research centers


Search results: Found 86

Listing 1 - 10 of 86 << page
of 9
>>
Sort by

Article
Molecular identification and characterization and phylogenetic study of six Eimeria species in cattle in Al-Najaf province
التشخيص الجزيئي ودراسة الشجرة الوراثية لستة انواع من طفيلي الايميريا في الابقار في محافظة النجف

Authors: Qasim Jawad Ameer Al-Jubory --- Haidar Mohammed Ali Al-Rubaie
Journal: Euphrates Journal of Agriculture Science مجلة الفرات للعلوم الزراعية ISSN: 38752072 Year: 2016 Volume: 8 Issue: 3 Pages: 83-96
Publisher: Al-kasim University جامعة القاسم الخضراء

Loading...
Loading...
Abstract

The study extended from April 2015 through January 2016 and included 600 cattle with varying age (1 day to 8 years). It was conducted in Al.Najaf province. Direct and flotation methods were used for the diagnosis of Eimeria infection. PCR and phylogentic tree was done for all isolates. Eimeria infection was reported in 211 out of 600 (35.2 %). PCR permitted the isolation of six Eimeria species. Nucleotide sequence was done and phylogenetic tree was established. The percentage of each species was as follows: E. zuernii(53.1%), E. cylindrical (49.3%), E. ellipsoidalis (34.6%), E. bovis(28.0%), E. auburnensis(22.7%) and E. alabamensis(19.4%).The Eimeriabovis, Eimeriaauburnensis, Eimeriacylindrica, and Eimeriazuernii were closely related together. The Eimeriaellipsoidalis appeared less related to other Eimeria species. Whereas, the Eimeriaalabamensis appeared significantly different from other Eimeria species and out off tree.For our knowledge this is the first molecular study done in Iraq for identification and characterization of Eimeria species in cattle. Molecular method can be utilized as a powerful, sensitive tool for the diagnosis of Eimeria infection in cattle, and as a superior substitute to the conventional morphologic methods. Phylogenetic tree analysis of the common six Eimeria species has been disclosed in this study to add to the original Japanese study by Kawahra in 2010.

امتدت فترة العمل منذ شهر نيسان 2015 وحتى شهر كانون الثاني 2016 واجريت هذه الدراسة في محافظة النجف الاشرف. وشملت العينة 600 من الابقار ترواحت اعمارها ما بين يوم وثمان سنوات. تم تشخيص الاصابة بطفيلي الايميريا بواسطة الفحص المجهري المباشر وطريقة التطويف. سجلت الاصابة بطفيلي الايميريا في 211 من النماذج الخاضعه للفحص وبنسبة (35,2%). اظهرت طريقة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) الاصابة بستة انواع من طفيلي الايميريا وهي (E. zuernii (53.1%), E. cylindrical (49.3%), E. ellipsoidalis (34.6%), E. bovis (28.0%), E. auburnensis (22.7%) and E. alabamensis(19.4%).. بعد ذلك اجرى فحص الشجرة الوراثية والذي اظهر ان (Eimeriabovis, Eimeriaauburnensis, Eimeriacylindrica, and Eimeriazuernii) كانت متقاربة جينيا وبصورة كبيرة ولكن ظهر أن (Eimeriaellipsoidalis) بعيدة وراثيا وبصورة ملحوظة عن بقية الانواع في حين كانت(Eimeriaalabamensis) بعيدة جداً عن بقية الانواع. وفقا للمعلومات المتوفرة فان هذه الدراسة تعد فريدة من نوعها في العراق كونها سباقة لاستخدام العزل الجيني والشجرة الوراثية في تشخيص الاصابة بطفيلي الايميريا في المواشي ويعد اضافة للبحث الذي قام به الباحث الياباني كوارا في سنة 2010.

