research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Polymorphism of Exon 1 of Dopamine Receptor D3 (DRD3) gene and Exon 2 of 5-hydroxytryptamine type 2a (HTR2A) in Schizophrenia Baghdad Patients Sample
تعدد الأشكال في منطقه التشفير الاولى لمستقبلات الدوبامين ومنطقه التشفير الثانية لجين HTR2A في عينة من مرضى فصام الشخصية قي بغداد / العراق

Author: Najwa Sh. Ahmed نجوى شهاب احمد
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2 Pages: 55-65
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract: The aim of this study is to investigate the association between polymorphisms Exon1 of Dopamine Receptor D3 (DRD3) receptor and Exon 2 of 5-hydroxytryptamine type 2a (HTR2A) genes and schizophrenia patients from Baghdad Iraq. To achieve this goal, blood samples were collected from 50 patients with schizophrenia (25 samples of male and 25 samples of female) and 25 samples of healthy individual, DNA was isolated and the DRD3 receptor and HTR2A genes were amplified by using specific primers for exon1 and exon 2 of this genes, then sequencing of nucleic acid of genes was performed by machine is AB13730XL, (Applied Biosystem, Macro gen company, USA). The DNA sequencing results of flank sense of DRD3 receptor and HTR2A genes from healthy individual was found to be compatible 100% with wild type of Homo sapiens from the Gene Bank, the DNA sequencing results of flank sense of DRD3 receptor from 50 cases schizophrenia patients was found to be compatible 99% and score 398 and expect 0.0 with the wild type sequences of gene bank, and the differences may be attributed to one transition mutations (G/A), at position 1804 of exon 1. It is a missense mutation that leads to changes in amino acid from Serine (S) to Glysine (G). Our results showed that the incidence of G/A mutation was highly significant (X2=100, P<0.01). In total, 8% of Shizophreina patients had two transition mutation +1804 G/A and +1830 G/A single nucleotide polymorphism, and compatibility 99%, score 397 and expect 0.0 with the wild type sequences of gene bank. The +1830 G/A SNP was silent mutation which result change of codon from GCG to GCA (Alanine to Alanine). However, the DNA sequencing results of flank sense HTR2A genes from 50 cases schizophrenia patients was found to be compatible 99% and score 259 and expect 5e-132 with the wild type sequences of gene bank, there was no significant correlation between shizopherina and incidence of transition mutation G/A (Serine to Serine) at nucleotide 156 of exon 2 HTR2A gene (X2=0.055, P>0.05). In conclusion, our case study suggests that the 1804 A/G SNP of the DRD3 gene is strongly associated with genetic susceptibility to schizophrenia in the Baghdad / Iraqi population.

الخلاصة: الهدف من هذا البحث هو دراسة العلاقة بين الأشكال المتعددة في منطقة التشفير الاول لجين DRD3 ومنطقة التشفير الثاني لجين HTR2A لمرضى فصام الشخصية في بغداد / العراق . ولتحقيق هذا الهدف، تم جمع عينات دم من 50 مريضا يعانون من انفصام الشخصية (25 عينة من الذكور و 25 عينة من الإناث) و25 عينة من اشخاص اصحاء، تم عزل الحامض النووي وتضخيم DRD3 مستقبلات الجينات و HTR2Aباستخدام بادئات محددة لمنطقه التشفير الاولى ومنطقه التشفير الثانيه على التوالي واجراء تسلسل الاحماض النووية للجينات بواسطة آستخدام الجهاز AB13730XL ، من قبل شركة ماكروجين في الولايات المتحدة الأمريكية باستخدام برنامج BLAST في الموقع الالكتروني www.ncbi.nlm.nih.go وبرنامج BioEdit . أظهرت نتائج تتابع الحامض النووي الدنا للجين DRD3 و HTR2A عند أفراد السيطرة والذي تطابق بنسبة 100% مع الحامض النووي الدنا في البنك الجيني العالمي. ونتائج تسلسل الحامض النووي DRD3 مستقبلات ل 50 عينة من فصام الشخصية حيث كانت نسبة التطابق 99٪ ونقطة النجاح 398 وقيمة التوقع 0.0 مع تسلسل الحامض النووي للنوع البري من بنك الجينات، ويمكن أن يعزى الاختلاف الى وجود الطفره (G/A)، في الموقع 1804 من اكسون 1 ، وهي طفرة missense التي تودي الى تغير الحامض الأميني سيرين إلى كلايسين. وقد اظهر التحليل الإحصائي لهذه الطفرة G/A انها ذات تأثير عالي المعنوية P< 0.01 X2 = 100, . وكان 8٪ من مرضى فصام الشخصيه لهم طفرتين في الموقع +1804 G / A و G +1830 / A ومقدار التطابق 99٪، ونقطه النجاح 397 وقيمة التوقع 0.0 مع تسلسل النوع البري من بنك الجينات، بينما الطفره +1830 G / هي من الطفرات الصامته التي تؤدي الى تغيير الشفرة الوراثية GCA الى GCC واللتان تشفران لنفس الحامض الاميني الأدنين . ومع ذلك، تم العثور على نتائج تسلسل الحامض النووي لجين HTR2A ل50 عينة لمرضى انفصام الشخصية لنسبة تطابق 99٪ ونقطه نجاح 259 و قيمة التوقع 5e-132 مع تسلسل النوع البري من بنك الجينات، لم يكن هناك ارتباط كبير بين انفصام الشخصية وظهور الطفره في الموقع 156 من منطقه التشفير الثانية لجين HTR2A (سيرين الى سيرين) ضمن المعنوية P> 0.05 و X2 = 0.055. وتشير الدراسة ان 1804الطفرة A / G SNP من الجين DRD3 يرتبط بقوة مع ظهور مرض فصام الشخصية لدى عينة من المواطنين الموجودين في بغداد .


