research centers


Search results: Found 8

Listing 1 - 8 of 8
Sort by

Article
Association of HLA class I -A and B alleles with hydatidosis In Iraqi patients

Author: Samir Sabaa1,Lazim Hammed2,Batool Al-Ghurabi3
Journal: Almuthanna Journal of Pure Science (MJPS) مجلة المثنى للعلوم الصرفة ISSN: 22263284 Year: 2014 Volume: 2 Issue: 1
Publisher: Al-Muthanna University جامعة المثنى

Loading...
Loading...
Abstract

Hydatidosis is a parasitic disease caused by infectionwith larval stage of cestode worm Echinococcusgranulosus ,it is a worle_wide disease results in serioushealth and financial loss. Iraq considered as an endemicregion for this disease. the association of HLA –allelesfrequency with the occurrence of various diseases werestudied . and significant associations were found, nosufficient studies on hydatidosis and possible role of HLAtyping and the immune status of the patients andassociation of them with cyst characteristics ,andcytokines profile and their effect on production ofimmunoglobulin . blood samples were collected forextraction of DNA and amplification by (PCR-SSO) andHLA typing by Automatic Line Probe Assay (Auto-Lipa) forHLA typing of both patients and healthy control groups, tostudy the association of certain HLA alleles. Withoccurrence of Hydatid disease. The present studyreported increase in frequency of HLA-A*0273 in hydatidpatients compare to healthy control .

Keywords

HLA --- alleles --- Hydatidosis --- PCR


Article
Rht-B1b and Rht-D1b analysis of Semidwarf wheat cv. Uruq produced by Induced Mutation
التحليل الجيني لصنف الحنطة شبه القصير اوروك المستنبط باستخدام الطفرات الوراثية

Author: Ayad Jabir Kubba1, Ali Imad Mohammed Munir1 , Majeed Arsheed Sabbah2
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2013 Volume: 12 Issue: 2 Pages: 107-113
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract: there are many genes associated with dwarfing growth in bread wheat. Two genes in particularRht-B1b and Rht-D1b were used for identification of dwarfism in many wheat varieties. In this study PCR technique was used for identification of Rht-B1b and Rht-D1b in parent cv. Inia-66 and mutant genes in semidwarf cv. Uruq. Two sets of primers were used for identification of mutants genes in semidwarf cv. Uruq and its parent Inia-66 genes. The results showed that cv. Uruq contains the dwarf gene Rht-D1 which is absent in the parent cv.Inia-66. RAPD-PCR performed in order to establish a molecular marker for cv. Uruq. A specific band was observed in cv. Uruq but absent in cv. Inia-66. These results proved that Uruq is semidwarf wheat at the molecular level.

الخلاصة:هناك العديد من الجينات المرتبطة بنمو الساق في نباتات الحنطة الناعمة وبشكل خاص فان الجينين Rht-D1b و Rht-B1b استخدما لتعيين صفة القصر في عدة اصناف من الحنطة. وفي هذه الدراسة فان تقنية التفاعل التسلسلي لانزيم البوليميريز PCR استخدمت لتعيين الجينين Rht-B1b و Rht-D1b في الصنف الاصل (اينيا-66) وفي الصنف المستنبط شبه القصير (اوروك). تم استخدام مجموعتين من البرايمرات لتعيين الجينات في الصنفين اوروك واينيا-66. بينت النتائج بان الصنف اوروك يحتوي على الجين المسبب للقصر Rht-D1 بينما لايوجد في الصنف الاصل اينيا -66. استخدمت تقنية RAPD-PCR لايجاد المؤشر للصنف اوروك وقد وجدت حزمة مميزة في الصنف اوروك لم تلاحظ في الصنف اينيا -66. وتؤكد هذه النتيجة ان الصنف اوروك هو صنف حنطة شبه قصير على المستوى الجزيئي.


Article
Frequency of HLA-DR3 Alleles and Pedigree Analysis for Patients with Thyroiditis

Authors: Alaa Jawad Hassan --- Eman Wahab Kadhum
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2015 Volume: 12 Issue: 3 Pages: 849-856
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

A study was performed to estimation the concentration of HLA-DR3 alleles and pedigree analysis in patients with thyroid diseases in Babylon province .The results showed that there was significantly increased (p<0.05) in frequency of HLA-DR alleles in all groups of patients (hyperthyroidism , hypothyroidism , euthyroidism and normal with family history ) compared with healthy subjects . Furthermore , the results reveals increased ratio of disease in females compared with males , also the ratio of thyroiditis patients were higher in second age categories compared with first and third age categories . The pedigree analysis showed genetic role in the frequency of disease depending on the genetic history of family , where more patients with thyroiditis were found in families, one of them (especially mother) or their uncles undergo from this disease .


