research centers


Search results: Found 4

Listing 1 - 4 of 4
Sort by

Article
Screening Microbial Contamination ofSmoking Waterpipe (Narghile) in Erbil city/ Iraq

Authors: Salah Tofik JalalBalaky --- Payman Akram Hamasaeed --- Ahang Hasan Mawlood
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2018 Volume: 26 Issue: 5 Pages: 309-318
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Tobacco smoking, which is a traditional habit is a major health risk worldwide. However waterpipe (Narghile) smoking is an emerging smoking type, specifically among Erbil/ Iraq. In the recent years, smoking of Shisha (Narghile) has spread amongst adolescents and young adults in Erbil city. The aims of this study are to examine the prevalence of shisha pipe smoking in Erbil city and to determine the microbial pathogen contaminants present in these Shisha pipes. In this study, we performed a qualitative and quantitative analysis of the microbial contamination of (90) Shisha hose samples in Erbil. Eighteen samples were selected from each cafe and swabs were cultured and identified. Results showed that most Narghile users 82.2 % were male and half of them(50%) were in the age group of 20-30 years followed by the age group of 30-40 years.Data showed that 54% of the samples were contaminated, from them most microbial pathogens were G+ve bacteria. Staphylococcus albus and Staphylococcus aureus were among the most isolated pathogens, however E. coli was the most common G-ve bacteria in this study.On the other hand the number of fungi and yeasts identified in this study were 7 isolates, among them Monilia,Paecillomycet spp andAspergillus niger were most common isolates. In conclusion, data produced from this study showed that Narghile users are exposed to many infectious microbial agents, because many users are unaware of the associated microbial contaminations and smoke narghile as a safe alternative to cigarette smoking.More research, should focus on strategies on how to avoid shisha smoking as the impact of its use is expected to affect the health and life of many people in our local community.

إنّ تدخين التبغ عادة تقليدية وخطر صحي كبير في جميع أنحاء العالم. مع ذلك فإن الشيشة (الناركيلة) هي نوع من أنواع التدخين الناشئة تحديداً في مدينة أربيل/ العراق،حيث انتشرت الظاهرة في السنوات الأخيرة بين المراهقين والشباب في مدينة أربيل. تهدف هذه الدراسة إلى معرفة مدى انتشار تدخين الشيشة في مدينة أربيل وتحديدا التلوث الميكروبي الموجود في أنابيب الشيشة. أجرينا - في هذه الدراسة - تحليلاً نوعيًا وكميًا للتلوث الجرثومي ل (90) عينة خرطوم الشيشة. وتم اختيار ثمانية عشر عينة من كل مقهى ، وتم زرع المسحات وتشخيصها . أظهرت النتائج أن معظم مستخدمي النركيلة كانوا 82.20٪ ذكور ونصفهم (50٪) كانوا من الفئة العمرية 20-30 سنة، تلتها المجموعة العمرية 30-40 سنة. كما أظهرت البيانات أن 54٪ من العينات كانت ملوثة ، حيث شكلت بكتيرياالمجبة لصبغة كرام معظم المسببات الجرثومية، و أكثر العزلات هي البكتيريا العنقودية والمكورات العنقودية الذهبية ، إلا أنE. coli كانت أكثر البكترياالسالبة لصبغة كرام الشائعة في هذه الدراسة. ومن ناحية أخرى كان عدد الفطريات والخمائر المحددة في هذه الدراسة 7 عزلات ، من بينهاMonilia,Paecillomycet spp and Aspergillus niger، كانت الأكثر شيوعا.في الختام ، أظهرت البيانات التي تم الحصول عليها من هذه الدراسة أن مستخدمي الناركيلة يتعرضون للعديد من العوامل الجرثومية المعدية، لأن العديد من المستخدمين لا يدركون التلوث الجرثومي المرتبط بها ويدخنون النرجيلة كبديل آمن لتدخين السجائر. يجب أن يركز المزيد من الأبحاث على استراتيجيات كيفية تجنب تدخين الشيشة، حيث من المتوقع أن يؤدي تأثير استخدامه على صحة العديد من الأشخاص وحياتهم في مجتمعنا المحلي.


Article
Molecular detection of SHV-Type ESBL in E. coli and K.pneumoniae and their antimicrobial resistance profile
الاكتشاف الجزيئي لـ ESV-Type ESBL في E. coli و K.pneumoniae ومظهر مقاومتهما المضادة للميكروبات

Authors: Ahang Hasan Mawlood --- Sharmin Abdullah Omer --- Salah Tofik Jalal --- Sayran Hamad Haji
Journal: Zanco Journal of Medical Sciences مجلة زانكو للعلوم الطبية ISSN: 19955588/19955596 Year: 2018 Volume: 22 Issue: 2 Pages: 262-272
Publisher: Hawler Medical Univeristy جامعة هولير الطبية

