research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Detection of Polymorphism in the Gene blaKPC2 of Local Klebsiella pneumoniae Isolated from Iraqi Patients
تحديد التغايرات الوراثية لجين blaKPC2 لعزلات محلية لبكتيريا الكليبسيلا الرئوية والمعزولة من المرضى العراقيين

Loading...
Loading...
Abstract

Carbapenemases are clinically important because they destroy and may confer a resistance to carbapenems, severe infections caused by carbapenemase producers is associated with increased mortality. To achieve this goal, 180 samples were collected from different clinical sources included 92 urine, 33 smears of wounds, 13 smears of burns and 42 sputum. The samples were taken from patients attended Al-Yarmouk Teaching Hospital and Ibin Baladi Hospital in Baghdad Governorate. Diagnosis of bacterial isolates was done depending upon the microscopic examination, the cultured characteristics and biochemical tests. DNA extracted from 84 samples. Accordingly, detection of blaKPC2 gene was conducted by using specific primers for amplification of blaKPC2 gene. Moreover, the sequencing of 910 bp for blaKPC2 gene was performed by the biotechnology lab. at the National Instrumentation Center for Environmental Management (NICEM). Such test has been implanted by using 3730XL as a DNA sequences. The obtained results were analyzed by blast at the National Center Biotechnology Information (NCBI) and detect polymorphism in blaKPC2 based on the Bio Edit. Consequently, 94 variations between 47 transversions, 43 transitions and 4 deletions nucleotide were noticed. In a sense the test showed 79% under sequence ID gb|CP009872.1| from 3037673 -3038166 number of nucleotide from K. pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPNIH30 of Gene Bank, score (329) and expect 5e-86 with the wild type of blaKPC2 gene from Gene Bank. Finally, the results illustrated polymorphism between local strains ofK. pneumoniae isolated from Iraqi patients and strain of K. pneumoniae obtained from Gene Bank.

Carbapenemases تعد مهمة سريريا وذلك لأنها تدمر وتمنح المقاومة لمجموعة الكاربينيم، والاصابات الشديدة التي تسببها البكتريا المنتجة لأنزيم carbapenemase المرتبطة مع زيادة معدل الوفيات. وبغية الوصول الى الهدف، جمع مائة وثمانين عينة من مصادر سريرية مختلفة ( 92 ادرار، 33 مسحة الجروح، 13 مسحة الحروق و 42 قشع ) من مرضى راقدين في مستشفى ابن بلدي وكذلك مستشفى اليرموك التعليمي في محافظة بغداد. وشخصت العينات بالاعتماد على المجهر الضوئي، الصفات المزرعية والاختبارات الكيموحيوية. وعزل الحامض النووي الدي اوكسي رايبوزي DNA من 84عينة. ووفقا لذلك، تم الكشف عن طريق تضخيم الجين blaKPC2 باستخدام بادئات متخصصه للجين. علاوة على ذلك، اجريت عملية تسلسل الاحماض النووية للجين blaKPC والذي هو بحجم 910 زوج قاعدي باستخدام جهاز AB13730XL في شركة مايكروجين في الولايات المتحدة الامريكية. أظهرت نتائج تتابع الحامض النووي لجين blaKPC2 مطابقتها مع تسلسل الاحماض النووية انفس الجين والمسجل لدى الموقع العالمي لبنك الجينات. بناءاً على ذلك، لوحظت تغايرات وعددها 94 تغاير ما بين 47 انقلابي، 43 انتقالي و4 حذف قاعدة نيتروجينية. اظهر الاختبار نسبة التطابق 79% وتحت الرقم ID gb|CP009872.1| من الرقم النيوكلوتيدة 3037673 -3038166 من عزلة بنك الجيناتKlebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPNIH30 وسكور 329 والقيمة المتوقعة 5e-86 مع جين blaKPC2 في بنك الجينات العالمي. اخيراً، استنتج من الدراسة الحالية وجود تغايرات بين العزلة البكتيرية المحلية المعزولة من المرضى العراقيين مقارنة مع العزلة البكتيرية المسجلة في بنك الجينات.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2017 (1)