي تسسببه هذه الفطريات بدل طريقة الزرع الكلاسيكبة كونها غير دقيقة نتيجة حدوث التلوث بالجراثيم الاخرى عند زرع عينة الدم كما انها تستهلك موادا كثيرة لان كل عينة يجب ان يعاد زرعها يوميا ولمدة شهر كامل الى ان يتم الحصول على النتيجة النهائية.

Keywords

Candidemia --- PCR --- Candida albicans.


Article
Separation of Y-chromosome Bearing Ram’s Sperms using an Albumin Gradient Technique and Identification of Embryos by PCR
فصل الحيامن الذكرية بالاكباش بواسطة تقنية الالبومين وتجنيس الاجنة المخصبة خارجيا بواسطة بي سي ار PCR))

Authors: S. Hadi سجى هادي --- I. H. Al-Timimi احسان حمودي التميمي
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2013 Volume: 12 Issue: 1 Pages: 144-151
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Several advantages have been suggested for producing sexed sperms including using fewer and genetically superior female animals for replacement.Four hundred active ovaries collected from the slaughter house of Al-shu'alah, the number and type of oocytes, ratios of maturation and fertilization shown that there was a significant difference in the numbers of oocytes (P<0.05) between right and left ovaries. A high recovery rate was obtained of good oocyte (Grade A) 42.35% (432/1020), fair oocyte (Grade B) 37.54% (383/1020) followed by and poor oocyte (Grade C) 17.84% (182/1020). There was a significant difference (P<0.05) between the 3 different grades. grades A and B oocytes, (815/1020) 79.9% of recovered oocytes were cultured. Maturation rate was 86.38% (704/815).Y- Bearing sperms separation applied by using procedure of the modified albumin technique; either one (8%) or two layers (8 and 16%) of BSA (M1, and M2) at 200, 300 or 400 xg, then used for in vitro fertilization.The in vitro fertilization rate observed was 21.8% (132/604) of matured oocytes by choosing universal primers from sequences that are highly conserved in the X and Y chromosomes, sex-specific sequences were successfully amplified in embryonic lysates. Bovine serum albumin sexed sperms result in more percentage of male embryos by using one layer of BSA ( 8%) at 200 × g (M1a) and 300× g (M1b) which were 72.7% and 54.5% respectively, and shows a deviation (p<0.05) from the 50% expected percentage for male and female embryos. While using two layer of BSA (16% and 8% BSA) at the 200 × g (M2a) and at 300× g (M2b) were 81.8% and 63.6% respectively. When we compare the rate of male embryos produced from IVF by sperms isolated by two layers of BSA (M2a, and M2b), moderate results obtained with M2b (63.6%) while the best results were with M2a separation protocol (81.8%).

ان تجنيس او اختيار جنس الجنين له فوائد وتطبيقات مهمة في مهنة الطب البيطري. في البحث الحالي تم جمع 400 مبيض اغنام من مجزرة الشعلة لغرض جمع البيوض. وقد وجدت فروقات معنوية بين عدد الجريبات بين المبيضين الايمن والايسر.كانت نسبة جمع البيوض عالية من النماذج حيث كان عدد البيوض من النوع الجيد 42,35%,المتوسط37,54% والردئ17.84%. تم فصل (عزل) الحيامن الذكرية لثلاثة كباش بواسطة التقنية التي تستعمل مصل دم الابقار, اما باستعمال طبقة واحدة 8% او طبقتين8و16% من البومين مصل الابقار. تم الاستعمال هذه الحيامن في الاخصاب الخارجي للبويضات ثم تم تحديد جنس الجنين بواسطة تقنية ال PCR حيث كانت النتيجة الحصول على اجنة الذكرية بنسب72.7%و54.5% عند استعمال طبقة واحدة BSAوبقوة ×g200و×g 300على التوالي. في حين ان استعمال طريقة العزل بطبقتين من BSAوكانت نسب الاجنة الذكرية 81.8%و63.6%عن قوة طرد مركزي تعادل×g200و×g300على التوالي.