Keywords

Phylogenetic tree --- PCR --- Eimeria


Article
Using PCR for detection of cutaneous leishmaniasis in Baghdad
استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل للكشف عن الإصابة باللشمانيا الجلدية في بغداد

Authors: Marwa M. Kamil مروة مصطفى كامل --- Hayder Z. Ali حيدر زهير علي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 2B Pages: 1125-1130
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Cutaneous Leishmaniasis (CL) is an endemic disease and one of the major health problems in Iraq. Leishmania tropica is known as the causative agent of Cutaneous Leishmaniasis in Baghdad.The classical serological methods of diagnosing leishmaniasis is a poor sensitivity especially for the sub genus and time consuming Here we have investigated two primer pairs, one specific for Leishmania as genus and the primer specific for the species of L. tropica to be detected by polymerase chain reaction (PCR).Samples were collected from (AL-karama Teaching Hospital) and whole genomic DNA was extracted from axenic promastigotes.The extracted DNA was amplified by PCRwith two KDNA primer pairs, for genus specific (13A/13B) and (Lmj4/Uni21) to identify the specific species of cutaneous leishmaniasis. Amplified PCR products then run on gel electrophoresis and two visible bands of the two primers were seen, 120 and 800 bp, respectively. Our results indicate that the PCR technique is sensitive and specific for the detection and differentiation of cutaneous leishmaniasis agents and can be recommended to applied in hospitals and research centers.

داء اللشمانيات الجلدي (CL) من الامراض المتوطنة ويشكل احدى المشاكل الصحية الرئيسية في العراق. Leishmania tropica هي من المسببات المسؤلة عن اللشمانيا الجلدية في بغداد. الطرق المصلية التقليدية في تشخيص داء اللشمانيات هي طرق قليلة الحساسية خاصة بالنسبة للاجناس الفرعية اضافة الى أنها مستهلكة للوقت . في هذه الدراسة قمنا بفحص بادئين اثنين احدهما خاص بجنس اللشمانيا والاخر خاص بنوع L . tropica للكشف عنه بطريقة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). تم في هذه الدراسة جمع العينات من مستشفى الكرامة التعليمي في بغداد , اذ تم استخلاص الحامض النووي الدنا من الطور السوطي للطفيلي وبعدها خضع للتضخيم باستخدام بادئين خاصين للبانية الحركية بواسطة تفاعل السلسلة المتبلمر. (13A/13B) خاص بجنس اللشمانيا و (Lmj4/Uni21) خاص لتشخيص انواع اللشمانيا الجلدية. أظهرت نتائج تضخيم تفاعل البلمرة المنتج بواسطة الترحيل الكهربائي حزمتين مرئيتين للبادئين (120, 800) زوج نيتروجيني على التوالي, النتائج اثبتت ان الPCR طريقة حساسة ودقيقة للكشف والتفريق بين انواع اللشمانيا الجلدية لذلك نوصى باستخدامها في المستشفيات ومراكز البحوث.


Article
Bacteriological and Molecular detection of Salmonellatyphimurium from Chicken Meat in AL- Najaf province

Authors: Angham Jasim Muhammed Ali --- Haqee Abd.Al.Abaas Essa --- Amer A. Al-Ramahi
Journal: Mesopotamia Environmental Journal بيئة وادي الرافدين ISSN: 24102598 Year: 2016 Issue: Special Issue A Pages: 33-38
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to detect the prevalence of Salmonellae infection among isochicken meat samples imported from different area to local markets in Najaf governance. The result showed that 11 and 13 isolates were belong to Salmonella spp. According to identification by Biochemical test and vitek system respectively , where as the result of identification by PCR using 16s , ,RNA and inVA gens showed that only 17 and 8 isolates were belong to Salmonella spp respectively . out of 25 Salmonella spp. Isolates that detected by PCR only 10 isolates were belong to Salmonella typhimurium.the highest percent age of isolates were 85.8 % for foreign origin and the lowest percent age were 23% from local origin.

Keywords

Meat --- S.typhimurium --- PCR.


