research centers


Search results: Found 14

Listing 1 - 10 of 14 << page
of 2
>>
Sort by

Article
دراسة تشخيصية ووبائية لداء الليشمانيا الاحشائية Visceral Leishmaniasis باستعمال تقنية PCR في محافظة ذي قار

Author: فاضل عباس منشد العبادي
Journal: Univesity of Thi-Qar Journal مجلة جامعة ذي قار العلمية ISSN: 66291818 Year: 2008 Volume: 4 Issue: 1 Pages: 1-8
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract


Article
Detection of Porphyromonas gingivalis from Periodontal Pocket Infections by Microbial Cultivation and PCR Techniques
التحري عن جرثومة Porphyromonas gingivalis من إصابات جيوب ما حول الأسنان بطرق الزرع الجرثومي وبتقنية PCR

Author: Amera M. M. Al-Rawi أميرة محمود محمد الراوي
Journal: Rafidain journal of science مجلة علوم الرافدين ISSN: 16089391 Year: 2012 Volume: 23 Issue: 1A Pages: 39-55
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The study aimed to detect P. gingivalis from 49 patients with periodontitis at different ages and both sexes, after determination of pocket depth, types of infection whether chronic or progressive by dentists. Routine culture method was done using selective media and anaerobic condition and compared with species specific polymerase chain reaction (PCR) technique.DNA was extracted from samples and its concentration and purity were determined. The results showed domination of chronic infections and the pocket depths ranged between 3-9mm, as well as the results revealed that isolation percent of P.gingivalis by PCR was more higher than culture method, it was 65.3% and 28.5% respectively. The results also showed that phenol-chloroform was the efficient method for DNA extraction comparing with other methods. The study revealed that there are effects of age and sex on isolation rate and the results indicated that percentage of P.gingivalis was detected in 20-30 years old and males were more infected than females.

هدف البحث إلى عزل وتشخيص جرثومة P.gingivalis من 49 مريضاً مصاباً بالتهاب جيوب اللثة (ما حول الأسنان) و بأعمار مختلفة من كلا الجنسين بعد أن تم تحديد عمق الجيب Pocket depth ونوع الإصابة إما مزمنة Chronic أو متقدمة Progressive من قبل طبيب أسنان اختصاص بأمراض اللثة. تم استخدام الطرائق الروتينية بالزرع على الأوساط الانتخابية وتوفير ظروف لا هوائية وقورنت مع تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للنوع المتخصص (PCR)، إذ تم استخلاص الحامض النووي DNA وحدد تركيزه ونقاوته.بينت النتائج سيادة الاصابة المزمنة على المتقدمة وان عمق الجيب تراوح بين 3-9 ملم كما أظهرت النتائج أن نسبة الكشف عن الجرثومة بتقنية PCR اعلى بكثير مقارنة بنسبة عزلها والتحري عنها بالطرائق الزرعية إذ بلغت 65.3% و 28.5% على التوالي. كما ابدت النتائج ان طريقة الفينول-كلوروفورم الروتينية هي الاكفأ في استخلاص الـ DNA مقارنة بالطرق الأخرى.كما أظهرت الدراسة أن هناك تأثيراً لعاملي العمر والجنس على نسبة العزل فقد كانت اعلى نسبة عزل لجرثومة P.gingivalis عند الفئة العمرية 20-30 سنة وان الذكور اكثر اصابة من الإناث.


Article
Diagnosis of Toxoplasmosis among couples by immune detection and genetic evaluation of Toxoplasma gondii
تشخيص داء المقوسات بين الأزواج بواسطة التحري المناعي والتقييم الوراثي لطفيلي Toxoplasma gondii

Loading...
Loading...
Abstract

In this study, 27 married patients were totally examined for the presence of antibodies against Toxoplasma gondii by using a standard commercial enzyme-linking immunosorbent assay (ELISA) and Polymerase Chain Reactin (PCR) technique was used evaluate the genome of this parasite. Of 27 whole blood of married samples, nested PCR was positive in 22 (77.77%) by got the 96 bp DNA fragment, 9(40.9%) of them appeared with IgM and 6 (27.27%) of no anti-Toxoplasma, while 7 (31.81%) was positive nPCR results revealed both IgM+ and IgG+ antibodies, and 5 (22.22%) were negative results obtained by ELISA and nPCR

