research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
Real-Time PCR for direct detection of Clostridium perfringens from horse with enterocolitis infection

Authors: Jabbar A. Alwan --- Ali A. Al-zaidy --- Kadhim H. Abbas
Journal: Kufa Journal For Veterinary Medical Sciences مجلة الكوفة للعلوم الطبية البيطرية ISSN: 20779798 Year: 2016 Volume: 7 Issue: 1 Pages: 74-80
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Clostridium perfringens is one of the most important causative agents of enterocolitis infection in horses. This bacterium capable to produce potential enterotoxin that cause diarrhea in horses. This study was aimed to molecular identification of Clostridium perfringens from horses infected by diarrhea by using Real-Time PCR technique. The Clostridium perfringens type C was identified by using specific primers for enterotoxin (CPE) gene that designed in this study using NCBI-Genbank data base (Genbank code: GQ225719.1) and primer3 plus for primer design. The results show that prevalence of infection by Clostridium perfringens type C was (40%) of 12 positive samples out of 30 fecal samples. This study demonstrated that the direct Real-Time PCR technique is a highly specific and rapid tool for the detection Clostridium perfringens.

تعد بكتريا Clostridium perfringens واحدة من اهم مسببات الاضطرابات المعوية في الخيول وذلك لقدرة هذه البكتريا على انتاج الذيفانات الداخلية القوية المفعول والذي يحدث الاسهال في الخيول . هدفت هذه الدراسة تشخيص بكتريا Clostridium perfringens نوع C باستخدام تقانة Reat time PCR . بكتريا Clostridium perfringens نوع C شخصت باستعمال باديء خاص بالذيفان الداخلي الجين (CPE)والذي تم تصميميه لغرض الدراسة بالاعتماد على NCBI-Genbank data base (Genbank code: GQ225719.1) and primer3 plus لتصمصم البادئ و اضهرت النتائج ان نسبة الاصابة كانت 40% أي بواقع 12 عينة موجبة من أصل 30 عينة براز التي تم جمعها من الخيول المصابة .أعتمدت هذه الدراسة استخدام تقانة Real time PCR والذي يعد فائق التخصصية والسرعة في تشخيص بكتريا Clostridium perfringens نوع C .


Article
EFFECT OF IRRIGATION SCHEDULING (IW:CPE) IN SOIL WATER , SALINITY , HEAT DISTRIBUTION AND WATER PRODUCTIVITY OF COWPEA IN MIDDLE OF IRAQ
جدولة الري بالتنقيط باعتماد نسبة IW:CPE واثرها في توزيعات الرطوبة والاملاح وحرارة التربة وانتاجية وحدة الماء لنبات اللوبيا وسط العراق

Author: laithfarhan.1@gmail.com عصام خضير حمزة
Journal: IRAQI JOURNAL OF DESERT STUDIES المجلة العراقية لدراسات الصحراء ISSN: pISSN: 19947801 / eISSN: 26649454 Year: 2016 Volume: 6 Issue: 1 Pages: 95-103
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