Loading...
Loading...
Abstract

Background and objective: The increase in the incidence of Beta-lactam resistance in Gram-negative bacteria has become a main clinical problem worldwide that limits therapeutic options. The production of extended-spectrum blactamases is the major source of resistance to newer beta-lactam antibiotics in Enterobacteriaceae. This study aimed to check the presence of extended-spectrum β-lactamase producing K. pneumoniae and E. coli and the evaluation of ESBL among those isolates.Methods: A total of 120 E. coli and K. pneumoniae clinical isolates were obtained from Rizgary Teaching Hospital in Erbil City, Iraqi Kurdistan Region, during the first six months of 2016. All isolates were identified and checked for the production of ESBL using Vitek 2 automated system. The technique of PCR was performed for the detection of the presence of blaSHV gene from these isolates. The antibiotic resistant profiles for these isolates were also investigated.Results: The overall proportion of ESBL-producing E. coli and K. pneumoniae isolates, 77 (76.2%) and 15 (78.9%) isolates were ESBL producers, respectively. ESBL-producing isolates were significantly more resistant than Non-ESBL-producers (P < 0.05). PCR performed on 30 ESBL positive isolates, 21(70%) isolates were of E. coli, and 9 (30%) isolates were of K.pneumoniae. The ESBL B-lactamase related SHV gene was detected only in 11 (36.6%) isolates, 6 (28.5 %) of E. coli and 5(55.5%) of K. pneumoniae isolates respectively. All isolates were susceptible to carbapenems.Conclusion: The great diversity of ESBL and the prevalences of clinical isolates of E. coli and K. pneumoniae producing these enzymes indicate that this is an important problem in our region. The most active antimicrobial agent against isolates used in this study was carbapenem. It is, therefore strongly recommended to consider carbapenems as the drug of choice for such multi-drug resistant ESBL-producing microorganisms.

Keywords

ESBL --- blaSHV gene --- E. coli --- K. pneumoniae


Article
Molecular Diagnosis in Differentiating Active and Inactive Forms of Hepatitis B Virus Carriers

Authors: Salah Tofik Jalal Balaky --- Saeed Ghulam Hussain --- Amer Ali KhaleelcFurat Tahseen Sabeer --- Ahang Hasan Mawlood
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2018 Volume: 26 Issue: 10 Pages: 41-45
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Background & objectives:Introducing a nucleic acid test program is aimed to diagnose and reduces the risk of viral infection or transmission. DNA assay for HBV can detect infection in the windows period, chronic occult infection and can discriminate between active and inactive HBV infection. This cross-sectional study designed to diagnose, analyze HBV infection and to differentiate active from inactive infection based on viral DNA detection.Methods: Blood samples were collected from 256 patients previously diagnosed on the clinical ground as hepatitis B seropositive in Erbil Central Lab. The viral nucleic acid quantitative assessment was done for the collected samples using RT-PCR. Q-square was performed for statistical analysis. Results: Out of 256 collected blood samples 93 (36.3%) showed HBV-DNA positive titers above 50 IU/ml. Among positive subjects, 67 (72.04%) was categorized as inactive carriers (˂ 2000-20.000 IU/ml HBV-DNA titers). Conclusions:The data produced from this study confirmed the importance of the RT-PCR technique in sensitivity and reliability as a superior diagnostics tool specifically in differentiating active from inactive HBV carriers.

الهدف: استخدام برنامج اختبار الحامض النووي لغرض تشخيص العدوى الفيروسية وتقليل انتقالها. ان فحص الحامض النووي الرايبوزى منقوص الاوكسجين لفايروس التهاب الكبد نمط B.يمكن استخدامه في تشخيص العدوى من خلال فترة النافذة والمزمنة الغامض ايضا، اضافة الى ذلك استخدام هذه الطريقة تودئ الى تشخيص النوع الفعال وغير الفعال للفايروس. اجريت هذه الدراسة المقطعية لتشخيص وتحليل عدوى فايروس التهاب الكبد نمط B والتميز بين الشكل فعال وغير فعال اعتمادا على الفحص النووي المكتشفة.الطرائق: تم جمع256عينة الدم من اشخاص تعرضوا سابقا للاصابة بفايروس التهاب الكبد نمط B وارجعوا مختبر الصحة العامة المركزي في اربيل. تم استخدام طريقة تقنية عكس رد الفعل الناسخ البلمرة المتسلسلRT-PCR لغرض التشخيص الكمي للحامض النووي الرايبوزى منقوص الاوكسجين. حللت النتائج الدراسية الحالية اخصائيا باستخدام اختبار Q-square.النتائج: اظهرت النتائج ان 93 (36.3٪) عينة دم من مجموع 256 عينة تحمل قياس تاثير اعلى من 50 وحدة دولية لكل مل من ضمن الاشخاص الحاملين للفايروس. 67 شخص صنفوا على انهم حامل لفايروس اقل 2000-20.000 وحدة دولية/ مل.الاستنتاجات: اظهرت الدراسة الحالية اهمية استخدام تقنية عكس رد الفعل الناسخ البلمرة المتسلسل RT-PCR في حساسيتها وقوتها كاداة معتمدة للتشخيص وخاصة التميز بين الحالة الفعالة وغير الفعالة لحاملي فايروس نمط B.


