research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Use Box –PCR to Study Genetic Relatedness of Some Pseudomonaus aeruginosa Isolates from Different Clinical and Environmental Sources In Baghdad
"استعمال BOX-PCR لدراسة التقارب الوراثي لبعض من بكتريا Pseudomonaus aeruginosa المعزولة من مصادرمرضية و بيئية مختلفة في بغداد "

Author: Ebtesam H. Nassir ابتسام حمود ناصر
Journal: journal of the college of basic education مجلة كلية التربية الاساسية ISSN: 18157467(print) 27068536(online) Year: 2013 Volume: 19 Issue: 80 / علمي Pages: 724-732
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Totally twenty six different isolates of Pseudomonas aeuruginosa ( P. aeruginosa ) were collected ,sixteen clinical isolates ( 62% of total group ) were isolated from different samples ( Urine , blood , sputum , wound , ear , eye and throat swabs ) from Medical city hospital in Baghdad, and ten environmental isolates ( 38% of total group ) were isolates from different places of soil and water in the same city . All isolates were diagnosed by bacteriological and biochemical tests . The crude DNA was extracted from all clinical and environmental isolates . BOX-PCR was achieved using BOX1AR primer . The BOX-PCR products were analyzed by horizontal agarose gel electrophoresis . The dendrogram for all isolates was draw by using band-based Jaccard and Dice coefficients where the fingerprints were generated by banding patterns using un weighted pair-group method with arithmetic average ( UPGMA ) , in order to study the relatedness among the clinical and environmental isolates . The results were showed that the crude DNA was suitable to BOX-PCR , and presence of the high similarity in banding patterns of clinical and environmental isolates itselves , which was about 45%-99% and 61%-100% in Jaccard and Dice coefficients respectively . The similarity between these two groups was about 40% and 55% in Jaccard and Dice coefficients respectively . Although , the marked relatedness among all clinical and environmental isolates , this study was concluded presence of genetic variation between the clinical and environmental isolates of this opportunistic bacterium , by using BOX-PCR technique and BOX1AR primer

تم جمع ست و عشرون عزلة بكتيرية مختلفة من بكتريا Pseudomonas aeuruginosa، كان منها 16 عزلة مرضية أي 62 % من العدد الكلي للعزلات , معزولة من نماذج مختلفة ( ادرار و دم و قشع و جروح و مسحات الاذن و العين و البلعوم ) من مستشفى مدينة الطب في بغداد . و كان منها عشرة عزلات بيئية أي 38% من العدد الكلي للعزلات , معزولة من اماكن مختلفة من الماء و التربة في نفس المدينة . شخصت كل العزلات بألاختبارات البكتريولوجية و البايوكيميائية . تم استخلاص DNA الخام من كل من العزلات المرضية و البيئية . أنجز BOX-PCR بأستخدام البادئ BOX1AR , بعدها تم تحليل ناتج التضخيم BOX-PCR بأستخدام الترحيل الكهربائي الافقي بهلام الاكاروز . تم رسم Dendrogram لكل العزلات بأستخدام معاملان Jaccard و Dice معتمدة – الحزم , اذ أنجزت الطبعة الوراثية لنسق الحزم باستعمال UPGMA , لدراسة التقارب الوراثي بين العزلات المرضية و البيئية . بينت النتائج ان DNA الخام مناسب لأجراء BOX-PCR , و وجود تشابه كبير بين نسق الحزم الناتجه عن التضخيم للعزلات المرضية و البيئية نفسها , و التي كانت بحدود 45 % - 99% و 61% - 100% حسب المعاملان Jaccard و Dice على التوالي . اما التشابه بين هاتين المجموعتين كان بحدود 40% و 55% حسب المعاملان Jaccard و Dice على التوالي . بالرغم من العلاقة الملحوظة بين كل من العزلات المرضية و البيئية , استنتجت هذه الدراسة وجود تباين وراثي بين العزلات المرضية و البيئية لهذة البكتريا الأنتهازية بأستخدام تقنية BOX-PCR و بأستخدام البادئ BOX1AR .

Keywords


Article
عزل وتشخيص بكتريا Aeromonas hydrophila من مياه نهر دجلة و دراسة قابليتها على انتاج البروتيز و الهيمولايسين

Authors: رشا محمد ساجت العكيلي --- استبرق محمد علي سلمان العبيدي --- ابتسام حمود ناصر
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2017 Volume: 25 Issue: 1 Pages: 89-96
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Eighty water samples were collected from different locations of Tigris river, 25 isolates (30%) were isolated and identified as Aeromonas hydrophila using MiniApi32 E ,in addition to traditional routine methods .Their abilities for production of protease and hemolysin were tested. The results showed that all isolates were produced the protease and β- hemolysin

معت 80 عينة مياه من مناطق مختلفة من نهر دجلة, تم عزل 25 عزلة 30%)) تعود لبكتريا Aeromonas hydrophila وشخصت بأستعمال جهاز MiniApi32E اضافة الى الطرق الروتينية المعروفه، اختبرت قابليتها على انتاج البروتيز وذيفان الهيمولايسين .اظهرت النتائج ان جميع العزلات منتجة لانزيم البروتيز وذيفان الهيمولايسين نوع β .

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (2)


Year
From To Submit

2017 (1)

2013 (1)