research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Use Multiplex PCR For Detection of Some Virulence Genes of Klebsiella Isolated From Different Environmental loci
استخدام تقنية Multiplex PCRلتشخيص بعض جينات الضراوة لبكتريا Klebsiella sp. المعزولة من مواقع بيئية مختلفة.

Loading...
Loading...
Abstract

This study includes collected of 399 samples from different sources included clinical and non clinical samples. 293 clinical samples (urine, wounds, burns, stool, sputum). Non- clinical samples included 106 samples (water, soil) from November 2014 through February 2015. 51 samples were diagnosed as K. pneumoniae using phenotypic, biochemical and cultural diagnosis features and definitely diagnosed with API20E and vaitek test. Results of antibiotic resistance against different antibiotics showed that K. pneumoniae isolated from clinical and non- clinical samples varied in their resistance to these antibiotics and all isolates were sensitive 100% to Imipenem. A number of specific primers were designed to detect bacteria by using distinct gene and also to detects resistance to antibiotics using multiplex PCR technology for the presence or absence of 8 genes(magA, rmpA, htrA, Uge-1, gent-2,blaCTX, terA-1,StrA-2) that encodes for main virulence factors to diagnose K. pneumoniae. The result showed that that 45 isolates had rmpA which might be used as detection marker, in the same reaction of multiplex PCR detection of 4 genes related with resistance to different antibiotic groups(StrA,terA,blaCTX,gent-2) were done all K,pneumoniae contained StrA gene. According to this study we can concluded that multiplex PCR can use to distinguish isolated bacteria from different sources more correctly and also to determine its antibiotic resistance that are widely used in short time and little effort without need to routine testing.

تضمنت الدراسة جمع 399عينة من بيئات مختلفة والتي شملت السريرية والغير سريرية حيث جمعت 293عينة سريرية(ادرار، جروح،حروق، خروج، قشع) اما الغيرسريرية (التربة والمياه) فقد كان مجموعها106 عينة خلال الفترة من تشرين الثاني 2014 ولغاية شباط 2015.تـم تشخيص 51 عزلة بكـتيرية تعــود الــى بكتريـــا K. pneumoniaeبأستخدام طرق التشخيص المــظهرية والــزرعية والكيموحيوية وتم تأكيد التشخيص بأستخدام API20E وبأستخدام جهازالفايتكvaitek2 .أظهرت نتائج اخـتبار مقاومــة الـمضادات للعينات الــمعزولة مـن الحالات المرضية المختلفة والمصادرالبيئية (التربة،المياه) لـ12 من المضادات الحياتية مـن مختـلف الـمجاميع تباينا فيما بينها بين مقاومة وحساسة لهذه المضادات بينما كانت البكتريا حساسة وبنسبة100% فقط للمضاد الحيوي Imipenem.صممت عـدد مـن الــبادئات المتخصصة للــكشف عــن البكتريا بــاستخدام جين مميز فيها والكشف ايضا عن مقاومتها للمضادات بأستخدام تقنية تفاعــل البلمرة الــتسـلـسلـي الـمتعدد Multiplex PCR للكشف عن وجود او غياب ثمانية انواع مــن الجينات magA, rmpA ,htrA ,Uge-1 ,gent-2, blaCTX ,terA-, StrA-2 المشفرة لعوامل الضراوة الرئيسية لتشخيص K. pneumoniae.واظهرت النتائج وجود تباين في المحتوى الجيني بين العزلات فقد احتوت 45عزلة بكتيرية على الجين rmpA والذي يمكن ان يتخذ كمؤشرتشخيصي وفي نفس التفاعل تم الكشف عــن وجودجينات مــقاومة لأربعة مــن المضادات الحياتية العائدة الـــى مجاميع مختلفة (StrA, terA ,blaCTX, gent-2) حيث احتوت كل عزلاتK.pneumoniae علــى جين StrA. ومــن خلال هـــــذه الدراسة يمكن استثمار تقنية البلمرة التسلسلية المتعددة كوسيلة لــتمييز الــبكتريا الــمعزولة مــن مــصادرمـختلفة بصورة دقيقة وتشخيص مقاومتها للمضادات الحياتية الشائعة الاستعمال بوقت قصير وجهد اقل دون الرجوع الى الفحوصات الروتينية المعروفة.


Article
Isolation and Identification of Pseudomonas from Soil and different cases and study of susceptibility to antibiotics
عزل وتشخيص بكتريا Pseudomonas من التربة ومن حالات اصابة مختلفة و دراسة حساسيتها للمضادات الحيوية

Loading...
Loading...
Abstract

85 samples were collected to investigate Pseudomonas sp. bacteria and study their resistance to antibiotics. The samples were included (18 specimen of wounds, 21 of burns, 23 specimen otitis media, 6 of urine tract infact, 3 of sputum) and soil samples . These cases were diagnosed using cultural and biochemical tests, the diagnosis was confirmed using the API 20E system. The results showed high isolation from burns and otitis media (23%) . The species was obtained Pseudomonas aeruginosa 49 (94.2%) followed by the bacteria Pseudomonas fluorescens 2 (3.8%), Pseudomonas oryzihabitans 1 (1.9%). Resistance of Pseudomonas sp. isolates to antibiotics were examined to 10 antibiotics, and isolates showed highest sensitivity to antibiotics Imipinem, Ciprofloxacin, Amikacin 98.1% and 92.3% and 90.4%, respectively. Isolates were showed high resistant (88.5%) to Cefotaxime .

تم جمع 85 عينة لغرض التحري عن بكتريا .Pseudomonas spp ودراسة مقاومتها للمضادات الحيوية. وقد شملت العينات ( 18عيتة من التهابات الجروح، 21عينة حروق ، 23عينة التهاب الأذن الوسطى، 6من التهاب المجاري البولية و3 عينة قشع ) بالاضافة الى 14 عينة من التربة. وشُخصت هذه الحالات باستخدام الفحوصات الزرعية والكيموحيوية، وايضاً تم التشخيص باستخدام اختبار نظام API 20E . وبينت النتائج اعلى نسبة عزل لبكتريا Pseudomonas spp كانت للحروق والاذن بنسبة %23 وشملت الانواع التابعة لجنس Pseudomonas sp. التي تم الحصول عليها في هذه الدراسة بكتريا Pseudomonas aeruginosa 49(94.2%) تليها Pseudomonas fluorescens 2(3.8%)، Pseudomonas oryzihabitans 1(1.9). فُحصت مقاومة عزلات spp. Pseudomonas تجاه 10 انواع من المضادات الحيوية، واظهرت العزلات اعلى حساسية لمضادات Imipinem ، Ciprofloxacin، Amikacin وبنسبة 98.1 % و 92.3% و 90.4% على التوالي. وسجلت اعلى نسبة مقاومة لجميع العزلات كانت لمضاد Cefotaxime وبنسبة %88.5. .

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (2)


Year
From To Submit

2015 (2)