research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
ENUCLEATION... THE STARTING POINT FOR BIOLOGICAL CLONING
إزالة (فصـع) الأنوية ... نقطـة البدايـة للإستنسـال البـايـولـوجـي

Author: أياد محمد علي فاضل
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2011 Volume: 10 Issue: 2 Pages: 149-167
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The Enucleation Technique considered as the first and most important step to accomplishe any biological cloning process which includes also Fusion; Activation ,and Embryo transfer. This Review Article was carried out to elucidate, the different Enucleation methods since the first attempt of “Brigg”and “King” (1952) and by others till (2011) including the physical methods such as UV Irradiation to Enucleate the Amphibian nuclei or using Microsurgery and/or both Techniques. The Microsurgery technique includes two methods: the Enucleation of nuclei of the MII Oocyte and the Enucleation of nuclei of the Telophase II Oocyte. The review article includes also the Enucleation using the chemical methods which includes the cytochalsin B; Enucleation using Hypertonic solution; and Enucleation using Demecolcine and Nocadazole.

تُشكل تقنية إزالة الأنوية (الفصع) من البيوض الخطوة الأولى والأكثر حرجاً من خطوات نجاح عملية الإستنساخ البايولوجي اللاحقة والتي تشمل مجموعة من الخطوات كالاندماج، التنشيط، غرس الأجنة، ثم متابعة الجنين النامي .أُجريت هذه الدراسة المرجعية لغرض توضيح التقنيات والأساليب المختلفة المستعملة في إزالة الأنوية منذ المحاولات الأولى التي أجراها العالمان Briggs وKing في عام 1952 ولغاية 2011 وذلك بإستعمال الطرق الفيزيائية في إزالة أنوية البرمائيات بإستعمال الأشعة فوق البنفسجية (UV) أو الجراحة المجهرية أو بكلاهما وتمثل الجراحة المجهرية بإستعمال أبر الحقن المجهرية من التطورات المهمة التي تتضمن أسلوبين هما إزالة أنوية بيوض الطور الاستوائي الثاني MII وإزالة أنوية بيوض الطور النهائي تضمنت الدراسة أيضا إزالة الأنوية بالطرق الكيميائية والتي شملت طريقة إستعمال السايتوكالاسين وإزالة الأنوية بإستعمال المحاليل مفرطة التوتر وإستعمال ألديميكيوليسن وأخيرا التنشيط بالنوكادوزول.


Article
The Effect of different Nitrogen Sources in the growth and antibiotic production in Streptomyces
تأثير استخدام مصادر نتروجينية مختلفة في نمو وإنتاج المضادات في بكتريا الستربتومايسس

Author: Fadhil, Ayad M.Ali أياد محمد علي فاضل
Journal: Tikrit Journal of Pure Science مجلة تكريت للعلوم الصرفة ISSN: 18131662 Year: 2011 Volume: 16 Issue: 2 Pages: 147-152
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

A solid culture media containing different Nitrogen sources were used for to study their effects on the growth and antibiotic production of selected strains of Streptomyces spp.Results indicates that the casein hydrolysate was the best nitrogen source for antibiotic production in most of the tested Streptomyces strains, the second best nitrogen source was the amino acid L-Asparagine ; then NF4No3 , the latter better than the Ammonium sulfate.Results also indicated that None of the tested Streptomyces strains were capable to produce antibiotics in the medium containing urea as the sole nitrogen source.

لدراسة تأثير مصادر نتروجينية مختلفة في نمو وانتاج مضادات الحيوية في سلالات مختلفة منبكتريا الستربتومايسس استخدمت اوساط زراعية صلبة حاوية على مصادر نتروجينية مختلفة.اظهرت النتائج ان متحلل الكازائين هو المصدر النتروجيني الافضل لانتاج مضادات الحيوية في اغلب سلالات بكتريا الستربتومايسس المختبرة، يليه الحامض الاميني لـ اسباراجين ، ثم نترات الامونيوم وبصورة افضل من المصدر النتروجيني كبريتات الامونيوم . واخيراً اظهرت النتائج عدم قدرة جميع السلالات على انتاج مضادات الحيوية في الوسط الحاوي على اليورياكمصدر نتروجيني ، كذلك بينت النتائج عدم وجود ارتباط مباشر بين القدرة علىانتاج المضاد ونمو البكتريا ستربتومايسس.

