research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
Biovar of Brucella isolated from cows by using Restriction fragment Length Polymorphism –Polymerase Chain Reaction in AL-Diwaniya City
التنميط الحيوي لجرثومة البروسيلا المعزولة من الابقار بأستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة نوع تقييد طول الجزء المتعدد الاشكال RFLP-PCR)) في مدينة الديوانية

Authors: A. N. AL-Naiyli أزهار عبدالسادة نعمة --- A. H. Al-Hamadani عدنان حمد الحمداني
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2013 Volume: 12 Issue: 2 Pages: 1-10
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

The current study was aimed to characterize the Brucella abortus in cows at molecular level after isolation and identification morphologically and serology by using the amplification of specific primers of omp2a gene that encodes to proteins of outer membrane of Brucella by using a technique of Restriction Fragment Length Polymorphism – Polymerase Chain Reaction (RFLP- PCR) . A Total of 105 samples were collected from cow blood that clinically suspected with brucellosis for the period of November /2011 to May / 2012 from animal shelters in different areas of AL-Diwaniya city . Blood sera were prepared to conduct the Laboratory tests which included the serological tests (Rose Bengal (RBT) and Tube Agglutination (TAT) ) ,then the Brucella was isolated on selective media such as Brucella agar media which confirmed molecularly by using classical Polymerase Chain Reaction to amplify the primers of omp2a gene and finlly the technique of RFLP- PCR was used to determine the species and biovars of Brucella after using the restriction endonuclease (PSTI) for Amplification products of omp2a gene . the results of Brucella isolation On Brucella agar was 15/18(83.3%), Results of classical Polymerase Chain Reaction (PCR) as confirming test for Brucella isolates after extraction of DNA and amplification of primers belong to omp2a gene showed the appearance of single band on agarose gel represented the DNA amplified (amplicon ) with molecular size (1100 bp) , and the percent of Brucella detection by this technique was 13/15(12.3%) .The results of (RFLP-PCR) for differention among species and biovars of Brucella revealed the appearance of two distinct band on agarose gel that had a molecular sizes (200 and 550 bp) which belong to B.melitensis biovars 1,3 and B.abortus biovars 3,5,6,9 , respectively .

هدفت الدراسة الحالية الى توصيف جرثومة البروسيلا المجهضة Brucella abortus في الابقارعلى المستوى الجزيئي بعد عزلها وتشخيصها مظهرياً ومصلياً بأستخدام تضخيم البادئات الخاصة بالجين omp2a المشفر لبروتينات الغشاء الخارجي للجرثومة بتقنية تفاعل سلسلة البلمرة نوع RFLP- PCR. جمع 105 نموذج من دم الابقار المشكوك بأصابتها سريرياً بداء البروسيلا المجهضة للمدة من تشرين الثاني 2011 / ولغاية ايار /2012 من حظائر حيوانية في مناطق مختلفة في مدينة الديوانية. حضر مصل الدم (Serum) لأجراء الفحوصات المختبرية والتي تضمنت الأختبارات المصلية (اختبارالروزبنكال Rose Bengal testواختبار التلازن الانبوبي (Tube agglutination test ثم عزل جرثومة البروسيلا في اوساط زرعية انتقائية مثل وسط اكار البروسيلا والتي تم تاكيد تشخيصها جزيئياً باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة التقليدي PCR باستخدام البادئ OMP2a ، بعدها استخدمت تقنية تفاعل سلسلة البلمرة نوع تقييد طول الجزء المتعدد الاشكال ( RFLP-PCR ) لتحديد النوع والانماط الحيوية للعزلات المشخصة باستخدام انزيم القطع PSTI لنواتج تضخيم الجين omp2a. اما نتائج العزل الجرثومي على وسط اكار البروسيلا الانتقائي فكانت18/15 (%83.3) . اظهرت نتائج تفاعل سلسلة البلمرة التقليدي (PCR (Classical كفحص توكيدي لجرثومة البروسيلا بعد استخلاص ال Extraction) DNA) من العزلات وتضخيمه (Amplification ) باستخدام بادئات نوعية للجرثومة متمثلة بالجين omp2a ظهور حزمة مفردة المرحلة كهربائياُ على هلام الاكاروز تمثل ناتج ال DNA المضخم (Amplified DNA) ذو حجم جزيئي (1100 ) زوجاً قاعدياً وكانت نسبة الكشف عن تواجد الجرثومة بهذه التقنية (%12.3 ) 15/13 . اظهرت نتائج تفاعل سلسلة البلمرة نوع تقييد طول الجزء المتعدد الاشكال(RFLP- PCR ) للتمييز بين الانواع والانماط الحيوية للبروسيلا ظهور حزمتين متميزتين المرحله كهربائياُ على هلام الاكاروز ذات حجم جزيئي 200 و550 زوجاً قاعدياً تعودان الى نوعين من البروسيلا هما B.melitensis ذات الانماط الحيوية (biovars 1,3) و B. abortus ذات الانماط الحيوية ( biovars 3, 5, 6 ,9 ) على التوالي .


