research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Isolation and Identification of Local Isolates of Sinorhizobium meliloti and Studying its Tolerance Towards the Herbicide Glyphosate
عزل وتشخيص عزلات محلية لبكتريا meliloti Sinorhizobium ودراسة مدى تحملها للمبيد العشبي Glyphosate

Author: Fawz A. AL-Safar فوز عبد السلام الصفار
Journal: Rafidain journal of science مجلة علوم الرافدين ISSN: 16089391 Year: 2012 Volume: 23 Issue: 1A Pages: 11-21
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Four strains (FA37, FA38, FA39, and FA40 ) of Sinorhizobium meliloti were isolated from different agricultural areas of Ninaveh, Erbil and Duhok Governorates. Identification studies were conducted for these strains for their resistance to chloramphenicol, Erythromycin and production of cell surface molecules and their ability to grow in a Minimal Medium. Results showed that the four strains had the ability to resist both antibiotics, production of β(1→2) cyclic glucan molecules and growth in Minimal Medium. The study of symbiosis relation between the strains and Medicago sativa plant showed that the strain FA37 was the most successful isolate in constructing symbiosis relation indicated by the dry shoot group, which reached 45.7 mg. The strain was then selected for further experiments. Results revealed that the strain FA37 had high resistance against different concentrations of the herbicide Glyphosate, whereas the plant showed no resistance against the least concentration 10 µg/ml that the Rhizobium strains tolerated.

عزلت أربع عزلات من بكتريا Sinorhizobium meliloti وهي A39, FA38, FA37 وFA40 من مناطق زراعية مختلفة من محافظات نينوى و اربيل ودهوك. اجريت دراسة تشخيصية لهذه العزلات من حيث قابلية مقاومة الكلورامفينيكول و الارثرومايسين و إنتاج جزيئات سطح الخلية وقابلية النمو على الوسط الأدنى. أظهرت النتائج إن العزلات الأربعة لها القابلية على مقاومة المضادين المذكورين و إنتاج جزيئات كلوكانات β(1←2) الحلقية والنمو على الوسط الأدنى. أظهرت دراسة العلاقة التعايشية بين العزلات المذكورة ونباتات الجت ان العزلة FA37 هي الأكثر نجاحا في إقامة العلاقة التعايشية بدلالة الجزء الخضري الجاف إذ بلغ 45.7 ملغم، وتم اختيار هذه العزلة لاحقا. بينت نتيجة دراسة تأثير تراكيز مختلفة من المبيد العشبي الـ Glyphosate على نمو العزلة FA37انها ذات مقاومة عالية لهذا المبيد، في حين أن النبات لم يكن مقاوماً لأقل التراكيز (10 مايكروغرام/مل) التي تحملتها عزلات الرايزوبيوم.


Article
ISOLATION OF SINORHIZOBIUM MELILOTI MUTANTS HAVE HIGH ABILITY FOR SALT TOLERANCE AND ENHANCED SYMBIOSIS WITH ALFALFA PLANTS
عزل طافرات جراثيم Sinorhizobium meliloti قادرة على تحمل الملوحةالعالية والتعايش مع النبات البقولي بشكل أفضل بإستعمال الأشعه فوق البنفسجية

Authors: غصون فاضل راضي2 --- جبار دهري نعمه2 --- باسل عبدالزهرة عباس1
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2010 Volume: 9 Issue: 4 Pages: 716-728
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

الخلاصة
تم عزل جرثومة Sinorhizobium meliloti من العقد الجذرية لنبات الجت ودرست خواصها العامة وأجري التلقيح التجريبي على النبات ذاته. ثم تم إختبار قابلية العزلات على النمو في تراكيز مختلفه من أملاح كلوريد الصوديوم و كبريتات البوتاسيوم وتم حساب التركيز المثبط الأدنى للنمو. بعدها تم تطفير العزلات التي أبدت مقاومة أعلى للملوحة بوساطة إستعمال الأشعة فوق البنفسجية وتبين ظهور عزلات مختلفة مظهرياً عن العزلة الأبوية ولها القابلية للنمو في تراكيز عالية من الملوحة تصل إلى10% كلوريد الصوديوم و 12% كلوريد البوتاسيوم إلا أنها لم تختلف عن العزلة الأبوية في قابليتها للنمو بظروف مختلفة من الدالة الحامضية. كما كانت هناك اختلافات واضحة بالنسبة للنباتات الملقحة بالعزلات المطفرة حيث كانت الأفضل من ناحية عدد العقد الجذرية وأرتفاع النبات والوزن الجاف للجزء الخضري ومحتوى النتروجين بالمقارنة مع العزلة الأبوية. وقد إمتازت العزلتان المطفرتان أيضاً بإختلافات واضحة في مقاومتها للمضادات الحيوية عن العزلة الأبوية.