Keywords


Article
THE PRESERVATIVE EFFECT OF TREHALOSE
التأثيرات الحافظة لسكر التريهالوزعلى البكتريا

Author: بسام سمير محمد رؤوف أياد محمد علي فاضل
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2011 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 95-104
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACT Two isolates Staphylococcus aureus and Escherichia coli were used in this study, Results showed that bacteria treated with 100 mM Trehalose was able to preserved S.aureus from drying for one month in room temperature, while no effect was observed in the Trehalose treated E.coli. Results also indicated that Trehalose preservative effects were for month. The survival percentage of S.aureus treated with Trehalose after 1 month was 67% compared with the control 30%, while the results of E.coli was 66% compared with the control 32%. Results also indicated that Trehalose can protect the lyophilized bacteria stored in room Temperature for 4 months. The percentage of the viable cells of bacteria was 27% compared with the control 2%. Results also revealed that the protective effects of Trehalose reduced the lethal effects of UV Irradiation. Results indicated that S.aureus treated with Trehalose was more resistance to Tetracycline, Gentamycin, Erythromycin and Norfoxacin, Antibiotics in comparison with the control treatment, while no effect was indicated in the trehalose treated E.coli resistance ability to these antibiotics.

الخلاصة أُستعملت عزلتان من البكتريا إحدهما تعود إلى جنس المكورات الذهبية الأخرى لبكتريا القولون. أظهرت النتائج بأن معاملة البكتريا بـ 100 ملي مولار تريهالوز له القدرة على حفظ بكتريا المكورات العنقودية من الجفاف ولمدة شهر في درجة حرارة الغرفة الاعتيادية، في حين لم يلاحظ أي تأثير في بكتريا القولون المعاملة بنفس النسبة من التريهالوز. بينت النتائج التأثير الحافظ لسكر التريهالوز في حالة خزن البكتريا في ظروف الانجماد و لمدة أربعة أسابيع وكانت نسبة بقائية بكتريا المكورات الذهبية 67% مقارنة مع السيطرة بنسبة 30% بينما كانت النتائج في بكتريا القولون 66% والسيطرة 32%. وأشارت النتائج أيضاً إلى قدرة الحماية التي يوفرها السكر للبكتريا المجفدة المخزونة في درجة حرارة الغرفة ولمدة 4 أشهر، حيث كانت نسبة البقائية للبكتريا المعاملة بالتريهالوز 27% والسيطرة 2%. أظهر التريهالوز تأثيرات الحماية للبكتريا من الأشعة فوق البنفسجية.بينت النتائج المعاملة بالتريهالوز ان بكتريا المكورات العنقودية الذهبيةأصبحت أكثر مقاومة لمضادات Norfloxacin, Erythromycin, Tetracycline Gentamycin, في حين بقت بكتريا السيطرة حساسة لها، ولم يظهر أي تأثير للتريهالوز في مقاومة بكتريا القولون لمضادات الحيوية.


Article
Molecular diagnosis of E.coliO157:H7 Which Isolated from Children with Diarrhea by using Multiplex PCR
التشخيص الجزيئي لبكتريا E.coliO157:H7المعزولة من براز أطفال مصابين الإسهال باستخدام Multiplex Polymerase Chain Reaction

Authors: Ayad M.Ali أياد محمد علي فاضل --- Amna N. Jassim آمنة نصيف جاسم --- Shatha T. Ahmed شذى ذنون أحمد
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2010 Volume: 7 Issue: عدد خاص بمؤتمر العلمي النسوي 1 Pages: 207-215
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 96 stool samples were collected from children with bloody diarrhea from two hospitals in Baghdad. All samples were surveyed and examined for the presence of the Escherichia coli O157:H7 and differentiate it from other Non -Sorbitol Fermenting Escherichia coli (NSF E. coli). The Bacterial isolates were identifed by using morphological diagnostic methods, Samples were cultured on liquid enrichment medium, incubated at 37C for 24 hrs, and then cultured on Cefixime Tellurite -Sorbitol MacConkey Agar (CT- SMAC). 32 non-sorbitol fermenting bacterial isolates were obtained of which 11 were identified as Escherichia coli by using traditional biochemical tests and API20E diagnostic system without differentiation between serotype O157:H7 and other NSF E. coli isolates . Four special biochemical tests were done for serotype O157:H7 differentiation from other NSF bacteria. Only 3 isolates belonging to the serotype O157:H7 were obtained . Latex agglutination test for O157 and H7 showed that the 3 isolates gave positive results with both tests. The Bacterial isolates were identifed by using Multiplex Polymerase Chain Reaction (MPCR) technology for the presence or absence of 4 genes (Stx1, Stx2, hlyA and eaeA) that encode for main virulence factors to diagnose E. coli O157:H7 isolated By using specific primers in MPCR . The result showed that one E. coli O157:H7 isolates contain all 4 genes , other isolates contain 3 genes: Stx2, hlyA & eaeA.

