research centers


Search results: Found 168

Listing 1 - 10 of 168 << page
of 17
>>
Sort by

Article
Detection of extended spectrum B-lactamase in E. coli from clinical samples

Author: Ansam M. Hamdoon انسام محمد حمدون
Journal: Annals of the College of Medicine Mosul مجلة طب الموصل ISSN: 00271446 23096217 Year: 2011 Volume: 37 Issue: 1&2 Pages: 122-128
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Objectives: 1- To study the frequency of ESBL (extended spectrum beta lactamase) among E. coli clinical isolates. 2- To determine the antibiotic profile for the isolates. 3- To determine the difference between the antimicrobial susceptibility of the ESBL producing E. coli and non producers.Methods: A 4-months review of patients from three different hospitals who were diagnosed to have genitourinary tract infections with E. coli. These isolates were identified and assessed for their production of B-lactamase, and their antibiotic susceptibility to 21 different antimicrobial agents was determined.Results: Out of the total 136 E. coli isolates, 58.82% were found to be ESBL producers. The most effective antimicrobial agent against the isolates was amikacin (85%), followed by ciprofloxacin (67.6%), while all the isolates were fully resistant to penicillin, cephradine, cephalothin and carbencillin. Multi-drug resistance (MDR) were found to be more among the ESBL producers. There was a statistical association between the production of B-lactamase and the resistance to Amikacin, nitrofurantoin, levofloxacin, kanamicin, nalidixic acid, gentamicin, piperacillin, cefotaxime and cephalexin.Conclusions: This study shows that E. coli recovered from clinical specimens produce B-lactamase in high percentage and are resistant to penicillins and most cephalosporins. In addition, the MDR was higher among the B-lactamase producers. Therefore, determination of B-lactamases production, antimicrobial sensitivity of the isolates and strict antibiotic policy should be adopted in hospitals to take steps for reducing the bacterial resistance.

الأهداف: دراسة وجود أنزيم البيتا لاكتاميز في العزلات السريرية للشريشيات القولونية وتحديد حساسيتها للمضادات الحيوية. بالإضافة إلى دراسة الفرق بين منتجات أنزيم البيتا لاكتاميز وغير المنتجة للإنزيم من ناحية حساسيتها للمضادات الحيوية.طرق العمل: كانت مدة جمع العينات 4 أشهر من مرضى من ثلاث مستشفيات مختلفة. تم عزل الشريشيات القولونية عندهم من خمج الجهاز البولي والتناسلي وفحصت العزلات من ناحية إنتاجها لإنزيم البيتا لاكتاميز ومدى حساسيتها ﻟ 21 نوعا مختلفا من المضادات الحيوية.النتائج: خلال فترة الدراسة وجد أن 58,82% من العزلات مكونة لإنزيم البيتا لاكتاميز وقد أظهر مضاد الاميكاسين أعلى نسبة حساسية (85%) يليه السبروفلوكساسين (67,6%). كانت كل العزلات مقاومة للبنسلين والسيفرادين والسيفالوثين والكاربنسلين. كما وجد أن العزلات المقاومة لأكثر من نوع من المضادات الجرثومية كانت الأكثر ضمن منتجات إنزيم البيتا لاكتاميز. كانت هناك علاقة إحصائية ايجابية بين منتجات الإنزيم ومضادات الاميكاسين، نايتروفيورانتوين، ليفوفلوكساسين، كانامايسين، ناليدكسيك اسيد، جنتامايسين، بيبراسيللين، سيفوتاكسيم وسيفاليكسين.الاستنتاج: أظهرت هذه الدراسة أن نسبه عالية من عزلات الشريشيات القولونية كانت منتجة لإنزيم البيتا لاكتاميز وهي مقاومة للبنسلينات ولنسبة كبيرة من السيفالوسبورينات. كما أن العزلات المقاومة لأنواع متعددة من المضادات الجرثومية كانت أكثر شيوعا ضمن منتجات الأنزيم. لذا فان تحديد حساسية العزلات للمضادات الحيوية وإنتاجها لإنزيم البيتا لاكتاميز وتقليص استخدام المضادات الحيوية في المستشفيات يجب أن يتم العمل به لتقليل إنتاج هذا الإنزيم.

