research centers


Search results: Found 11

Listing 1 - 10 of 11 << page
of 2
>>
Sort by

Article
Comparative diagnostic study of Klebsiella usingApi20E System and the device vitek2 and PCR
دراسة تشخيصية مقارنة لجراثيم الكليبسيلا باستخدام نظام الـ Api20Eوجهاز الـvitek2 وجهاز الـ PCR

Loading...
Loading...
Abstract

The current Study included 273 samples colected from models of different clinical Samples (urine , Stool, blood , sputum, and swabs from the vagina ,wounds, ear and throat) which have been get on 30 (10.98% ) isolates of Klebsiella from total of various clinical samples. The rate of Klebsiella from urine samples was 26.6% of the total 30 samples and The isolation rate from stool and blood sampls was 16.6%, while in wound infection the rat was (13.3%). Klebsiella isolated from vaginal swabs with (10%), and with respect to ear infections the percentage of isolation that have emerged in this study are (3.33%) and isolated rate from the throat and sputum was (6.6%). After a Diagnosis results have shown the prevalence of K.pneumoniae with rate(23 with76.66%) followed by K.oxytoca rate (5with16.66%) and 2 K.terrigena isolates with( 6.66%) of the total 30 isolates. Twenty isolates were selected belonging to the species K.pneumoniae and K.oxytoca which diagnosed by Api20E for rediagnosing by(PCR and viteke2) , and the results of the diagnostic system Vitek2 showd that the Klebsiella which have been previously diagnosed byApi20E system (90%) K.pneumoniae and (10%) K.oxytoca while the genetic diagnosis results showed 80% of the isolates belonged to the type of the K.pneumoniae and 20% of isolates belonging to K.oxytoca

ضمـنت الـدراسة الحالية جـمع 273 عـينة من نماذج مرضية مخـتلـفة شملت (الإدرار، الـبراز، الدم، القشع ، مسحات من المهبل ‘الجروح، الأذن والحنجرة) ومن خلالها تم الحـصول عـلى 30عـزلة لجـراثـيم الـKlebsiella بنسبة )10.98%( من مجموع النماذج المرضية المختلفة إذ تم عزل جرثومة الـKlebsiella من عينات الإدرار بنسبة) 26.6% ( من مجموع 30 وكانت نسبة الجرثومة في البرازوالدم 16.6% اما بالنسبة لاخماج الجروح كانت نسبة العزل للجرثومة (13.3%(وتم عزل جرثومة الـKlebsiella من المسحات المهبلية بنسبة (10% ) وفيما يخص أخماج الأذن فإن النسبة المئوية لعزل الجرثومة التي ظهرت في هذه الدراسة كانت (3.33%) وعزلت الجرثومة من الحنجرة و القشع بنسبة (6.6%) . بينت نتائج التشخيص شيوع النوع K.pneumoniae بنسبة أعلى من بقية الأنواع إذ بلغ عددها 23 وبنسبة (76.66%) تليها عزلات الـK.oxytoca التي كانت عددها 5وبنسبة (16.66%) من ثم عزلات الـK.terrigenaالتي بلغ عددها 2 وبنسبة ( 6.66%) من مجموع 30عزلة . تم اختيار 20 عزلة تابعة لنوعي الـ K.pneumoniae و K.oxytoca والمشخصة مسبقا بنظام الـApi 20 E وتم تشخيصها بالطرائق التشخيصية (Vitek2،PCR) كانت نتائج التشخيص بنظام الـ2Vitek لعزلات الـKlebsiella التي تم تشخيصها مسبقا بنظام الـApi20E(90%)K.pneumoniae و(10%) K.oxytoca اما في التشخيص الجيني فقد أبدت النتائج أن( 80% ) من العزلات كانت تابعة لنوع الـ K.pneumoniae و)20% ) من العزلات تابعة لنوع الـK.oxytoca. وتم الاستنتاج بان نتيجة التشخيص بنظام الـPCR كانت اقرب لنتائج نظام الـ APi20E وابعد من نتائج نظام الـVitek2


