research centers


Search results: Found 21

Listing 1 - 10 of 21 << page
of 3
>>
Sort by

Article
Cryptography Operation Using DNA Computing

Authors: د. سلمان محمود سلمان --- د. عماد عيسى عبد الكريم
Journal: Iraqi Journal of Information Technology المجلة العراقية لتكنولوجيا المعلومات ISSN: 19948638/26640600 Year: 2014 Volume: 6 Issue: 1 اللغة الانكليزية Pages: 28-43
Publisher: iraqi association of information الجمعية العراقية لتكنولوجيا المعلومات

Loading...
Loading...
Abstract

There are many encryption algorithms using DNA properties have been Introduced. Most of these algorithms used the well-known binary operation called Exclusive-OR operation to give the algorithm some difficulties for the Cryptanalysis of breaking the algorithm. Exclusive – OR has nothing related to DNA or its properties. It is required to find an operation which makes use of the idea of the XOR operation but using DNA properties and others. This DNA encryption algorithm becomes more powerful thanusing binary XOR

هناك عدة طرق تشفير بأستخدام خواص الحمض النووي DNA قد قدمت. معظم هذه الطرق تستخدمعملية معروفة في النظام الثنائي تسمى Exclusive – OR لكي تعطي لطريقة التشفير صعوبة في كسر الشفرة ان عملية Exclusive – OR ليست لها علاقة لا بالحمض النووي ولا بخواصه. لقد اصبح مطلوبا ايجاد عملية تستفيد من فكرة عملية XOR ولكنها تستخدم خواص الحمض النووى .ان طرق التشفير هذه ستستخدم خواص الحمض النووى لتصبح اكثر قوة من تلك التى تستخدم XOR الاعتيادية


Article
Role of Proteus mirabilis DNA in Comparison to Candida albicans DNA in Rats’ Joints Infection
دور دنا بكتريا Proteus mirabilis مقارنه بدنا الخميره Candida albicans في اصابه مفاصل الجرذان

Authors: Ahmed F. Kadhim احمد فاضل كاظم --- Harith J. AL-Mathkury حارث جبار المذخوري --- Hind H. Obaid هند حسين عبيد
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2014 Volume: 55 Issue: 3B Pages: 1170-1182
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

In This study a comparison between Proteus mirabilis DNA and Candida albicans DNA in Arthritis. Fourteen Proteus isolates (11.6%) were collected from 120 specimens collected from midstream urine of patients of both sex and different ages attending different hospitals in Baghdad. Antibiotic sensitivity assay showed that All Proteus mirabilis recovered from UTI developed multidrug resistance and variable degree of resistance. Histopathological changes in model treated with Proteus mirabilis DNA revealed congestion, inflammatory cells infiltration, oedema, hemorrhagic exudates as well as necrotic cells. Furthermore, articular joints damage has been noticed with articular tissue in ligament and lining epithelium. In addition, an aggregation of lymphocyte was observed as well. While rats treated with Candida albicans DNA depict a congestion and a mild infiltration of inflammatory cells with oedema and augmented infiltration reaction inside the joint space. Serum Interleukine-6 (IL-6) levels peaked within 24 hours after injection of P. mirabilis DNA intraarticularly, while serum IL-6 levels did not increase in rats injected with C. albicans DNA and TE. The serum level of Anti-double strand antibody IgM (Anti-ds Ab) was assessed after 14 days and results revealed that Anti-ds Ab concentration was significantly higher (P< 0.01) in the animal model treated with Proteus mirabilis DNA than those treated with Candida albicans DNA. Total white blood cell count has been assessed, Animal model treated with 30µg/100 µl P. mirabilis DNA showed a significant (P< 0.05) increasing in total count of WBC, while there were insignificant differences between animals treated with 30µg/100 µl C. albicans and control animal.