A field experiments was conducted during spring season 2015 at Agricultural field of Veterinary college- Baghdad University. In order to study the Drip irrigation scheduling for cowpea based on IW:CPE ratio and its effect on soil moisture ,salts ,temperature distribution and water productivity in middle of Iraq. Six irrigation treatment were chosen (0.6 IW:CPE , 0.8 IW:CPE , 1.0 IW:CPE , 1.2 IW:CPE , 1.4 IW:CPE , 1.6 IW:CPE). The results of Soil-water distribution showed that the soil moisture content was higher nearest to the emitter and decreased in both horizontally direction around the emitter and vertically by depth between the emitter for all treatments, moisture content relatively decreased with increasing of IW:CPE ratio, nearest to the emitter (0,0cm) in treatments 0.6 IW:CPE, 0.8 IW:CPE and 1.0 IW:CPE, the soil moisture content are higher than soil field capacity (FC) 41.3%, while the soil moisture content decreased nearest to the emitter in treatments 1.2 IW:CPE, 1.4 IW:CPE and 1.6 IW:CPE below soil field capacity. In general the soil salinity distribution (EC) was at the minimum nearest to the emitters at point (0,0) and increased by increasing the distance from the emitters in both horizontally around the emitter and vertically by depth. Horizontally, the salt content increased by increase the distance from emitter, in all treatments, and the results also showed that soil salinity distribution was the opposite of soil moisture distribution when water content is increased near to the emitter. The electric conductivity (EC) was increased by depth. It could be resulted from the showed that the same distribution of soil moisture content. There were limit variations in soil temperature between the treatments. The lowest temperature was 18.2co at (0,0cm) for the treatment 0.6 IW:CPE, while the heights value at the same point was 19 co which was for 0.6 IW: CPE treatment. The heights soil temperature 29.0co was recorded at (40,45cm) distance for 1.4 IW:CPE treatment; however the lowest value at the same distance was 21.5co for the treatment 1.6 IW:CPE. Soil temperature was increased horizontally between each laterals and emitters and increased vertically by depth too. A significant 2nd degree equation relationship with was obtained as result of interaction between the irrigation treatments and Crop water productivity (CWP), and the treatments 1.2 IW:CPE and 1.0 IW:CPE gave a significant increasing in (CWP) by 2.140 and 2.096 ton.hec-1., respectively compared with treatment 0.6 IW:CPE which gave the lowest value in (CWP) by 1.943 ton.hec-1.

الربيعي 2015 في حقول كلية الطب البيطري جامعة بغداد, لدراسة جدولة الري بالتنقيط باعتماد ستة نسب من IW:CPE وهي 0.6 و0.8 و1.0 و1.2 و1.4 و1.6 كمعاملات للري واثرها في التوزيعات الرطوبية والاملاح وحرارة التربة وانتاجية وحدة الماء لنبات اللوبيا. اظهرت نتائج التوزيعات الرطوبية في التربة ان اعلى محتوى رطوبي كان قرب المنقط وينخفض في الاتجاهين الافقي والعمودي ولجميع المعاملات، مع انخفاض نسبي للمحتوى الرطوبي بزيادة نسبة IW:CPE، اذ تجاوزت قيم المحتوى الرطوبي قرب المنقط (0،0) للمعاملات IW:CPE 0.6 و IW:CPE0.8 و IW:CPE1.0 المحتوى الرطوبي الحجمي عند السعة الحقلية فيما انخفض المحتوى الرطوبي قرب المنقط للمعاملات IW:CPE 1.2 و IW:CPE1.4 و IW:CPE1.6 دون حدود السعة الحقلية. اظهرت نتائج التوزيعات الملحية وبصورة عامة لوحظ ان التوصيل الكهربائي اقل ما يمكن عند المنقط ولكافة المعاملات ويزداد بدرجة ملموسة افقيا وعموديا بالابتعاد عن المنقط. سجلت توزيعات حرارة التربة اقل قيمها قرب المنقط (0،0) وازدادت بالابتعاد عنه في الاتجاهين الافقي والعمودي. أظهرت النتائج اختلافات محدودة في حرارة التربة بين المعاملات، وقد سجلت اقل درجة حرارة عند النقطة (0،0) كانت 18.2 م° للمعاملة IW:CPE 1.0 واعلى قيمة عند نفس النقطة للمعاملة IW:CPE 0.6 كانت 19.0 م° فيما سجلت اعلى درجة حرارة عند النقطة 40،-45 وكانت 29.0 م° للمعاملة IW:CPE 1.4 واقل قيمة عند نفس النقطة 21.5 م° للمعاملة IW:CPE 1.0. وقد جاءت نتائج التوزيعات الملحية والحرارية معاكسة مع التوزيع الرطوبي. وحققت المعاملة 1.2 Ef اعلى قيمة لإنتاجية وحدة المياه والتي بلغت 2.140 بينما بلغت اقل قيمة لإنتاجية وحدة الماء 1.943 كغم.م-3 للمعاملة 0.6 Ef. وجدت علاقة ارتباط معنوية من الدرجة الثانية ناتجة عن تداخل بين معاملات الري وانتاجية وحدة الماء (CWP), واعطت معاملتي 1.2 IW:CPE و 1.0 IW:CPW زيادة معنوية في انتاجية وحدة الماء بلغت 2.140 و2.090 طن.هكتار-1 ,على التتابع مقارنة مع 0.6 IW:CPE والتي اعطت اوطأ قيمة في انتاجية وحدة الماء بلغت 1.943 طن.هكتار-1.