الخلاصةمن العقد الجذرية لنبات الجت ودرست خواصها العامة Sinorhizobium meliloti تم عزل جرثومةوأجري التلقيح التجريبي على النبات ذاته. ثم تم إختبار قابلية العزلات على النمو في تراكيز مختلفه من أملاحكلوريد الصوديوم و كبريتات البوتاسيوم وتم حساب التركيز المثبط الأدنى للنمو. بعدها تم تطفير العزلات التيأبدت مقاومة أعلى للملوحة بوساطة إستعمال الأشعة فوق البنفسجية وتبين ظهور عزلات مختلفة مظهرياً عن% العزلة الأبوية ولها القابلية للنمو في تراكيز عالية من الملوحة تصل إلى 10 % كلوريد الصوديوم و 12كلوريد البوتاسيوم إلا أنها لم تختلف عن العزلة الأبوية في قابليتها للنمو بظروف مختلفة من الدالةالحامضية. كما كانت هناك اختلافات واضحة بالنسبة للنباتات الملقحة بالعزلات المطفرة حيث كانت الأفضل منناحية عدد العقد الجذرية وأرتفاع النبات والوزن الجاف للجزء الخضري ومحتوى النتروجين بالمقارنة معالعزلة الأبوية. وقد إمتازت العزلتان المطفرتان أيضاً بإختلافات واضحة في مقاومتها للمضادات الحيوية عنالعزلة الأبوية.PDF created


Article
Genetic Variation of Sinorhizobium meliloti Isolates Differing in Their Ability to Drought Tolerance
الاختلافات الوراثية بين عزلات Sinorhizobium meliloti في قابليتها على تحمل الجفاف

Loading...
Loading...
Abstract

Soil bacteria Sinorhizobium meliloti had enormous agricultural value, due to their ability in fixing nitrogen symbiotically with an important forage crop legume- alfalfa. The aim of this study (i) isolate indigenous S. meliloti from different field sites in Iraq, (ii) evaluate the isolates tolerance to induce drought using polyethylene glycol-6000, (iii) assessing genetic diversity and genetic relationships among isolates of natural population with drought tolerant abilities. Drought tolerance study revealed vast variations between Sinorhizobium isolates, the highest tolerant isolates to drought were twelve from total thirty 40%, tolerated from -3 up to -4 Mpa (mega pascal), while the drought sensitive isolates tolerated upto – 1.5 Mpa, except isolate Bs58 which tolerated upto -1 Mpa water potential. The growth declined with the increase of drought stress. Cluster analysis based on RAPD-PCR showed significant differences among S. meliloti isolates, and the results gave almost identical grouping of isolates in regards to drought experiment. Among indigenous isolates two divergent groups could be determined, the first major group included drought tolerant isolates and the second major group comprised all drought moderate and sensitive isolates with 40% similarity between the two major groups.

بكتريا التربة Sinorhizobium meliloti لها اهمية كبيرة في الزراعة وذلك لقابليتها على تثبيت النتروجين تعايشيا مع نبات الجت البقولي. الهدف من الدراسة :1) الحصول على عزلات من Sinorhizobium من مناطق مختلفة من العراق 2) تقييم تحمل العزلات للجفاف المستحث بواسطة البولي اثيلين كلايكول6000 ,3) تحديد التغايرات والعلاقات الوراثية بين العزلات بناءا على قابليتها لتحمل الجفاف. ان دراسة تحمل الجفاف بينت وجود تغايرات كثيرة بين عزلات Sinorhizobium وبلغت العزلات المتحملة اثنى عشر من مجموع ثلاثين عزلة 40% حيث تحملت من -3 الى -4 ميغاباسكال بينما العزلات الحساسة للجفاف تحملت 1 , 5ميغاباسكال باستثناء العزلة Bs 58 تحملت لغاية -1 ميغاباسكال جهد مائي. النمو انخفض بزيادة الجفاف كما ان تحليل شجرة العلاقة بين العزلات بناءا على نتائج التضخيم العشوائي للدنا بجهاز البلمرة الحراري اظهرت وجود اختلافات واضحة بين عزلات Sinorhizobium meliloti وهذه النتائج جاءت متوافقة مع نتائج تجربة تحمل الجفاف حيث قسمت العزلات الى مجموعتين رئيسية الاولى ضمت جميع العزلات المتحملة للجفاف والثانية ضمت العزلات الحساسة والمتوسطة التحمل للجفاف وبنسبة تشابهه بلغت 40%بين المجموعتين.


