research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
Dissemination Multi-Drug and Carbapenems Resistant Pseudomonas aeruginosa among Clinical Isolates in Najaf Hospitals
نشر البكتيريا متعددة الأدوية والكارباapينيمات Pseudomonas aeruginosa بين العيادات الإكلينيكية في مستشفيات النجف

Authors: Alaa Abdulhussein Rasool علاء عبد الحسين --- Ali M. Almohana عي المحنة
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2017 Volume: 9 Issue: 3 Pages: 146-155
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Pseudomonas aeruginosa is one of the most common Gram negative pathogens associated with nosocomial infections. Carbapenems, specially imipenem and meropenem have the widest activity ranges of any β-lactam antibiotics and are often the most appropriate agents for use in the treatment of infections caused by multi-drug resistant P. aeruginosa. Resistance to carbapenems is emerging, and it is a great problem to therapeutic the serious infections caused by this bacteria.

Pseudomonas aeruginosa هي واحدة من أكثر مسببات الأمراض السرطانية شيوعًا المرتبطة بالعداوى المستشفوية. تمتلك Carbapenems ، خاصة imipenem و Meropenem ، نطاق أوسع من أي مضادات حيوية من β-lactam وهي غالباً أكثر العوامل الملائمة لاستخدامها في علاج العدوى الناجمة عن P. aeruginosa المقاوم للعقاقير المتعددة. تظهر المقاومة ل carbapenems ، وأنها مشكلة كبيرة للعلاج من الإصابات الخطيرة التي تسببها هذه البكتيريا.


Article
Dissemination of Carbapenem Resistant Pseudomonas aeruginosa among Burn Patients in Karbala Province Iraq
إنتشار بكتريا Pseudomonas aeruginosa المقاومة للكارببنيم بين مرضى الحروق في محافظة كربلاء/ العراق

Authors: Aseel A. Shilba أسيل عبدالرضا شلبه --- Raghad H. Al-Azzawi رغد حربي العزاوي --- Salwa J. Al-Awadi سلوى جابر العوادي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 3A Pages: 1850-1857
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

In this study, 158 clinical samples were collected from hospitalized burn patients during the period from December 2012 to June 2013 in Karbala province Iraq. Bacterial isolates were identified using conventional biochemical tests and then identification was confirmed by using Vitek-2 compact system. Pseudomonas aeruginosa recovery was 60 isolates in this study. These isolates were analyzed for antibiotic susceptibility by the disk diffusion test (DDT) according to Kirby Bauer's method using seven clinically important antipseudomonal agents: carbapenems (Imipenem and Meropenem), pencillins (Piperacillin), cephalosporins (Ceftazidim), monobactam (Aztreonam), quinolones (Ciprofloxacin) and aminoglycosides (Gentamicin). The results of resistance were as following: Imipenem 58.33%, Meropenem 66.67%, Piperacillin 86.67%, Ceftazidim 51.67%, Aztreonam 43.33%, Ciprofloxacin 46.67% and Gentamicin 91.67%. Antibiotic susceptibility test was confirmed by using VITEK-2 compact system. Differences between antibiotic susceptibility levels were calculated by Chi-square for each antibiotic. Results were highly significant for all antibiotic groups, p <0.01. The prevalence of increasing resistance rate to carbapenems, the final drug choice for the treatment of P. aeruginosa, among the immunocompromized burn patients is due to the increasing usage of this group especially Meropenem.

