This study was done during the period from December 2012 until May 2013. The watersamples were collected from rivers (Shatt-Al-Arab, Robat, Khora, Khandq),sewage water(Al-Asmai, Hay Al-Rafadin and Nadhran), Taps water (Qurna, Karmit Ali, Zabir and Basrah old city) and water treatment plant (Al-Bradai and Karmit Ali ). Modifieds acid fast stain and flotation in saturated sugars solution method were used for diagnosis parasite oocyst. The results of the present study showed that the height concentration of oocyst were in February (119 /litter) and April (147 / litter) and the less concentration were in May (61 / litter) and January/2013 (58 / litter).

أجريت هذه الدراسة للفترة من كانون الاول 2012 وحتى نهاية أيار2013 تم فيها جمع عينات المياه من أربعة محطات هي مياه انهر شط العرب والرباط والخورة والخندق ,ومياه المجاري في مناطق الأصمعي وحي الرافدين ونظران ,ومياه إسالة منزلية في القرنة والكرمة والزبير والبصرة القديمة ,اضافة إلى مياه محطتي تصفية البراضيعية والكرمة.استعملت طريقة التطويف بالمحلول السكري المشبع وصبغة زيل نيلسن المحورة الحارة للكشف عن ألاكياس البيضية للطفيلي .اتضح من خلال الدراسة الحالية ان اعلى وجود للأكياس البيضية كان في العينات المأخوذة من مياه المجاري( 104.6/لتر)ومياه الأنهر(24.6/لتر)على التوالي . وان اعلى تركيز للأكياس البيضية كان في شهري شباط (119/لتر) ونيسان (147/لتر) على التوالي واقل تركيز كان خلال شهري ايار(61/لتر )وكانون الثاني (58/لتر).(2013)

Cryptosporidium --- water --- Basrah

A total of 47 of infected potatoes in different size ( Solanumtuberosum) were collected from local vegetable and fruit market and from University of Basrah-Collage of Agriculture, Department of Plant Protection in addition to the three soil samples were taken from Basrah city. From which 22 (44%) isolates were isolation and identification including 19(86.4%) isolates from infected potatoes and 3(13.7%) isolates from soil. All isolates were identification and characterization by using biochemical, physiological and biotechinqicalinvestigation.The extracted DNA of Agrobacteriumtumefaciens isolates were subjected to PCR for amplifying 16S rRNA and for amplifying T-DNA fragment then subjected to gel electrophoresis. The individual band of the 16S rRNA gene was characterized by 1479bp and of the T-DNA fragment by 1200bp. The products were comparison with the standard molecular DNA ladder (1200 and 1500bp). The purified β-lactamase gene was cut from PGLO plasmid and ligated by use T4DNA ligase enzyme with the Ti plasmid which disarmed T-DNA by the same restriction enzyme. The result was indicated by using the E.coli K12 for carries the Ti plasmid vector which contain a β-Lactamase gene when put the antibiotic ampicillin in different consternation into the LB, MHA plate only the colonies which that have picked up exogenous DNA(dTi plasmid ) can grow that is mean it become resistance to ampicillin by using dTi vector

جمعت 47 عينة مختلفة الاحجام لبطاطا مصابة بمرض التورم التاجي من الاسواق المحلية للخضر والفواكة ومن جامعة البصرة كلية الزراعة ، قسم وقاية النبات بالاضافة الى ثلاثة عينات اخذت من التربة لمدينة البصرة. عزلت منها 22 عزلة شكلت (44%) شملت 19 عزلة (86.4%) من بطاطا مصابة بمرض التورم التاجي وكذلك 3 عزلات (13.7%) من عينات التربة. جميع العزلات شخصت وصنفت اعتماداً على الفحوصات البايوكيمياويةوالفسلجية والتقنية الاحيائية. الـDNA المستخلص لعزلاتAgrobacteriumtumefaciens عمل له (PCR) لتضخيم الجين 16S rRNA وكذلك تضخيم قطعة الـ T-DNA بعد ذلك عمل لها ترحيل كهربائي حددت الحزم لكل من T-DNAو 16S rRNAوقورنت مع مقياس قياسي وكانت اطوال الحزم هي 1474 زوج قاعدة لـ16S rRNA و 1200 زوج قاعدة لـ T-DNA مع مقياس يتراوح بين 1500و 1200 زوج قاعدة ، نقي الجين المسؤول عن صفة المقاومة للامبسلينβ-lactamase gene حيث تم قطعة من بلازميدPGLO وتم ربطة بواسطة انزيم الرابط T4DNA مع بلازميد(Ti) حيث قطع الاثنان بنفس الانزيم القاطع .وظهرت النتائج باستخدام عترة E.coli K12 القياسية لنقل الجين المسؤول عن مقاومة المضاد الحيوي الامبسلين المحمول على بلازميد (Ti)حيث عند اضافة المضاد الحيوي الامبسلين الى الوسط الزرعي (LB) لوحظ ان المستعمرات التي اخذت هذه الصفة فقط هي التي نمت في الوسط الزرعي الحاوي على المضاد الحيوي الامبسلين مما يعني انها اكتسبت صفة المقاومة للمضاد الحيوي الامبسلين.