في هذه الدراسة تم فحص مجموعة مكونة من 27 زوجا من المرضى المتزوجين تحريا عن وجود الأجسام المضادة للطفيلي Toxoplsma gondii باستخدام الاختبار المناعي المرتبط بالإنزيم ELISA مع تقييم مجين هذا الطفيلي بواسطة تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). من مجموع 27 زوجا من عينات دم المتزوجين، كان لفحص الـ nested PCR لـ 22 عينة (77.77%) موجباً بعد الحصول على قطعة دنا بحجم 96 زوج قاعدي، وأعطت 9 عينات (40.9%) نتيجة إيجابية مع IgM و6(27.27%) ايجابي مع غياب الأجسام المضادة للمقوسة، بينما سجلت 7 عينات (31.81%) نتيجة إيجابية مع كل من nPCR ومع الضدين المتأزرين (IgM، IgG)، في حين ان خمسة عينات (22.22%) كانت النتائج فيها سلبية في كلا الاختبارين (الاختبار المناعي المرتبط بالإنزيم وتفاعل البلمرة المتسلسل).


Article
Bovine tuberculosis: Diagnosis by PCR technique in bovine milk samples
السل البقري :تشخيص مرض السل البقري في عينات الحليب باستخدام تقنية تفاعل البلمرة الجزيئي

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to determine the percentage of borne tuberculin infection in milk sample by using PCR. (102) milk samples were collected from cows , AL-Dejella (39) samples, AL-Suara (20) samples cow station, AL-Fthalia (20) samples, AL-Azezia (11) samples and AL-Twarege (12) samples during the period July 10th 2010 to Nov.30th 2010. The samples were examined by direct smear stained by Ziehle-Neelson stain, culture methods and confirmed the isolates by Polymerase Chain Reaction (PCR) assay. The results showed that 5 out 102 (4.9%) milk samples were M. bovis positive that were detected by direct milk smear method and 10 out 102(9.8%) M.bovis +ve were detected by culture method and PCR assay. The results also showed that high percentage of bacterial isolates from milk samples AL-Dejella city show (12.8%) by culturing and PCR method followed by AL-Suara (10%), AL-Fthelia (10%), Al-Twarege (8.3%) but no bacterial isolation was recorded in AL-Azezia milk samples. This study concluded that M.bovis infection was spreading in dairy cow within the mentioned areas and PCR was more sensitive, rapid, and accurate technique for M.bovis infection diagnosis.

ان الهدف من هذه الدراسة هو عزل جرثومة السل البقري من حليب الابقار بطريقة الزرع الجرثومي والمسحة المباشرة وتاكيد تشخيص العزلة بتقنية تفاعل البلمرة الجزيئي تم جمع ( 102) عينة حليب من محطة ابقارالدجيلة (39) والصويرة(20) ومن منطقة الفضيلية (20) والعزيزية (11) ومن منطقة طويريج (12) خلال الفترة الزمنية 10/7/2010 الى 30/11/ 2010 وفحصت العينات بطريقة المسحة المباشرة باستخدام طريقة الزيل –نلسن والزرع الجرثومي على الاوساط الزرعية الخاصة وتثبيت تشخيص العزلات الموجبة باستخدام تقنية تفاعل البلمرة الجزيئي. اوضحت النتائج بان (5) من (102) عينة (4.9%) موجبة لجرثومة السل البقري شخصت بطريقة المسحة المباشرة وان (10) من (102)(9.8%)عينة موجبة لجرثومة السل البقري شخصت بواسطة الزرع الجرثومي وتاكد تشخيصها بتقنية تفاعل البلمرة الجزيئي. كذلك بينت النتائج بان اعلى نسبة للعزل الجرثومي من عينات حليب الدجيلة (12.8) شخصت بطريقة الزرع الجرثومي وتقنية تفاعل البلمرة الجزيئي وبعدها الصويرة (10%) والفضيلية (10%) وطويريج (8.3) ولم يسجل أي عزل جرثومي من عينات العزيزية. نستنتج من الدراسة الحالية بان السل البقري منتشر في ابقار الحليب من المناطق التي جمعت منها العينات وان تقنية تفاعل البلمرة الجزيئي سريعة واكثر حساسية ودقة لتشخيص جرثومة السل البقري من حليب الابقار.