Article
Performance of VITEK 2 in the routine identification of bacteria from positive blood cultures in Sulaimani pediatrics’ hospital
أداء جهاز VITEK2 في الفحوصات الروتينية لتشخيص البكتريا من مزارع الدم الموجبة في مستشفى الاطفال في السليمانية

Author: Seenaa M. Ali سيناء محمد علي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2017 Volume: 58 Issue: 1C Pages: 435-441
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Sepsis is a major cause of death worldwide among hospitalized patients, however, an accurate and advanced identification method is associated with improved sepsis patient survival. This Retrospective study carried out in Sulaimani pediatric teaching hospital from January 2014 to July 2015 and aimed to compare the effectiveness of VITEK 2 system with traditional manual procedures for identification of pathogenic bacteria in patients with a serious disease like sepsis. The positive blood cultures were divided into two groups; 138 positive cultures identified by conventional manual methods and 104 positive cultures identified by automated VITEK 2 system. The results showed that VITEK 2 system identified 16 genera and 30 species whereas only nine genera with seven species diagnosed by using routine method. The most important result during this study was the identification of five uncommon bacterial genera Kocuria, Leuconostic, Cedecea, Pantoea and Burkhoderia which have never been diagnosed in the microbiology laboratory of the hospital until the modern automated system VITEK 2 use. In conclusion, using VITEK 2 is required to enhance the performance of hospital’s microbiology laboratory which is essential for accurate diagnosis and prompt effective treatment of blood stream infections.

يعد تسمم الدم سببا رئيسا للوفاة بين المرضى الراقدين في المستشفى وان دقة التشخيص باستعمال طرق حديثة يكون مرتبطا بتحسين فرصة المريض للنجاة. اجريت هذه الدراسة في مستشفى الاطفال في السليمانية للفترة من بداية شهر كانون الثاني 2014 والى نهاية شهر حزيران 2016 .هدف الدراسة هوالمقارنة بين الجهاز الالي VITEK2 و الطرق اليدوية التقليدية المستعملة لتشخيص البكتريا المرضية للمرضى المصابين بتسمم الدم. شملت الدراسة تسجيل نتيجة التشخيص لكل الحالات التي اظهرت نتيجة زرع دم موجبة والتي قسمت الى مجموعتين: الاولى تضمنت 138 عينة شخصت بواسطة الطرق الروتينية والثانية تضمنت 104عينة شخصت بواسطة الجهاز الالي VITEK2. اسفرت نتائج التشخيص باستعمال VITEK2 عن تشخيص 16 جنس بكتيري و 30 نوع بينما لم تشخص الا 9 اجناس و 7 انواع باستعمال الطرق التقليدية. ان اهم نتيجة استحصلت من هذه الدراسة كانت تشخيص 5 اجناس لبكتريا غير شائعة (Kocuria, Leuconostic, Cedecea, Pantoea and Burkhoderia) والتي لم تشخض سابقا في مختبر المايكروبايولوجي ولكن شخصت فقط عندما بدأ العمل بنظام التشخيص الالي. نستنتج من هذه الدراسة ان استعمال جهاز VITEK2 ضروري لتحسين الاداء في قسم المايكروبايولوجي والذي يعد اساسيا للحصول على تشخيص دقيق يؤدي الى معالجة فعالة لحالات تلوث مجرى الدم.