Article
Toxoplasmosis: Detection of Serum Immunoglobulin by ELISA and Placenta DNA by PCR; A Comparative Study
داء المقوسات: الكشف عن مصل الغلوبولين المناعي بواسطة تقنية اليزا والحمض النووي للمشيمة بواسطة طريقة PCR ; دراسة مقارنة

Author: Abeer Abbas Ali عبير عباس علي
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2016 Volume: 12 Issue: 1 Pages: 99-107
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

The prenatal diagnosis of congenital toxoplasmosis is important to prevent unnecessary termination of pregnancy. Thus, there is a need for application of laboratory test that is sensitive and specific for the diagnosis of toxoplasmosis .The objective of the present study was to check the validity of determination of serum specific IgG and IgM anti-toxoplasma antibodies in comparison to PCR method for detecting toxoplasmosis DNA in placenta samples twenty one women suffered from abortion were included in this study. Their ages ranged from 20 -35 years . Cases of abortion due to other causes were excluded . Sera and placentae were collected from all participants. Specific IgM and IgG anti- toxoplasma antibodies were determined using capture ELISA technique according to the manufacturer's instructions. Nested primer sets were used for amplifying fragments of the B1 gen. Specific IgG anti –toxoplasmosis antibodies were detected by ELISA in 17 (77.2%) women out of 21 while specific IgM anti-toxoplasmosis antibodies were detected in 8 (36.3) women out 0f the 21 examined sample . However , PCR detected toxoplasmosis DNA in 20 (95.4%) out of 21 placental samples.Nested PCR amplification of the B1 gene of T. gondii is a rapid, sensitive and specific diagnostic procedure and considered a valuable tool for the diagnosis of T. gondii infection in adults females . Detection of specific IgG and IgM anti-toxoplasma antibodies in serum of women with abortion was with higher specificity .However , their sensitivities were 85% and 40% for serum IgG and IgM respectively

يعتبر التشخيص المبكر لداء المقوسات الولادي من الفحوصات المهمة وذلك لمنع حدوث ولادات لاجنة مصابة بداء المقوسات الولادي . ولهذا السبب ظهرت هناك حاجة ملحة لايجاد فحوصات مختبرية حساسة ودقيقة لتشخيص داء المقوسات. وهدفت الدراسة الحالية لاجراء مقارنة بين طريقتين مهمتين في تشخيص داء المقوسات وهي 1- تحديد الكلوبيولينات المناعية IgMو IgG في المصل 2- طريقة PCR لتحديد مدى دقة هذين الفحصين في التشخيص المختبري . تمت في الدراسة الحالية اقناع احدى وعشرون سيدة يعانين من الاجهاض للمشاركة في الاختبارات اعلاه تراوحت اعمارهن بين 20- 35 سنة وتم استبعاد حالات الاجهاض التي كانت لأسباب اخرى . جمعت عينات المصل والمشيمة منهن وتم قياس IgM وIgG باستخدام تقنية الاليزا ELISA . واستخدمت مجموعة البادئات لتضخيم اجزاء من جين B1 . اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان 17 سيدة كانت موجبة في الكولبيولين المناعي IgG وبنسبة (77.2%) بينما كانت 8 سيدات موجبة في الكولبيولين المناعي IgM وبنسبة (36.3%) . واظهرت نتائج الـ PCR في المشيمة الاصابة بداء المقوسات في 20 سيدة وبنسبة (95%) . نستنتج ان وجود الكلوبيولينات المناعية الخاصة بداء المقوسات في مصل النساء المجهضات كانت ذات خصوصية عالية . الا ان حساسيتها للاختبار كانت 85% و 40% لل IgG وIgM على التوالي.


