research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
The genetic relationship for Klebsiella pneumoniae isolated from human urinary tract and beef
العلاقة الوراثية لجرثومة الكلبيسيلا الرئوية والمعزولة من الجهاز البولي في الإنسان والأبقار

Authors: S.F. Klaif صبا فلاح كليف --- H.H. Nasir حسن حاجم ناصر --- J.N. Sadeq وجنان ناظم صادق
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894 Year: 2019 Volume: 33 Issue: 1 Pages: 75-80
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The present study aimed to describe the genetic relationships of zoonotic characterization of Klebsiella pneumoniae isolated from Human urinary tract and beef. The study includes (50) urine samples from human and (50) beef samples. The isolation and identification of Klebsiella pneumonia were done by using enrichment culture method and Vitek 2, then confirmed by PCR technique based on 16S ribosomal RNA gene which designed in this study using NCBI-GenBank (LT599801.1) and DNA sequencing was done on some positive isolates. The results show that Klebsiella pneumoniae was isolated from beef at 38 (76%) and from human at 32 (64%) by vitek2. The PCR technique was show highly sensitive and specific confirmative detection of Klebsiella Pneumonia isolates at Clarify DNA sequencing of a partial sequence of 16S ribosomal RNA gene was shown homology sequence identity highly with NCBI-Blast Klebsiella pneumoniae isolates. The phylogenetic analysis was show clear genetic similarity at (0.5 genetic change) between human and beef in Klebsiella pneumoniae isolates. The gene sequence deposited into NCBI-GenBank accession numbers (MF314450.1, MF314451.1, MF314452.1, MF314453.1). In conclusion, the study presents the first report in Iraq of genetic relationship among K. pneumoniae isolates from beef and humans. Therefore, it is essential to define the role of animals as an important source for the distribution of pathogen related to public health.

الدراسة الحالة تهدف العلاقة الوراثية للأهمية المشتركة للكليبسلا الرئوية التي تصيب الجهاز البولي للانسان ولحوم الأبقار. تضمنت الدراسة جمع 50 عينة من إدرار الإنسان و50 عينة من لحوم الأبقار تم تشخيصها والكشف عنها بواسطة استخدام الصفات الزرعية والاختبارات الكيموحيوية باستخدام فحص الفايتك2و تقنية تفاعل سلسة البلمرة (بي سي ار). باستخدام الجين التشخيصي 16س رايبوسومال ار ان اي الذي صمم في هذه الدراسة باستخدام العترة العالمية التي أخذت من جين البنك العالمي يحمل رقم الانضمام LT599801.1. أظهرت النتائج أن نسبة الإصابة في الأبقار باستخدام فحص الفايتك 38 (76%) في الأبقار في حين نسبة الإصابة في الإنسان 32 (64%). تم استخدام التقنية الجزيئية للتحقق من النتائج وذلك عن طريق استخلاص الحامض النووي الرايبي DNA لبكتريا الكليبسلا الرئوية وقياس تركيزه ونقاوته بواسطة جهاز Nanodrop ليتسنى التحري عن قطعة الجين وذلك باستخدام بادئات primers لبكتريا الكليبسيلا الرئوية والعزلات تم إرسالها لغرض تتابع النيوكلوتيدات وتم الحصول على أرقام الانضمام لعزلتين من الإنسان وعزلتين من الأبقار (MF314450.1, MF314451.1, MF314452.1, MF314453.1) من بنك الجينات العالمي NCBI-Genbank. أظهرت الشجرة الوراثية تشابه بنسبة (99 % -100%) مع العزلات العالمية لكليبسلا الرئوية المعزولة من الإنسان والأبقار. الخلاصة ,الدراسة الحالية تسجل لأول مرة في العراق حيث سجلت العلاقة الوراثية للكليبسلا الرئوية بين الإنسان والأبقار لذلك من الضروري معرفة الدور الحقيقي لدور الأبقار كمصدر في نقل وانتشار الإصابة إلى الإنسان وخطرها على الصحة العامة.