في هذه الدراسه اجريت مقارنه بين دنا بكتريا Proteus mirabilis ودنا الخميره Candida albicans المسببه لالتهاب المفاصل اربعة عشر عزله (% 11,6) تم الحصول عليها من (120) عينه جمعت من مرضى مصابين بالتهاب المجاري البوليه لكلا الجنسين ومن مختلف الاعمار من مستشفيات مختلفه في بغداد. اختبار الحساسيه اظهر مقاومه متعدده للمضادات الحيويه لكل عزلات Proteus mirabilis. التغييرات النسيجيه في النموذج المعامل مع دنا البكتريا اظهرت ترشيح خلايا التهابيه, وذمه, خراجات دمويه وكذلك خلايا ميته. فضلا عن ذلك, لوحظ ضرر في المفصل, النسيج, الاربطه, والخلايا الطلائيه المبطنه للمفصل. بالاضافه الى ذلك لوحظ تجمع للخلايا اللمفاويه. بينما اظهرت الجرذان المعامله بدنا الخميره ترشيح بسيط للخلايا الالتهابيه مع وذمه.ارتفع مستوى Interleukin-6 في مصل الجرذان خلال 24 ساعه بعد حقن دنا البكتريا في داخل المفصل بينما لم يزداد تركيزه في الجرذان المعامله بدنا الخميره والدارئ TE Buffer. مستوى Anti-ds DNA antibody تم تقديره بعد 14 يوم واظهرت النتيجه زياده معنويه (0.01>P) في النوذج الحيواني المعامل مع دنا البكتريا مقارنه بتلك التي تم معاملتها بدنا الخميره. مجموع كريات الدم البيضاء تم تقييمه في النوذج الحيواني المعامل بدنا البكتريا والتي اظهرت زياده معنويه (0.05>P) في مجموع كريات الدم البيضاء, بينما التغيير غير معنوي بين الحيوانات المعامله بدنا الخميره وحيوانات السيطره (Control).


Article
Studying the Effect of Partially Purified ArthrobacterB1.Polysaccharide on Nucleosomal Distribution of HepG2 Tumor Cell Line

Authors: Ali Z. Al-Saffar --- Nawar B. Al-Roubaie --- Abdul Wahid B. Al-Shaibani
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2014 Volume: 17 Issue: 3 Pages: 170-177
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

This study was designed to investigate the effect of partially purified polysaccharide extracted from ArthrobacterB1 on the DNA banding pattern of HepG2 tumor cell line invitro. The polysaccharide was extracted from Arthrobacter B1using phenol sulfuric acid methodwith a recovery yield of 181mg. Partial purification of polysaccharide was performed by using sepharose Cl-6B gel filtration chromatography and two peaks were obtained. Chemical analysis involving the estimation of carbohydrate and protein contents which showed that the large first peak contained the higher carbohydrate contents (30.1%) as compared with the crude polysaccharide 15.9% with low protein constituents (5.7%).The effect of Arthrobacter B1polysaccharide on HepG2 tumor cells was examined by studying whether bacterial polysaccharide participating in affecting the structure of tumor cell’s DNA or not. Results indicated that only intact nucleosomal DNA bands were separated on the gel for the untreated cells as compared with the banding pattern of the colchicine treated DNA, in which besides to intact nucleosomal DNA, mononucleosomes, dinucleosomes and oligonucleosomes were separated on the gel following electrophoresis process. Such pattern does not affected by the gradual increase in MNase concentration. On the other hand, the DNA banding pattern for the cells treated with Arthrobacter B1 polysaccharide showed significant effect by the separation of nucleosomal DNA, in which mononucleosomes, dinucleosomes and oligonucleosomes were clearly separated from intact nucleosomal DNA, and such effect was markedly appeared by increasing the concentration of MNase as compared with the cells treated colchicine.

