research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Molecular diagnosis and genetic relationship of food and mouth disease virus serotype Asia1/Basne/Sul/2015
التشخيص الجزيئي والعلاقة الوراثية لمرض فيروس الحمى القلاعية المصلي Asia1 / Basne / Sul

Loading...
Loading...
Abstract

Foot and Mouth Disease (FMD) is the most economically important viral-induced livestock disease worldwide. From April to May of 2015, tongue epithelial tissue samples were collected from 36 cattle in six villages, which share the border with Iran. Samples were screened using RT-PCR to amplify a conserved region in the VP1 gene, and phylogenetic tree analysis was performed based on the VP1 nucleotide sequence results. Furthermore, the nucleotide sequence was converted to an amino acid sequence in order to detect similarities between the studied samples and those previously published in GenBank (NCBI). Epidemically, based on the amino acid residues, genetic similarity, and amino acid substitutions, the VP1 nucleotide sequences were determined to be close to a novel group, group VII, with 94% identity. The VP1 amino acid sequence analysis revealed a close relationship to the Asia/BAL/PAK/iso-2/2011 isolate (Accession no. JX435109), with 95.7% identity. Analysis of the studied samples revealed that the FMDV serotype Asia1 causing the outbreak in the Basne district belonged to group VII, which was introduced from the Balochistan province of Pakistan through illegal movement of animals from this region.

يعد مرض الحمى القلاعية من الأمراض الفايروسيه‌ ذو اهميه‌ اقتصادية‌ حول العالم. تم جمع عينات الأنسجة الظهارية السنية من البقرة في ست قرى في كردستان العراق‌ ذو حدود مشتركة‌ مع إيران من الفترة‌ أبريل إلى مايو2015. تم إجراء فحص العينات باستخدام RT-PCR بهدف لتضخيم منطقة محفوظة من جين VP1، وبناء على نتائج تتابع النيوكليوتيدات للجين المذكور وتم إجراء تحليل شجرة النشوء. اضافة الى ذلك، تم تحويل تسلسل النيوكليوتيدات إلى تسلسل الأحماض أميني من ‌أجل الكشف عن أوجه التشابه بين العينات المدروسة وتلك التي تم نشرها سابقا في البانك الجيني (GenBank NCBI). استناداً إلى بقايا الأحماض الأمينية والتشابه الوراثي واستبدال الحمض الأميني تم إجراء تحديد متواليات النيوكليوتيدات جين VP1 وبعد التحلي لأوضحت بانها قريبة من المجموعة السابعة‌‌ (group VII) حيث ان نسبه‌ التشابه هى 94٪. دراسة تتابع الاحماض الامينية اشارت الى ان هنالك علاقة وثيقة بعزلة آسيا BAL/PAK/iso-2/2011(Accession no. JX435109)، حيث ان نسبة‌ التماثل والتشابه هيه 95,7٪ موضحا. وكشف تحليل العينات المدروسة أن النمط المصلي لـFMDV Asia1 الذي مسبب ‌لتفشى المرض في منطقة باسني ينتمي إلى المجموعة السابعة والتي تم إدخالها من محافظه ‌بلوجستان الباكستان من‌ خلال الحركة غيرالقانونية ‌للحيوانات من هذه المنطقة.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)