Article
Molecular characterization of enterohemorrhagic E. coli O157 and O153 isolated from tissue camel and human stool samples in Al-Diwaniyah, Iraq
التوصيف الجزيئي لبكتريا الايشريشيا القولونية النزفية O157 و O153المعزولة من لحوم الجمال وعينات براز الإنسان في الديوانية، العراق

Loading...
Loading...
Abstract

The present study aimed to describe the genetic relationships of zoonotic characterization of Escherichia coli isolated from human and livestock camel clinical infection. The study includes collected (50) meat of camel and (50) stool human samples. These samples were foreword to traditional bacterial isolation and identification using enrichment culture method and biochemical tests, then confirmed by PCR technique based on Gyr B gene Escherichia coli and DNA sequencing was done on some positive isolates. The results show that Escherichia coli were isolated from animals at 42 (84%) and 39 (78%) from human infection. The PCR technique was show highly sensitive and specific confirmative detection of Escherichia coli the positive results into 40 (95%) meat sample of camel, and 35 (89.7%) stool sample of a human. To evaluate of Virulence E.coli,we used specific virulence hlyA gene from NCBI-GenBank, published sequence of E. coli hly A gene (Genbank code: X94129.1) and the results show high of presence of virulence gene hly A in camel in percentage (19) 45% than of virulence gene in human (15) 38%. DNA sequencing of a partial sequence of GyrB gene was shown highly homology sequence identity with NCBI-Blast Escherichia coli strain O157H7 isolates from human and O153H3 from the camel. The phylogenetic analysis was shown there is clear genetic similarity at between human and animal’s E. coli isolates and then the gene sequence deposited into NCBI-Genbank accession numbers (MG560867.1, MG560866.1). Also, study design for detection of some virulence gene hly A Escherichia coli. In conclusion, there prevalence E. coli in humans and camel. Therefore, it is essential to define the role of animals as an important source for the distribution of pathogen related to public health. Our study found gyrB gene sequence could be used for identification and making a phylogenetic analysis of gyrB nucleotide.

هدفت الدراسة الحالية إلى وصف العلاقة الوراثية للتوصيف الحيواني المنشأ بين الاشيركيا القولونية المعزولة من العدوى السريرية للإنسان والماشية. تضمنت الدراسة جمع 50 عينة من لحوم الجمال و 50 عينة براز من الإنسان. تم زرع العينات على أوساط أغنائية وتم تفريقها وتشخيصها بالاختبارات البايوكميائية، ثم أكدت بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة على أساس جين الجايريز صنف (ب) للاشريشيا القولونية وتم أجراء تسلسل الحامض النووي على بعض العزلات الايجابية. تشير النتائج أن نسبة العزل للاشرشيا القولونية من لحوم الجمال 42 (84%) بينما كانت النسبة من الإنسان 39 (78%). أظهرت تقنية التفاعل البولمريز المتسلسل حساسية عالية اذ كانت النتائج الايجابية في لحوم الجمال 40 عينة (95%) بينما في براز الإنسان كانت النسبة 35 عينة (89,7%). في هذه الدراسة استخدمنا تقنية تفاعل سلسلة البلمرة للكشف عن وجود جين الذيفان الهيمولايسين hlyA كعامل ضراوة ينتج من قبل البكتريا (EHEC) المعزولة من حالات إسهال من الإنسان ولحوم الجمال. تم تصميم البادئات لجين hlyA حسب برنامج من قبل بنك الجينات NCBI (Genbank code:X94129.1). تظهر النتائج وجود عالي لجين الفوعة hlyA في الجمال بنسبة 19 (45%) وفي الإنسان 15 (38%). تم إظهار تسلسل الحامض النووي من التسلسل الجزيئي من جين Gyr B كهوية تسلسل لتسجيل العزلات في NCBI للاشركيا القولونية حيث كانت O157H7 في الانسان وO153H3 من عزلات الجمال. واظهر التحليل للجينات بوجود تشابه جيني واضح بين عزلات البشرية والحيوانية ومن ثم تسلسل الجينات المودعة في أرقام انضمام NCBI MG560867.1، MG560866.1. أيضا هدفت الدراسة للكشف عن بعض جينات الفوعة hlyA وتبن أن هناك انتشار للاشريشيا القولونية في البشر والجمال وعليه من الضروري تحديد دور الحيوانات كمصدر مهم لنقل العامل الممرض المتعلق بالصحة العامة. وجدت الدراسة أن التتابع الجيني Gyr B يعمل على تحديد هوية وعلاقته بالتطور النوعي وتحليل الأحماض الأمينية.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2019 (2)