Keywords

B-lactamase --- E. coli


Article
CAMEL RUMINAL BACTERIA,THEIR COUNT AND ANTIBACTERIAL EFFECT INCOMPARSION TO OTHER RUMINANT ANIMALS
بكتريا كرش الجمال اعدادها وتاثيرها المضاد للجراثيم مقارنة مع الحيوانات المجترة الاخرى

Author: Fawziah A.Abdulla * _ A Adnan M. Al—Rodhan فوزية علي عبد الله عدنان موسى الروضان
Journal: Basrah Journal of Veterinary Research. مجلة البصرة للابحاث البيطرية ISSN: Print:18138497 E; 24108456 Year: 2007 Volume: 6 Issue: 1 Pages: 38-44
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

The baicterial and fungal population in the rumen fluid was measured by using, different Vcultures mediia and incubation temperature. The Psychrophil, Camel, higher mean of mesophils,‘psychrophilsj, coli form and fungi count was found in the rumenal fluid of sheep. While highermean of staphylococci and Escherichia coli count was observed in the rumenal fluid of camel.Significant mean difference among microbial population in the rumenal fluid was observedbetween camel and sheep and between sheep and cow concerning the psychrophilic bacteria Also _significant mean difference was observed in E coli mean count among camel ,sheep and cow I,rumenal fluid microbial population .There was no significant difference in the mean count ofmesophils ,coliforrn ,staphy1ococci and fungi.A freshly isolated _E.coli from rumenal fluid of camel had antibacterial activity against 'Streptococcus: spp and Staph aureus

تم حساب مجاميع الجراثيم والفطريات الموجودة في سائل الكرش باستخدام اوساط زرعية مختلفة وبدرجات حضن مختلفة ان اعلى معدل لعدد الجراثيم المحبة لدرجات الحرارة المعتدلة والمحبة للبرودة والجراثيم القولونيةفي سائل كرش الجمالولوحظ فرق احصائي معنوي في معدل عدد الجراثيم المحبة للبرودةبين الجمال والاغنام وبين الاغنام والابقار ولذلك لوحظ فرق احصائي معنويفي معدل عدد الجراثيمالمحبة لدرجات الحرارةالمعتدلة والجراثيم القولونية والمكورات العنقودية والفطريات ان الشريكيا القولونية المعزولة من كرش الجمال اظهرتفعالية مضادةللجراثيم المكورات السبحيةوالمكورات العنقودية

Keywords

Camel Psychrophil --- E.coli


Article
The incidence of Lower (UTI) according to the age and sex in Ramadi City.

Author: Essam M. Abdullah* VM, PhD د. عصام عبد الله
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: 00419419 Year: 2009 Volume: 51 Issue: 3 Pages: 289-291
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Summary:Back ground: A urinary tract infection is one of the most common diseases occurring from neonate up to geriatric age groups Patients and Methods: A total of (100) Midstream urine (MSU) samples were collected from patients having signs and symptoms of Lower urinary tract infection. These patients were attending Urology Clinic, Ramadi General Hospital. Result: Culturing of (100) MSU samples on MacConky and blood agar resulted in (5) types of bacteria which included: Escherichia coli (46%) and it was found the most frequent bacteria causing LUTI. This is followed by Klebsiella pneumonia (23%), Pseudomonas aeruginosa (13%), Proteus mirabilis (10%) and Staphylococcus epidermidis (8%).Conclusion: Out of the total studied samples, (38%) were males and (62%) were females. It was found that the age of frequent infection was 60 year in male, while in female was 16-35 year.Key word: MSU, E. coli, LUTI.

Keywords

MSU --- E. coli --- LUTI.


Article
DETECTION OF VIRULENCE AND ADHERENCE GENE IN Escherichia Coli O157:H7 ISOLATED FROM ANIMAL PRODUCTS
التحري عن جينات الضراوه والالتصاق في جرثومة الاشيريشيا القولونية O157:H7 المعزولة من المنتجات الحيوانية

Author: Basil A. Abbas باسل عبد الزهرة عباس
Journal: Basrah Journal of Veterinary Research. مجلة البصرة للابحاث البيطرية ISSN: Print:18138497 E; 24108456 Year: 2013 Volume: 12 Issue: 2 Pages: 95-103
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

Twenty nine E. coli isolates were previously isolated from beef from slaughter house, and raw milk of different origin were collected from different parts in Basrah. Five E. coli isolates were identified as E.coli O157:H7 using O157 and H7 antisera. E. coli O157:H7 isolates were tested for antimicrobial susceptibility test. The results showed that all tested bacteria were sensitive to gentamycin and Amikacin and resistant to amoxicillin and cefoxitim. The DNA of these isolates were amplified to detect verotoxins gene (vt1, 91bp) and pyelonephritis-associated pili gene ( pap,91bp). All the isolates were observed having (vt1) All the isolates were observed having (vt1) and pap genes.