Article
Detection of Some Staphylococcal Enterotoxin Genes in MRSA Strains Using PCR Techniques
تحديد بعض جينات التسمم المعوي في بعض سلالات بكتيريا المكورات العنقودية الهبية المقاومة للمثيسيلين بإستخدام تقنية تفاعل البلمره المتسلسل

Authors: Suha M. Abed سهى ماهر عبد --- Waad M. Raoof وعد محمود رؤوف --- Akeel H. A. Assie عقيل حسين العاصي
Journal: Tikrit Journal of Pure Science مجلة تكريت للعلوم الصرفة ISSN: 18131662 Year: 2016 Volume: 21 Issue: 3 Pages: 33-38
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

In view of the increasing interest in the Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). The extracted DNA yield was observed using the phenol-chloroform method, it ranged from (1.6-1.8) and concentration ranged from 100 to 800 ng/µl. Five classical enterotoxin genes were investigated in 20 isolates using multiplex PCR method after it had been molecularly identified into methicillin resistant using mec A (which is the key genetic component of methicillin resistance) and fem A genes in a duplex PCR technique. A multiplex PCR test based on the simultaneous amplification of the five genes genes; sea 102bp, seb 164bp, sec 451bp, sed 278 bp and see 209bp was conducted to directly detect the toxin gene content. Our results had showed that most of MRSA samples harbored at least one enterotoxin gene. Multiple toxin gene combinations were also observed. Using this PCR assay we found that among the MRSA strains obtained (n=20). The most commonly found gene was the enterotoxin A sea (n: 18, 90%), which was found alone and together with other toxin genes.

نظراً لتزايد الاهتمام حول سلالات بكتريا المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين, تم استخلاص المادة الوراثية باستخدام الطريقة الاعتيادية (طريقة الفينول-كلوروفوم) حيث تراوحت تراكيز المستخلص ونقاوته بين ng/µl) 100-800 1.6-1.8( تم التحري عن الجينات التي تشفر لأنواع الذوفانات المعوية الخمسة الرئيسة لعشرين عزله بعد ان تم تشخيصها على المستوى الجزيئي الى سلالات مكورات عنقوديه ذهبيه مقاومه للمثيسيلين باستخدام البادئات fem A و mec A )إذ يعّد الأخير مفتاح المكون الجيني الرئيس لمقاومة المثيسيلين( في تقنية تفاعل انزيم البلمره المزدوج وذلك بأستخدام طريقة تفاعل البلمره المتسلسل حيث تعتمد تقنيه تفاعل البلمره المتعدد على تضاعف الخمس جينات سويةً : sea 102bp, seb 164bp, sec 451bp, sed 278 bp and see 209bp .أظهرت نتائج دراستنا بأن اغلب السلالات قد احتوت على الأقل على واحد من هذه الجينات. لوحظ أيضاً وجود مزيج من الجينات. كان جين الذوفان المعوي نوع sea هو الأكثر تواجد ضمن عيناتنا (من أصل 20 عزله أعطى نسبة 90%).


Article
A Study of Some Physiological and Molecular Variables for Infertility Women in Anbar Province-Iraq
دراسة بعض المتغيرات الفسلجية والجزيئية لعقم النساء في محافظة الأنبار- العراق

Loading...
Loading...
Abstract

Infertility is a global health problem and one of the major problems in many countries, including Middle East, this phenomenon grow in recent years, as the world has seen a rise in the rates of infertility, especially women infertility, so this study conducted to find some reasons of unexplained women infertility. The current study included (100) infertile women in Anbar province, the ages ranged from 20-45 years of revisions to Al-Ramadi Education Hospital for women and pediatric and some medical clinics in a number of cities and districts of Anbar province, through the period from September / 2013 to January / 2014, in addition to (40) healthy women who did not have any history or clinical signs of infertility and their ages matches of the study group, the results of the current study showed that the proportion of primary infertility in Anbar province, the highest of secondary infertility, amounting to 60% and 40% respectively. The study also included some hormonal tests to members of study and control samples included measurement of Luteal hormone concentration (LH), Follicle Stimulation hormone (FSH), Prolactin hormone (PRL) and Testosterone Hormone (Testo) to excluding any sample suffer from hormonal disorders the study showed a significant increase P≤0.05 in the concentrations of infertile women hormones as compared with the control group, and it was found among the (100) infertile women that 59 (59%)women have different hormonal disorders. A molecular study of 28 infertile woman (do not suffer from any hormonal disorders) in addition to (30) healthy women from the control samples for the detection of polymorphism and disorders that may occur to the aromatase gene CYP19A1 using a pair of specific primers designed throughout this study to determining its relationship with unexplained infertility in women, and showing that there disorders in 25 (89.3%) sample of infertile women ranged from the absence of the primers bands or appearance differs from the expected size while the control group did not show any disturbance.

