Objectives: (1) to identify the opportunistic fungi from sputum and bronchial wash of patients with lower respiratory tract (LRT) infections in immunocompromised (IC) and immunocompetent (IP) patients, and apparently healthy controls, (2) to detect antibodies against Aspergillus species by double immunodiffusion test (ID). Subjects and methods: Three hundred patients suffering from LRT infections of both IC (150/300) and IP (150/300) patients were included in the study. The clinical specimens collected were samples of sputum (247), bronchial wash (80), and blood (300). The control group was 50 apparently healthy individuals, from whom sputum and blood were obtained. The identification of the isolated fungi was carried out by direct fluorescent and/or light microscopy, culture on different media, and biochemical tests. Moreover, the serums of patients with Aspergillus isolates were tested by double ID test for the detection of specific antibody.Results: One hundred eighty patients showed fungal elements in their clinical specimens (60%). Two hundred four funguses were detected, including 24 samples with 2 types of isolates. The identified fungi were encountered from both IC (60.9%) and IP (39.1%) patients with a significant difference between them (p< 0.001). Nine opportunistic genus-species were identified. Five were filamentous type namely Aspergillus spp., Penicillium spp., Cladosporium spp., Fusarium spp., and Geotrichum spp., while the other 4 were unicellular organisms including Candida spp., Saccharomyces cereviciae, Cryptococcus neoformans, and Rhodotorula rubra. In the control group, 36% showed fungal isolates in their sputa, and the ID test showed a positive result for antibody in only one patient with Aspergillus isolate.Conclusions: Many opportunistic fungi are important uncommon pathogens in LRT infections in IC patients. The ID test is of limited value for the detection of specific antibody of Aspergillus spp.Keywords: Opportunistic fungi, fungi in L.R.T.

الهدف: (1) تمييز الفطريات المأخوذة من القشع والغسيل القصبي لمرضى ذوي المناعة المنقوصة والمناعة الكفوءة للمصابين بخمج الجهاز التنفسي السفلي ومن أفراد أصحاء يمثلون مجموعة السيطرة. (2) الكشف عن الأجسام المضادة لفطر Aspergillus بوساطة فحص الانتشار المناعي المزدوج.عينات الدراسة وطرائق العمل: تضمنت هذه الدراسة 300 مريضاً يعانون من خمج الجهاز التنفسي السفلي 150/300 من ذوي المناعة المنقوصة و150/300 من ذوي المناعة الكفوءة. ان العينات السريرية التي تم جمعها كانت 247 عينة من القشع، 80 عينة من الغسيل القصبي، و300 عينة من الدم. كما تضمنت الدراسة مجموعة السيطرة التي شملت 50 من الأشخاص الأصحاء وتم الحصول منهم على 50 عينة من القشع و50 عينة من الدم. تم تمييز الفطريات المعزولة بواسطة الفحص المباشر باستخدام مجهر التألق الضوئي و/أو المجهر الضوئي، والزرع على أوساط مختلفة، وكذلك الفحوصات الكيموحيوية. بالإضافة إلى ذلك، تم إجراء فحوصات على مصل دم المرضى الذين عزلت منهم الـ Aspergillus spp. باستخدام فحص الانتشار المناعي المزدوج للكشف عن المضاد الخاص.النتائج: أظهر 180 مريضاً وجود عناصر فطرية انتهازية في عيناتهم السريرية (60%). تم تشخيص 204 فطر، وقد وجد نوعين من الفطريات في 24 عينة. تم حساب الفطريات المعزولة من المرضى ذوي المناعة المنقوصة (60,9%) ومن ذوي المناعة الكفوءة (39,1%) وكان هناك فرق معنوي بينهما (p< 0.001). ميّزت 9 أجناس وأنواع من الفطريات الانتهازية. كان 5 منها من النوع الخيطي وهي Aspergillus, Penicillium, Cladosporium, Fusarium, وGeotrichum بينما كانت الأربعة الأخرى أحادية الخلية وتشمل Candida spp. Saccharomyces cereviciae, Cryptococcus neoformans, وRhodotorula rubra. أظهر 36% من مجموعة السيطرة وجود عزلات فطرية في القشع وأظهر فحص الانتشار المناعي المزدوج نتيجة إيجابية لوجود الأجسام المضادة في مريض واحد فقط عزل منه الـ Aspergillus. الاستنتاجات: تعد بعض من الفطريات الانتهازية من الممرضات المهمة غير الشائعة في أخماج الجهاز التنفسي السفلي عند المرضى ذوي المناعة المنقوصة. ان فحص الانتشار المناعي المزدوج ذو قيمة محددة للكشف عن الأجسام المضادة.