صممت هذه الدراسة للتحقق من تاثير متعدد السكريات البكتيري الموجب لصبغة كرام و المستخلص والمنقى جزئيا من بكترياArthrobacter sp. على نمط حزم الحامض النووي (الدنا) لخطوط الخلايا السرطانية في الزجاج. استخلص متعدد السكريات من الغلاف الخارجي لبكتريا Arthrobacter B1 اعتمادا على الطريقة التي وصفت بواسطة Chandan وFraser (1994) حيث كان عائد الاستخلاص هو 181 ملغم. كما اظهرت نتائج التحليل الكيميائي ان المحتوى الكاربوهيدراتي والبروتيني 15.9% و 1.9% على التوالي. تم اعتماد التنقية الجزئية لمتعدد السكريات بواسطة استخدام كروماتوكرافيا الترشيح الهلامي باستخدام هلام (SepharoseCl- B6) وبعد التنقيه تم الحصول على قمتين و بعد تحديد الخواص الكيميائيه و التي تنطوي على تقدير المحتوى الكاربوهيدراتي والبروتيني اظهرت النتائج بأن القمة الاولى كانت ذات محتوى كاربوهيدراتي عالي 30.1% مع مكونات بروتينيه قليلة 5.7%.درس تأثير مستخلص متعدد السكريات المنقى جزئيا من بكتريا Arthrobacter على خط الخلايا السرطانية HepG2 وذالك بدراسة في ما اذا لمتعدد السكريات البكتيري تاثير في تركيب الحامض النووي للخلايا السرطانيه ام لا. اشارت النتائج الى انه فقط حزم الدنا النيوكليوسومي الكاملة قد فصلت في الهلام لدنا الخلايا الغير معاملة بالمقارنه مع نمط حزم الحامض النووي للخلايا المعاملة مع الكولجسين حيث بالاضافة الى الدنا النيوكليوسومي الكامل تم الحصول على فصل للنيوكليوسوم الاحادي, الثنائي والنيوكليوسوم المتعدد القليل في الهلام بعد عملية الترحيل الكهربائي. أن مثل هذا النمط لم يتأثر بالزيادة التدريجية لتركيز .MNase من جانب اظهر نمط حزم الحامض النووي للخلايا المعاملة مع متعدد السكريات المستخلص منArthrobacter B1 تأثيرا معنويا من خلال فصل نيوكليوسوم الحامض النووي الاحادي، الثنائي و المتعدد القليل بصورة واضحة عن نيوكليوسوم الحامض النووي الكامل حيث ان مثل مثل هذا التاثير كان ظاهراً بصورة واضحة مع زيادة تركيز MNase بالمقارنه مع الحامض النووي للخلايا المعامله بالكولجسين.

Keywords

Arthrobacter --- Polysaccharide --- DNA --- MNase


Article
The Role of anti –DNA Abs. in Chronic Renal Failure in Diabetes Mellitus Type I and Type II

Authors: Suha A.AL-Fakhar --- Manal Kamal Rasheed --- Mohammed Kamal Rasheed
Journal: Iraqi Academic Scientific Journal المجلة العراقية للاختصاصات الطبية ISSN: 16088360 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2 Pages: 165-168
Publisher: The Iraqi Borad for Medical Specialization المجلس العراقي للاختصاصات الطبية

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACT: BACKGROUND: Diabetic nephropathy (DN) is the leading cause of CKD and end-stage renal disease (ESRD). CKD is characterized by a progressive loss of renal function, chronic inflammationOBJECTIVE:To compare the relationship between the anti –DNA Abs in diabetic patients type 1 and type 2 and their relation with chronic renal failure.METHODE:The ELISA methods was used to detect the presence of anti-DNA –Abs in sera of diabetic patients with type 1 and type 2 D.M. with CRF.RESULT: The concentration of anti-DNA Abs. were more in type II D.M. patients with CRF than those with type I D.M. without CRF and control group. CONCLUSION:The anti-DNA Abs. play an important role in the CRF in patients with long duration of D.M. type II ,while in patients with short duration of D.M. type I , anti-DNA Abs. do not play a role.


Article
Effect of Long Term Exposure to Sodium Nitrite on Gene Responsible for DNA Repair
تـأثير التعرض الطويل الأمد لنتريت الصوديوم في الجين المسؤول عن عملية إصلاح الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين

Authors: Ala'a H. Mirza-Hussain --- Sadiq M. A. AL- Hiti
Journal: nursing national Iraqi specility المجلة العراقية الوطنية للعلوم التمريضية ISSN: 18122388 Year: 2014 Volume: 27 Issue: 2 Pages: 17-22
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract: Objective: The aim of this study is to detect the effect of continuous exposure to Sodium Nitrite on 8-oxoguanine DNA glycosylase (OGG1) gene which responsible on DNA repairs. DNA repair play a major role in maintaining genomic stability when DNA exposure to damage. Genomic stability is very important for keeping body cells healthy and to prevent many types of tumor development. Many genes are responsible for this job; one of them is OGG1 gene. Methodology: In current study two groups of mice were chronically exposed to sodium nitrite for six months and eighteen months while third group was used as a control. Then sizes of OGG1 were estimated. Results: The results exhibited in the unexposed (control) mice had two different alleles for this gene while the exposed animals showed more polymorphisms and this finding is independent to the period of exposure. Conclusion obtained from this study indicated that sodium nitrite has ability to act on this gene that leads to develop more polymorphisms. Recommendations: Other research should be done in order to detect how nitrite can act on this gene. Keywords: Sodium nitrate, DNA repair genes, OGG1

المستخلص : الهدف: تهدف هذه الدراسة الى معرفة تأثير التعرض المستمر لنتريت الصوديوم في أحدى الجينات المسؤولة عن عملية أصلاح الحمض النووي ( الدنا). تلعب عملية أصلاح الحامض النووي دور مهم وكبير في المحافظة على أستقرار الدنا عند تعرضه للتلف, واستقرار الحامض النووي مهم جدا في الحفاظ على سلامة الخلية ومنع حدوث العديد من الاورام السرطانية. وهناك العديد من الجينات المسؤولة عن هذه العملية و يعتبر أوكسو كوانين كلايكوسليز (Ogg1) هو أحد هذه الجينات. المنهجية: في هذه الدراسة عرضت مجموعتين من الفئران لنتريت الصوديوم أحداهما لمدة ستة أشهر والثانية لثمانية عشر شهرا وأستعملت مجموعة ثالثة سيطرة للمجموعتين, بعدها تم قياس حجم جين أوكسو كوانين كلايكوسليز. النتائج: أظهرت النتائج في المجموعة غير المعرضة لنتريت الصوديوم (مجموعة السيطرة) وجود اليلين مختلفين لهذا الجين بينما أظهرت الفئران المعرضة الى نتريت الصوديوم تعدد في أشكاله بغض النظر عن فترة التعرض. نستحصل من هذه الدراسة الى ان نتريت الصوديوم له القابلية في العمل على هذا الجين مؤديا الى تعدد في أشكاله. التوصيات: أجراء المزيد من الابحاث للتعرف على آلية تأثير النترات على هذا الجين.


Article
Assessment of Sperm DNA Fragmentation for Patients Suffering from Varicocele

Authors: Saif H. Mohammed --- Adib M. Al-Kazzaz --- Usama S.Al- Nasiri
Journal: Iraqi Journal of Embryos and Infertility Researches المجلة العراقية لبحوث الأجنة والعقم ISSN: eISSN: 26166984 / pISSN: 22180265 Year: 2014 Volume: 4 Issue: 2 Pages: 47-52
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Background:Varicocele is an abnormal dilation of the testicular veins in the pampiniform plexusand characterized by retrograde blood flow in the internal spermatic veins due toincompetent or absent valves. It is considered one of the main causes of male factorinfertility. Sperm DNA integrity is essential for in vivo and in vitro fertilization, andvaricocele causes a progressive decrease in sperm quality .Objective:To study the impact of varicocele on semen quality and sperm DNAintegrity.Patients, Materials and Methods:Twenty patients with varicocele and 20 men without varicocele were assigned intotwo groups in the Out-Patient Clinic of Urology in Al-Kadhimya Teaching Hospital. Semen was collected from both groups and the rate of sperm DNA fragmentationassessed by the "Comet assay" and categorized to 4 classes. Class I (no DNAfragmentation), class II (little DNA fragmentation), class III (meaningful DNAfragmentation), and class IV (high DNA fragmentation) .Results: No statistically significant differences were found between the varicoceleand control groups with respect to age. Men with varicocele had significantlyhigher ejaculate volume, lower sperm concentration, and lower progressive motility,and showed more abnormal morphology than men in the control group. TheVaricocele group showed a lower percentage of sperm with little DNAfragmentation (class II) and a higher percentage of sperm with DNAfragmentation (class IV), than the control group.Conclusions:Compared with men without varicocele, men with varicocele had a higherpercentage of cells with DNA fragmentation .