Article
Detection of Salmonella typhimurium in chicken meat imported in the local markets of Diwaniya city By using PCR technique
عزل وتشخيص جرثومة السالمونيلا تايفيميوريم من لحوم الدواجن المستوردة في اسواق مدينة الديوانيه بأستخدام تقنية الPCR

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study to detected contamination with Salmonella spp. In imported chicken meat in the local markets of Al- Diwaniyia city . to protect health of consumer and Determintion the most contaminated origin with salmonella spp. A toatl of 100 chicken meat samples collected from different origin. The bacteria cultured and isolated in enrichment and selective media . Salmonella isolates were subjected to some biochemical tests show positive productive results H2S .TSI . SIM And its give negative for indole , vo-gs Proskauer and ureas , Biochemical identification was carried out using API 20-E test ..the result showed isolation sample (3355)60% on bismuth sulphate agar and the results of isolation on chromogenic agar were 87.8 |%(2933) .according to reading Api20-E system the results of confirmation of isolates 92%(2526) In this study,( 23) Salmonella isolates were detected by polymerase chain reaction (PCR) by using 16s rRNA and invA gene these primers were selected specifically for the detection of Salmonella to amplify a 406bp and 558 bp DNA fragments, respectively. Only 7 isolates out of 23 were identified as S. typhimurium the results of this study showed the highest percent of s.typhimurim isolates was ( 50%) ( 3/6) for India origin and the lowest was Turkish origin

لهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن التلوث بجرثومة salmonella spp. في عينات لحوم الدواجن المستوردة في السوق المحلية لمدينة الديوانية وذلك لحماية صحة المستهلك .وقد تم جمع 100 عينة من لحوم الدجاج ومن مناشئ مختلفة . وقد استخد مت عدة اوساط اغنائية وانتقائية لعزل الجرثومة وأظهرت هذه الدراسة عزل 55 عزلة على مرق tetrarathionate و(33 55) 60٪ على وسط bismuth sulphate وكانت نتائج العزل على وسط chromogenic 87،8.٪ (29 33) . .كما استخدمت عدة اختبارات كيميوحيويه لعزلات السالمونيلا حيث اعطت هذه العزلات نتائج ايجابية الانتاج H2S .TSI .SIM, MRD . واختبار الحركة ونتائج سالبة للاندول والفوغس بروسكاور واليوريز ووفقا لقراءة لنظام Api20-E كانت نتائج العزلات 96.1 ٪ (26 25) و في هذه الدراسة قد تم تأكيد عزل 23 عزله من السالمونيلا من اصل 25 بنسبة 92% عن طريق تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) باستخدام البادئ النيوكليوتيدي 16s rRNA لنوع السالمونيلا والبادئ النيوكليوتيدي وinvA تم اختيار هذه البادئات خصيصا للكشف عن السالمونيلا لتضخيم الحمض النووي 406bp و 558bp ، على التوالي. وقد تم تحديد 7 عزلات من أصل23 بنسبة 30.4% للنمط المصلي S.typhimurium . نتائج هذه الدراسة أظهرت أن أعلى نسبة من عزلات السالمونيلا تايفيموريم كانت 50% للمنشأ الهندي (63) واقل منشأ تلوثا المنشأ التركي.


Article
Bovine tuberculosis: Diagnosis by PCR technique in bovine milk samples
السل البقري :تشخيص مرض السل البقري في عينات الحليب باستخدام تقنية تفاعل البلمرة الجزيئي

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to determine the percentage of borne tuberculin infection in milk sample by using PCR. (102) milk samples were collected from cows , AL-Dejella (39) samples, AL-Suara (20) samples cow station, AL-Fthalia (20) samples, AL-Azezia (11) samples and AL-Twarege (12) samples during the period July 10th 2010 to Nov.30th 2010. The samples were examined by direct smear stained by Ziehle-Neelson stain, culture methods and confirmed the isolates by Polymerase Chain Reaction (PCR) assay. The results showed that 5 out 102 (4.9%) milk samples were M. bovis positive that were detected by direct milk smear method and 10 out 102(9.8%) M.bovis +ve were detected by culture method and PCR assay. The results also showed that high percentage of bacterial isolates from milk samples AL-Dejella city show (12.8%) by culturing and PCR method followed by AL-Suara (10%), AL-Fthelia (10%), Al-Twarege (8.3%) but no bacterial isolation was recorded in AL-Azezia milk samples. This study concluded that M.bovis infection was spreading in dairy cow within the mentioned areas and PCR was more sensitive, rapid, and accurate technique for M.bovis infection diagnosis.