Keywords

E.coli --- Beef --- Gentamycin.


Article
-SURVEY OF PATHOGENIC BACTERIA IN FRESHWATER CRAB (POTAMON MESOPOTAMICUM) COLLECTED FROM TIGRIS , BASRAH.

Author: Ghazi maleh Al-Malki
Journal: Basrah Journal of Veterinary Research. مجلة البصرة للابحاث البيطرية ISSN: Print:18138497 E; 24108456 Year: 2015 Volume: 14 Issue: 1 Pages: 62-69
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

The present study was carried out to determine the presence of pathogenic bacteria in freshwater crab (Potamon mesopotamicum) in Tigris at North of Qurna, as well as their antibiotic resistance. A total of 21 bacterial isolates consisting three bacterial species were isolated from freshwater crab, P. aeroginosa, E. coli, A. hydrophila kanamycin was found to be effective against all the bacterial isolated whilst the highest percentage of antibiotic resistance was shown beyond to Lincomycin (76.4%) followed by ampicilin(66.14%), Erythromycin(57.3%).

Keywords

freshwater --- Lincomycin --- E. coli.


Article
Microbiological Quality of Wheat Cultivated in Many Different Regions of Iraq

Authors: Abeer Salh Alhendi --- Hiba Ezzat Mohammed
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2018 Volume: 59 Issue: 2A Pages: 654-659
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Microbiological quality (total plate count, yeast and molds, coliform, and E. coli) of wheat cultivated in seven provinces of Iraqi were determined and compared to Standard Quality of Iraq (IQS) and to the standardization of Food and Drug Administration (FDA). The samples were collected from fields, and some samples taken from near of a street (reachable by people) and far of a street as well as rural fields. The regulation has two limits, which are good and acceptable limits, and the samples within the acceptable limit should be two samples of five. The results showed that all analyzed samples were within the acceptable limit that approved by IQS and FDA. There was one field exceed IQS regulation and there were several fields exceed the FDA regulations related to the number of samples within the good limit. The main reason for exceeding was total plate count (APC) followed by yeast and molds. Enhancing the microbiological quality of wheat cultivated in Iraq should be truly considered to be within IQS and FDA regulations.

Keywords

Wheat --- Microbiology --- E. coli.


Article
Detection of LT and ST Toxin genes for E.coli isolated from UTI
الكشف عن جينات الذيفان Lt و St لبكتريا الاكولاي والمعزولة من التهاب المجاري البولية

Loading...
Loading...
Abstract

This study design ,study the importance of recurrence Urinary Tract infection caused by enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) via detect LT and ST toxin genes in E.coli samples isolated from patients with UTI. A total of 60 urinary samples were collected from patients with UTI especially from children Infected in the Central Child Hospital and Al-Yarmouk Teaching Hospital in Baghdad for the period 27/12/2011 to 7/7/2012.isolation of E. coli was performed according to the standard laboratory methods ,Agglutination test was done in the Central Health Laboratory and API 20E system was done in the Children Teaching Hospital. DNA was extracted from samples by High-Speed Plasmid Mini Kit DNA and pure yield plasmid miniprep system were used as a template for PCR reaction. Two sets of primers were used to simultaneously detect the genes encoding LT and ST by multiplex PCR assay. Out of 60 samples ,15/60 negative (25%),45/60 positive (75% ), and infection in males was 6/45 (13.3%) While in females 25/45(56%). The percentage of LT gene 9/45 (20%), while none of samples were carrying ST gene. The results indicate that ETEC strains , with a relatively conserved genetic pool, are capable of causing urinary tract infection. Due to the importance of these strains in public health, it is suggested that the conventional methods used for their detection less accurate than molecular method Because of the great similarity with cholera toxin .

