research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
Antibiotic susceptibility patterns of Escherichia coli isolates from patients with significant bacteriuria

Author: Firas Srhan Abd Al- Mayahi
Journal: Al-Qadisiyah Journal of pure science(quarterly) مجلة القادسية للعلوم الصرفة (فصلية). ISSN: 19972490 Year: 2015 Volume: 1 Issue: 20 Pages: 29-49
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to the isolation and identification of E. coli bacteria from patients with significant bacteriuria and Antibiotic susceptibility patterns. During the period from March 2011 to May 2012, a total of 2000 urine samples were collected from patients with suspected UTI. Isolates were identified by traditional biochemical tests, and then confirmed by VITEK 2 system. 455 (22.8%) samples were recognized as significant bacteriuria. The study documented that E. coli is the most important uropathogen causing UTI and recovered from 207 (45.5%) patients. However, of the patients with significant bacteriuria, a total of 143 (31.4%) positive urine cultures were implicated in nosocomial infections. Additionally, 312 (68.6%) positive urine cultures were implicated in community-acquired infections. According to demographic data, it was observed that the number of patients with significant bacteriuria was higher in females, 309 (67.9%) compared to males, 146 (32.1%). The mean age of these patients was 39.1 years range from 2-90 years (standard deviation, 18.1years). Majority of patients with significant bacteriuria (269, 59.1%) were in the age group 20-50 years. Sensitivity of all isolates was tested against 23 Antibiotics. Results showed all isolates of E. coli were resistant 100% to ampicillin but sensitive100% to imipenem, the antibiotics resistance rate among the tested E. coli isolates ranged from 92.7%-74.9%, 69.6%-31.4% and 48.3%-10.2%, present to cephalosporins, fluoroquinolone and aminoglycosides respectively.


Article
Isolation and Identification of food Probiotic Saccharomyces boulardii by using traditional methods, Vitek 2 system and molecular identification methods.
عزل وتشخيص المعزز الحيوي الغذائي Saccharomyces boulardii باستعمال الطرائق التقليدية ونظام الفايتك2 والطرائق الجزيئية.

Loading...
Loading...
Abstract

This study was aimed to isolate and identify Saccharomyces boulardii from Mangosteen fruits (Garcinia mangostana L.) by traditional and molecular identification methods To get safe and healthy foods probiotics for use, The isolates and two commercial strains were subjected to cultural, morphological and biochemical tests, The colonies of the isolates were spherical, smooth, mucoidal, dull and white to cream colour on SD agar media .The shape of cells was globose to ovoid and sometimes with budding, in a single form or clustered like a beehive. The isolates and two commercial strains were unable to metabolized galactose and lactose , Results shows that all isolates were unable to utilize potassium nitrate and not grow in the presence of (0.01%) cyclohexamide. Also the isolates and two commercial strains were identified by the Vitek 2 identification system, as S. cerevisiae with probability 90-94%, Since there are no data in this device includes S. boulardii. Because the cultural, morphological and biochemical tests didn’t provide sufficient evidence to distinguish between S. boulardii and S. cerevisiae, the probiotics strains must be identified up to genus and strain levels by internationally accepted methods, So the SbR7 isolate which shown high probiotic advantages and two commercial strains were diagnosed molecularly by using specific primers targeting sequence for the region (ITS) of the 5.8S rRNA gene Genomic DNA was isolated from SbR7 Isolate and ITS region of the 5.8S rRNA gene was amplified using PCR. PCR products was sequenced and compared with the sequence of this region in the DNA of S. boulardii available in GenBank (NCBI) using the program BLASTn. Results revealed, this isolate was almost genetically identical (99%) with S. boulardii standard strains.

هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص المعزز الحيوي الغذائي Saccharomyces boulardii من ثمار المانغستين (Garcinia mangostana L.) بطرائق التشخيص التقليدية والتشخيص الجزيئي للحصول على معززات حيوية غذائية امنه الاستعمال وصحية، اخضعت العزلات فضلا عن عزلتين تجاريتين للاختبارات المزرعية والمجهرية والكيموحيوية، اذ أظهرت العزلات مستعمرات ذات شكل دائري بلون ابيض مائل إلى الكريمي الباهت عند تنميتها على الوسط الصلب SD وبدت بشكل محدب ذات حواف منتظمة وقوام كريمي لزج، وان الخلايا تمتلك أشكالا بيضوية، او شبه كروية متبرعمة أحيانا، مفردة او متقاربة في تجمعات، وعدم المقدرة على تمثيل الكالاكتوز فضلا عن سكر اللاكتوز ولم تستطع استهلاك نترات البوتاسيوم او النمو بتركيز 0.01% من المضاد الحيوي السايكلوهكسمايد.كما شخصت باستعمال نظام الفايتك 2 على انهاSaccharomyces cerevisiae باحتمالية تراوحت بين90– 94%، اذ لا تتضمن بيانات الجهازS. boulardii، ولكون الاختبارات المزرعية والمجهرية والاختبارات الكيموحيوية لا تعطي ادلـــة كافية وقاطـــعة للتفريق بين النوعين S. boulardii وS. cerevisiae، شخص المعزز الحيوي S. boulardii جزيئيا باستعمال بوادئ متخصصة تستهدف التسلسل النوعي الخاص بالمنطقة البينية الفاصلة (ITS) للجين الرايبوسومي 5.8S rRNA، واستخلص الدنا المجيني من العزلة SbR7 التي اظهرت امتلاكها للعديد من صفات المعزز الحيوي والعزلتين التجاريتين، واجري تفاعل تضخيم السلسلة للمنطقة البينية ITS وحددت تعاقبات القواعد النيتروجينية وتمت مقارنتها مع تعاقباته في دنا سلالات S. boulardii المتوفرة في بنك الجينات NCBI باستعمال برنامج BLASTn تبين ان هناك تطابقا للتعاقبات، وان هذه العزلة تتماثل جينيا بنسبة 99% مع سلالات Saccharomyces boulardii القياسية المتوافرة في بنك الجينات.


Article
عزل وتشخيص البكتريا المحللة للمركبات الفينولية من المياه

Author: سوزان كامران حسن حسن رحيم الشريفي جامعة بغداد/ كلية الزراعة – قسم علوم الاغذية
Journal: journal of the college of basic education مجلة كلية التربية الاساسية ISSN: 18157467(print) 27068536(online) Year: 2016 Volume: 22 Issue: 96/ علمي Pages: 165-176
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Isolation and Identification of phenol degrading bacteria from waterAbstractSix phenol degrading bacteria were isolated from the industrial sewage of Al-Doura oil refiner and identified by the developed bacterial identification technique Vitek 2 system. Four of these isolates were identified as Pseudomonas fluorescens , one as Citrobacter freundii and Serratia liquefaciens . The better of phenol degrading Isolate Pseudomonas fluorescens SK was chosen as its total number was 262x105 c.f.u.ml when they were grown in mineral medium containing phenol as carbon source.

المقدمةيعد تلوث البيئة مشكلة من اكبر واخطر مشاكل العصر والذي شهد العالم خلاله تطورا كبيرا في جميع المستويات ومن أكثرها ضرراً على مستقبل الحياة على كوكب الارض ، ويعد التلوث المائي أحد المخاطر التي تهدد البيئة) 2). اذ ان الصناعة هي من اهم وانشط المصادر المسببة لتلوث المياه، ولاسيما الصناعات التي تستعمل وتطرح العناصر الثقيلة والمركبات السامة أذّ مما لا شك فيه ان هذه المواد ذات تأثيرات ضارة وسامة عندما تنتقل الى الكائنات الحية وتستقر في انسجتها (14) . وإن ما يعظم الحالة ويدعو الى الحذر والاهتمام بالموضوع هو كون العناصر الثقيلة والمركبات السامة لا تتحلل بفعل الاحياء المجهرية ولكن تتجمع ويزداد تركيزها تدريجيا وقد تخزن فى انسجة الكائنات الحية (التركيز الحياتي Bioconcentration) ، كما يمكن ان تنتقل الى مسافات بعيدة عن مصادر طرحها في الماء ومن ثم تاثيرها في الانسان عبر انتقالها عن طريق السلسلة الغذائية(26). ويعد الفينول والمركبات الفينولية من ملوثات المياه السامة ولزيادة طرح المياه الصناعية الملوثة بهذا المركب كان لابد من ايجاد طرائق كفؤة لازالة هذه الملوثات عن طريق استعمال انظمة مايكروبايولوجية لازالة المركبات السامة من المخلفات الصناعية ومن ثم طرحها الى الانهار (23).

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

Arabic (2)

English (1)


Year
From To Submit

2016 (2)

2015 (1)