يعد العقم مشكلة صحية عالمية وهي من المشاكل الرئيسية في العديد من البلدان بما في ذلك الشرق الاوسط التي اخذت بالازدياد في الآونة الاخيرة اذ شهد العالم ارتفاعاً في معدلات العقم ولاسيما العقم عند النساء لذا صممت الدراسة لمعرفة اسباب العقم. شملت الدراسة الحالية (100) امرأة مصابة بالعقم في محافظة الانبار تراوحت اعمارهن بين 20-45 سنة من المراجعات لمستشفى الرمادي التعليمي للنسائية والأطفال وبعض العيادات الطبية في عدد من مدن واقضية محافظة الانبار للفترة من أيلول/2013 ولغاية كانون الثاني/2014 بالإضافة الى (40) امرأة سليمة ليس لديهن تاريخ اصابة او دلائل سريرية على اصابة محتملة بالعقم ومطابقات عمرياً للمجموعة المرضية , أوضحت نتائج الدراسة الحالية بأن نسبة العقم الأولي في محافظة الانبار أعلى من العقم الثانوي اذ بلغت (60،40%) على التوالي. كما اشتملت الدراسة اجراء بعض الفحوصات الهرمونية لأفراد عينتي الدراسة تضمنت قياس تركيز هرمون Lotine hormone (LH) و Follicle Stimulation hormone (FSH) و Prolactin hormone (PRL)و Testosterone Hormone (Testo)لغرض استبعاد اي عينة تعاني من اضطرابات هرمونية وتبين حدوث ارتفاع معنوي P≤0.05 في تراكيز الهرمونات لدى النساء العقيمات مقارنة بمجموعة السيطرة ، اذ وجد انه من بين الـ(100) امرأة عقيمة 59 (59%) امرأة مصابة باضطرابات هرمونية مختلفة. تم اجراء الدراسة الجزيئية لـ(28) امرأة عقيمة (لا تعاني من اي اضطرابات هرمونية) بالإضافة الى (30) امرأة سليمة من عينة السيطرة كمجموعة مقارنة للكشف عن تعدد الاشكال والاضطرابات التي قد تطرأ على الجين اروماتيزCYP19A1 باستخدام زوج من البادئات المتخصصة المصممة اثناء الدراسة للجين المذكور لغرض تحديد علاقته بالعقم غير المفسر عند النساء وتبين حدوث الاضطرابات في 25 (89.3%) عينة من النساء العقيمات تراوحت بين غياب حزم البادئ او ظهورها بحجم يختلف عن الحجم المتوقع في حين لم تظهر مجموعة السيطرة اي اضطرابات للجين المذكور.


Article
Using of Species-Specific Primers for Molecular Diagnosis of in Vitro Promastigotes of Leishmania donovani
استخدام بادىء متخصص للتشخيص الجزيئي لطفيلي اللشمانيا الاحشائية للاطوار المسوطة خارج الجسم الحي

Authors: Farah Tariq Yaseen فرح طارق ياسين --- Hayder Z. Ali حيدر زهير علي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 2A Pages: 824-829
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Visceral Leishmaniasis (VL) is a disseminated protozoan infection caused by Leishmania donovani parasites which affects almost half a million persons annually. Classical diagnosis methods of VL still not very sensitive and time consuming. In this study, we reported the success of polymerase chain reaction (PCR) method to identify L. donovani based on kinetoplast deoxyribonucleic acid (kDNA) for the diagnosis of the parasite using in vitro promastigote cultures. LdI species - specific primer was used to identify L. donovani and the result showed a single band of about ~600bp. It can be recommended that this primer is to be used for detection the visceral L. donovani