Article
HLA Class I and II Genotyping by PCR-SSO in Patients with Type-1 Diabetes Mellitus

Authors: Ahmed A. Al-Hassan --- Anwar Mohammad --- *, Batool H. Al-Ghurabi --- Laith Abdul Elah
Journal: Iraqi Academic Scientific Journal المجلة العراقية للاختصاصات الطبية ISSN: 16088360 Year: 2013 Volume: 12 Issue: 4 Pages: 519-524
Publisher: The Iraqi Borad for Medical Specialization المجلس العراقي للاختصاصات الطبية

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACT:BACKGROUND: Type 1 diabetes mellitus is a chronic autoimmune disease that involves destruction of the pancreatic beta cells. It is well known that both genetic and environmental factors involved in pathogenesis of type-1diabetes mellitus. OBJECTIVE:This study seeks to determine whether there is any association between human leukocyte antigen class I and II alleles and type-1diabetes mellitus. SUBJECTS AND METHODS: Seventy type-1 diabetes mellitus patients compared to 30 apparently healthy individual were enrolled in this study. Human leukocyte antigens genotyping were analyzed by polymerase chain reaction sequence specific oligonucleotide technique. RESULTS: The present study revealed significantly high frequency of DQB1*0101 and DQB1*0201 alleles among patients in comparison with healthy control, while there was significantly low frequency of each HLA-A*3301, B*0826, DRB1*0701, *1101 and HLA-DQB1*0604 alleles in patients as compared to healthy controls. CONCLUSION: These findings indicate that higher frequency of HLA-DQB1*0101 and *0201 alleles may be a risk factor for type-1diabetes mellitus, meanwhile low frequency of HLA-A*3301, B*0826, DRB1*0701, *1101 and HLA-DQB1-*0604 alleles could be a protective factor.


Article
Polymorphism of growth hormone gene in the artificial insemination result of Madura cattle with Limousin semen as a reference for genetic selection
تعدد أشكال جين هرمون النمو في نتائج التلقيح الصناعي لأبقار مادورا الملقحة بمني اليموزين كمرجع للاختيار الوراثي

Authors: B. Utomo بودي اوتمو --- E. Safitri إيرما سفتاري
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894/20711255 Year: 2018 Volume: 32 Issue: 1 Pages: 113-118
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Research on genetic polymorphism of growth hormone (GH) and receptor growth hormone (rGH) has not been done in crossbred of Limousin cattle, so it is interesting to be examined. Blood samples were taken from 14 Madura calves were artificially inseminated with Limousin cement. DNA amplification is done by using Polymerase Chain Reaction (PCR) method, Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) method to determine the genotype. DNA sequencing was done to determine nucleotide sequences of GH unit genes. The results showed that identification of GH and rGH gene polymorphisms was done by breaking DNA fragments from 432 and 298 bp in Madura and Limousin cattle (Madrasin) ie, L and V alleles have a frequency of 0.67 and 0.33 for the GH gene, respectively. This proves that the crossed-breeding of Madrasin have V allele that is not owned by the Madura cattle. While in the rGH gene, the A allele is 0.92 and the G allele is 0.08, with the frequency of the A allele larger than the G allele. This research concluded: that GH and rGH undergo changes on polymorphisms in Madrasin cattle can be used as a basis for selection.

لم تجرأبحاث على تعدد الأشكال الوراثي لهرمون النمو (GH) وهرمون النمو المستقبلي (rGH) في الأبقار المهجنة من أبقار الليموزين، لذلك حاولنا في هذا البحث اجراء هذا الفحص. تم أخذ عينات دم من 14 من عجول مادورا تم تلقيحها اصطناعياً بمني اليموزين. تم إجراء تضخيم الحمض النووي باستخدام طريقة تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، طريقة تعدد الأشكال (RFLP) المقيد للطول لتحديد النمط الوراثي. تم إجراء تسلسل الحمض النووي لتحديد تسلسلات النوكليوتيدات من جينات الوحدة GH. أظهرت النتائج أن التعرف على تعدد الأشكال الجيني GH و rGH قد تم عن طريق تكسير شظايا الحمض النووي من 432 و 298 bp في ماشية Madura و Limousin (Madrasin) أي أن الأليلات L و V لها تردد 0,67 و 0,33 لجين GH، على التوالي. هذا يثبت أن التكاثر المتقاطع للمدرسين له أليل V غير مملوك من قبل الماشية Madura. بينما في الجين rGH، الأليل A هو 0,92 وأليل G هو 0,08، مع تواتر الأليل A الأكبر من الأليل G. وخلص هذا البحث: أن GH و rGH يخضعان لتغييرات في الأشكال في الماشية Madrasin يمكن استخدامها كأساس للاختيار.