Keywords

Sepsis --- VITEK 2 --- Blood culture


Article
Isolation and identification of microorganisms in acne patients
عزل وتحديد المكروبات في مرضى حب الشباب

Authors: Rassool A. Dabbagh --- Niyan Innam Muhammed
Journal: Zanco Journal of Medical Sciences مجلة زانكو للعلوم الطبية ISSN: 19955588/19955596 Year: 2016 Volume: 20 Issue: 2 Pages: 1330-1336
Publisher: Hawler Medical Univeristy جامعة هولير الطبية

Loading...
Loading...
Abstract

Background and objective: Acne is a follicular skin disease most frequently occurring during the adolescent or the teenage years of a person's life. It has been found that around 85% of teenagers suffer from this skin disorder worldwide. However, acne is not only restricted to teenagers but in many cases continues well into adulthood. This study aimed to examine the prevalence of acne in relation to age in Erbil City, and isolation and identification of microorganisms in acne patients. Methods: Specimens were collected from inflamed and discharging pus from 160 acne patients (74 male, 86 female) attending the Department of Dermatology in Rizgari Teaching Hospital in Erbil city. The cultures were examined using the Vitek-2 compact system.Results: Among 160 samples taken, 150 (99%) were culture positive. From there 70 (46.6%) were male and 80 (53.3%) were female. Only ten (6.25%) samples revealed no growth. The highest prevalence of acne was 32 (20.0%) at age group (15-17) years of both genders. The most frequent etiological agent isolated (aerobically) bacteria from acne patients was Staphylococcus epidermidis (27.08%), and the most common anaerobic pathogen bacteria species were Propionibacterium acnes, 25 (13.02%), while among fungi Candida albicans was the most common fungi representing nine (64.29%) isolates.Conclusion: Gram-positive bacteria were the most common microorganisms involved in acne infection. There are variations in the incidence of acne infection in relation to sex, age, and socioeconomic level


Article
Effect of Some Teeth Cleaning Methods on the Microbiological Content of the Oral Cavity
تأثير بعض طرائق تنظيف الاسنان في المحتوى الميكروبي لتجويف الفم

Author: Saad Dhamin Oleiwi سعد ضامن عليوي
Journal: Tikrit Journal for Agricultural Sciences مجلة تكريت للعلوم الزراعية ISSN: 18131646 Year: 2019 Volume: 19 Issue: 1 Pages: 46-56
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACTThe study was conducted in the period from January to May 2018. The study included the identification of the total account and types of microbial content of the oral cavity during the normal daily practices at different times, which were after waking up, after washing mouth with water (rinsing), after breakfast and after using toothpaste for 33 donors of females and males, smokers and non-smokers, and the ages range were 25-35 years. The results of the study showed that all donor groups showed positive growth during the isolation stages, but there were no significant differences in the growth density of the total count, Enterobacteriaceae and staphylococcus for the donor groups, and the recorded account are not considered to be dangerous to the health of mouth. This is because donor's mouth health was good and smoking period was short. The highest account of bacteria in isolates were seen among smokers after waking up was 74-550 cfu / ml. The study also included the diagnosis of isolated microbial species using VITEK2. The results showed that the isolated bacterial species are Staphylococcus aureus, Lelliottia amnigena, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas luteola, Klebsiella pneumonie, Stenotrophomonas maltophilia which were varied in count, Bacterial resistance was tested for some of the antibiotics that were Doxycycline (DO), Mastiscs (TS), Ceftriaxone (CRO), Tobramycine (TOB), Mastiscs (T), Mastdiscs (T), Gentamicin (CN). The results showed that L. amnigena and S.maltophilia were sensitive to all antibiotics. P. fluorescens were sensitive to antibiotics CN, T, TOB, DO and resistance to antibiotics CRO, TS whereas K.pneumonie was sensitive to all Antibiotics used except the DO antibiotic. The S.aureus bacteria showed resistance to antibiotics CN, TOB, CRO, TS and sensitive to antibiotics T, DO.