Article
Epidemiological and Diagnostic Study for Fasciola gigantica in Cattle by using PCR Technique at Thi-Qar Province
دراسـة وبــائيـة وتشخيصية لطفيلي دودة الكبد العملاقة Fasciola gigantica في الأبقار باستعمال تقنيـة الـ PCR في محافظة ذي قار

Author: Fadhil Abbas Al-Abady & Abdul-Hussein H. Awad
Journal: Journal of Education for Pure Science مجلة التربية للعلوم الصرفة ISSN: 20736592 Year: 2014 Volume: 4 Issue: 1 Pages: 447-464
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

The present study includes epidemiological survey for giant liver fluke parasite Fasciola gigantica in immolated cattle in slaughter house of Nasirriya city in Thi-Qar Province. The period of study extends from the beginning August 2008 up to end of July 2009. A total of 1684 cattle were examined with the percentage of whole infection 269 (15.97 %) and intensity of whole infection 8.14. The study records the highest percentage of whole infection for parasite 23.36 % in cattle during January, while it records the low percentage for infection in July 9.90 %. The highest intensity of whole infection is in December 11.45 and their least was in August 2.92 and does not record significant differences in percentage and intensity of infection. . The present study distinguishes percentage and intensity of infection in the liver and gallbladder and demonstrates a rate of liver infection percentage in cattle 15.32 % is higher than rate of gallbladder infection percentage in all the months of the year. It is also found out that the rate of infection intensity in liver 6.02 is less than that in gallbladder (13.83), but the intensity of infection in both liver and gallbladder is different during the months of the same year and is found significant difference in infection intensity of gallbladder. . The age has an influence on the percentage and intensity of infection in cattle. The cattle with an age less than one year records the least percentage of infection 1.78 % and intensity of infection 1.8 while the cattle older than 4 years records the highest percentage and intensity of infection 32.78 % and 10.40 respectively. Significant differences are observed in the percentage of infection for groups aged 3 – 4 years and older than 4 years (P<0.01). . The study proves that the percentage of infection in females of cattle 21.84 % is higher than in the males 3.36 % with significant differences. The Polymerase chain reaction (PCR) technique used in diagnosis Fasciola gigantica that is isolated from bile duct of cattle infected and is distinguished from F.hepatica.

تضمنت الدراسة الحاليـة وبائية طفيلي دودة الكبد العملاقـة Fasciola gigantica في الأبقار المذبوحة في مجـزرة مدينة الناصرية - محافظة ذي قـار وللفترة مـن شهر آب 2008 إلى شهر تموز 2009. فحص خلالها 1684 رأس من الأبقــار بنسبة إصابــة كليـة 269 (% 15.97)وشدة إصابة كلية 8.14. سجلت أعلى نسبة إصابة كلية للطفيلي 23.36 % في الأبقار خلال شهر كانـون الثـاني في حين سجلت اقــل نسبـة إصابة خـلال شهر تمــــــــوز 9.90% وكانت أعلى شدة إصابة كلية في شهر كانون الأول 11.45 واقلها في شهر أب 2.92 ، ولم تكن نسبة وشدة الإصابة مختلفة معنوياً.حددت هذه الدراسة نسبة وشدة الإصابة في كل من الكبد وكيس الصفراء إذ أوضحت الدراسة أن معدل نسبة إصابة الكبد في الأبقار15.32 % أعلى من معدل نسبة إصابة كيس الصفراء 2.79 % وفي جميع أشهر السنة. أشـارت الدراسـة إلى أن معدل شدة الإصابة في الكبد 6.02 اقل من كيس الصفراء .13.83تباينت شـدة الإصابـة في كل من الكبد وكيس الصفراء خلال أشهر السنة ، ولوحظ فرق معنوي في شدة إصابة كيس الصفراء. اثـر العمر على نسبة وشدة الإصابة في الأبقار إذ سجلت الفئة العمـريـة اقـل من سنة واحدة في الأبقار اقل نسبة إصابة 1.78 % وشدة إصابة 1.8 بينما سجلت الفئة العمرية اكبر من 4 سنوات أعلى نسبة إصابة 32.78 % وشدة إصابة 10.40 ولوحظ فرق معنوي في نسبة الإصابة للفئات العمرية 4 – 3 سنوات واكبر من 4 سنوات .(P<0.01)تفوقت نسبة إصابة إناث الأبقـار 21.84 % على نسبة إصابـة الذكـور 3.36 % وبفرق معنوي (P<0.01). استعملت تقنيـة تفاعــــل سلسـلة البوليميريز Polymerase Chain Reaction (PCR) في تأكيد تشخيص طفيلي دودة الكبد العملاقة F.gigantica المعزولة من قنوات الصفراء للأبقار المصابة وتمييزها عن دودة حلزون الكبد F.hepatica.