Basrah --- Agrobacteriumtumefaciens --- dTivector --- genecloning

This study aimed to evaluate the safety and efficacy of percutaneous epididymal and testicular sperm aspiration as a diagnostic technique to confirm sperm production and as a therapeutic technique to harvest sperms for use in the intracytoplasmic sperm injection and the indications for performing testicular biopsy in azoospermic infertile males. Thirty married patients were included in this prospective study from February 2011 to December 2012 seen in Basrah General Hospital. Their age ranged from 20 to 40 years. All patients underwent full medical examination with laboratory tests which included seminal fluid analysis, serum leutinising hormone (LH), follicular stimulating hormone (FSH), testosterone, and prolactin in addition to color Doppler ultrasonography of the scrotum. Patients with history of undescended testes, varicocele, & testicular pathology were excluded from this study. All patients showed normal physical examination with normal secondary sexual characters. The external genitalia were normal with normal sizes of their testes. The percutaneous epididymal and testicular sperm aspirations were positive in 12 out of 30 patients (40%). The rest had negative aspirations (60%). The testicular biopsy which performed in the patients with negative aspiration showed normal germinal epithelium with mature spermatozoa in only 5 patients out of 18 (28%) while the rest 13 patients had spermatogenic arrest (72%). In conclusion, percutaneous epididymal and testicular sperm aspiration has been found helpful as a diagnostic technique for patients with non-reconstructable azoospermia. It is a minimally invasive sperm retrieval technique and appears to be an effective alternative to microsurgical epididymal sperm aspiration, which is more invasive and costly. It is less invasive than testicular biopsy and preferably performed as a first step procedure in an attempt to obtain sperms for both diagnostic and therapeutic purposes.

TESTICULAR SPERM --- AZOOSPERMIC --- INFERTILE --- BASRAH

Background: This is a cancer registry- based study carried out in Basrah to analyze the pattern of gastrointestinal tract malignant diseases over a period of seven years (2005-2011 inclusive). The study is in line with the work of Basrah Cancer Research Group to quantify cancer in Basrah governorate.Objectives: To describe the time trend, spatial distribution and histopathological types of gastrointestinal tract cancers in Basrah governorate over the years 2005-2011.Methods: The data used in the study were based on all new malignant cases which were diagnosed, treated and registered in Basrah cancer registration units. A total of 1601 new cases could be identified. Of these 1123 cases were from the inhabitants of Basrah governorate. The rest were from other Iraqi governorates.Results: Analysis of cases from Basrah indicated an overall annual incidence rate of gastrointestinal malignant diseases of 6.87 per 100000 population with very little variation with the passage of time from 2005 to 2011. Great variation in the district specific incidence rates was found with Basrah city centre and Shatt Al-Arab districts having the highest incidence rates (8.28 and 8.62 per 100000 population. Other districts have lower incidence rates: north of Basrah (5.59), West of Basrah (4.24) and south of Basrah (4.53). Histopathologically, four types represented 94.2% of total registered cases. Adenocarcinoma was the commonest cancer representing 71.8% followed by Squamous cell carcinoma (12.8%), Non-Hodgkins lymphoma (7.6%) and undifferentiated carcinoma (3.0%).Conclusions: Gastrointestinal tract cancer represented one of the major cancer groups in Basrah and deserves more care regarding prevention, early detection and treatment and research. Key words: Cancer, Basrah, Incidence, Time trend, place distribution