جمعت 96 عينة براز لأطفال مصابين بالإسهال الدموي من مستشفى أطفال العلوية ومستشفى المنصور التخصصي. اجري المسح لجميع العينات للتحري وعزل بكتريا Escherichia coli O157:H7 وتمييزهــا عــن باقـي ســلالات E.coli غيــر المخــمرة للسور بتول Non-Sorbitol Fermenting Escherichia coli ((NSF E.coli. شخصت العزلات البكتيرية بإستخدام طرائق التشخيص المظهري حيث زرعت العينـات على وسـط اغنائي سـائل وحضنت بــدرجة حرارية 37 م لمدة 24 ساعة تبعها الزرع على وســط Cefixime - Tellurite Sorbitol MacConkey Agar (CT-SMAC). تم الحصول على 32 عزلة بكتيرية غيرمخمـرة للســوربتول شـخص منها 11 عزلة E.coli وذلك باستخدام الاختبارات الكيموحيوية التقليدية ونظام التشخيص API20E والتي لم تعطِ نتائج كافية تمكن من تفريق النمط المصلي O157 بشكل نهائي عن باقي عزلات NSF E.coli. أجري أربع اختبارات كيموحيوية خاصة لتشخيصE.coli النمط المصلي O157:H7وتمييزه عن باقي NSF E.coli وأظهرت النتائج أن3 عزلات فقط كانت من النمطO157:H7 ، ثم اجري فحص التلازن بحبيبات اللاتكس المرتبطة بالأجسام المضادة للـمستضدين O157 وH7 وأعطت العزلات الثلاث نتيجة ايجابية مع كلا العدتين. شخصت العزلات باستعمال تقنية التفاعل التضاعفي المتعدد لسلسلة الدنا( Multiplex Polymerase Chain Reaction)( (MPCR للكشف عن وجود أوغياب أربعة أنواع من الجينات هي Stx1 و Stx2 و hlyA و eaeA المشفرة لعوامل ضراوة رئيسية لتشخيص بكتريا E.coliO157:H7 المعزولة وذلك بأستخدام بادئات نوعية تستهدف مواقع متخصصة للجينات الهدف المذكورة انفاً وفي تفاعل واحد ، وأظهرت النتائج وجود تباين في المحتوى الجيني بين عزلات بكتريا E.coliO157:H7 حيث احتوت احدى العزلات على الجينات الأربعة بينما احتوت العزلتان الاخريتان على ثلاثة جينات هي Stx2 و hlyA و eaeA

Keywords

E.coliO157:H7 --- MPCR --- Stx1 --- Stx2


Article
THE EFFECT OF CHANGES IN CULTURE MEDIA, pH AND TEMPERATURE ON IN VITRO FERTILIZATION AND PREIMPLANTATION EMBRYONIC DEVELOPMENT OF MICE
أثير التغييرات في الأوساط الزرعية والباهاء ودرجة الحرارة على الاخصاب الخارجي وتطور الأجنة قبل الانغراس في الفئران