Article
Diagnosis of Brucella melitensis infection in goats milk by milk ring test& Polymerase chain reaction
تشخيص اصابة حليب الماعز بالبروسيلا المالطية بواسطة اختبار حلقة الحليب وسلسلة تفاعل البلمرة

Author: Ali Anok Najum علي عنوك
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2014 Volume: 6 Issue: 1 Pages: 198-201
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

B. melitensis is a more infectious zoonotic agents infect human and animals, 120 suspected brucellosis milk samples from goats with history of abortion were collected from Al-Samawa city tested with Milk ring test and Polymerase chain reation technique, results showed 11(9.16%) samples were positive for MRT, while 5(4.16%) samples were positive for PCR technique.

البروسيلا المالطية واحدة من اهم المسببات المرضية المعدية والمشتركة التي تصيب الانسان والحيوانات , تم جمع 120عينة حليب ماعز مجهضات سابقا , اجري فحصي حلقة الحليب وتفاعل سلسلة البلمرة على عينات الحليب , اظهرت النتائج بان 11(9,16%)عينة موجبة لفحص حلقة الحليب وان 5(4,16) عينة موجبة لفحص تفاعل سلسلة البلمرة .


Article
PCR detection of rmpA gene among Klebsiella isolated from wound and burn infections
كشف PCR من الجينات rmpA بين الكلبسيلة المعزولة عن جرح وحرق الإصابات

Authors: Ruaa Sh. Al-Rediany رؤى شلتاغ --- Abbas Sh. Al- Muhanna عباس شاكر المحنة
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2013 Volume: 5 Issue: 2 Pages: 124-129
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

One hundred and twenty five Gram-negative-lactose fermented bacteria grown on MacConkey agar were collected from burn and, wound infections, in Al- sadar Medical City in Al- Najaf province. The bacterial isolates were identified according to cultural characteristics ,the results revealed that 40(32%) isolates were identified as Klebsiella spp, all of them 40(100%) isolates were belong to K. pneumonia subsp. pneumonia .The capsule of klebsiella isolates were tested .the result revealed all Klebsiella isolates40(100%) were capsulated ,the gene coding capsule in isolates gave positive results. Genotypically were studied carefully using PCR technique , the results pointed out that 35 (87.5%) of bacterial isolated have rmpA gene coding for producing polysaccharide capsule .

تم عزل مائة وخمسة وعشرون من البكتيريا السالبة لصبغة جرام المخمرة للاكتوز المزروعة على أجار ماكونكي والمعزولة من إصابات الحروق والجروح من مدينة الصدر الطبية في محافظة النجف، خلال 10/9/2010-10/12/2010. تم التعرف على العزلات البكتيرية وفقا لخصائص الصفات الزرعية والكيمياء الحيوية بالإضافة إلى استخدام عدةApi 20E .وقد كشفت النتائج إن 40 (32٪) البكتيريا المعزولة هيklebsiella spp.وان هذه العزلات40 (100٪) تنتمي إلى. K .pneumonia subsp pneumonia وقد أجريت اختبارات لتشخيص عوامل الضراوة في عزلات Klebsiella، وذلك باستخدام أساليب مختلفة. وأظهرت النتائج أن جميع عزلات Klebsiella 40(%100)تحتوي على كبسولوراثيا، تمت دراسة جينات العزلات التي أعطت نتائج إيجابية باستخدام اختبار تفاعل البلمرة التسلسلي تقنية (PCR). وأشارت النتائج(%87,5) من البكتريا المعزولة لها rmpA الجينات المسؤولة عن إنتاج كبسولة السكاريد.