نفذت الدراسة في الفترة من شهر كانون الثاني ولغاية شهر ايار من عام 2018 تضمنت محاولة التعرف على اعداد وانواع المحتوى الميكروبي لتجويف الفم خلال الممارسات اليومية الطبيعية بأوقات مختلفة والتي كانت بعد الاستيقاظ من النوم وبعد غسل الفم بالماء (المضمضة) وبعد الفطور وبعد استخدام معجون الاسنان لـ 33 متبرع من اناث وذكور مدخنين وغير مدخنين وبأعمار تراوحت بين 25-35 سنة. بينت نتائج الدراسة ان جميع فئات المتبرعين اعطت نموا موجبا خلال مراحل العزل، ولكن لم تكن هناك اختلافات كبيرة في كثافة النمو للعدد الكلي والمعوي والمكورات العنقودية لفئات المتبرعين، كما ان الاعداد التي سجلت لا تعتبر خطرة على صحة الفم وذلك لكون صحة فم المتبرعين جيدة وتاريخ التدخين قصير، وقد كان اعلى تواجد للعدد الكلي للبكتريا في العزلات المأخوذة من المدخنين بعد الاستيقاظ والذي بلغ 74-550 cfu/ml . كما تضمنت الدراسة تشخيص الانواع الميكروبية المعزولة باستخدام جهاز VITEK2 اظهرت النتائج ان الانواع البكتيرية المعزولة هي Staphlococcua aures, Lelliottia amnigena, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas luteola , Klebsiella pneumonie , Stenotrophomonas maltophilia وباعداد مختلفة , تم اختبار مقاومة البكتريا تجاه بعض المضادات الحياتية والتي كانت من نوع Doxycycline(DO), Mastiscs(TS), Ceftriaxone(CRO), Tobramycine(TOB), Mastiscs(T), Mastdiscs(T), Gentamicin(CN) . والتي اظهرت النتائج ان بكتريا L.amnigena و S.maltophilia كانتا حساسة لكل انواع المضادات المستخدمة, اما بكتريا P.fluorescens فقد كانت حساسة للمضادات CN, T, TOB, DO ومقاومة للمضادات CRO, TS , في حين كانت البكتريا من نوع K.pneumonie حساسة لجميع المضادات المستخدمة ما عدا المضاد DO, اما بكتريا S.aures فقد اظهرت النتائج مقاومتها للمضادات نوع CN, TOB, CRO, TS وحساس للمضاد T, DO.


Article
Isolation and Identification of Vancomycin-Resistant Enterococcus Faecalis
عزل وتشخيص بكتريا المكورات المعوية البرازية المقاومه لمضاد الفانكومايسين

Authors: Haider S. Kadhem حيدر صباح كاظم --- May T. Flayyih مي طالب فليح
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2014 Volume: 55 Issue: 4B Pages: 1811-1816
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

One hundred thirty - five clinical specimens of urine, blood, teeth root canal and burns were obtained from patients in hospitals of Baghdad. The specimens were cultured on Pfizer Selective Enterococcus agar to purify Enterococci isolates. 20 E. faecalis isolates were identified biochemically by growing in 10Cº, 45Cº, 6.5% NaCl, at pH 9.6 and confirmed by VITEK. Determination of Vancomycin-Resistant E. faecalis isolates were done by the minimum inhibitory concentrations [MICs] using agar dilution method. Seventeen E. faecalis isolates were determined as Vancomycin-Resistant and Intermediate Resistant.

مائة وخمس وثلاثين عينة سريرية من الادرار والدم وقنوات جذر الأسنان واصابات الحروق تم الحصول عليها من المرضى في مستشفيات بغداد. وقد تم زرع العينات المأخوذه على الوسط الزرعي الصلب فايزر الاختياري لبكتريا المكورات المعويه لغرض تنقيه عزلات E. faecalis. بكتريا المكورات المعويه البرازية تم تشخيصها من خلال تنميتها عند درجة حرارة 10 و 45 مئوية, تنميتها في وسط مغذي يحتوي 6.5 بالمئة من كلوريد الصوديوم وايضا تنميتها في الاس الهيدروجيني القاعدي 9.6 بالاضافة الى ذلك تم تشخيصها بواسطة الفايتك. عشرون عزلة من المكورات المعوية البرازيه تم تشخيصها. عزلات المكورات المعوية البرازية المقاومة لمضاد الفانكومايسين تم تحديدها بطريقة التركيز المثبط الادنى بواسطة عملية التخفيف الزرعي. سبعة عشر عزلة من المكورات المعويه البرازية تم تحديدها كعزلات مقاومة أو متوسطه المقاومة لمضاد الفانكومايسين.