إن الهدف هو دراسة أسباب الإصابة المتكررة بالتهاب المسالك البولية نتيجة الإصابة ببكتريا enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) عن طريق الكشف عن جينات الذيفانات ( LT ,ST ) والمحمولة على البلازميدات والموجودة في بكتريا Escherichia coli والمعزولة من المرضى لمصابين بالالتهاب المسالك البولية UTI)). حيث تم جمع 60 نموذج من الإدرار من المرضى المصابين بالالتهاب المجاري البولية وبالأخص الأطفال الراقدين في مستشفى الطفل المركزي واليرموك التعليمي في بغداد وفي الفترة 2011/12/27 إلى 2012/7/7 , و أثبتت إن العزلة كانت تعود إلى بكتريا الــ E.coli بالاختبارات االمختبرية التقليدية والاختبارات المصلية التي أجريت في مختبر الصحة المركزي , واختبارات API 20E التي أجريت في مستشفى الطفل المركزي , إذ كانت 1560 عزلة سالبة للفحص أي بنسبة 25% و 2560 عزلة موجبة للفحص أي بنسبة 75%, وان نسبة إصابة الذكور 645 أي بنسبة 13,3% بينما الإناث كانت 2545 أي بنسبة 56%. استخلص ألــ DNA البلازميدي من عزلات E.coli باستخدام High-Speed Plasmid Mini Kit حيث استخدم بعدها كقالب في تفاعلات PCR إذ تم استخدام نوعين من البادئات وإدخالها في تفاعل PCR واحد .كانت نسبة جينات ألـ lt ( 945) 20% في حين لم يتم الحصول على جينات ألـ st .وبذلك أثبتت النتائج أن سلالة ETEC تحمل جينات الضراوة مما يجعلها قادرة على إحداث الإصابة بــ UTI(لذا تعتبر مهمة في مجال الصحة العامة ) , إن الاختبارات المصلية و المختبرية التقليدية لم تعد كافية للكشف بالإضافة إلى إنها اقل دقة من الاختبارات الجزيئية في التفريق بين أنواع البكتريا وأسباب إحداث الإصابة .

Keywords

ENTEROTOXIN --- E. COLI --- LT --- ST --- ENTEROTOXIN --- E. COLI --- LT --- ST


Article
Re-evaluation of lunation of the activity of somantibacterial drugs against clinical isolates of Escherichia coli in al- najaf al- ashref governorate

Authors: Adel H. Sheeh عادل شيح --- Saad B. Nashtar سعد نشتار
Journal: Al-Kindy College Medical Journal مجلة كلية الطب الكندي ISSN: 18109543 Year: 2010 Volume: 6 Issue: 1 Pages: 21-27
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Escherichia coli is one of the most important bacterial pathogen that can cause several disease to human being . In our study we try to investigate the sensitivity resistance pattern of Escherichia coli against three antibiotics ( Amikacin, Nalidixic acid and Cephalexin). Methods: For this purpose we collected 51 clinical isolates of Escherichia coli from stool and urine of outpatient and inpatient patients from different wards of AL-SADER Teaching Hospital in AL-NAJAF AL-ASHRAf, IRAQ, and tested by culture and sensitivity test . Results: The results appeared that Amikacin show the highest percentage of sensitivity ( 66.66 % ) , while Cephalexin show the lowest percentage of sensitivity ( 6.34 % ) .Conclusions: we conclude that Amikacin is the most sensitive antibacterial drug for Escherichia Coli as compared with Nalidixic acid and Cephalexin, while Cephalexin is the most resistant antibacterial drug for Escherichia Coli as compared with Amikacin and Nalidixic acid.


Article
EFFECT OF SUBMINIMAL INHIBITORY CONCENTRATION OF GENTAMICIN ON THE PATHOGENICITY OF ESCHERICHIA COLI CAUSING INFANTILE DIARRHOEA
تأثير ما تحت التركيز المثبط الأدنى للجنتامايسين على امراضية الايشريكية القولونية المسببة للإسهال لدى الرضع

Author: ABDULRAHMAN M.G. AL-FAHDAWI عبد الرحمن محمد جيران
Journal: Journal of university of Anbar for Pure science مجلة جامعة الانبار للعلوم الصرفة ISSN: ISSN: 19918941 Year: 2007 Volume: 1 Issue: 2 Pages: 10-15
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

One hundred patient infant complaining from infantile diarrhoea were studied, the percentage of E. coli infection was 24%. The in vitro adherence test was done to determine the adhesion capacity of bacteria to Human Buccal Epithelial Cells (HBECs). The result shows, increasing in the mean adhesion of E. coli as compared with the control group. Minimal Inhibitory Concentration (MIC) and sub Minimal Inhibitory Concentration (subMIC) of gentamicin was done to study the effect of subMIC of this antibiotic on the adhesion , the result shows that the using of gentamicin in lower doses (subMIC) decreases the adhesion capacity of bacteria .EPEC still mediclly important as a danger pathogen especially in poorly hyagiene communities such as Iraqi community.