الخلاصةفي هذه الدراسة تم جمع 158 عينة سريرية من مرضى الحروق الراقدين خلال الفترة الواقعة ما بين كانون الأول 2012 و حزيران 2013 في محافظة كربلاء/ العراق. تم تشخيص العزلات البكتيرية باستخدام الاختبارات الكيموحيوية التقليدية ثم تم تأكيد التشخيص بواسطة استخدام جهاز Vitek-2 compact. تم الحصول على 60 عزلة عائدة لبكتريا Pseudomonas aeruginosa. أجريت فحوصات الحساسية للمضادات الحياتية على هذه العزلات بواسطة طريقة انتشار الأقراص DDT)) لكيربي بوير, وذلك باستخدام سبعة مضادات للزوائف الزنجارية P. aeruginosa مهمة سريرياً هي الكارببنيم (إميبينيم وميروبنيم) ، البنسلينات (ببراسلين)، السيفالوسبورين (سيفتازيديم) ، المونوبكتام (أزترونام) ، الكينولونات (سبروفلوكسسين) والامينوكلايكوسيدات (جنتمايسين). كانت نتائج المقاومة المستحصلة من الاختبار كالآتي : 58.33% للإميبينيم ، 66.67%, ميروبينيم ، 86.67% ببراسلين , 51.67% سيفتازيديم ،43.33% أزترونام, 46.67% سبروفلوكسسين و91.67% للجنتمايسين. تم تأكيد اختبار الحساسية للمضادات الحياتية بواسطة استخدام جهاز Vitek-2 compact. إن الفروقات بين مستويات الحساسية حسبت بواسطة مربع كاي (Chi-square) لكل مضاد حيوي والتي أظهرت قيمة معنوية عالية لجميع المضادات الحياتية المستخدمة في هذه الدراسة, بمستوى p < 0.01. إن ظهور نسبة المقاومة المتزايدة للكارببنيم (وهو الخيار العلاجي الأخير لعلاج الزوائف الزنجارية P. aeruginosa) بين مرضى الحروق هابطي المناعة هو نتيجة الاستخدام المتزايد لهذه المجموعة، خصوصاً الميروبنيم.


Article
Prevalence of Metallo-β-Lactamaseproducing Pseudomonas aeruginosaisolated from different clinical samples in Baghdad province

Authors: Alaa H. Al-Charrakh علاء الجراخ --- Salwa Jaber Al-Awadi سلوى جابر العوادي --- Ahmed Salim Mohammed احمد سالم محمد
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2014 Volume: 10 Issue: 18 Pages: 13-19
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Metallo beta lactamase(MBL) producing Pseudomonas aeruginosahave been reported to be an important nosocomialinfections.Pseudomonas aeruginosa is a leading cause of nosocomial infections, giving risetoa wide range of life-threatening conditions. Its intrinsic & acquired resistance to many antimicrobial agents and its ability to developmultidrug resistance imposes a serious therapeutic problem.Materials and Methods: A total of 75 P.aeruginosaisolates were isolated from different clinical samples in some public & private hospitals in Baghdad city during the period from April to August 2011.Bacterial identification was done using conventional cultural & chemical methods &and VITEk 2 cards for identification (GN), while the minimum inhibitory concentration (MIC) testing was performed using disk diffusion,E-test for Imipenem& Meropenem(oxoid, UK) & (AST-GN30)cards in VITEK 2 automated system(bioMérieux, , France).Each P.aeruginosa isolates showed resistance to Carbapenems(Imipenem& Meropenem) were subjected to Imipenem-EDTA combined disc synergy test (CDST) to investigate the production of MBL(confirmative test)Results:Out of 75 P.aeruginosa isolates,16 (21.3%) were grow on MacConkey agar supplemented with Meropenem4mg/L (MMAC),this method used as screening test, The MIC of different antibiotics was performed on these isolates using different methods(VITEK2AST-GN30,Imipenem&Meropenem E-test) showed that 6 (37.5%) isolates were Carbapenem resistant MIC ≥16µg/ml,while 4(25%) pseudomonas isolates appear to be MBL producer usingImipenem-EDTA combined disc synergy test(CDST). Discussion: MBL mediated carbapenemresistance in P. aeruginosa is a cause for concern in thetherapy of critically ill patients. The MBL producing P. aeruginosa isolates were more resistant to various antimicrobial agents. This result suggests that MBL producing isolates in hospitals may cause serious infections that illustrated when these strains were responsible for a nosocomial outbreak.The findings strongly suggest that there is a need to track the detection of MBL producers and that judicious use of carbapenems is necessary to prevent the further spread of these organisms.Conclusion: The prevalence of multi-drug resistant P.aeruginosa isolates especially Carbapenem resistant bacteria was increased in Baghdad province.Phenotypic characterization of MBLs provide information about the prevalence of MBLs producing P. aeruginosa in Baghdad.