Article
INVESTIGATION OF FECUNDITY FecB GENE IN IRAQI AWASSI EWES
التحري عن جين الخصب FecB في نعاج العواسي العراقي

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to investigate the multiple aspects of mutant fertile gene and their effects in reproductive performance of Iraqi Awassi ewes. A total of 82 Iraqi Awassi (2-3 years) old with an average live body weight 45 kg were obtained from two locations (First , College of Agriculture , second , Agricultural Research Station / Ministry of Agriculture) in Abu-Ghraib , (30 km) south – west of Baghdad, were used in this study from August 2009 to August 2010. Investigation was carried out for multiple fertility gene (FecB) using the (PCR-RFLP) technique. Blood samples (5 ml/ewe) were drawn from the juglar vein using vacutainer tubes with anticoagulant material (ACD). Genomic DNA was extracted from whole blood for each sample using (Wizard genomic DNA purification Kit). The concentration and the purity of extracted DNA were measured with Spectrophotometry. Gel concentration (0.8%) was used for the purpose of electrophoresis. Specific parts of mutant region were isolated and amplified using (polymerase chain reaction) and specific (DNA markers) technique. For the purpose of natural point mutation diagnosis in the resulting PCR product is through the digestion of (FecB) gene (190 bp), by using restriction enzymes (Ava II). The results of the study showed that: Awassi ewes studied with (++) genotype revealed the absence of fertility genes (FecB). Twining percentage found in some Awassi ewes were not related to this gene and may be are related to other fertility genes or to other factors such as nutrition. No significant differences were observed in the birth weight or body weight at 90 days postpartum.

اجريت هذه الدراسة بهدف التحري عن تعدد المظاهر الوراثية لجين الخصب وتأثيره في بعض مظاهر الاداء التناسلي لدى النعاج العواسي العراقي. استخدمت 82 نعجة عواسي تراوحت اعمارها من 2-3 سنوات وبمعدل وزن جسم حي 45 كغم. تم الحصول عليها من موقعين (الاول كلية الزراعة/ جامعة بغداد والثاني محطة البحوث الزراعية/وزارة الزراعة) الواقعة في منطقة ابو غريب (30 كم) جنوب غربي بغداد للمدة من اب 2009 الى اب 2010. تم التحري عن تعدد المظاهر الوراثية لجين الخصب (FecB) باستخدام تقنية PCR-RFLP. تم سحب عينة دم (5 مل/نعجة) من الوريد الوداجي في انابيب مفرغة من الهواء تحتوي على مادة مانعة للتخثر (ACD). استخلصت المادة الوراثية الدنا (DNA) من الدم الكامل لكل عينة دم باستخدام عدة (Wizard Genomic DNA purification). تركيز ونقاوة المادة الوراثية (DNA) تم قياسها باستخدام جهاز مطياف الاشعة البنفسجية (Spectrophotometry) مع استخدام تركيز هلام (8%) لغرض الترحيل الكهربائي (Electrophorsis). تم عزل ومضاعفة اجزاء محددة من المنطقة المشفرة للمادة الوراثية الدنا (DNA) باستخدام تقنية انزيم بلمرة الدنا المتسلسل (Polymerase chain reaction) وبادئات متخصصة (DNA Markers). ولغرض تشخيص الطفرات الطبيعية النقطية في نواتج التكثير التي تم الحصول عليها من خلال هضم جين (FecB) لازواج القواعد (190bp) على التوالي باستخدام انزيمات التقييد وهي (Ava 11). اوضحت نتائج الدراسة ان نعاج العواسي التي تحمل التركيب الوراثي (++) لا تحمل جين الخصب (FecB). نسبة التوائم التي وجدت لدى بعض نعاج العواسي ليس سببها الجينات المدروسة وربما يكون السبب جينات خصب اخرى او عوامل اخرى مثل التغذية. لم تلاحظ فروقات معنوية في الوزن عند الولادة وعند عمر 90 يوماً بعد الولادة.