تم دراسة 100 حالة لأطفال مصابين بالإسهال للتحري في دور الإصابة بالايشريكية القولونية لوحظ أن نسبةالإصابة بهذه الجرثومة هي % 24 تم دراسة اختبار اللصوق على الخلايا الطلائية الوجنية للإنسان خارج الجسمحيث لوحظ زيادة معدل التصاق هذه الجراثيم على تلك الخلايا بالمقارنة مع مجموعة السيطرة .لقد تم اختبار تأثيرمستويات منخفضة ما تحت التركيز المثبط الأدنى للمضاد الحيوي الجنتامايسين لدراسة مدى تأثيره على عمليةاللصوق ، لوحظ إن استخدام هذه التراكيز يقلل من القابلية الالتصاقية للجراثيم على الخلايا الطلائية . ان بكتريا (لا تزال مهمة طبيا كممرض خطر في المجتمعات التي تفتقر الى الظروف الصحية المتوازنة وهذا ما (EPECهو موجود في المجتمع العراقي .


Article
The rapid detection of E. coli 0157 Antigen in meat products by using ELISA Test Kit
التشخيص السريع لمستضدات الايشيريشيا القولونية نوع O157 في منتجات اللحوم باستخدام عُدة فحص الاليزا

Author: Maithem Ihsan Abdulrasool ميثم إحسان عبد الرسول العبيدي
Journal: The Iraqi Journal of Veterinary Medicine المجلة الطبية البيطرية العراقية ISSN: 16095693 Year: 2011 Volume: 35 Issue: 2 Pages: 61-65
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted for rapid detection of contamination of meat products with E. coli 0157 by usage of ELISA test kit as one of the most rapid and newest test. The study showed the efficiency of ELISA test kit used in this study in detection of bacteria antigen in meat products samples of raw beef meat , kabab and beef burger which subjected to improper storage conditions or undercooked and hence when some peoples uptake some of these products they suffered from clinical intoxication signs like diarrhea ,vomiting and hyperthermia. The kit showed the presence of (9) samples positive among (90) samples ; (2) positive out of (30) kabab samples,(3) positive out of (30) beef burger and (4) positive out of (30) raw beef meat after 16 hrs of enrichment of all samples in EC Modified broth including Novobiocin supplement as inhibitor of other bacteria and then the liquid supernatants from all prepared samples got tested by ELISA kit used in this study and the data recovered in less than 1 hr.The study indicated the ability of using ELISA kit for detection of E. coli 0157 antigens in food stuffs and reduce the time for releasing the results in less than 24 hrs when compared with conventional culturing procedure which reuiqred more than 3 days and launch the food products for consumption with focusing on the main point here which is the protection of our consumer safety.

اجريت هذه الدراسة لتشخيص تلوث منتجات اللحوم بجراثيم E.coli نوع O157 باستخدام عُدة فحص الاليزا كاحد الفحوصات السريعة الحديثة. اذ اظهرت الدراسة كفاءة فحص الاليزا بتشخيص وجود مستضدات الجرثومة في نماذج منتجات لحوم الابقارالغير المطبوخة والكباب والبركر البقري المستورد والتي لم يتم خزنها في ظروف مثالية اوتعرضت الى الطبخ غير السليم وحدث نتيجة تناولها من بعض الاشخاص الى ظهور اعراض تسمم سريرية منها الاسهال الحاد والقئ وارتفاع درجات الحرارة.اظهر الاختبار وجود (9) نماذج موجبة من اصل (90) وبواقع (2) انموذج من اصل (30 ) نموذج كباب و (3) انموذج من اصل (30) انموذج بركر بقري و (4) انموذج من اصل (30) انموذج لحم بقري بعد تنمية جميع النماذج لمدة 16 ساعة في وسط الــ EC Modified broth المضاف له مضاد الــ Novobiocin كمثبط لنمو الجراثيم الاخرى ومن ثم فحص السائل الطافي من تحضير النماذج جميعها بعُدة فحص الاليزا المستخدمة في هذه الدراسة خلال مدة اقل من ساعة والحصول على النتائج مقارنة بطول المدة اللازمة لطريقة العزل الجرثومي التقليدية.وبذلك يمكن الاعتماد على استخدام عدة فحص الاليزا للتشخيص السريع لوجود مستضدات هذه الجراثيم في نماذج الغذاء واعطاء النتائج بوقت اسرع وباقل من 24 ساعة واطلاق المنتجات للاستهلاك مع توفير النقطة الرئيسة وهي حماية المستهلك.

Keywords

E.coli 0157 --- antigen --- Elisa .

Listing 1 - 10 of 168 << page
of 17
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (168)


Language

English (107)

Arabic (29)

Arabic and English (29)


Year
From To Submit

2019 (8)

2018 (18)

2017 (27)

2016 (16)

2015 (19)

More...