research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Development of SYBR Green Real time PCR for identification methicillin-resistance Staphylococcus aureus (MRSA)
الكشف عن البكتريا العنقودية الذهبية المقاومة للمثسلين Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus باستخدام طريقة التضاعف التسلسلي المزدوج SYBR Green Real time PCR

Loading...
Loading...
Abstract

The increasing resistance of staphylococci to ß -lactam antibiotics has become a major clinical problem. Development of rapid and sensitive techniques for detection of MRSA is an important aim for public health. A duplex PCR were established for specific identification of methicillin-resistance Staphylococcus aureus (MRSA) in clinical samples. In this work a duplex SYBR Green real time PCR was developed for rapid identification of MRSA in local methicillin-resistance S. aureus isolates. Twenty methicillin-resistance S. aureus isolates, as determined by disc diffusion method, were subjected to DNA extraction and PCR amplification. Two genes were amplified successfully, mecA (533bp) and femA (314bp), as targets for methicillin-resistance and specific identification of S. aureus, respectively using conventional PCR. Sensitivity of the duplex PCR showed that the minimum concentration of DNA that gave positive results for the two genes was 30ng/µl. In order to develop rapid and sensitive test for identification of MRSA, serial dilutions of purified DNA were amplified gradually according to their concentrations using SYBR Green real time PCR. These results indicated that the SYBR Green real time PCR can be used for identification of methicillin-resistance S. aureus (MRSA) in clinical

تعد صفة المقاومة لدى بكتريا الـS. aureus لمضادات البيتا لاكتام من المشاكل الطبية المنتشرة في العالم.لذلك يعد تشخيص بكتريا S.aureus المقاومة للمثسيلين من خلال تطوير طريقة سريعة و حساسة لهذا التشخيص من اهم الاهداف للصحة العامة . استخدمت طريقة التضاعف التسلسلي المزدوج لعينات البكتريا السريرية ، حيث تم تطوير طريقة الـReal-Time PCR ببادئات مزدوجة للتشخيص السريع لعينات البكتريا المحلية . استخدمت عشرون عزلة بعد تشخيصها بواسطة الطريقة التقليدية ( disk diffusion method) وبعد ان تم استخلاص الدنا منها و اجراء عملية التضاعف التسلسلي لها باستخدام بادئان بنجاح احدهما متخصص لصفة المقاومه mecA بحجم 533 قاعدة نايتروجينية و اخر متخصص لتعريف هذا النوع femA بحجم 318 قاعدة نايتروجينية . ان حساسية هذا الاختبار قد وصلت الى تركيز 30مايكرو غرام /مل . ولغرض ايجاد طريقة سريعة وحساسة في الوقت نفسه للتعرف على هذه البكتريا ، اجريت عدة تخافيف متسلسلة على الدنا المستخلص وتم اجراء فحص التضاعف التسلسلي بطريقه الـ Real-Time باستخدام صبغة سايبر الخضراء . واثبتت النتائج امكانية استخدام هذه الطريقة لتعريف البكتريا المقاومة للمثيسلين في العينات السريرية .


Article
Some epidemiological features of BCoVs infection in Al-Qadisiya province by using real time-qPCR technique.
دراسة بعض الصفات الوبائية للفايروس التاجي البقري في محافظة القادسية باستخدام خطوة واحدة في الوقت الحقيقي الكمي للفلورة - تفاعل البلمرة العاكس الناسخ

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out to evaluate some epidemiological features of Bovine Coronavirus infection by using one-step real-time fluorogenic quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) assay based on SYBR Green I dye in detection. Coronaviruses detected by the same neocleocapsid (N) gene primers under 98% similarity with HECV-4408 (human enteric Coronavirus) in children according to NCBI with product size 124bp. 285 fecal samples has been examined by routine methods against pathogenic bacteria in the intestines (E.coli, Salmonella Spp.) and Cryptosporidium parvum, the samples positive for the parasite submitted to molecular testing because they may be mixed with coronavirus infections. 100 samples were screened for the presence of BCoVs antigens by using a immunochromatographic rapid test as a field fast test. Where 44% of samples showed positivity to BCoVs, out of 50 samples submitted to quantitative reverse transcription (RT-qPCR) assay. Out of 50 – 31 samples had been positive. We found, that distribution of BCoVs was significantly higher in rural areas 33.3%-87.5% as compare to cities 71.4%-75%, the infection in males reach to75% vas 53.5% in females, high infection rate 62.9% in < 1- 4 months age as compare with > 1 month age 62.9%. The results of infection rate showed high percentage during February 77.7% while the percentage on (January, December, March, and April) was (66.6%, 66.1%, 54.5% and 50%) respectively.

أجريت هذه الدراسة لتقييم بعض السمات الوبائية لعدوى الفايروس التاجي باستخدام خطوة واحدة في الوقت الحقيقي الكمي للفلورة- تفاعل البلمرة العاكس الناسخ Real Time RT-qPCR مقاس على أساس صبغة SYBR الخضراء في الكشف. تم كشف الفيروس من قبل نفس الجين التمهيدي تحت نسبة 98 % وفقا ل NCBI مع حجم المنتج 124 زوج قاعدي . كل العينات البرازية فحصت بالطرق الروتينية ضد البكتيريا الممرضة للأمعاء (الاشريشية القولونية، السالمونيلا) والابواغ الخبيئة, وقد تم استبعاد العينات الموجبة للنمو البكتيري في حين أن العينات إلموجبة للطفيلي قدمت إلى الاختبار الجزيئي لأنها قد تكون مختلطة مع الاصابة بالفايروس التاجي. تم فحص 100 عينة فقط لوجود مستضدات BCoVs باستخدام الاختبار الحقلي المناعي السريع . حيث أظهرت 44% من العينات إيجابية لBCoVs ، قدمت 50 عينة مفحوصة بالاختبار السريع للوقت الحقيقي لتفاعل سلسة البلمرة النسخ العكسي الكمي ( Real Time RT- qPCR). حيث ظهر BCoVs في 31 من أصل 50 عينة برازية سريرية من العجول. وجدنا, أن توزيع BCoVs أعلى بكثير في المناطق الريفية 33.3 -87.5 % بالمقارنة مع المدن 71.4 -75 %، و الإصابة في الذكور تصل 75 % بالمقارنة في الإناث 53.5 %. وزيادة الإصابة مع تقدم العمر < 1-4 62.9% مع انخفاض طفيف في عمر > 1 شهر 62.9 % , أظهرت النتائج أن معدل الإصابة العالية كانت خلال شهر شباط 77.7% في حين كانت النسبة في (يناير، كانون الأول وآذار، وإبريل) (66.6%، 66.1%، 54.5% و 50%) على التوالي.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2014 (1)

2013 (1)