Article
Antibiotic susceptibility patterns of Escherichia coli isolates from patients with significant bacteriuria

Author: Firas Srhan Abd Al- Mayahi
Journal: journal of al-qadisiyah for pure science(quarterly) مجلة القادسية للعلوم الصرفة (فصلية). ISSN: 19972490 Year: 2015 Volume: 1 Issue: 20 Pages: 29-49
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to the isolation and identification of E. coli bacteria from patients with significant bacteriuria and Antibiotic susceptibility patterns. During the period from March 2011 to May 2012, a total of 2000 urine samples were collected from patients with suspected UTI. Isolates were identified by traditional biochemical tests, and then confirmed by VITEK 2 system. 455 (22.8%) samples were recognized as significant bacteriuria. The study documented that E. coli is the most important uropathogen causing UTI and recovered from 207 (45.5%) patients. However, of the patients with significant bacteriuria, a total of 143 (31.4%) positive urine cultures were implicated in nosocomial infections. Additionally, 312 (68.6%) positive urine cultures were implicated in community-acquired infections. According to demographic data, it was observed that the number of patients with significant bacteriuria was higher in females, 309 (67.9%) compared to males, 146 (32.1%). The mean age of these patients was 39.1 years range from 2-90 years (standard deviation, 18.1years). Majority of patients with significant bacteriuria (269, 59.1%) were in the age group 20-50 years. Sensitivity of all isolates was tested against 23 Antibiotics. Results showed all isolates of E. coli were resistant 100% to ampicillin but sensitive100% to imipenem, the antibiotics resistance rate among the tested E. coli isolates ranged from 92.7%-74.9%, 69.6%-31.4% and 48.3%-10.2%, present to cephalosporins, fluoroquinolone and aminoglycosides respectively.


Article
Study the Antimicrobial effect of Kombucha tea on bacteria isolated from Diabetic foot ulcer
دراسة التأثير المضاد للمكروبات لشاي الكمبوشا على عزلات جرثومية من قرح القدم السكري

Author: E. J. AL-Kalifawi عصام جاسم الخليفاوي
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2014 Volume: 8 Issue: 4 Pages: 27-33
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

The study was conducted from January to March 2012. In this study colorimetric VITEK-2 Compact system used for its accuracy and rapidity to identify isolates and to detect several antimicrobial resistances.The study also investigate the antibacterial effect of Kombucha tea on isolated bacteria from diabetic foot ulcer. The bacteria isolated were eight gram negative bacteria, namely, Acinetobacter baumannii 3 (2%), Enterobacter cloacae 5 (4%), Escherichia coli 13 (10%), Klebsiella pneumoniae 7 (6%), Citrobacter spp. 4 (3%), Proteus mirabilis 3 (2%), Proteus vulgaris 3 (2%) and Pseudomonas aeruginosa 44 (35%). Four gram positive bacterium, Enterococcus faecalis 6 (5%), Staphylococcus aureus 17 (13%), Staphylococcus epidermidis 13 (10%) and Streptococcus spp. 9 (8%). The antimicrobial activities of antibiotics showed that, all isolates are sensitive to Ciprofloxacin, Levofloxacin and Ofloxacin. The resistance to other types of antimicrobial differ with different isolate. The effect of Kombucha tea on all isolates wasclear at 7days of incubation; the diameter of inhibition was 6mm for Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris and Enterococcus faecalis. 7mm for Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter spp., Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp. 8mm for Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. The maximum activity of fermented tea was recorded at 14days incubation of Kombucha organism against all isolates, the diameter of inhibition was 21mm for Acinetobacter baumannii, 24mm for Enterobacter cloacae, 23mm for Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp., 16mm for Klebsiella pneumoniae, 22mm for Citrobacter spp. and Enterococcus faecalis, 25mm for Proteus mirabilis and Staphylococcus aureus, 20mm for Proteus vulgaris, 26mm for Pseudomonas aeruginosa. The antibacterial activity of Kombucha tea decrease with increase incubation periods28 days.