Article
Investigation of Live Attenuated Measles Virus Vaccine as Anti Tumor Agent

Authors: Farah E. Ismaee --- Ahmed M. Al-Shammari --- Shahlaa M. Salih
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2014 Volume: 17 Issue: 3 Pages: 144-154
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out to evaluate the antitumor effect of live attenuated measles virus Schwarz (MV) vaccine strain on tumor cell lines in vitro. Live attenuated measles virus Schwarz vaccine strain was obtained from Aventis Pasteur, France. Live attenuated measles virus Schwarz strain was propagated on Vero, human Rhabdomyosarcoma (RD) and human Glioblastoma-Multiform (GBM) cell lines which were supplied by Iraqi Center for Cancer and Medical Genetic Researches (ICCMGR). Results revealed that cell fusion occurred after 24 h of infection. The infected confluent monolayer appeared to be covered with syncytia with granulation and vaculation of cells after 72 to 120 h. Moreover, the formation of large round empty plaque spaces was observed in infected cells. Results of oncolytic cytopathic effect showed that after 120 h of exposure alterations in morphology of Vero, RD and GBM cells. Cells were rounded, shrink, clustered cells and large empty space with cell debris as a result of cell lysis and death. Haemadsorption effect of MV was studied and result recorded that all cell lines infected with virus have the ability for haemadsorption human red blood cells after 72 h of infection. While uninfected cells gave negative results. Detection of MV H protein by monoclonal antibodies in infected cells of all cell lines by immunocytochemistry assay gave positive results (brown color) in cytoplasm of infected cells. Cell viability was measured after 72 h of infection by MTT assay. Results showed a significant cytotoxic effect for measles virus (P ≤0.05) on growth of RD and GBM cell lines at the first dilution and the second one after 72 h of infection. When the dilution increases, there was a significant decline in the inhibitory effect with a significant cytotoxic effect as compared with the control. Also, concentrated inoculums of measles virus showed a significant cytotoxic effect when compared with the control.