Article
Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis to investigation of genetic diversity, and relationships among a set of clinical Aspergillus fumigatus isolates
استخدام مؤشرات ال RAPD في تشخيص التغايرات الوراثية والعلاقة بين عزلات سريرية من الرشاشيات الدخناء

Loading...
Loading...
Abstract

This study is an attempt to determine the genetic diversity and relationships among fourteen local isolate isolated from patients with Aspergillosis (Aspergillus fumigatus) by using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. Twelve universal primers used in this study produced 94 bands across fourteen isolates. Of these bands, 67 bands or 71.2% were polymorphic. The size of the amplified bands ranged between 100-2000 bp. The genetic polymorphism value of each primer was determined and ranged between 33-100%. In terms of unique banding patterns, determine the finger print for six isolates the most characteristic banding pattern was for the (AFU1, AFU2, AFU3, AFU4, AFU8 and AFU14) with primer (OP F-16 , OP I-06, OP F-16, OP X-01, OP X-01and OP A-06). Genetic distances ranged from 0.12419 to 0.64404 among A. fumigatus isolates. Cluster analyses were performed to construct a dendrogram among studied A. fumigatus isolates. The cluster analysis places most of the A.fumigatus isolates isolated from patient come from yhe same area into a close relation (subcluster) showing a high level of genetic relatedness and were distinct from isolates from another area (the other subcluster). Interestingly, a number of isolates originating from the same sources did form well defined groups, indicating association between the RAPD patterns and the geographic origin of the isolates. The information generated from this study can be used in the future for controlling of Aspergillosis programs.

في هذه الدراسة محاولة لتحديد التغايرات الوراثية والقرابة الوراثية بين 14 عزلة من الرشاشيات الخضراء معزولة من مرضى يعانون من داء الرشاشيات باستخدام مؤشرات مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا المتعدد الأشكال وقد استخدم 12 بادئ في هذه الدراسة وانتجت 94 حزمة رئيسية للعزلات الأربعة عشر من هذه الحزم 67 حزمة متباينة ويترواح الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة بين 100-2000 زوج قاعدي قيمة التغايرات الوراثية تراوحت بين 33-100% نمط الحزمة الفريدة استخدم لتحديد بصمة الدنا وفي دراستنا استطعنا تحديد البصمة لستة عزلات والتي تحمل الرمز AFU1,AFU2,AFU3, FU4,AFU8 and AFU14)) وكانت البادئات التي أعطت الأكثر تمييزا هي OP I-06, OP F-16, OP X-01, OP X-01and OP A-06) (OP F-16, . البعد الوراثي تراوح بين 0.12419 - 0.64404 بين عزلات الرشاشيات الدخناء المدروسة وقد تجمعت العزلات الأربعة عشر في المخطط الشجري في ثلاث مجموعات رئيسة،ضمت المجموعة الاولى اعتمادا على مكان سكن المريض الذي تم عزل الفطر منه وقد تجمت العزلات المعزولة من مرضى من مناطق متقارب في مجموعات متقاربة ، المعلومات التي حصلنا عليها في دراستنا ممكن أن تستخدم في السيطرة على المرض .


Article
عدد نماذج التداخل الجيني العاملة في النبات النامي تحت عوامل الشد
NUMBER OF GENES INTERACTIVE MODELS IN PLANTS GROWN UNDER STRESS VARIABLES

Author: M. Al-Khafajy مدحت مجيد الساهوكي
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2014 Volume: 45 Issue: 1 Pages: 99-104
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