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACTThe present study was conducted to investigate the effect of different typesof culture media, degrees of temperature of culture medium and wide range ofpH within culture medium on the percentages of in vitro fertilization of mouseoocytes and embryonic development. Nine hundred and twenty four oocyteswere recovered from eighty one superovulated mice. Groups of mature oocyteswere incubated with active spermatozoa within different culture media (Ham’sF-10, Medi-Cult. IVF, TCM-199, Earl’s + TCM-199 and RPMI-1640) atdifferent degrees of temperature (36, 37, 38 and 39), as well as, the pH of culturemedium was changed (range: 6.9-8.1) in 5% CO2 for 18-20 hour. Percentages ofin vitro fertilization and abnormal embryonic development were assessed.The best results for IVF and normal embryonic development wereachieved with RPMI-1640 medium at temperature 37 oC and acidity (7.3-7.4) ofmedium. However, best results for in vitro development of mouse embryos wereobtained by using TCM-199 medium and Ham’s F-10 medium at temperature36 oC and acidity (7.3-7.4). In conclusion, the mouse spermatozoa and oocytesare highly sensitive to changes in the environmental conditions. In addition,conditions of culture medium and its selection are may be the main limitedfactor for improvement in vitro fertilization and embryonic development inmice. Further biochemical and molecular studies are recommended to assess theeffect of culture medium on content of RNA and protein synthesis of differentstages of mouse embryo.Key words: Superovulation, in vitro fertilization and embryonic development.PDF created

(Culture medium) أجريت هذه الدراسة لمعرفة تأثير أنواع مختلفة من الأوساط الزرعيةعلى النسب المئوية للأخصاب الخارجي (pH) ومدى واسع من الباهاء (Temperature) ودرجات الحرارةفي الفئران. فقد أستردت (Embryonic development) وتطور الاجنة (In vitro fertilization)تسعمائة وأربع وعشرين بويضة من أحدى وثمانين أنثى فأر محفزة هرمونياً لاحداث افراط الاباضةثم حضنت مجاميع البويضات الناضجة مع نطف نشيطة في عدة أوساط زرعية .(Superovulation)و (Earl’ + TCM- و ( 199 (TCM- و ( 199 (Medi-Cult. IVF) و (Ham’s F- وتشمل ( 10وبدرجات حرارية متعددة ( 36 و 37 و 38 و 39 ) ه م، بالاضافة الى احداث تغييرات ،(RPMI-1640)8.1 ) الوسط الزرعي وبظروف حضن هي 5 % من غاز ثاني أوكسيد الكاربون – في باهاء (المدى 6.920 ساعة. تم تقييم النسب المئوية لاخصاب البويضات وتطور الاجنة خارج الجسم في – لفترة 18 (CO2)الفئران.تم تحقيق أفضل النتائج للأخصاب الخارجي وتطور الاجنة الطبيعي بأستخدام الوسط7.4 ). وعلى أي – وبدرجة حرارة ( 37 ) ه م وحموضة الوسط الزرعي ( 7.3 (RPMI- الزرعي ( 1640TCM-) حال تحققت أفضل النتائج بالنسبة لنمو الاجنة خارج الجسم باستخدام الوسطين الزرعيين7.4 ). نستنتج ان – وبدرجة حرارة ( 36 ) ه م وحموضة الوسط الزرعي ( 7.3 (Ham’s F- 199 ) و ( 10نطف وبويضات الفئران ذات حساسية عالية للتغييرات في الظروف المحيطة. كذلك تعتبر ظروف الوسطالزرعي واختيارها هو عامل محدد رئيس لتحسن الاخصاب الخارجي وتطور الاجنة خارج الجسم فيالفئران. نوصي باجراء دراسات جزيئية وكيموحيوية أضافية لتقييم تأثير الوسط الزرعي على محتوى الرنالمختلف مراحل أجنة الفئران. (Protein synthesis) وتصنيع البروتين (RNA)


Article
Isolation and characterization E. coli O157:H7 from meat &cheese and detection of Stx1, Stx2, hlyA, eaeA by using multiplex PCR
عزل وتوصيف بكتريا E. coli O157:H7 من اللحم والجبن والكشف عن جينات Stx1 و Stx2 و hlyA و eaeA باستخدام تقنية Multiplex PCR