Article
Genetic variation between wild type and auxotrophic mutant isolates of Sinorhizobiummeliloti by using RAPD-PCR technique
التباين الوراثي بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي في بكتيريا Sinorhizobium melilotiبأعتماد تقانةRAPD-PCR

Authors: Ihsan A. Hussein إحسان عرفان حسين --- Salwa A. Ganim سلوى علي غانم
Journal: Ibn Al-Haitham Journal For Pure And Applied Science مجلة ابن الهيثم للعلوم الصرفة والتطبيقية ISSN: P16094042/ E25213407 Year: 2014 Volume: 27 Issue: 3 Pages: 118-130
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

SGI2 wild type isolate of Sinorhizobiummeliloti was isolated from Medicagosativa (alfalfa) plant which was obtained from Al-Tarmiaa region / Baghdad. Nine auxotrophic mutants were obtained from the SGI2 wild type isolate by mutagenesis with Nitrous acid (HNO2). The SGI2 wild type and the all auxotrophic mutant isolates had two Megaplasmids; pSymA and pSymB. No genetic variations in plasmid number and size were detected when gel electrophoresis was done for plasmid profile detection. Genetic variations by using RAPD-PCR technique were obtained between wild type and auxotrophic mutant isolates. One band was detected in SGI6 gel profile with 1.5 Kb size when OPY-04 primer was used. Using OPB7 primer by using RAPD-PCR technique showed large variation between all the isolates. Two bands were obtained from the SGI2 wild type isolate with 800 bases and 1.5 Kb in size. These bands were absent from the auxotrophic mutant isolates. The band with 800 bases was also found in SGI10 isolate. The other auxotrophic mutant isolates have different bands with size ranging from 200 bases and more than 1.5 Kb for the SGI6 isolate. No bands were detected in SGI8, SGI9 and SG12 isolates. The large differences in bands number and size suggested that the variation is clear at the genes level of the total genome and not at plasmid level as a result after nitrous acid mutagenesis.

عزلت عزلة برية SGI2 لبكتيريا Sinorhizobiummeliloti من نبات الجتMedicago sativa (alfalfa) الذي حصلنا عليه من منطقة الطارمية / محافظة بغداد، وتم الحصول على 9 طافرات عوز غذائي من العزلة البرية SGI2 بالتطفير مع حامض النيتروز Nitrous acid. امتلكت جميع العزلات البرية والطافرة بلازميدين كبيرين هما pSymA وpSymB ولم يظهر الترحيل الكهربائي لهما أي تغيرات نتيجة التطفير بحامض النيتروز. أظهرت التباينات الوراثية بأعتماد تقانة RAPD-PCR بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي وجود حزمة واحدة في العزلة SGI6 بحجم أكبر من 1.5 كيلو قاعدة عند أستعمال البادئ OPY-04، وعند أستعمال البادئ OPB7 أظهر تباينات كبيرة بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي. تم مشاهدة حزمتين في العزلة البرية SGI2 بحجم 800 قاعدة و1.5 كيلو قاعدة وعدم ظهورها في العزلات الطافرة الأخرى. أظهرت الحزمة التي بحجم 800 قاعدة في العزلة الطافرة SGI10فحسب،في حين أظهرت بقية العزلات الطافرة حزماً تباين حجمها من 200 قاعدة إلى أكثر من 1.5 كيلو قاعدة كما في العزلة SGI6. ولم تظهر أي حزم عند أستعمال هذا البادئ في العزلات SGI8، SGI9 و SGI12. إن ظهور هذه الحزم يوضح مدى التباين الوراثي على المستوى الجيني للجينوم الكلي وليس على مستوى البلازميد نتيجة التطفير الكيمياوي بأستعمال حامض النيتروز.