Opportunistic fungi --- fungi in L.R.T.

Background: This work aimed to isolate and identify fungi from different superficial fungal infection since these infections are widely distributed among low socioeconomic level people.Patients and Methods: All clinical specimens from skin, hair, scalp and feet were diagnosed as dermatophytes or other fungi according to well-known established mycological methods for isolation and identification of certain fungi. Results: This study was undertaken at AL-Yarmook Teaching Hospital during the period January 2008-December 2009 in which 55 clinically diagnosed as fungal infection were the source of clinical specimens. Out of 55 cases it has been found that 45 specimens (81.8%) were positive for fungi from which 21 (46.6%) were dermatophytes, 16 (35.5%) pityriases versicolor, 8(18.2%) candida albicans.Conclusion: It is concluded that dermatophytes are the major cause of mycotic superficial infections and that skin is the predominant area of the body which is invaded by fungi.

Dermatophytes --- superficial fungi

The local Streptomyces sp. strain showed an ability to produce antimicrobial metabolite active against standard strains, in primary and secondary screening. The produced antibiotic was extracted, purified and identified as a peptide antibiotic produced about 1.4g/L in 7 days incubation period, and its LD50 was 5500. There was an inverse effect for orange acridine dye on the grown colonies number of S. sp., the 28 g/ml dye concentration was chosen as the best concentration because it led to colonies killing by 95%. Plasmid DNA extracted from S. sp. and then transformed to E. coli pBR 322, the E. coli pBR 322 showed negative results against the standard strains in primary screening before plasmid DNA transformation, while transformed E. coli pBR322 showed positive results. The antibiotic produced by trans. E. coli pBR322 was extracted, purified and identified by the same ways, which gave the same antibiotic produced by S. sp. with an increase of 2.2 g/L in the quantity and shorter period of time (2 days).

اظهرت العزلة المحلي Streptomyces sp. القدرة على انتاج مادة ذات فعالية مضادة للجراثيم القياسية في الغربلة الاولية والثانوية, تم عزل وتنقية وتشخيص المضاد المنتج وكان ذوطبيعة ببتيدية وامتلك نصف جرعة قاتلة 5500 ملغم/كلغم, وانتج بكمية محدودة 1.4غم/لتر في سبعة أيام. اظهرت نتائج المعاملة بالاكردين ان عدد المستعمرات النامية يتناسب عكسيا مع كمية الاكردين المضافة للوسط ، حيث بلغت 95%نسبة القتل عند تركيز 28μg/ml حيث تم اختياره كتركيز افضل لترحيل البلازميد. استخلص الـDNA البلازميدي من S. sp.. ومن ثم نقل البلازميد الى بكتريا الـE. coli pBR322 حيث اظهرت هذه البكتريا صفة انتاج مضاد بكتيري في الغربلة الاولية لم تكن تمتلكها قبل عملية النقل. ومن ثم تم عزل, تنقية وتشخيص المضاد المنتج من الـE. coli pBR322 trans. بنفس الطريقة المستعملة لعزل, تنقية وتشخيص المضاد المنتج من S. sp. ، وكان هذا المضاد هو نفس المضاد المنتج من بكتريا S. sp. وبكمية اكبر2.2غم/لتر في فترة زمنية قصيرة (يومين).