Article
Polymorphism of The Promote Region of Chicken Insulin like Growth Factor-1 and Association With Bone Abnormalities
التغايرات الوراثية في منطقة المشغل لجين IGF-1لعينات الدجاج وعلاقتها بتشوه العظام

Author: Farah Thamer Abdullah فرح ثامر عبدالله
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2015 Volume: 9 Issue: 2 Pages: 107-112
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

The insulin like growth factor-1(IGF-1) is important regulators in stimulating growth, protein synthesis, cell proliferation and differentiation in a variety of cell types. To achieve this goal, blood samples were collected from 50 Gallus gallus affected from bone abnormalities (distortion) and 50 samples a control group from the Animal farm/ College of Veterinary medicine/ University of Baghdad. DNA was isolated and the IGF-1genewas amplified by using specific primers for promoter region and 5' UTR of this genes, then DNA sequencing was performed by using AB13730XL, (Applied Bio system, Macro Gen company, USA). The DNA sequencing results of flank sense of IGF-1gene from a control group was found to be compatible 100% with wild type of Gallus gallus from the Gene Bank. On the other hand, sequencing results of the same gene from 35cases abnormalities (distortion) revealed of 99% compatible and score 1351 and expect 0.0 with the wild type sequences of gene bank. The minor differences could be attributed to two transversion substitutions of (G>T,T>G) and (C>T) on locations 404, 104, and 249 nucleic acid respectability. Fifteen cases of bone abnormalities (Distortion) of Gallus gallus, 99% compatibility have one Transversion substitution G>T on position 404 andone transition substitution (C>T) on 249 positions, under number Sequence ID: gb|JX414253.1|. In conclusion, our case study suggests that polymorphisms of IGF-1gene are strongly associated with vertebrate growth and development of some chicken breeds in Iraq. The aim of this study is to identify the genetic polymorphisms of IGF-1gene and its association with vertebrate growth and development of some chicken breeds in Iraq.

يعتبر عامل نمو الانسولين من المنظمات المهمة في تحفيز النمو، تخليق البروتين، والتكاثر والتمايز في مختلف أنواع الخلايا. استخدمت عينات دم من 50 دجاجة جنس Gallus gallus من المصابين بتشوهات العظام و 50 عينه من الاصحاء من الحقل الحيواني/ كلية الطب البيطري/ جامعة بغداد. وعزل الحامض النووي الدي اوكسي رايبوزي ( DNA(لهذه العينات وتم تضخيم جين عامل نمو الانسولين باستخدام بادئات متخصصه لمنطقه المشغل و 5' UTR لهذا الجين, ثم اجراء تسلسل الاحماض النووية باستخدام جهاز AB13730XL في شركة مايكروجين في الولايات المتحدة الامريكية. أظهرت نتائج تتابع الحامض النووي( الدنا ) لجين عامل نمو الانسولين لعينات السيطرة تطابقا بنسبة 100% مع الحمض النووي( الدنا) لجنس Gallus gallus عند مقارنتها مع مثيلاتها في البنك الجيني العالمي, و كانت نتائج تسلسل جين عامل نمو الانسولين في 35 عينة من المصابين بتشوه العظام من Gallus gallus المعزولة من العراق بنسبة تطابق 99% ( وسكور1351 والمتوقع 0.0 مع بنك الجينات العالمي) ويعزى الاختلاف نتيجه نوعين من الطفرات الانقلابية (G>T and T>G) وطفره انتقالية (C>T) في المواقع 404, 104 و 249 حامض نووي وعلى التوالي. لوحظ ان 15 عينة من المصابين بتشوهات العظام من جنس Gallus gallus ذات تطابق 99% لوجود طفره انقلابية واحدةG>T ضمن الموقع 404 و طفرة انتقالية (C>T) ضمن الموقع 249. تهدف الدراسة إلى التعرف على التغيرات الوراثية في جين IGF-I وعلاقتها بتشوه العظام في بعض السلالات.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2015 (1)

2014 (1)