Article
Effect the different levels of zinc element in efficiency of Sinorhizobium meliloti atmosphere Nitrogen fixing isolated from Medicago sativa and some plant characteristics inoculums with it laboratory and formerly
تاثير مستويات مختلفة من عنصر الزنك في كفاءة بكتريا Sinorhizobium meliloti المثبتة للنتروجين الجوي والمعزولة من نبات الجت Medicago sativa وبعض صفات النبات الملقح بها مختبريا وحقليا

Author: Anmar Saadi Aboud انمار سعدي عبود
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2014 Volume: 10 Issue: 4 Pages: 90-111
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

Environmental pollutants like heavy metals at lowe concentrations are required for various metabolic activities of microbes including Rhizobia and legume crops on one hand, the excessive metal concentrations on the other hand cause undeniable damage to Rhizobia, legumes and their symbiosis. This study deals with the effect of different levels of zinc element in the efficiency and growth of Sinorhizobium meliloti that infect Alfa alfa plant(Medicago sativa) laborator. Symbiotic characteristics of these bacteria and some characteristic of Alfa alfa plants were studied by treating them with zinc element under normal conditions. Four isolates of S. meliloti have been isolated and identified from root nodules of Medicago sativa plants. These plants were gathered from different agricultural locations in Baghdad and Diyla provinces. Symbols have been given for each isolate (AN-1,AN-2 AN-3 and AN-4).The viable bacterial count have been measured (Cfu) laboratory under the effect of three concentrations of zinc element(0.1, 0.2, 0.3 g/L) through incubation for 48, 72 hours from the beginning of bacterial growth. The results showed significant decrease (P≤0.05) in viable bacterial count and for all zinc concentrations that are used compared with control groups. Increasing zinc concentrations leads to decrease .Also, there were differences between isolates since AN-3, AN-4 isolates were the more sensitive for zinc element than other isolates. The alfa-alfa plants were infected with (AN-1, AN-2, AN-3 and AN-4) isolates. These plants were cultured in soil treated with (0.13, 0.2, 0.52 g /3Kg) concentrations of zinc under normal conditions. Some characteristic of alfa-alfa plants were studied; such as the measurement of the length of shoot and root net, measurement of the dry and wet weight of the plants, number of root nodules, percentage of nitrogen and the content of protein in plants. Also the results showed ahighly significant decrease of (P≤0.05) for most plan characteristics that are under study, and an apparent decrease in the nodulation process of the plants in comparision with the control groups. The most negatively effected isolates were (AN-3, AN-4) and then (AN-1, AN-2).

تناولت هذه الدراسة تأثير تراكيزمختلفة من عنصر الزنك في نمو و كفاءة بكتريا Sinorhizobium meliloti التي تصيب نبات الجت Medicago sativa مختبريا, كذلك دراسة الصفات التكافلية للبكتريا و بعض صفات نبات الجت الملقح بها حقليا تحت تاثير عنصر الزنك و في الظروف الطبيعية. تم عزل و تشخيص اربع عزلات من بكتريا S. meliloti من العقد الجذرية لنبات Medicago sativa من مناطق زراعية مختلفة في محافظتي بغداد و ديالى واعطي رمز لكل عزلة(N-1, AN-2, AN-3, AN-4 ).تم حساب اعداد البكتريا الحيه(Cfu ) مختبريا تحت تاثير ثلاث تراكيز من عنصر الزنك(g/L 0.1,0.2,0.3 ) خلال 48, 72 ساعة حضانة من بداية تنمية البكتريا واظهرت النتائج وجود انخفاض معنوي (P≤0.05) في اعداد البكتريا الحية و لجميع التراكيز المستخدمة من الزنك مقارنة بمجاميع السيطرة, ويزداد هذا الانخفاض كلما ازداد تركيز الزك, كذلك وجود تفاوت بين العزلات اذ كانت العزلتان (AN-3, AN-4 ) اكثر حساسية للزنك من بقية العزلات . تم اصابة نبات الجت بالعزلات (AN-1,AN-2, AN-3, AN-4 )و المزروع في تربة ملوثة بالزنك بثلاث تراكيز (0.13,0.26,0.52 g /3kg ) وفي الظروف الطبيعية ودراسة بعض صفات نبات الجت كقياس طول المجموع الخضري والجذري وقياس الوزن الطري و الجاف للنبات و عدد العقد الجذرية ونسبة النتروجين والمحتوى البروتيني في النبات و اظهرت النتائج انخفاضا معنويا عاليا (P≤0.05) لاغلب صفات النبات المدروسة وانخفاض ملحوظ في عملية التعقيد في النبات مقارنة بمجاميع السيطرة وكانت اكثر العزلات تاثرا بشكل سلبي (AN-3,AN-4 ) ثم العزلتين (AN-1, AN-2 ).

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

Arabic (2)

English (2)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2015 (1)

2014 (2)

2012 (1)

2010 (1)