أجريت هذه الدراسة لتقييم تأثير لقاح فيروس الحصبة الحية المضعفة من سلالة اللقاح شفارتز على خطوط الخلايا السرطانية في المختبر. تم تكثير فيروس لقاح الحصبة شفارتز بعد الحصول عليها من افنتش باستورعلى الخط الخلوي(Vero) والخط الخلوي السرطاني للخلايا العضلية المخططة للإنسانRD) ) والخط الخلوي السرطاني العراقي الاصل ورم أرومي دبقي- المتعددة الأشكال (GBM) بعد الحصول عليها من المركز العراقي لسرطان و الأبحاث الجينية الطبية (ICCMGR). اظهرت النتائج اندماج الخلية بعد 24 ساعة من الاصابة لتكون مغطاة بخلايا عملاقة تدعى syncytia مع التحبيب و التعدد الفجواتي للخلية بعد 72-120 ساعة. ولوحظ تشكيل مساحات فارغة كبيرة في الخلايا المصابة. لتقييم التأثير الخلوي الممرض للفايروس في الخلايا السرطانية ، كانت الخلايا كلآ من (Vero، RD و GBM) بعد زراعتها في اطباق بكثافة 1 × 105 خلية. بعد 24 ساعة من زراعة الخلايا أصيبت الخلايا باللقاح المركز لمدة 2 ساعة في 37 درجة مئوية. في نهاية فترة الحضانة، تم ازالة الفيروس، و تمت المحافظة على الخلايا في وسط زرعي وحضنت لحين ظهور التأثير الخلوي الممرض. أظهرت النتائج أن بعد 120 ساعة من التعريض للفيروس تغيرات في الشكل لكل من Vero و RD وGBM و تدور الخلايا و انكماشها وتكون خلايا عنقودية ومساحات فارغة كبيرة مع حطام الخلايا نتيجة لتحلل الخلايا وموتها . اجرى اختبار الامتزاز الدموي مع لقاح الحصبة واظهرت النتائج أن جميع خطوط الخلية المصابة بفيروس الحصبة لديها القدرة على الالتصاق بخلايا الدم الحمراء البشرية بعد 72 ساعة من الاصابة. بينما أعطت الخلايا غير المصابة نتائج سلبية. الكشف عن بروتين (H) بواسطة الأجسام المضادة وحيدة النسيلة في الخلايا المصابة من جميع خطوط الخلايا اعطى نتائج إيجابية (اللون البني) في سيتوبلازم الخلايا المصابة. أجري تقييم للتأثير السمي الخلوي للقاح الحصبة MV على RD وGBM وقيست حيوية الخلية بعد 72 ساعة من الاصابة بعد إزالة الوسط الزرعي عن طريق فحص MTT. أظهرت النتائج وجود تأثير تثبيطي كبير لفيروس الحصبة (P ≤ 0.05) على نمو RD و GBM في التخفيف الأول والثاني بعد 72 ساعة من الاصابة. كما لوحظ انخفاضآ كبيرآ في التأثير المثبط للفيروس مع وجود تأثير سمي للخلايا كبير بالمقارنة مع السيطرة. فضلآ عن ذلك أظهر لقاح فيروس الحصبة المركز تأثيرآ سميآ كبير للخلايا بالمقارنة مع السيطرة.


Article
Optimization of a new cloud point extraction procedure for the determination of trace amounts of total Barium (II) in some environmental samples by turbidimetric
الاستفادة المثلى من الإجراء الجديد استخراج نقطة السحابة لتحديد كميات ضئيلة من مجموع الباريوم في بعض العينات البيئية من خلال قياس التعكرية

Author: Shamaa Ibrahem sead
Journal: journal of kerbala university مجلة جامعة كربلاء ISSN: 18130410 Year: 2016 Volume: 14 Issue: 3 Pages: 45-55
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

A new, simple, and rapid cloud point extraction (CPE) procedure system, combined with turbidity was created for particular partition, preconcentration, and determination of follow measures of aggregate barium in some ecological specimens. The methodology depends on the complexation of Ba(II) particles with chlorazol clear reagent within the sight of SDS as a non-ionic surfactant. The ideal conditions for the CPE of Ba(II) particles were explored as for a few trial parameters, for example, order addition , pH of the solution, SDS and chlorazol blank concentrations, incubation time and temperature, and effect of intervirrnses and time. The detection limit for Ba(II) ions taking into account the 8 times the standard deviation of the blanks (N:8) was found to 0.004554μg mL−1, while the relative standard deviation (RSD) was 0.041514 . The proposed strategy was broke down for soil and water tests, which assembled from Environment Iraq , as guaranteed reference materials , were utilized, and spike tests were connected to accept the technique. The technique was connected to some genuine ecological examples to assess their aggregate barium levels. With respect to accomplished information, water and soil of contextual analysis is dirtied

