research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Genetic Diversity Assessment of Some Citrus Species Cultivated in Iraq Based on RAPD Molecular Marker.
الوراثية تقييم التنوع من بعض أنواع الحمضيات المزروعة في العراق بناء على RAPD الجزيئية ماركر.

Authors: Iqbal Harbi Mohammed Al-Zaidi اقبال الزبيدي --- SalwaJaberAbdulah Al-Awadi سلوى جابر --- Ali.Saeed.Atiyah.AL-Janabi علي سعيد الجنابي
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2016 Issue: Special Second International Scientific Conference for the Life Sciences Pages: 23-30
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Genotyping of six Citrus accessions was carried out using RAPD marker .The genetic variability among the six Citrus accessions was estimated using six decamer RAPD primers. Five primers generated reproducible and easily storable RAPD profiles with a number of amplified DNA fragments ranging from nine to 12 ,the primer OPA – 17 was negative results . The total number of amplicons detected was 50, including unique bands reached seven polymorphism were 34,this represents a level of polymorphism of 68.33% and an average number of 6.8 polymorphic bands per primer. a maximum numbers of amplicons was amplified with primer OPA-18 reached 12 while the minimum number of fragments was amplified with primers OPA-12 and OPN-16 reached 9 respectively. The highest number of polymorphic bands reached 8 were obtained with primer OPN-16 and OPA-01respectively, while the highest number of monomorphic bands reached 3 was obtained with primer OPA-12 and OPS-147 with percentage reached 33.33% and 30 respectively. RAPD markers detected genetic distance and similarity , a maximum genetic distance value was observed between sour orange (SO) and sweet orange (OR) reached 0.578 with less similarity value reached 42%, a minimum genetic distance value was observed between sweet orange (OR) and mandarin (MA) reached 0.316 with high similarity value reached 69% . The similarity matrices were employed in the cluster analysis to generate a dendrogram using the UPGMA method. The cluster tree analysis showed that the citrus species were broadly divided into two main groups A and B. A group including two species were troyercitronge (TC) and sour orange (SO) with genetic similarity reached 56%. B group was divided into two sub-cluster B1 and B2 with genetic similarity reached 51%. The first sub-cluster (B1) including only citrone(CI) species but the second sub-cluster (B2) divided into two groups( B2A and B2B),the first group (B2A) included sweet orange (OR) and mandarin (MA) with high genetic similarity reached 69%, and second group (B2B) included volkamer lemon (VL) species only.

أجريت التنميط الجيني لستة انضمام الحمضيات خارج باستخدام علامة RAPD قدرت. والتباين الوراثي بين الانضمامات الحمضيات ستة باستخدام ستة الاشعال RAPD decamer. ولدت خمسة الاشعال الشخصية RAPD استنساخه وللتخزين بسهولة مع عدد من شظايا تضخيم الحمض النووي التي تتراوح بين تسعة إلى 12، وقانون التلوث النفطي التمهيدي - كان 17 نتائج سلبية. وكان العدد الإجمالي للamplicons الكشف عن 50، بما في ذلك وصلت عصابات فريدة كانت سبعة التعدد 34، وهذا يمثل مستوى من تعدد الأشكال من 68.33٪ ومتوسط ​​عدد 6.8 عصابات متعددة الأشكال في التمهيدي. وقد تضخمت أعداد أقصاها amplicons مع التمهيدي الذي تم التوصل إليه OPA 18 12 في حين تم تضخيم العدد الأدنى من شظايا مع الاشعال OPA-12 و OPN-16 وصلت 9 على التوالي. تم الحصول عليها بلغ أعلى عدد من عصابات متعددة الأشكال 8 مع التمهيدي OPN-16 وقانون التلوث النفطي، 01respectively، في حين بلغ أعلى عدد من العصابات monomorphic تم الحصول عليها 3 مع التمهيدي OPA-12 و OPS-147 بنسبة وصلت 33.33٪ و 30 على التوالي. علامات RAPD الكشف عن المسافة الوراثية والتشابه، لوحظ أقصى قيمة المسافة الجينية بين البرتقال الحامض (SO) والبرتقال الحلو (أو) قد بلغ 0.578 مع أقل قيمة التشابه صلت إلى 42٪، لوحظ الحد الأدنى قيمة المسافة الجينية بين البرتقال الحلو (أو) واليوسفي (MA) بلغ 0.316 مع قيمة تشابه عالية وصلت 69٪. تم توظيف المصفوفات التشابه في التحليل العنقودي لتوليد dendrogram باستخدام طريقة UPGMA. أظهر تحليل شجرة الكتلة التي الأنواع الحمضيات وتنقسم إلى مجموعتين رئيسيتين ألف وباء وكانت مجموعة من بينهم اثنان من الأنواع troyercitronge (TC) والبرتقال الحامض (SO) مع التشابه الجيني وصلت 56٪. تم تقسيم المجموعة (ب) إلى قسمين B1 مجموعة فرعية وB2 مع التشابه الجيني وصلت 51٪. أول المجموعة الفرعية (B1) بما في ذلك citrone فقط (CI) الأنواع ولكن المجموعة الفرعية الثانية (B2) وتنقسم الى مجموعتين (B2A وB2B)، ضمت المجموعة الأولى (B2A) البرتقال الحلو (أو) واليوسفي (MA ) مع التشابه الجيني عالية وصلت 69٪، وشملت المجموعة الثانية (B2B) volkamer الليمون (VL) أنواع فقط.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2016 (1)