اجريت الدراسة في الجامعة المستنصرية، المركز الوطني للسكري في الكرخ/ وزارة الصحة، دائرة صحة بغداد، المركز التخصصي لأمراض الغدد الصم والسكري في الرصافة، في مدينة بغداد، للفترة من كانون الثاني الى اذار 2012. في هذه الدراسة تم استخدام نظام VITEK-2 Compact وذلك لدقته وسرعته في تشخيص العزلات ولتقدير المقاومة للمضادات الحيوية. كما بحثت الدراسة تأثير شاي الكمبوشا على الجراثيم المعزولة من قرح القدم السكري. تم عزل ثمانية جراثيم سالبة جرام هي Acinetobacter baumannii3 (2%)، Enterobacter cloacae 5 (4%) ، Escherichia coli 13 (10%) ، Klebsiella pneumoniae 7 (6%) ، Citrobacter spp. 4 (3%) ، Proteus mirabilis 3 (2%) ، Proteus vulgaris 3 (2%) و Pseudomonas aeruginosa 44 (35%). أربع جراثيم موجبة جرام هي Enterococcus faecalis 6 (5%) ، Staphylococcus aureus 17 (13%) ،Staphylococcus epidermidis 13 (10%) و Streptococcus spp. 9 (8%). أظهرت نتائج أختبار الحساسية للمضادات الحيوية أن كل العزلات حساسة للمضادات Ciprofloxacin ، Levofloxacin و Ofloxacin.المقاومة لبقية المضادات الحيوية اختلفت باختلاف العزلات. أن تأثير شاي الكمبوشا على جميع العزلات كان واضح بعد سبعة ايام من الحضن، حيث كان قطر التثبيط 6 مليمتر لجرثومة Acinetobacter baumannii ، Proteus vulgarisو Enterococcus faecalis . 7مليمتر لجرثومة Enterobacter cloacae، Escherichia coli ، Klebsiella pneumoniae ، Citrobacter spp. ، Staphylococcus epidermidis و Streptococcus spp . 8 مليمتر لجرثومة Proteus mirabilis ، Pseudomonas aeruginosa و Staphylococcus aureus . أن الفعالية القصوى للشاي المخمر سجل بعد اربعة عشر يوم من حضن الكمبوشا ضد كل العزلات، حيث كان قطر التثبيط 21 مليمتر لجرثومة Acinetobacter baumannii ، 24 مليمتر لجرثومة Enterobacter cloacae،23 مليمتر لجرثومة Escherichia coli ، Staphylococcus epidermidis و Streptococcus spp.. 16 مليمتر لجرثومة Klebsiella pneumoniae . 22 مليمتر لجرثومة Citrobacter spp. و Enterococcus faecalis . 25 مليمتر لجرثومة Proteus mirabilisوStaphylococcus aureus . 20 مليمتر لجرثومة Proteus vulgaris. 26 مليمتر لجرثومة Pseudomonas aeruginosa. أن الفعالية المضادة للجراثيم لشاي الكمبوشا تقل مع زيادة فترة الحضن (28 يوم).


Article
Isolation and Identification of Vancomycin-resistant Staphylococcus aureus
عزل وتشخيص المكورات العنقودية الذهبية(Saphylococcus aureus) المقاومة للفانكومايسين

Authors: Hawraa A. Mahmood حوراء علي محمود --- May T. Flayyih مي طالب فليح
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2014 Volume: 55 Issue: 3A Pages: 994-998
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Susceptibility of thirty seven clinical isolates of Staphylococcus aureus to various antibiotics was tested. 100 % of tested isolates were resistant to ampicillin, while the lowest resistance recorded to amikacin 8.10 %. Four of S. aureus isolates showed resistant to vancomycin. Minimum inhibitory concentration (MIC) of isolates 33 and 56 for vancomycin was ≥ 32 μg/ml.