بكتريا الزوائف الزنجارية المنتجة لانزيم Metallo-β-lactamase مثبته بانها من المسببات المهمة للاصابات والالتهابات المختلفة في المستشفيات. بكتريا الزوائف الزنجارية لها قابلية عالية على مقاومة العديد من المضادات الحياتية المستخدمة حاليا من خلال ميكانيات مختلفة منها داخلية او مكتسبة واهم الميكانيكيات هو انتاج انزيم β-lactamaseMetallo- تم جمع 75 عزلة من بكتريا الزوائف الزنجارية من مختلف العينات السريرية من بعض المستشفيات والمختبرات الحكومية والخاصة في محافظة بغداد للفترة من نيسان ولغاية اب لعام 2011. تم تشخيص البكتريا باستخدام مختلف الطرق سواء كانت فحوص كيميائية او عن طريق تشخيص البكتريا في اوساط زرعية مختلفة,كذلك تم تشخيص العزلات البكتيرية باستخدام جهاز VITEK2 وتم قياس الحساسية الدوائية للعزلات البكتيرية باستخدام disk diffusion وكذلك تم قياس اقل تركيز مثبط من العقار (MIC) باستخدام جهاز VITEK2 وكذلك طريقة E-Test لعقاريImipenem وMeropenem وتم اجراء فحص (CDST) كفحص تاكيدي للعزلات المقاومة لعقاري Imipenem ,Meropenem للتاكد من انتاج انزيم MBL .وتم التوصل للنتائج التالية:نسبة انتشار العزلات المقاومة لعقارات الكاربابينيم هي 8% وعدد العزلات البكتيرية المنتجة لانزيم MBL باستخدام الطرق المظهرية هو 4 وبنسبة 5.3%.


Article
Pathogenicity of Carbapenems and Third Generation Cephalosporins Resistant K. pneumoniae in Murine Urinary System
امراضية الكليبسيلا الرئوية المقاومة لمضادات الكاربابنيم والجيل الثالث سيفالوسبورين في الجهاز البولي للفئران

Authors: Abdulkadir K. Rhumaid عبد القادر كريم رميض --- Harith J.F. Al-Mathkhury حارث جبار فهد المذخوري
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 4B Pages: 3072-3082
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

One hundred and nine clinical lactose fermenter isolates were collected from different samples (urine, stool, wound swab, blood, and sputum) , in a period from February 2014 till May 2014. All samples gathered from Alyarmok laboratories, Alkadimiya laboratories, and Baghdad teaching laboratories which are situated at Baghdad city. Fifty three (48,62%) isolates were identified as Klebsiella pneumoniae depending on microscopic characterization , conventional biochemical tests and then the identification confirmed with API 20E system . The rest of 56(51, 38%) isolates represented other bacteria.Susceptibility test was achieved to all fifty-three K. pneumoniae isolates using five antibiotic disks (Ceftazidime, Ceftriaxone, Cefotaxime, Imipenem, and Meropenem). Most of tested isolates were susceptible to Meropenem and Imipenem, 90.5% and 77.3%, respectively, and less susceptible to third generation Cephalosporin. Pathogenicity of Carbapenems and the third generation Cephalosporins resistant K. pneumoniae in murine urinary system in this study revealed Cabrapenem resistant isolates (K2 and K3) displayed severe histopathological changes compared to the third generation Cephalosporins resistant isolates (K6 and K46).