خلفية الدراسة: هذه دراسة مبنية على البيانات المتوفرة في التسجيل السرطاني في البصرة أجريت لتحليل نمط سرطان القناة الهضمية في محافظة البصرة للسنوات 2005-2011 وهي جزء من مشروع مجموعة البصرة لأبحاث السرطان لقياس السرطان.الأهداف: وصف النمط الزماني والمكاني والنسجي لسرطان القناة الهضمية في محافظة البصرة للسنوات 2005-2011.الطرائق: اعتمدت الدراسة على البيانات المتوفرة في وحدات التسجيل السرطاني في البصرة والتي تخص الحالات الجديدة لسرطان القناة الهضمية. بلغ مجموع الإصابات المسجلة في البصرة للسنوات أعلاه 1601 منها 1123 حالة من سكنة محافظة البصرة.النتائج: بلغ معدل نسبة الإصابة السنوية لسرطان القناة الهضمية في البصرة لكل 100000 نسمة مع نسبة تغاير طفيفة مع مرور السنوات. أما التغاير المكاني فكان واضحا حيث كانت أعلى نسبة إصابة سنوية في مركز مدينة البصرة وفي منطقة شط العرب. أما أوطأ نسبة إصابة فكانت في منطقتي غرب البصرة (الزبير) وجنوب البصرة (أبو الخصيب والفاو). أما من حيث التنوع النسجي فكانت أربعة أنواع هي السائدة وهي السرطان الغددي والطلائي واللمفاوي وغير المتميز ومثلت نسبة تقارب ال95% من مجموع الإصابات.الاستنتاج: يمثل سرطان القناة الهضمية احد الأنواع المهمة في البصرة الا إن الطراز الزماني لا ينذر بتفاقم هذا النوع في المستقبل المنظور عدا سرطان الأمعاء الغليظة.

Cancer --- Basrah --- Incidence --- Time trend --- place distribution

Background: Infertility is a relatively common condition. It can be attributed to factors in a female partner, a male partner, or in both partners. However, certain socio-demographic and life style factors have been linked to female infertility.Objective: To determine the association between female infertility and selected risk factors.Patients and Methods: This is a case – control study carried out in Basrah Governorate over a period of ten months, from 1st of January to 31st of October, 2006. Cases were married women who had no pregnancy for at least one year (infertile women), a total of 212 cases were included. The controls were married women who had babies aged less than one year (fertile women); the total number of controls was 213.Results: the study found that the risk of infertility increases steadily with the increase in age. The risk of female infertility also increased in women with menstrual cycle disturbances (like irregular menstrual cycle length and scanty or heavy menstrual blood loss), women with previous history of abortion, women with previous caesarean section, and in women with previous history of ectopic pregnancy. Infertility was also found to be associated with obesity and with daily caffeine consumption.Conclusion: the independent risk factors for female infertility were history of previous CS, menstrual cycle disturbance, regular daily caffeine intake and obesity. Key words: Female infertility, risk factors, Basrah.

أهداف الدراسة: الهدف الرئيسي للدراسة هو دراسة بعض عوامل الخطورة التي من المحتمل ان تسبب عقم النساء.طرق العمل: أجريت هذه الدراسة (حالة - ضابطة) في محافظة البصرة خلال مدة عشرة اشهر للفترة الممتدة من الأول من شهر كانون الثاني 2006 لغاية الحادي والثلاثين من شهر تشرين الثاني 2006. الحالات التي تضمنتها هذه الدراسة شملت النساء المتزوجات المراجعات الى مركز العقم في مستشفى البصرة للولادة والطفل وهو المركز الوحيد الموجود في محافظة البصرة وقد كان العدد الكلي للحالات هو 212 حالة تضم 131 حالة عقم أولي و81 حالة عقم ثانوي.أما المجموعة الضابطة فقد تضمنت النساء المتزوجات الأمهات لأطفال دون السنة الواحدة من العمر المراجعات الى مركز الرازي للرعاية الصحية الأولية والأمهات الراقدات مع أطفالهن في ردهة الأطفال في نفس المستشفى، وكان العدد الكلي للعينة الضابطة 213.النتائج: أظهرت نتائج هذه الدراسة إن من ضمن عوامل الخطورة المتعلقة بعقم النساء هو تقدم عمر المرأة حيث يزداد احتمال العقم مع تقدم عمر المرأة. كما إن احتمالية العقم عند النساء تزداد بين النساء اللواتي يعانين من اضطراب الدورة الشهرية ، تاريخ حمل خارج الرحم او إسقاط سابق، ولادة سابقة بعملية قيصرية (بالنسبة لحالات العقم الثانوي) . من العوامل الاخرى التي تزيد من احتمالية العقم تناول الأطعمة والمشروبات التي تحتوي على مادة الكافائين بانتظام يوميا والسمنة.الاستنتاج: أظهرت نتائج هذه الدراسة ان أهم عوامل الخطورة المتعلقة بعقم النساء تتضمن ولادة سابقة بعملية قيصرية (بالنسبة لحالات العقم الثانوي)، اضطراب الدورة الشهرية، تناول الأطعمة والمشروبات التي تحتوي على مادة الكافائين بانتظام يوميا والسمنة.مفتاح الكلمات: عقم النساء، عوامل الخطورة، البصرة

Female infertility --- risk factors --- Basrah. --- عقم النساء، عوامل الخطورة، البصرة