Peptide --- DNA --- Fungi

The effect of aspirin( non steroidal anti-inflammtory drug a cyclooxygenase inhibitor) as antifungal has been studied against some opportunistic fungi : Aspergillus flavus , A. niger , A. terreus ,Cryptococcus neoformans, Penicillium sp . and Trichoderma sp. Aspirin was showed a potent activity against all tested fungi in vitro . Aspirin gives the greatest effects in a concentration of 1000 µg , 2000 µg and 3000 µg causing 100% inhibition .

درس اثر الأسبرين ( عقار غير ستيرويدي ، مضاد للاتهاب ومثبط لانزيم السايكلوجينيز ) كمضاد فطري ضد بعض الفطريات الانتهازية Aspergillus flavus , A. niger , A. terreus ,Cryptococcus neoformans, Penicillium sp . and Trichoderma sp. وجد ان الاسبرين ذو فعالية قوية ضد جميع الفطريات المدروسة مختبريا واعطى اكبر تاثير عند التراكيز 1000 µg/ml , 2000 µg/ml and 3000 µg/ml اذ ادت هذه التراكيز الى حدوث تثبيط كامل للنمو الفطري

Asprin --- Fungi --- Pain killer

The present study has been investigate the fungal species which lived in Shatt Al –Arab River, and the ability of some of them to produce lipase, as well as the effect of salinity on the activity of lipase production. Different species of fungi were isolated from water at the sites: Al-Faw , Abu - Floos Port and Ashar during the period 3/3 -29/9/2005.True aquatic fungi belong to Saprolegniaceae were isolated from Abu- Floos Port and Ashar during March and April, with no sign of their occurrence in Al- Faw. A lot of different fungal species which belong to Deuteromycetes, few of Ascomycetes, and very few belong to Zygomycetes were isolated. The activity of ten species were investigated for production of lipase . It is appeared that seven species have the ability to produce this enzyme. The most active fungi was Alternaria chlamydospora followed by Aspergillus candidus and Fusarium sp. and the lowest activity was the fungi Stachybotrys sp. and Scytalidium lignicola. The effect of salinity on the lipase activity of seven fungal species was examined at salty concentration 15 , 20 , 25 , 30 , 35 and 40 ppt, they have show significant effect in the reduce of redial growth and the lipase production by these fungi.

أجريت الدراسة الحالية لمعرفة الأنواع الفطرية التي تعيش في مياه شط العرب وفعالية البعض منها في إنتاج أنزيم اللايبيز وتأثير الملوحة في هذه الفعالية.حيث عزلت عدة أنواع من الفطريات من مناطق الفاو وميناء أبو فلوس والعشار للفترة من 3/3–29/9/2005 ، تم عزل فطريات ماء حقيقية تعود إلى عائلة Saprolegniaceae من موقع ميناء أبو فلوس والعشار خلال شهري آذار ونيسان ولم يظهر أي من أنواعها في موقع الفاو، وعزلت العديد من الأنواع الفطرية التي تعود إلى مجموعة الفطريات الناقصة Deuteromycetes والقليل من الفطريات الكيسيةAscomycetes والقليل جداً من الفطريات اللاقحية Zygomycetes. أختبرت فعالية عشرة أنواع منها على إنتاج أنزيم اللايبيز Lipase وتبين أن لسبعة منها القدرة على إنتاج هذا الأنزيم وكان أكثرها فعالية هو الفطر Alternaria chlamydospora، يليه الفطرين Aspergillus candidus و Fusarium sp.،وأقلها فعالية كان الفطر Stachybotrys sp. فالفطرScytalidium lignicola . أختبرتأثيرالملوحة Salinity في فعالية سبعة أنواع من الفطريات المنتجة لأنزيم اللايبيز عند التراكيز الملحية 15-20-25-30-35-40 جزء بالألف (ppt) وكان لها تأثير معنوي في أختزال النمو الشعاعي والفعالية الأنزيمية للفطريات المختبرة.

Fungi --- Lipase --- Salinity