داء الليشمانيات الحشوي (VL) هواصابة بابتدائيات منتشرة تسببها طفيلي Leishmania donovani الذي يصيب ما يقرب من نصف مليون شخص سنويا. طرق التشخيص التقليدية للشمانيا الحشوية لا تزال غير حساسة للغاية وتستغرق وقتا طويلا. في هذه الدراسة، تم استخدام طريقة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) لتحديد Leishmania donovani على أساس حمض النووي الرايبي منقوص الأكسجين (kDNA) لتشخيص الطفيلي باستخدام الاطوار المسوطة المزروعة. وقد استخدم باديء LdI للكشف عن L. donovani وأظهرت النتيجة وجود حزمة واحدة~600bp وبذلك يمكن استخدام هذا الباديء للكشف عن الشمانيا الحشوية L. donovani.

Keywords

L. donovani --- PCR --- specific primers


Article
Genotyping of Klebsiella spp. isolated from different clinical sources
التنميط الجيني لبكتريا Klebsiella spp المعزولة من مصادر سريرية مختلفة

Authors: Dalal S. Al- Rubaye دلال صالح الربيعي --- Heba Mohammed Hamza هبة محمد حمزة --- Thanaa R. Abdulrahman ثناء رشيد عبد الرحمن
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 3B Pages: 1937-1951
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 172 clinical were obtained over 6 months. Klebsiella spp. was detected in 58 (33.7%) samples with a high percentage 29 (50%) in urine in female and low percentage 1(1.7%) in pus and burn swabs in male, and the vaginal swab was 1(1.7%). The female to male ratio was 3.1:1. PCR detection showed that 51(87.93%) out of 58 produce 108 bp. product with rpoB specific primer that represented K. pneumonia. Whereas 7(12.07%) showed PCR product with 343 bp by K. oxytoca specific primer (peh X), furthermore, the sequences of two selected isolates showed that the species related to K. oxytoca strain CAV1335, and to K. oxytoca strain CAV1374. Five selected isolates were re-tested by the gyr A primer, all were showed specific band product with 441bp. Sequencing blast analysis for these isolates showed that one was related to K. pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJF999, two isolates related to K. pneumoniae strain 17265 GyrA, one related to K. oxytoca strain 7102 GyrA and one related to K. pneumonia isolate 103 GyrA gene. Phylogenetic tree analysis showed the relation of 3 K. pneumoniae isolates to USA and UK strains and one with the Asian strains, and 2 K. oxytoca isolates have a relation within the Iranian strains and one has a genetic variation.

جمعت 172 عينة سريرية على مدى اكثر من ستة أشهر، وتم الكشف عن الكليبسيلا في 58 (33.7%) عينة وكانت اعلى نسبة 29 (50%) في عينات الادرار في النساء, واقل نسبة 1 (1.7%) من مسحات القيح والجروح في الدكور وبنفس النسبة في مسحات المهبل. وأشارت النتائج إلى أن نسبة عزلات الكليبسيلا في الإناث إلى الذكور هي 1:3.1. اظهر فحص انزيم البلمرة المتسلسل أن نسبة 51 (87.98%) من اصل 58 باستخدام بادئ rpo B قطعه بحجم 108 والتي تشير الى pneumoniae K. . بينما اظهرت 7(12.07%) قطعة بحجم 343 بأستخدام بادئ pehx الخاص ببكتيريا K.oxytoca وكان تطابق تسلسل القواعد النتروجينية لعزلتين منتخبتين منها الى انها ترجع الى K. oxytoca strain CAV1374و K. oxytoca strain CAV1335 تم اختبار خمس عزلات منتخبة باستخدام بادئ gyra واظهرت قطعة بحجم 441 باستخدام طريقة انزيم البلمرة المتسلسل للقواعد النتروجينة الى ان واحدة تعود الى K. pneumoniae subsp. Pneumonia strain RJF999 واثنين الى K. pneumonia strain 17265 GyrA وواحدة K.oxytoca strain 7102 GyrA وواحدة الى K.pneumonia isolate 103 . اظهر فحص شجرة العائلة الى ان ثلاث عزلات من K.pneumoniaقريبة بصفاتها من العزلات الامريكية والبريطانية وواحدة قريبة من صفات العزلات الاسيوية بينما كانت عزلتين K.oxytoca قريبة بصفاتها من العزلات الايرانية وعزلة واحدة مغايرة وذات صفات جينية بعيدة.