Article
التشخيص الجزيئي لطفيلي الاميبا الحالة للنسيج في منطقة الفرات الاوسط

Authors: صبا فاضل علي --- علي حسين مكي
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2017 Volume: 25 Issue: 1 Pages: 57-68
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

This study aimed to find the prevalence of E. histolytica parasite in Middle Euphrates region – Iraq, using one of the molecular methods. The study was conducted on the (1350) stool samples from diarrhea - suffering patients in three provinces of Middle Euphrates region: Karbala, Babel and Al- Najaf (450 in each province). Patients ranged in age (1 to more than 60) years and from both sexes and different regions who were attended to some hospitals, dispensaries and private laboratories in these governorates during the period from the first of May 2013 till the end of April 2014. All collected fresh samples were examined microscopically by wet-mounts method for E. histolytica detection. Around 0.5 g of each positive and some of negative stool samples in microscopic examination was preserved at -20Cº until use in molecular study. One third of positive samples in microscopic examination (which was selected to be representative for all positive samples) from each province and five of negative one as control group were submitted to the nucleic acid (DNA) extraction. One pairs of specific primers was designed to be used for molecular diagnosis of E. histolytica using PCR technique. Primers materials were supplied by Bioneer Co. and prepared according to its instructions. Molecular diagnosis of E. histolytica were performed using PCR reaction with amplification of the 355-bp fragments from the internal transcribed spacer region1 ITS1. The PCR was conducted using Accupower® PCR Premix kit/ Bioneer as DNA polymerase and the reaction was performed in a thermocycler. The products were submitted to 1.5 % agarose gel electrophoresis, stained with ethidium bromide and the gel images were recorded under transilluminator UV light. Based on the results of this study, microscopic examination showed that the total percentages of infection with E. histolytica were (15.1, 13.3 and 16.7) % in Karbala, Babel and Al- Najaf respectively. As infection rates are close in the three provinces and the absence of vast differences between these percentages, so the three provinces were treated as one (Middle Euphrates region). For the molecular diagnosis by using PCR technique the true prevalence of E. histolytica in Middle Euphrates region was found to be %12.8.

هدفت هذه الدراسة إلى ايجاد مدى انتشار طفيلي الاميبا الحالة للنسيج في منطقة الفرات الاوسط باستخدام إحدى الطرائق الجزيئية. اجريت الدراسة على 1350 عينة غائط طرية جمعت من المرضى الذين يعانون من الإسهال في ثلاث محافظات من محافظات منطقة الدراسة ( كربلاء و بابل و النجف) و بواقع 450 عينة لكل محافظة. تراوحت أعمار المرضى بين سنة واحدة إلى أكثر من 60 سنة ومن كلا الجنسين و مختلف المناطق الوافدين على بعض المستشفيات و المستوصفات والمختبرات الخاصة في هذه المحافظات في المدة من الأول من أيار 2013 وحتى نهاية نيسان 2014. جميع عينات الغائط الطرية فحصت مجهريا بطريقة المسحة الرطبة للكشف عن الاميبا الحالة للنسيج Entamoeba histolytica. حفظ حوالي نصف غرام من العينات ذات التشخيص الموجب و بعض العينات السالبة بدرجة حرارة ( 20 - ) م لحين استخدامها في الدراسة الجزيئية. انتخب ثلث العينات الموجبة المشخصة بالفحص ألمجهري (بحيث تكون هذه العينات ممثلة لمجتمع العينات الموجبة التشخيص) مع خمسة عينات سالبة لكل محافظة كمجموعة سيطرة لغرض استخلاص المادة الوراثية ( DNA). صمم زوج من البادئات النوعية لتشخيص طفيلي الاميبا الحالة للنسيج باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسلPCR . اعتمد التشخيص الجزيئي على نتائج تضخيم البادئات النوعية Specific primers بتقنيةPCR لمنطقة للحيز ألاستنساخي الداخلي ITS1)) الخاصة بتشخيص طفيلي الاميبا E. histolytica عند ناتج بلغ355) ) bp. حضر مزيج تفاعل البلمرة المتسلسل باستعمال عدة Accupower® PCR Premix المجهزة من قبل شركة Bioneer الكورية و تمت عملية التضخيم باستخدام جهاز المبلمر الحراري. أجريت عملية الترحيل الكهربائي باستخدام هلام الاكاروز 1.5% و صبغه بروميد الاثيديوم و صور الجل بجهاز مصور الحزم الجينية تحت الأشعة فوق البنفسجية. بالاعتماد على نتائج هذه الدراسة فان الفحص ألمجهري أظهر إن إجمالي نسب الإصابة بطفيلي الاميبا الحالة للنسيج كانت) 15.1 و 13.3 و 16.7) % في كربلاء و بابل و النجف على التوالي. و لكون نسب الخمج متقاربة في المحافظات الثلاثة و عدم وجود فروق شاسعة بين هذه النسب تم معاملة المحافظات الثلاث كمنطقة واحدة هي ( الفرات الاوسط). فيما يخص التشخيص الجزيئي بتقنية PCR تبين إن نسبة الخمج الحقيقية بطفيلي الاميبا الحالة للنسيج في منطقة الفرات الأوسط هي12.8 %.