Article
Evaluation of Invasive and Non-Invasive Methods for the Diagnosis of H. pylori in Dyspepsia Patients
تقييم للطرق الغازية والغير الغازية لتشخيص الملوية البوابة (H. pylori) في المرضى الذين يعانون من سوء الهضم

Loading...
Loading...
Abstract

Background: H. pylori has been established as the major causative agent of chronic gastritis, and represents the main etiological cause of other gastroduodenal diseases such as peptic ulceration, gastric lymphoma, and gastric cancer. Therefore, screening and treatment of the bacterium is an important strategy for preventing gastric cancer. Objective: To compare some invasive classical histological tests to non-invasive serological antibody and stool antigen tests for the diagnosis of H. pylori infections. Patients and Methods:The study population comprised of 171 patients with symptoms of dyspepsia and other gastritis related symptoms. Three biopsy specimens were taken and collected from the stomach and sent for histopathologic study. H and E staining and modified Giemsa staining were performed on tissue sections of each case. Serology antibody and Stool antigen tests were also used as nan-invasive tests in this study.Results: Four tests had been done to detect the presence of H. pylori Bacteria. The mean age (+ SD) of the studied sample was 43.8 + 14.7 years, ranging from 20 to 74 years. The median was 44 years. The total agreement between the serum Ab test and the stool Ag test was 88.3%. Significant differences were detected between the two tests (p < 0.001). It is evident that the serum Ab test is highly sensitive (sensitivity = 98.4%), but the Predictive value positive (76.3%) was not so high. The Giemsa test was highly specific (specificity = 98.2%), and highly sensitive (sensitivity = 93.5%). Conclusion: The main advantage of histopathology tests is not only restricted to detection purpose, it also can detect any abnormalities of gastric mucosa by bacteria such as peptic ulcer bleeding, atrophic gastritis, intestinal metaplasia, and gastric cancer. The modified Giemsa staining method could be used as a method of choice for the detection of H. pylori due to its sensitivity, simplicity and consistency.

خلفية الدراسة: تعتبر الملوية البوابية (H.Pylori) باللاتينية العامل الرئيسي المسبب لالتهاب المعدة المزمن وواحد من المسببات الرئيسية للأمراض المعدية الأخرى مثل تقرح هضمي ، سرطان الغدد الليمفاوية في المعدة وسرطان المعدة. لذلك فإن علاج و فحص البكتيريا هو إستراتيجية مهمة للوقاية من سرطان المعدة.اهداف الدراسة: هدفت هذه الدراسة إلى مقارنة بعض الاختبارات النسيجية الكلاسيكية الغازية مع اختبارات الأجسام المضادة المصلية غير الغازية واختبارات المستضد البرازي. المرضى والطرائق: دراسة على المجتمع تضمنت مرضى عددهم الكلي 171 مريضا يعانون من أعراض عسر الهضم وغيرها من الأعراض ذات الصلة بالتهاب المعدة. تم أخذ ثلاث عينات خزع نسيجية من المعدة وإرسالها لإجراء الدراسة النسيجية. تم اجراء تلطيخ بالصبغتين (Hematoxolin) و (Eosin) وصبغة (Gimsa) المحورة على أقسام الأنسجة في كل حالة. تم أيضا استخدام الأجسام المضادة المصلية واختبارات مستضد البراز كاختبارات الغير الغازية في هذه الدراسة.النتائج: تم إجراء اختبارات الاربعة للكشف عن وجود بكتيريا (H.pylori). بلغ متوسط العمر بالانحراف المعياري (+ SD) للعينات المدروسة (43.8 + 14.7) سنة ، تراوحت بين (20) و(74) سنة. كان الوسيط( 44) سنة. بلغ إجمالي الاتفاق بين اختبار الاجسام المضادة المصلية واختبار مستضد البراز (88.3). تم الكشف عن اختلافات كبيرة بين الاختبارين (P <0.001). من الواضح أن اختبار الاجسام المضادة المصلية كانت عالية الحساسية (حساسية = 98.4٪) ، لكن القيمة التنبؤية الإيجابية (76.3٪) لم تكن عالية. كان اختبار (Giemsa) عالي الخصوصية(الخصوصية= 98.2٪) ، و عالي حساسة (حساسية = 93.5٪).الاستنتاجات : الميزة الرئيسية للاختبارات النسيجية لا يقتصر فقط على اغراض الكشف ، كما يمكن الكشف عن أي حالة غير طبيعية في الغشاء المخاطي في المعدة الناجم عن البكتيريا مثل نزيف قرحةالمعدية ، التهاب المعدة الضموري ، حؤول الأمعاء ، وسرطان المعدة. يمكن استخدام صبغة( Giemsa) المحورة كطريقة للاختيار للكشف عن H. pylori بسبب حساسيتها وبساطتها واتساقها.

Listing 1 - 4 of 4
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (4)


Language

English (4)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (3)