Keywords

K.oxytoca --- PCR --- sequencing --- phylogeny


Article
-DIAGNOSIS OF CARRIER STATE OF FOOT AND MOUTH DISEASE VIRUS IN VACCINATED AND UNVACCINATED CATTLE BY RT-PCR

Author: Hazim T. Thwiny
Journal: Basrah Journal of Veterinary Research. مجلة البصرة للابحاث البيطرية ISSN: Print:18138497 E; 24108456 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 2 Pages: 30-38
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of present work were to investigate the carrier state to foot and mouth disease virus in vaccinated cattle (vaccinated carriers) and unvaccinated cattle (unvaccinated carriers). Reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) technique was employed to detect FMDV from esophageal and pharyngeal fluid samples collected from both vaccinated and unvaccinated cattle. Results have been shown that the persistence of FMDV is significantly higher in unvaccinated cattle in comparison to vaccinated animals. It have been concluded that high vaccination trials were play a role in the elimination of carrier status from cattle.

Keywords

RT-PCR --- Cattle --- Vaccinated animals


Article
HUMAN PAPILLOMA VIRUS TYPES 16 AND 18 IN A SAMPLE OF IRAQIS PATIENTS PRESENTED WITH ORAL CANCER

Authors: Maysaa K Al-Malkey ميساء كاظم المالكي --- Ahmed A.H. Abbas احمد عبد الحسن عباس --- Nahi Y. Yaseen
Journal: IRAQI JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES المجلة العراقية للعلوم الطبية ISSN: P16816579,E22244719 Year: 2016 Volume: 14 Issue: 2 Pages: 174-181
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Background:Oral squamous cell carcinoma is the most common malignant neoplasm of oral mucosa. Human papilloma (HPV) virus cause a broad scope of diseases from benign to invasive tumors, types 16 and 18 classified as carcinogenic to humans.Objective:To assess the occurrence rate of human papilloma virus genotypes in oral cancer patients and their association with various risk factors. Methods:Fifty five (55) unstimulated whole saliva samples were collected from 35 histopathologically confirmed patients with oral cancer and 20 apparently healthy subjects were enrolled in this study. Genomic DNA was extracted from exfoliate cells to amplify HPV-DNA using HPV-L1 gene sequence primers by polymerase chain reaction method, the viral genotyping was performed using direct sequencing method. Results:The mean age of patients group was 52.23±13.73 years, while in healthy subjects group was (50.55±12.5) years. Risk of smoking was highly significant with odds ratio 60.79 and a 95% confidence interval of 3.40-1086.71. However, the risk of alcoholism was significant with odds ratio 27.77 and a 95% confidence interval of 1.51-511.27. Forty-six percent (16/35) of oral cancer patients were positive for detection of HPV-DNA (P < 0.0002). The most frequent HPV genotypes in patients group was HPV-18 accounting for (31%) of cases (P < 0.05). The rate of HPV was significantly higher among younger ages (< 50 years) with P = 0.042. In addition, the rate of HPV was higher with other variables (male, tongue tissue, grade I differentiation, squamous cell carcinoma) with no significant association (P = 0.273, P = 0.739, P = 0.173, and P = 0.700 respectively).Conclusion:Human papilloma virus types 16 and 18 may be a risk factor for oral cancer independent of alcohol and tobacco. Keywords: OC, HPV, OSCC, PCR, Direct sequencing

Keywords

OC --- HPV --- OSCC --- PCR --- Direct sequencing

Listing 1 - 10 of 86 << page
of 9
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (86)


Language

English (60)

Arabic (13)

Arabic and English (10)


Year
From To Submit

2016 (86)