ان الهدف من هذه الدراسة هو عزل جرثومة السل البقري من حليب الابقار بطريقة الزرع الجرثومي والمسحة المباشرة وتاكيد تشخيص العزلة بتقنية تفاعل البلمرة الجزيئي تم جمع ( 102) عينة حليب من محطة ابقارالدجيلة (39) والصويرة(20) ومن منطقة الفضيلية (20) والعزيزية (11) ومن منطقة طويريج (12) خلال الفترة الزمنية 10/7/2010 الى 30/11/ 2010 وفحصت العينات بطريقة المسحة المباشرة باستخدام طريقة الزيل –نلسن والزرع الجرثومي على الاوساط الزرعية الخاصة وتثبيت تشخيص العزلات الموجبة باستخدام تقنية تفاعل البلمرة الجزيئي. اوضحت النتائج بان (5) من (102) عينة (4.9%) موجبة لجرثومة السل البقري شخصت بطريقة المسحة المباشرة وان (10) من (102)(9.8%)عينة موجبة لجرثومة السل البقري شخصت بواسطة الزرع الجرثومي وتاكد تشخيصها بتقنية تفاعل البلمرة الجزيئي. كذلك بينت النتائج بان اعلى نسبة للعزل الجرثومي من عينات حليب الدجيلة (12.8) شخصت بطريقة الزرع الجرثومي وتقنية تفاعل البلمرة الجزيئي وبعدها الصويرة (10%) والفضيلية (10%) وطويريج (8.3) ولم يسجل أي عزل جرثومي من عينات العزيزية. نستنتج من الدراسة الحالية بان السل البقري منتشر في ابقار الحليب من المناطق التي جمعت منها العينات وان تقنية تفاعل البلمرة الجزيئي سريعة واكثر حساسية ودقة لتشخيص جرثومة السل البقري من حليب الابقار.


Article
Molecular Diagnosis of Brucella species in Baghdad
التشخيص الجزيئي لجنس البروسيلا في بغداد

Authors: Ashna Jamal Faik** آشنا جمال فائق** --- Khaled A. Habeb خالد عبد الرزاق حبيب --- Inas Saad mohammed إيناس سعد محمد
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2013 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 109-115
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Brucellosis is possess a significant public health problem in Baghdad. In this study, we investigated the potential role of the PCR assay in detection of Brucella species, from patients suspect to have brucellosis, using blood samples in both human and animal.To establish a PCR technique for diagnosis of active brucellosis in our samples, DNA extraction was carried out using a commercial kit, and a laboratory extraction procedure. PCR amplification was done using 1 set of primers: B4/B5 for Brucella species. Extraction of Brucella DNA using the commercial kit was successful. The laboratory extraction was successful and more economic. A total of 178 peripheral blood specimens were collected from patients with high suspected brucellosis, and 15 samples from animals. When PCR technique was applied to blood samples, 13 cases for patients blood and 9 cases for animals blood, were positive for Brucella species.

يشكل داء البروسيلا مشكلة صحية عامة في بغداد. في هذه الدراسة, نحن تقصينا عن الدور الكامن للــ PCR في الكشف عن جنس البروسيلا, من المرضى المشتبه بهم داء البروسيلا, بأستخدام عينات الدم في الأنسان والحيوان. بنى العمل على تقنية الــ PCR لتشخيص داء البروسيلا في كل العينات, إستخلاص الدنا بأستخدام الكت التجاري. تضخيم الــ PCRبأستخدام نوع من البادئات: B4/B5 لجنس البروسيلا .من مجموع 178 عينة دم جمعت من المرضى المحتمل إصابتهم بداء البروسيلا, و 15 عينة من الحيوانات. أظهرت النتائج بأستخدام تقنية الــ PCR , إن النتائج الأيجابية للعينات كانت 13 من دم المرضى من مجموع 178 و 9 من الحيوانات من مجموع 15 كانت مصابة بداء البروسيلا.

Listing 1 - 10 of 53 << page
of 6
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (53)


Language

English (39)

Arabic (5)

Arabic and English (5)


Year
From To Submit

2013 (53)