Keywords

Polymorphism --- GH Gene --- rGH Gene --- Madrasin --- PCR --- RFLP --- V alleles


Article
FREQUENCY OF HLA-DRB1/DQB1 ALLELES AMONG TYPE 1 DIABETES PATIENTS IN DUHOK, KURDISTAN REGION (IRAQ)
الانماط الفردانية HLA – DR / DQ لدى مرضى السكري النوع الاول في اقليم كوردستان العراق دراسة اولية

Authors: RAWAND A.AL-QADI راوند القاضي --- IDRIS H. AHMED ادريس احمد --- SALMA S. SHAFEEQ سلمه شفيق --- DHIA J. AL-TIMIMI1 ضياء التميمي
Journal: Duhok Medical Journal مجلة دهوك الطبية ISSN: ISSN: 20717334 (online)/ ISSN: 20717326 (Print) Year: 2019 Volume: 13 Issue: 1 Pages: 66-73
Publisher: University of Dohuk جامعة دهوك

Loading...
Loading...
Abstract

Background: A large number of studies have demonstrated that specific alleles at the HLA-DRB1 andHLA- DQB1 loci are strongly associated with type 1 diabetes mellitus (T1DM). This preliminary study investigated the heterogeneity in HLA class 11 genotypes distribution among Kurd patients with type 1 diabetes.Patients and Methods: The study was conducted at Duhok Diabetes Center, Duhok, Kurdistan Region (Iraq). The study participants comprised 96 unrelated T1DM patients and 48 healthy control subjects. Currently, HLA typing methods are relatively expensive and time consuming. We sought to determine the minimum number of HLA polymorphism among T1DM patients and healthy controls that could define the HLA-DR/DQ alleles relevant to T1DM patients .All participants were typed at a polymerase chain reaction-(PCR) for theDRB1 and DQB1 loci. The association analysis was performed by comparing the frequency of DR/DQ alleles among the diabetic patients with the frequency of alleles in the healthy controls.Results: Number of specific DR/DQ alleles has been identified and a statistically significant association with diabetes has been established. Compared with the healthy controls, patients were more than two-third as likely to have HLA- DRB1*03and -DRB1*04. HLA- DQB1*02allele was also more frequent in T1DM patients. HLA-DRB1*01,-DQB1*05 and -DQB1*06 were less frequent in T1DM patients.Conclusions: The data indicate that the HLA-DRB1*03, -DRB1*04 and -DQB1*02 were positively associated with TID and may be the most prone alleles, while the HLA-DRB1*01 followed by-DQB1*05 and -DQB1*06 were negatively associated with TID and may be the most protective alleles.

الخلفية والأهداف: هناك أدلة متزايدة على وجود علاقة قوية بين اليلات خاصة من HLA – DRB1 و ALA – DQB1 مع داء السكري النوع الاول. التحري عن الاختلاف الجيني في ALA النوع الثاني ما بين الاكراد الذين يعانون من داء السكري النوع الاول. المواضيع و طرق البحث: أجريت هذه الدراسة في مركز السكري/ دهوك، المشاركون في الدراسة كانوا 96 مريض تم تشخيصهم سابقاً بداء السكري النوع الاول و 48 من الاشخاص الاصحاء. حالياً طرق التصنيف ذات كلفة عالية وتستغرق وقت طويل، لذا تم اختيار اعداد قليلة من المرضى والاشخاص الاصحاء ذو امكانية ان تظهر الاليات ذات العلاقة. ثم اجريت عملية التصنيف الاليلي لـ (DR/DQ و HLA class) باستخدام مسيار اوليلوثيوكليوتايد الاحادي لتفاعل متسلسلة البلمرة ذو التسلسل الخاص. النتائج: أكدت الدراسة وجود ارتباط ايجابي بين داء السكري من النوع الاول مع الاليلDRB1O3والاليلDRB1*O4 اضافة لذلك بينت النتائج وجود علاقة ايجابية مع الاليلDQB1*O2في حين اظهرت النتائج علاقة سلبية مع الاليلاتHLA – DRB1*O1و DQB1OS و DRB1O6 . الاستنتاجات: تؤكد الدراسة الحالية على ان الاليلاتHLA – DRB1*O3 و DRB1*O1 و DQB1*O2 على ارتباط ايجابي بداء السكري النوع الاول ويمكن ان تكون عوامل الخطر لقابلية ظهور داء السكري في حين ان الاليلاتHLA-DRB1*O1–DQB1*O5–DQB1*O6 في ارتباط سلبي وقد تكون من ضمن العوامل الوقائية.