Article
Study of PPARG2 Gene Polymorphism (Pro12Ala) in Iraqi Patients with Type 2 Diabetes Mellitus.

Authors: Abdul Hussien A. Farage Algenabi --- Bara'a Adel Hadi
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2016 Volume: 24 Issue: 5 Pages: 1447-1454
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Type 2 diabetes mellitus is a multifactorial and polygenic disease, which is considered as a major life threatening problem all over the world. There has been a worldwide effort in the identification of susceptibility genes for type 2 diabetes mellitus. At present, adequate data are not available dealing with PPARG2 (rs1801282) gene polymorphisms and its association with type 2 diabetes mellitus cases among Iraqi populations. Thus, we conceived the need for further studies to investigate PPARG2 gene polymorphisms and its susceptibility to type 2 diabetes mellitus. The aim of this research is to study association PPARG2 gene polymorphism (Pro12Ala) with T2DM in Iraqi population. The study included 105 patients with T2DM referring to clinic and 80 healthy controls randomly selected based on WHO guidelines. BMI, FBS, lipid profile and insulin plasma levels were measured, DNA was extracted from blood and genotyped by PCR–RFLP with specific primers to amplify a fragment for digestion with restriction enzyme (Hpa II). Multinomial logistic regression was applied to compare the proportions of genotypes or alleles. Obtained results of PPARG2 gene GG, CG and CC genotype frequencies for T2DM individuals that obtained were 93.34% , 6.66% and 0% respectively, while in control group were 98.75% , 1.25% and 0% respectively . The genetic power of this study was 25.9% and according to HWE , X2= 41.299 , Pvalue=0.000 which is considered to be not significant. As a conclusion, there is no association between PPARG2 gene polymorphism and type 2 diabetes mellitus in Iraqi population.

المقدمة: في العراق هناك اعداد متزايدة من الإصابة بمرض السكري حيث تسبب نسب عالية من الخسائر، اثبتت الدراسات الوراثية ان الطفرة الوراثية في موروثة الـPPARG2 (Pro12Ala) متعلقة بمرض السكري. كما ان هذه الطفرات قد توثر على مؤشر كتلة الجسم, مستوى الدهون و حساسية الانسولين . هدف البحث هو دراسة علاقة التباين الجيني لموروثة الـPPARG2 (Pro12Ala) مع داء السكري النوع الثاني في المجتمع العراقي . شملت الدراسة 105 مريض بداء السكري و80 من الاصحاء تم اختيارهم عشوائيا استنادا الى المبادئ التوجيهية لمنظمة الصحة العالمية. تم قياس مؤشر كتلة الجسم، مستوى السكر، مستوى الدهون ومستوى الانسولين لكل شخص. الحامض النووي تم استخلاصه من الدم ثم تنميطه وراثيا باستخدام تقنية (RFLP-PCR) باستخدام ممهدات محددة لتضخيم جزء من الموروثة ثم تقطيعها باستخدام الانزيم القاطع (Hpa II). تم استخدام الانحدار اللوجستي المتعدد لأجل مقارنة الأنماط الجينية وترددات الأنماط الوراثية. النتائج التي تم الحصول عليها تشير ان الأنماط الجينية متماثلة ومختلفة اللواقح قد فشلت في زيادة خطر الإصابة بالسكري بشكل مؤثر عند مقارنتها بالنوع البري الطبيعي. وفي نفس الاتجاه لم تظهر هذه الأنماط الوراثية تأثير مهم على مؤشر كتلة الجسم، مستوى الدهون وحساسية الانسولين , كأستنتاج التباين الجيني لموروثة الـPPARG2 (Pro12Ala) ليس عامل خطورة للإصابة بالسكري من النوع الثاني في المجتمع العراقي.

Listing 1 - 10 of 14 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (14)


Language

Arabic (7)

English (5)

Arabic and English (2)


Year
From To Submit

2017 (4)

2016 (1)

2015 (1)

2014 (3)

2013 (2)

More...