جمعت 109 عزلة مخمرة لسكر اللاكتوز للمدة من شباط ولغاية شهر ايار2014 من مختبرات مستشفى اليرموك والكاظمية ومستشفى بغداد التعليمي في مدينة بغداد حيث شملت مختلف العينات السريرية (ادرار و خروج ومسحات جروح وعينات دم وقشع). وكانت نسبة بكتريا K. pneumoniae 48,62% تعود لنوع K. pneumoniae وباقي انواع البكتريا شكلت نسبة 51,73% . تم تشخيص عزلات K. pneumoniae اعتمادا على الصفات المظهرية والمجهرية والفحوصات الكيموحياتية . وقد تم تأكيد التشخيص باستعمال نظام Api 20 E . اظهرت نتائج فحص الحساسية الدوائية لثلاث و خمسين عزلة K. pneumoniae باستعمال خمسة انواع من مضادات الحياة ( سيفتازديم و سفتراكزون و سيفوتكسايم و اميبينيم و ميروبينيم) ، اظهرت معظم العزلات قيد الدراسة حساسية لمضادي ميروبينيم واميبنيم بنسب مئوية 90.5% و 77.3% على التتابع. واظهرت العزلات حساسية اقل لمضادات الجيل الثالث سيفالوسبورينات. كمابينت دراسة امراضية العزلات المقاومة لمضادات الكاربابنيم ومضادات الجيل الثالث سيفالوسبورين في الجهاز البولي للفئران ، ان عزلات الكليبسيلا الرئوية المقاومة للمضادات (K2 وK3) اظهرت تغييرات نسيجية شديدة مقارنة بالعزلات المقاومة للجيل الثالث سيفالوسبورين (K6 وK46).


Article
3.DETECTION OF NEW DELHI METALLO-BETA-LACTAMASE-1 (BLANDM-1) IN CARBAPENEM-RESISTANT PSEUDOMONAS AERUGINOSA ISOLATED FROM CLINICAL SAMPLES IN WASIT HOSPITALS

Authors: Zeyad K. Hussein --- Haider S. Kadhim --- Jabbar S. Hassan
Journal: IRAQI JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES المجلة العراقية للعلوم الطبية ISSN: P16816579,E22244719 Year: 2018 Volume: 16 Issue: 3 Pages: 239-246
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Background:Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) infections are clinical problem, it is a difficult to treat because of high resistant to many antibiotics (Multi-drug resistant) and a high risk of emergence of resistance during therapy. Carbapenems are therapeutic choice against infections caused by Gram-negative bacilli including strains of P. aeruginosa. New Delhi metallo-β-lactamase-1 (blaNDM-1) gene, an acquired class B carbapenemase. Dissemination predominantly involves transfer of the blaNDM-1 gene among promiscuous plasmids and clonal outbreaks. Bacteria with NDM-1 are typically resistant to nearly all antibiotics.Objective:To detect blaNDM-1 in the isolates of P. aeruginosa, which were recovered from various clinical samples from hospitalized patients in Wasit hospitals.Methods: This cross-sectional study involved 200 clinical samples were collected from three major hospitals in Wasit province. Samples were inoculated in Mackonkey and blood agar for primary isolation and then biochemical tests were used to confirm diagnosis of P. aeruginosa. The susceptibility test for 14 types of antibacterial drugs were tested by using disk diffusion method. Chromosomal and plasmid DNA were extracted by using special methods.Results: Out of 36 carbapenems resistant P. aeruginosa (CRPA) isolates, there were 18 isolates (50%) positive for blaNDM-1 gene.Conclusion: Rate of occurrence of blaNDM-1producers is highest among carbapenem-resistant P. aeruginosa isolated from clinical samples in Wasit hospitals. Therefore, its recognizable proof in clinical bacterial diseases will be suspected in any carbapenem resistance P. aeruginosa.Keywords: P. aeruginosa; carbapenems; metallo-β-lactamase; blaNDM-1Citation: Hussein ZK, Kadhim HS, Hassan JS. Detection of New Delhi metallo-beta-lactamase-1 (blaNDM-1) in carbapenem-resistant pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples in Wasit hospitals. Iraqi JMS. 2018; 16(3): 239-246. doi: 10.22578/IJMS.16.3.3