أَختبرت حساسية 37 عزلة مرضية من S.aureus الى مختلف المضادات. 100 %من العزلات المختبرة كانت مقاومة للأمبسيلين, بينما اقلها مقاومة للأميكاسين سجلت 8.10%. أربعة من عزلات S.aureus أظهرت مقاومة للفانكومايسين. ألتركيز المثبط الادنى للعزلة 33و56 للفانكومايسين كانت ≥ 32 μg/ml.


Article
Isolation and Identification of food Probiotic Saccharomyces boulardii by using traditional methods, Vitek 2 system and molecular identification methods.
عزل وتشخيص المعزز الحيوي الغذائي Saccharomyces boulardii باستعمال الطرائق التقليدية ونظام الفايتك2 والطرائق الجزيئية.

Loading...
Loading...
Abstract

This study was aimed to isolate and identify Saccharomyces boulardii from Mangosteen fruits (Garcinia mangostana L.) by traditional and molecular identification methods To get safe and healthy foods probiotics for use, The isolates and two commercial strains were subjected to cultural, morphological and biochemical tests, The colonies of the isolates were spherical, smooth, mucoidal, dull and white to cream colour on SD agar media .The shape of cells was globose to ovoid and sometimes with budding, in a single form or clustered like a beehive. The isolates and two commercial strains were unable to metabolized galactose and lactose , Results shows that all isolates were unable to utilize potassium nitrate and not grow in the presence of (0.01%) cyclohexamide. Also the isolates and two commercial strains were identified by the Vitek 2 identification system, as S. cerevisiae with probability 90-94%, Since there are no data in this device includes S. boulardii. Because the cultural, morphological and biochemical tests didn’t provide sufficient evidence to distinguish between S. boulardii and S. cerevisiae, the probiotics strains must be identified up to genus and strain levels by internationally accepted methods, So the SbR7 isolate which shown high probiotic advantages and two commercial strains were diagnosed molecularly by using specific primers targeting sequence for the region (ITS) of the 5.8S rRNA gene Genomic DNA was isolated from SbR7 Isolate and ITS region of the 5.8S rRNA gene was amplified using PCR. PCR products was sequenced and compared with the sequence of this region in the DNA of S. boulardii available in GenBank (NCBI) using the program BLASTn. Results revealed, this isolate was almost genetically identical (99%) with S. boulardii standard strains.

هدفت هذه الدراسة الى عزل وتشخيص المعزز الحيوي الغذائي Saccharomyces boulardii من ثمار المانغستين (Garcinia mangostana L.) بطرائق التشخيص التقليدية والتشخيص الجزيئي للحصول على معززات حيوية غذائية امنه الاستعمال وصحية، اخضعت العزلات فضلا عن عزلتين تجاريتين للاختبارات المزرعية والمجهرية والكيموحيوية، اذ أظهرت العزلات مستعمرات ذات شكل دائري بلون ابيض مائل إلى الكريمي الباهت عند تنميتها على الوسط الصلب SD وبدت بشكل محدب ذات حواف منتظمة وقوام كريمي لزج، وان الخلايا تمتلك أشكالا بيضوية، او شبه كروية متبرعمة أحيانا، مفردة او متقاربة في تجمعات، وعدم المقدرة على تمثيل الكالاكتوز فضلا عن سكر اللاكتوز ولم تستطع استهلاك نترات البوتاسيوم او النمو بتركيز 0.01% من المضاد الحيوي السايكلوهكسمايد.كما شخصت باستعمال نظام الفايتك 2 على انهاSaccharomyces cerevisiae باحتمالية تراوحت بين90– 94%، اذ لا تتضمن بيانات الجهازS. boulardii، ولكون الاختبارات المزرعية والمجهرية والاختبارات الكيموحيوية لا تعطي ادلـــة كافية وقاطـــعة للتفريق بين النوعين S. boulardii وS. cerevisiae، شخص المعزز الحيوي S. boulardii جزيئيا باستعمال بوادئ متخصصة تستهدف التسلسل النوعي الخاص بالمنطقة البينية الفاصلة (ITS) للجين الرايبوسومي 5.8S rRNA، واستخلص الدنا المجيني من العزلة SbR7 التي اظهرت امتلاكها للعديد من صفات المعزز الحيوي والعزلتين التجاريتين، واجري تفاعل تضخيم السلسلة للمنطقة البينية ITS وحددت تعاقبات القواعد النيتروجينية وتمت مقارنتها مع تعاقباته في دنا سلالات S. boulardii المتوفرة في بنك الجينات NCBI باستعمال برنامج BLASTn تبين ان هناك تطابقا للتعاقبات، وان هذه العزلة تتماثل جينيا بنسبة 99% مع سلالات Saccharomyces boulardii القياسية المتوافرة في بنك الجينات.