To acquire more information on genotype x environment interactions in plants grown under abiotic and/or biotic stresses, and to understand a new approach on the complex mechanism of tolerance, a formula was set-up to estimate the number of genes interactive models (NGIM) acting in plants under stress. Some of previous results and ideas on this topic were taken into consideration, including morpho-physiological traits and molecular approaches. The formula was: NGIM= n2-x, when n= number of stress variables and x= n-1. Genes of stress variables were sketched as circles, and the sectors of each group of genes and their interactions were identified. Sketches explained that in two stress variables, these sectors will appear, as two of genes groups acting alone, and one sector represents their interaction. If three variables taken, there will be seven sectors, three of them of genes groups acting alone, three sectors of two groups interactions, and one sector of three groups interaction. In case of four variables, four sectors will be of genes groups acting alone, four sectors of two groups interactions, four sectors of three groups interactions, and one sector of the four groups interaction (total 13). In case of five variables taken, the sectors will be 21, in case of six variables taken, the sectors will be 31, and for seven variables the sectors will be 43. Sectors of eight variables will be 57, namely, 8 sectors of genes groups acting alone, 8 sectors of two groups interactions, 8 sectors of three groups interactions, 8 sectors of four groups interactions, 8 sectors of five groups interactions, 8 sectors of six groups interactions, 8 sectors of seven groups interactions, and one sector for the eight groups interaction. However, using this formula for any number of stress variables will give similar trend of interactions. The results of applying this formula showed the complexity of multi-gene actions and interactions in plants grown under stress variables. This implies the need of a larger area of plots to grow thousands of genotypes individuals repeated under several levels of that stress, several traits taken under study, and genetically wide genotypes, planted in a honeycomb design to enable the breeder identifying tolerant individuals and/or genotypes under those environments.

لأجل زيادة المعلومات حول طبيعة التداخل الوراثي × البيئي في النباتات الواقعة تحت تأثير عوامل الشد اللاحيوي و/أو الحيوي, ولإيضاح بعض جوانب آلية التحمل المعقدة, تم وضع معادلة لحساب عدد التداخلات الجينية العاملة في النبات تحت الشد. تم الأخذ بنظر الاعتبار النتائج والأفكار السابقة حول طبيعة تحمل التراكيب الوراثية لعوامل الشد والصفات المظهرية والوظيفية والحالة الجزيئية المدروسة فيها. وضعت معادلة لتقدير عدد تداخلات مجاميع الجينات لعدة عوامل من الشدود. إذا اخذنا n = عدد مجاميع جينات عوامل الشد المدروسة وx = n-1 يكون عدد نماذج التداخل الجيني (NGIM) = n2-x. رسمت التداخلات لمجموعتين من الجينات وثلاث وأربع وست وثمان. اوضحت المعادلة أن هناك تداخلا واحدا فقط لمجموعتين من الجينات, فيما اعطت دراسة ثلاث مجاميع سبعة تداخلات منها ثلاثة فردية المجموعة الجينية وثلاثة ثنائية المجموعة الجينية المتداخلة وقطاعا واحدا فقط لتداخل ثلاث مجاميع جينية. أما تداخلات أربع مجاميع جينية فقد اعطت ثلاث عشرة مجموعة جينية فاعلة تحت الشد, منها أربعة قطاعات أحادية المجموعة وأربعة ثنائية المجموعة وأربعة ثلاثية المجموعة الجينية, وقطاع واحد يمثل تداخل المجاميع الجينية الأربع الحاكمة لتلك الصفات. كذلك اوضحت المعادلة أن دراسة ست مجاميع جينية تعطي واحدا وثلاثين قطاعا للفعل الجيني منها ستة قطاعات للمجاميع لوحدها وستة لكل من تداخلات المجاميع الثنائية والثلاثية والرباعية والخماسية, وواحدا للتداخلات الستة مجتمعة, فيما هناك ثلاثة وأربعون قطاعا لسبعة عوامل. أما التداخلات لثمان مجاميع جينية للصفات فقد اعطت سبعة وخمسين قطاعا, منها ثمانية للمجاميع لوحدها وثمانية لكل من التداخلات الثنائية والثلاثية والرباعية والخماسية والسداسية والسباعية, وقطاعا واحدا يمثل تداخل جينات المجاميع الثمان المدروسة. عليه, يمكن تصور العدد الكبير من التداخلات الجينية العاملة في التراكيب الوراثية الواقعة تحت الشدود المختلفة اللاحيوية والحيوية. إن ذلك يعطي صورة جديدة واضحة عن طبيعة تحمل التركيب الوراثي لذلك الشد أو الشدود. عليه, فإن الحاجة تكون واضحة لأجل الحصول على نباتات متحملة أن تزرع بمساحات واسعة وبآلاف النباتات للتركيب الواحد ولعدة شدود وباعتماد برنامج زراعة بطريقة خلية النحل يمكن تشخيص النبات المتحمل أفضل.