الاستخلاص بنقطة الغيمة (CPE) هو نظام جديد يمتاز بسرعة والبساطة وقد طورة جانبا الى جانب مع قياسات التعكرية لتقدير وانتقائية كميات ضئيلة من تركيز الباريوم الكلي في بعض العينات البيئية. ويستند هذا الاجراء على تعقيد ايون الباريوم الثنائي مع كاشف كلوروزول وبوجودSDS باعتباره غير الأيونية .وحددت الظروف المثلى لتكوين معقد من الباريوم الثنائي مع الكلوروزول وبوجود SDS حيث تضمنة دراسة اضافة التعاقب للمكونات ,تركيز الكاشف المستخدم ,تركيز SDS والدالة الحامضية للمحلول , درجة الحرارة , زمن الاحتضان , مدة استقرارية المعقد المتكون وتأثير الايونات المتداخلة وبعض المعالجات الاحصائية .كما اوجد منحني المعايرة واستخدمه مع الانحراف المعياري للمحلول المرجع و 8 مرات (N: 8) في اجاد حد الكشف عن الباريوم الثنائي ضمن هذه الطريقة والذي يساوي (0.004554 ملغرام /لتر ) في حين كان الانحراف المعياري النسبي ( RSD) للمنحني المعايرة لهذه الطريقة يساوي 0.041514. بعد تحديد الظروف الفضلى طبقة الطريقة المقترحة في تقدير مجمل مستويات الباريوم في بعض العينات البيئية الحقيقية حيث شملت العينات ثلاثة عينات من المياه وثلاث عينات من التربة التي تم جمعها من البيئة العراق لمحافظة كربلاء . أجريت مقارنة بواسطة المعالجة بتحلیل المتغيرات بطرق الاحصائية عند حدود ثقة 95 % ببن الطريقة المستحدثة والطريقة التقليدية الطيفية لتقدير ايون الباريوم وعلى هذا الاساس بالإمكان قبول الطریقة الجديدة كطريقة تحليلية بدیلة


Article
Preconcentration and determination of Metformine Hydrochloride in different samples by cloud point extraction coupling with uv-visible spectrophotometry
اعادة التركيز والتقدير الطيفي للميتفورمين هيدروكلوريد في نماذج مختلفة بواسطة الاستخلاص بنقطة الغيمة والمزدوجة مع مطيافية الاشعة فوق البنفسجية والمرئية

Authors: Jameel M. Dhabab جميل موسى ضباب --- Taif Th. Kazar طيف ذياب كزار
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2016 Volume: 13 Issue: 2ملحق ابحاث المؤتمر الوطني الثاني للكيمياء Pages: 470-479
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This work was influenced the separation and preconcentration steps were carried out to determination of metformin (MET) in pharmaceutical preparations and human serum samples. Complex formation method and cloud-point extraction (CPE) coupling with UV-Visible spectrophotometry were used to investigated of study target.The results has showed the best optical characteristic for calibration curve and statistical data which were obtained under optimum conditions. The first method is based on the reaction of MET with nickel (II) in alkaline medium an absorption maximum λ)max) at 434nm. ''Beer's low'' is obeyed in the concentration range (10-100µg.ml-1) with molar absorptivity of 3.9x103 L.mol-1.cm-1.The limit of detection and quantitation values were 2.37 and7.11 µg.ml-1 respectively. The second method based on extraction of traces amounts of MET using the cloud-point extraction (CPE). This method implicated for using of a nonionic surfactant (Triton x-114) as an extraction medium which was entrap the hydrophobic complex formed between MET and nickel(ii) in basic medium as reaction system for designing the CPE procedure. The optimum conditions were similar the first method expect the amount of surfactant which was 0.5 ml. The concentrations range of calibration curve from 3.5to100 µg.ml-1 and molar absorptivity of 1.2x104 L.mol-1.cm-1. In this method was access to less of concentrations in Limit of detection and quantitation which were 0.74and 2.22 µg.ml-1 respectively. The precise (RSD %) and accuracy (recovery %) of both methods were ranged between 0.24-0.47, 97.86-98.68 respectively. The data of two methods were appeared high acceptable with standered of British Pharmacopoeia through using statistic methods (f-test and t-test), that they may be used in analysis of MET.