Article
Occurrence and Detection of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates in Najaf Hospitals
حدوث والكشف عن Carbapenemase المنتجة للالكلبسيلة الرئوية عزلات السريرية في مستشفيات النجف

Loading...
Loading...
Abstract

Resistance to carbapenems is emerging, and it is a great problem to therapeutics. Carbapenemase producing Klebsiella pneumoniae have been reported to be important cause of nosocomial infections. There is no information available on carbapenemase producing K. pneumoniae from Najaf. The purpose of this study was undertaken to determine the occurrence of carbapenmase including metallo β-lactamases (MBLS), Klebsiella pnuemoniae carbapenemase (KPC) and GES-β-lactamase producing K. pneumoniae. A total of 770 clinical samples were collected from April to July, 2010. The K. pneumoniae isolates were identified according to API 20E system. Phenotypic detection of carbapenemase was performed by using the imipenem-EDTA disk method and confirmed by the modified Hodg test. KPC was detected on KPC CHROMagar medium. The isolates were subjected to polymerase chain reaction (PCR) assays with specific primers for blaIMP, blaVIM blaKPC. blaCTX-M and blaAmpC. Only 108 (14.%) K. pneumoniae isolates were recovered from clinical infections. only 95 (88%) isolates were β-lactam resistant (resistant to both ampicillin and amoxicillin). Of the β-lactam resistant isolates, 4/95 (4.2%) were found to be carbapenem disk resistant, of which,2 (50%) gave positive result with the imipenem-EDTA test, 4 (100%) gave positive result with modefied Hodg test and all isolates (100%) gave heavy growth on KPC CHROMagar. In PCR experiments using specific primers for blaIMP, blaVIM and blaKPC genes, the results were negative among all isolates. All isolate were harbored blaCTX-M and blaAmpC genes. The present findings suggest that the spread of carbapenemases in isolates is high in Najaf.

تعتبر مقاومة مضادات الكاربابنيم من المشاكل التي تواجه العلاجات الدوائية حاليا. والذي يتوسطه في كثير من الأحيان إنتاج إنزيمات الكاربابنيميز الذي تنتجه بكتريا الكلبسيلا الرئوية والمسببة لعدوى المستشفيات المكتسب. ولعدم وجود أي معلومات تفيد عن انتشار البكتريا المنتجة لهذا الانزيم والمقاومة لمضادات الكاربابنيم في مستشفيات النجف, جاء هدف هذه الدراسة لتحديد انتشار هذه البكتريا في محافظة النجف. جمعت 770 عينة سريرية من مستشفبات النجف للفترة بين نيسان وتموز لعام 2010. استخدمت الاختبارات المظهرية التأكيدية لإنزيمات الكاربابنيميز والتي أكدت باستخدام تقنية تفاعلات البلمرة PCR للتحري عن الجينات المنتجة لهذا الإنزيم. تم تشخيص 108)14.0%) عزلة تابعة لبكتريا الكليبسيلا الرئوية. وجد إن 95 (88%) منها كانت مقاومة لمضادات البيتالاكتام بشكل عام . أربعة عزلات (4.2%) فقط أبدت مقاومة مظهرية لمضادات الكاربابنيم بطريقة انتشار القرص لكيربي-باور, منها عزلتان (50%) أعطت فحصا موجبا لاختبار imipenem-EDTA test. كما ان جميع العزلات المقاومة للكالربابنيم كانت موجبة لاختباري modefied Hodg test و KPC CHROMagar. كانت نتيجة PCR سلبية لجميع جينات الكاربابنيميز blaIMP, blaVIM blaKPC قيد الدراسة. في حين أعطت هذه العزلات نتيجة ايجابية للجينات المنتجة لإنزيمات البيتالاكتانيز واسعة الطيف CTX-M وجين AmpC.

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

English (6)


Year
From To Submit

2018 (1)

2017 (1)

2015 (2)

2014 (1)

2013 (1)