Article
MECHANISM OF PLANT SALINITY STRESS TOLERANCE
آلية تحمل النبات لشد الملوحة

Authors: M. M. Elsahookie مدحت مجيد الساهوكي --- M. J. Al-Khafajy مصطفى جمال الخفاجي
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2014 Volume: 45 Issue: 5 Pages: 430-438
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Halophytes grown in some saline areas in Iraq and other countries could be propagated to be grown as green areas, green belts and for fodder. Field crops still suffer from low number of released cultivars tolerant to salinity stress. This could be attributed to difficulties in their breeding techniques and to low handling of such cultivars in the markets. Soil and water salinity cause osmosis to the plants, nutrient imbalance and cell toxicity. Halophytes are characterizing by morphological, histological, chemical and physiological traits different from those in cultivated crop cultivars. Accordingly, the mechanism of salt tolerance between these two groups of plants will be different. Some of these mechanisms is prevention of some ions to be absorbed by plant and/or translated, compartmentation of ions in the cell vacule on apoplast, and the ability of plants to survive well under salinity stress due to high ability of osmotic adjustment. The latter is considered as the best trait. However, the mentioned traits of plant salt tolerance are directly related to one or more of mechanisms; proteomic, metabolomics, genomic and/or transcriptomic. Plasma membrane, aquaporins, proteins and sugars are playing prime roles in salt tolerance. Meanwhile, DNA-methylation, histone modificated and RNAi have another dimension beside genotype genetic background. Low reactive oxygen spices (ROS), and/or ROS damage repair are importance in many crop species to be salt tolerant. Results of molecular analyses revealed that epigenetics plays an important role in salt stress tolerance. It was found in oats cultivars tested under salt stress that grain weight, number of tillers/m2 and longer time for maturity were positively correlated with plant salt tolerance. These traits could be used in selecting tolerant plants to salt stress.

تعيش في بعض البيئات الملحية في العراق وبعض دول العالم نباتات متحملة للملوحة. يمكن الاستفادة منها بإكثارها وزراعتها بالأراضي المتأثرة بالملوحة لتوفير أعلاف أو مسطحات خضراء أو أحزمة خضراء للمحافظة على البيئة. أما بالنسبة لمحاصيل الحقل والخضر فإنها لازالت تعاني من قلة عدد الأصناف المستنبطة منها والمتحملة للملوحة فعلا. ربما يعود ذلك إلى صعوبة آلية الاستنباط من جهة, وقلة الاقبال على شراء بذور تلك الأصناف من جهة أخرى. تسبب ملوحة التربة أو ماء الري إعاقة امتصاص بعض العناصر من قبل النبات وإذا ازداد امتصاص الأملاح فإنها تسبب التسمم الأيوني للخلية, كذلك تسبب زيادة الأملاح قلة امتصاص الماء من قبل النبات بسبب ارتفاع أزموزية ماء التربة. تتميز النباتات النامية في البيئات الملحية بصفات مظهرية وكيمياوية وتشريحية ووظيفية تختلف بها عن النباتات المنزرعة. كذلك تختلف آلية تحمل شد الملوحة في النباتات المنزرعة بحسب أنواعها وأجناسها النباتية. تتضمن تلك الآليات واحدة أو أكثر من النقاط التالية وهي عدم السماح لأيونات الأملاح بالدخول إليها, أو مقدرتها على طردها إلى الفجوات أو المسافات البينية. إن ذلك يعود لوجود واحدة أو أكثر من آليات تحمل الملوحة, وهي أنظمة Proteomic أو Metabolomic أو Transcriptomicأو Genomic. إن من بين أبرز أجزاء الخلية في التعامل مع شد الملوحة هو غشاء البلازما, فيما نجد أن من بين أبرز المركبات هي البروتينات. تقوم بعض هذه البروتينات ولاسيما تلك التي ترتبط مع مادة DNA, أما بتقليل ضرر الملوحة وتقليل إنتاج ROS أو بالسماح لجزء منها ثم القيام بإصلاح الضرر بالتخلص من أضرار ROS وإعادة تركيب البروتينات التي تجمعت أو انحلت نتيجة الشد. إنه وفي كلتا الحالتين تلعب ظاهرة فوق الوراثة دورا هاما وأساسيا في آليات التحمل والتي لابد من دراستها وتشخيصها لفهمها والعمل بمضمونها لدى التعامل مع برامج دراسة تحمل النباتات لشد الملوحة. تميزت ثلاثة صفات في الشوفان بنسب تغايرها الوراثي إلى البيئي في تحملها لشد الملوحة, وهي معدل وزن الحبة وعدد السوق في المتر المربع والأيام اللازمة للنضج. عليه نوصي بدراسة تحمل الملوحة لأصناف نوع معين عبر ثلاث مراحل أساسية هي الإنبات والبزوغ ثم التفرع والاستطالة ثم التزهير والنضج, وذلك لأن لكل مرحلة جيناتها الخاصة.