يتضمن هذا العمل انجاز خطوات فصل وتركيز لتقدير الميتوفورمين في نماذج من المستحضرات الصيدلانية وسيرم الدم البشري . استخدمت طريقتا تكوين المعقد كطريق اولى ونقطة الغيمة كطريقة الثانية المزدوجتان مع مطيافية الاشعة المرئية والفوق البنفسجية لتحقيق هذا الهدف. تم الحصول على افضل النتائج لمنحنى المعايرة والبيانات الاحصائية عند تطبيق الظروف الفضلى.اعتمدت الطريقة الاولى على تفاعل الميتفورمين مع ايون النيكل الثنائي في الوسط القاعدي لتكوين معقد له اقصى امتصاص(maxλ) عند 434 نانومتر وقد لوحظ ان قانون بير يسري على الكميات التي تتراوح بين (100-10) ميكروغرام /مل وان معامل الامتصاص المولاري (3.9x103) ل.مول-1.سم-1. وان حد الكشف وحدود التقدير الكمي كانت 2.371و7.11 ميكروغرام/مل على التوالي.اما الطريقة الثانية تشتمل على فصل وتقدير الكميات ذات التراكيز الواطئة للميتفورمين في نماذج من سيرم الدم لمتبرعين يتناولون الميتفورمين باستخدام طريقة الاستخلاص بنقطة الغيمة بوجود سطح انيوني من التريتون x-114 في وسط قاعدي تحت ظروف فضلى مشابه الى الطريقة الاولى ماعدا تركيز التريتون الذي كان حجمه0.5 ملليتر. وكان حدود التراكيز لمنحنى المعايرة من3.5 الى 100 ميكروغرام /مل وان معامل الامتصاص المولاري (1.2x104) ل.مول-1.سم-1. تم الوصول الى اقل تركيز في حدود الكشف وحدود التقدير الكمي والتي كانت 0.74 و2.22 ميكروغرام بالملليتر على التوالي. كانت التوافقية والدقة لكلتا الطريقتين بدلالة الاسترجاعية والانحراف المعياري النسبي بمدى 0.24-0.47, 97.86-98.68 على التوالي. واظهرت نتائج الطريقتين متوافقة مع نتائج الطريقة القياسية لدستور الأدوية البريطاني باستخدام الطرق الاحصائية مثل اختبارT واختبارF مما يجيز لهما ان يستخدما في تحليل الميتفورمين.


Article
A Simple Spectrophotometric Evaluation Method of Allura Red (E129) in Several Food Samples Using Cloud Point Extraction

Author: Mohammed Z. Thani
Journal: Al-Mustansiriyah Journal of Science مجلة علوم المستنصرية ISSN: 1814635X Year: 2017 Volume: 28 Issue: 3 Pages: 134-140
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Cloud point extraction (CPE) method was successfully used for estimation and preconcentration of Allura red by spectrophotometry. The procedure was depended on the extraction of Allura red as an ion pair with cetylpyridinium chloride from aqueous solution using a nonionic surfactant TX-114 or Brij-35. The absorbance of the extracted surfactant-rich phase was measured at 507 nm after dilution with water. The influence of different factors on cloud point extraction (CPE) of Allura red such as pH media, equilibrium temperature, incubation time, concentration of surfactant and electrolyte concentration were investigated. Calibration curve was linear in a concentration range between 2-40 μgml-1 of Allura red with correlation coefficient r= 0.9998 for TX-114 and 0.9992 for Brij-35.The developed procedure was applied for estimation and preconcentration of Allura red in different food samples.

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

English (5)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2017 (1)

2016 (4)

2014 (1)