Article
عزل وتشخيص البكتريا المحللة للمركبات الفينولية من المياه

Author: سوزان كامران حسن حسن رحيم الشريفي جامعة بغداد/ كلية الزراعة – قسم علوم الاغذية
Journal: journal of the college of basic education مجلة كلية التربية الاساسية ISSN: 18157467(print) 27068536(online) Year: 2016 Volume: 22 Issue: 96/ علمي Pages: 165-176
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Isolation and Identification of phenol degrading bacteria from waterAbstractSix phenol degrading bacteria were isolated from the industrial sewage of Al-Doura oil refiner and identified by the developed bacterial identification technique Vitek 2 system. Four of these isolates were identified as Pseudomonas fluorescens , one as Citrobacter freundii and Serratia liquefaciens . The better of phenol degrading Isolate Pseudomonas fluorescens SK was chosen as its total number was 262x105 c.f.u.ml when they were grown in mineral medium containing phenol as carbon source.

المقدمةيعد تلوث البيئة مشكلة من اكبر واخطر مشاكل العصر والذي شهد العالم خلاله تطورا كبيرا في جميع المستويات ومن أكثرها ضرراً على مستقبل الحياة على كوكب الارض ، ويعد التلوث المائي أحد المخاطر التي تهدد البيئة) 2). اذ ان الصناعة هي من اهم وانشط المصادر المسببة لتلوث المياه، ولاسيما الصناعات التي تستعمل وتطرح العناصر الثقيلة والمركبات السامة أذّ مما لا شك فيه ان هذه المواد ذات تأثيرات ضارة وسامة عندما تنتقل الى الكائنات الحية وتستقر في انسجتها (14) . وإن ما يعظم الحالة ويدعو الى الحذر والاهتمام بالموضوع هو كون العناصر الثقيلة والمركبات السامة لا تتحلل بفعل الاحياء المجهرية ولكن تتجمع ويزداد تركيزها تدريجيا وقد تخزن فى انسجة الكائنات الحية (التركيز الحياتي Bioconcentration) ، كما يمكن ان تنتقل الى مسافات بعيدة عن مصادر طرحها في الماء ومن ثم تاثيرها في الانسان عبر انتقالها عن طريق السلسلة الغذائية(26). ويعد الفينول والمركبات الفينولية من ملوثات المياه السامة ولزيادة طرح المياه الصناعية الملوثة بهذا المركب كان لابد من ايجاد طرائق كفؤة لازالة هذه الملوثات عن طريق استعمال انظمة مايكروبايولوجية لازالة المركبات السامة من المخلفات الصناعية ومن ثم طرحها الى الانهار (23).

Listing 1 - 10 of 11 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (11)


Language

English (8)

Arabic (3)


Year
From To Submit

2019 (1)

2017 (2)

2016 (3)

2015 (1)

2014 (3)

More...