Article
The Role of Antibiotic-Killed Staphylococcus aureus and Its DNA to Cause Arthritis in Rats
دور خلاياStaphylococcus aureus المقتولة بالمضادات الحياتية والدنا المستخلص منها في احداث التهاب المفاصل في الجرذان

Loading...
Loading...
Abstract

The purpose of this study is to investigate the capability of bacterial DNA compared to bacterial lysate in stimulating arthritis using rat model. One hundred mid-stream urine specimens were collected during November 2012 to January 2013, from patients suffering from urinary tract infections attending hospitals in Baghdad, Iraq. Susceptibility of Staphylococcus aureus isolates to antibiotics was examined. Twenty five isolates were identified as S. aureus and they developed multi drug resistance. S. aureus S1 lyaste and its DNA were intra-articulary injected in rats. The levels of IL-6, anti-ds DNA Ab and leukocytes count were measured. In general, IL-6, anti-ds DNA Ab and leukocytes count were significantly higher in sera of rats injected with cell lysate. Moreover, time period significantly (P< 0.05) affected the immunological aspects and joints damage. In a conclusion, bacterial lysate caused more damage to rat joints than DNA. Furthermore, bacterial lysate evoked immunological parameters more than DNA did.

الغرض من هذه الدراسة هو التحري عن قدرة الحمض النووي البكتيري مقارنة بالبكتريا المتحللة في تحفيز التهاب المفاصل باستعمال نموذج الفئران. تم جمع مائة عينة إدرار وسط المجرى للفترة من تشرين الثاني 2012 لغاية كانون الثاني2013 من مرضى يعانون من التهاب المجاري البولية من مستشفى اليرموك التعليمي والمختبرات التعليمية لمدينة الطب. تم فحص حساسية عزلات العنقوديات الذهبيه لمجموعة من مضادات الحياتية. وقد تم تحديد خمسة وعشرين عزلة تابعة للعنقوديات الذهبية واعطت مقاومة متعددة للمضادات الحياتية. تم حقن الخلايا المتحللة ودنا بكتريا S. aureus S1 في مفصل الجرذان وقد تم قياس مستويات IL -6 ، وAnti-ds DNA Ab و العدد الكلي لكريات الدم البيض. . بشكل عام ، كان تركيز IL -6 ، وAnti-ds DNA Ab والعدد الكلي لكريات الدم البيض أعلى بكثير في مصول الجرذان المحقونة بالخلايا المتحللة. علاوة على ذلك، المدة الزمنية كان لها تأثيرمعنوي (P< 0.05) في الجوانب المناعية و الضرر في المفاصل. نستنتج من هذه الدراسة ان البكتريا المتحللة سببت المزيد من الضرر لمفاصل الجرذان اكثر من الحمض النووي. علاوة على ذلك، أثارت البكتريا المتحللة المعلمات المناعية أكثر مما فعل الحمض النووي.

Listing 1 - 10 of 21 << page
of 3
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (21)


Language

English (17)

Arabic and English (2)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2014 (21)