Article
RFLP-PCR Fingerprinting ITS region of Fabaceae species in Hillah city in Iraq
RFLP-PCR البصمات المنطقة ITS من أنواع الفصيلة البقولية في مدينة الحلة في العراق

Authors: Huda Jasim Al-Tameme هدى جاسم --- Hussein J. Hussein حسين جبر --- Nidaa Adnan Abu-Serag نداء عدنان
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2016 Issue: Special Second International Scientific Conference for the Life Sciences Pages: 1-7
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

The aerial parts (fresh leaves) of thirteen species belong to family of Fabaceae were collected from various fields in Hillah city to investigate polymorphism in the ITS region of nrDNA by using polymerase chain reaction processed with restriction fragment length polymorphism (RFLP-PCR). Based on the data generated, it was possible to identify all of the species that were placed in three groups that are compatible with the three subfamilies within Fabaceae. So, we can be considered that the RFLP-PCR method is very reliable to identify different species belonging to the same family

والأجزاء الهوائية (الأوراق الطازجة) من ثلاثة عشر نوعا تنتمي إلى عائلة من الفصيلة البقولية جمعت من مختلف المجالات في مدينة الحلة للتحقيق في تعدد الأشكال في المنطقة ITS من nrDNA باستخدام البلمرة سلسلة من ردود الفعل معالجتها مع تعدد الأشكال طول تقييد جزء (RFLP-PCR). واستنادا إلى البيانات التي تم إنشاؤها، كان من الممكن التعرف على جميع الأنواع التي تم وضعها في ثلاث مجموعات التي تتوافق مع ثلاثة تحت العوائل ضمن الفصيلة البقولية. لذلك، فإننا يمكن اعتبار أن طريقة RFLP-PCR هو موثوق بها للغاية لتحديد أنواع مختلفة تنتمي إلى عائلة واحدة


Article
"GENETIC POLYMORPHISMS OF CSN3 GENE AND ITS EFFECT ON SOME PRODUCTION TRAITS"
"التباين الوراثي لجين ال CSN3 و تأثيره على بعض الصفات الانتاجية"

Author: I. A. Fadhil
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2019 Volume: 50 Issue: 2 Pages: 500-505
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Kappa-Casein gene (CSN3) polymorphisms were investigated in one breed of sheep (Awassi) reared in Babylon City. Genomic DNA was extracted from blood of 51 samples of Awassi ewe by using one primer. The primer of PCR were sequenced and prepared by Integrated DNA Technologies Company. PCR productions were loaded on gel electrophoresis. The polymorphism of kappa - casein gene was genotyped by Hindlll restriction enzyme (TAKARA), PCR products, Ethidium bromide and 2.5% Agarose gel in horizontal Medi Bio Rad electrophoresis with 0.5 x TBE (100 V. for 60 min.) were loaded to identify of results using Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) analysis. The present paper revealed three genetic patterns (AA, AB and BB) with two alleles (A and B). The gene frequency for A allele was record high percentage than the other allele (B). The statistical analysis of CSN3 patterns was indicated no significance different on parameters of milk components, while the results appeared positive influence of AB pattern on milk components inside the breed, that is confirm high in heterozygous genotype production (AB) in the sheep are reported in the present study. Furthermore, the first observation for Kappa casein patterns of Awassi sheep breed in Babylon city, Iraq was reported by the present paper. In addition, the population of kappa casein gene with AB genotype was the best choice for good fat and protein percentage of milk composition in the breed is previous reported.

ان التباين الوراثي للجين CSN3 تم الكشف عنه في سلالة الاغنام العواسية و التي تمت تربيتها في محافظة بابل. تم عزل الحمض النووي الجينومي من الدم ل 51 نعجة عواسية. تم تجهيز دليل تفاعل البلمرة المتسلسل (البادىء) من قبل شركة Integrated DNA Technologies. رحلت نواتج ال PCR على الرحلان الكهربائي للهلام باستخدام بادىء واحد. ان التباين الوراثي لجين الكابا - كازين تم التعرف عليها بواسطة إنزيم القطع HindIII المجهز من شركة (TAKARA)، منتجات PCR ، بروميد الإيثيديوم و 2.5% من جل الاكاروز في جهاز horizontal Medi Bio Rad electrophoresis مع 0.5 X TBE لمدة 60 دقيقة و بفولتية 100 فولت و ذلك للتنبؤ بالنتائج باستخدام تقنية تغاير قطع التقييد لتفاعل البلمرة المتسلسل (PCR-RFLP). كشفت النتائج عن وجود ثلاثة أنماط وراثية (AA ، AB و BB) مع أليلين (A و B). ان قيمة التكرار الجيني للاليل A أعلى من قيمتها مع الاليل الآخر (B). أشارت نتائج التحليل الإحصائي لجين CSN3 الى عدم وجود فروق معنوية لمقاييس مكونات الحليب، في حين يوجد تاثير موجب للشكل الجيني AB مع مكونات الحليب داخل السلالة، و هذا يؤكد ارتفاع انتاجية الشكل الجيني AB في الاغنام. علاوة على ذلك، ان دراستنا الحالية سجلت المشاهدات الاولى للاشكال الجينية لجين الكابا كازين في الاغنام العواسية لمحافظة بابل. بالاضافة لذلك، ان الافراد الحاملة للشكل الجيني AB من جين الكابا كازين هي افضل اختيار من حيث ارتفاع النسبة المئوية لكمية الدهن و البروتين في الحليب في السلالة السابقة الذكر.

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

English (2)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2016 (1)

2013 (1)