Loading...
Loading...
Abstract

total of 189 samples were collected from 74 raw uncooked minced beef meat, 115 local white cheeses from 3 different areas in Baghdad. All samples were surveyed and examined for the presence of the Escherichia coli O157:H7 and differentiate it from other Non -Sorbitol Fermenting Escherichia coli (NSF E. coli). The Bacterial isolates were identified by using morphological diagnostic methods; Samples were cultured on liquid enrichment medium, incubated at 41.5Cº for 6 hrs, and then cultured on Cefixime Tellurite -Sorbitol MacConkey Agar (CT- SMAC). 66 non-sorbitol fermenting bacterial isolates were obtained of which 13 were identified as Escherichia coli from (6 meat and 7 cheese samples). By using traditional biochemical tests and Api20E diagnostic system without differentiation between serotype O157:H7 and other NSF E. coli isolates. Four specific biochemical tests (Cellobiose fermentation, β-Glocuronidase production, KCN and Enterohemolysin production) were done to differentiate serotype O157 differentiation from other NSF bacteria. Only 2 isolates belonging to the serotype O157 were obtained of which one isolate from meat and other isolate from cheese. Latex agglutination test for O157 and H7 showed that the 5 isolates gave positive results with both kits. The Bacterial isolates were identified by using Multiplex Polymerase Chain Reaction (MPCR) technology for the presence or absence of 4 genes (Stx1, Stx2, hlyA and eaeA) that encode for main virulence factors to diagnose E. coli O157:H7 isolated from various sources by using specific primers in mPCR. The result showed that gene content variety in two E. coli O157:H7 isolates, 1 from meat contain all 4 genes and other isolate from cheese contains 2 genes: Stx1 and hlyA .

تم جمع 189عينة غذائية مختلفة اشتملت على 74 عينة لحم بقري مفروم ، 115 عينة جبن أبيض محلي من ثلاث مناطق من بغداد (الصدرية ، أبو غريب ، الفضيلية) ، أجــري المسح لجميع العينــات للتقصي عن وجود بكتريــا Escherichia coli من النمط المصلي O157:H7 وتمييزهــا عــن باقـي ســلالات ايشـيـريشـيا القولــون غيــر المخــمرة للســوربتول Non-Sorbitol fermenting Escherichia coli (NSF E.coli) . زرعت العينات على وسـط اغنائي سـائل(Enrichment broth) وحضنت بــدرجة حرارة 41.5 م لمدة 6 ساعات تبعها الزرع على وسـط اكار الماكونكي الحاوي على سـكر السوربتول والمضاف اليه مضــاد الحيويــة الــسفكسـيم وملح التيلورايــت Cefixime Tellurite - Sorbitol MacConkey Agar)) (CT-SMAC) . تم الحصول على 66 عزلة بكتيرية غيرمخمـرة للســوربتول شـخص منها 13عزلـة ايشــيريشيا القولـون (6 عزلات من اللحم و 7 عزلات من الجبن) وذلك باستخدام الاختبارات الكيموحيوية التقليدية ونظام التشخيص Api20E والتي لم تعطِ نتائج كافية تمكن من تفريق النمط المصلي O157:H7 بشكل نهائي عن باقي عزلات NSF E.coli. أجريت أربع اختبارات كيموحيوية خاصة لتشخيص النمط المصلي O157وتمييزه عن باقي انواع البكتريا غير المخمرة للسوربتول(اختبار تخمر السليوبايوز ، انتاج انزيم β-Glocuronidase ، النمو بوجود سيانيد البوتاسيوم وانتاج الانتيروهيمولايسين) حيث أظهرت النتائج عائدية عزلتان فقط إلى المجموعة المصليةO157 )عزلة واحدة من عينات اللحم وعزلة واحدة من عينات الجبن( ، تم إجراء فحص التلازن بحبيبات اللاتكس المرتبطة بالأجسام المضادة للـمستضدين O157 وH7 وأعطت العزلتان نتيجة ايجابية . شخصت العزلات باستعمال تقنية التفاعل التضاعفي المتعدد لسلسلة الدنا(Multiplex Polymerase Chain Reaction) ( (MPCR للكشف عن وجود أو غياب أربعة أنواع من الجينات هي Stx1 ، Stx2 ، hlyA ، eaeA المشفرة لعوامل ضراوة رئيسية لتشخيص بكتريا E.coliO157:H7 المعزولة وذلك بأستخدام بادئات نوعية تستهدف مواقع متخصصة للجينات الهدف المذكورة أنفا وفي تفاعل واحــد ، وأظهرت النتائج وجــود تباين في المحتوى الجيني بين عزلات بكتريــا E. coli O157:H7 فقد احتوت احدى العزلات (من اللحم) على الجينات الأربعة بينما احتوت العزلة الثانية (من الجبن) على اثنين من الجينات فقط هي Stx1 وhlyA.

Keywords

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

Arabic (4)

English (2)


Year
From To Submit

2011 (4)

2010 (1)

2007 (1)