Article
DRB1 allele frequencies in rheumatoid arthritis patients and their correlation with anti-cyclic citrullinated peptide antibodies severity marker

Authors: Laith Abdul Ellah Kamel --- Jamal Nasir Farhood --- Madha Mohammed Sheet Saleh --- Ali Hussain
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2014 Volume: 22 Issue: 9 Pages: 2478-2466
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Genetic influence, mainly the HLA-DRB1 on the predisposition of rheumatoid arthritis (RA) disease course is highly contradictive. This study aimed to shed spot light on the DRB1 genetic constitutions and their influence on the anti-citrullinated peptide autoantibodies (ACCP) modulation as a disease activity marker in Iraqi RA patients. A total of 110 RA patients and 50 healthy controls were enrolled in the study. Their HLA-DRB1 allelic constitution and ACCP serum level were evaluated highly sensitive ELIZA technique. The results reveals that the highest DRB1 allele frequencies were in *03, followed by *13, *11, *04, and *07. The majority of Iraqi patients were with positive ACCP and the frequency of this positivity were highest in *10, *16, followed by *04, *03, *11, *08, and *07, allele groups. This study also found that the highest ACCP mean titers were in the allele *13 followed by *11, *04 and *07. In addition, DRB1 *13, 13 homozygotic allelic combination was the highest in frequency (9.1%) and mean titer (3271.7 U/ml) among positive ACCP combinations, followed by *11, 7, *11, 4 and 11, 15. Finally, 44% of the RA-patients DRB1 allelic combination were RA-restricted, whereas 57.1% of the healthy control DRB1 allelic combinations were control-restricted. In conclusion, the distribution of the DRB1 alleles among Iraqi RA patients as well as their ACCP positivity was not subjected to the SE allele roles, and in addition, the presence of RA-restricted and control-restricted allelic combinations is a novel result and of value in differentiating the at-risk from the protecting allelic combination.

يتميز التأثير الوراثي المتعلق بأنسجة الخلايا اللمفاوية للانسان خصوصا (HLA-DRB1) على نزعة الإصابة بالتهاب المفاصل الرثواني بكونه متباين جدا. هذه الدراسة سعت لتسليط الضوء على التركيب الوراثي لل(DRB1) ودوره في تعديل الأضداد الذاتية للببتيدات السترولينية (ACCP) كعلامة للنشاط المرضي في مرضى التهاب المفاصل الرثواني العراقيين. شملت الدراسة 110 مريض و 50 من الاصحاءوتم تقييم التركيب الاليلي لل (DRB1) والمستوى المصلي لل (ACCP). أظهرت النتائج أن أعلى تكرارية لل(DRB1) كانت للاليل *03 ثم *13, *11, *04 و *07. غالبية المرضى كانوا ايجابيين لل (ACCP) وكان أعلى تكرارية لهذه الايجابية في الاليلات *10 و*16 أعقبها الاليلات *04, *03, *11, *08و *07. الدراسة وجدت أيضا أن أعلى معدل معياري لل(ACCP) كان في الاليل *13 اعقبه الاليلات *11, *04و *07. إضافة إلى ذلك كان الزيجوت المتماثل الالائل *13,13 الأعلى من حيث التكرارية والمعدل المعياري لأضداد ال(ACCP) في المرضى الموجبين لهذا المعلم أعقبه *11,7 , *11,4 و*11,15 . أخيرا, كان 44% من الاليلات المركبة بين مرضى التهاب المفاصل الرثواني العراقيين هو غير مرتبط بقواعد التوزيع المستندة على المحددات المستضدية المشتركة (shared epitopes) كما ان وجود اليلات مركبة خاصة بالمرض فقط واليلات مركبة خاصة بالأصحاء فقط هو نتيجة جديدة وغير معلومة سابقا وستكون ذات فائدة كبيرة في تمييز من لديه حماية أو استعداد للإصابة بمرض التهاب المفاصل الرثواني.


Article
HLA-CLASS II RISK ALLELES CONTROL T-LYMPHOCYTE PROLIFERATION IN RESPONSE TO ENTEROVIRUS AND ADENOVIRUS ANTIGENS AND IgG ANTIBODY PREVALENCE IN NEWLY DIAGNOSED T1DM CHILDREN
دور اليلات الخطورة لنظام مستضدات خلايا الدم البيض البشرية- الصنف الثانى فى استجابة الخلايا اللمفية ضد مستضدات الحمات المعوية والغدية وتفشى اضداد IgG هذه المستضدات في الأطفال المشخصين حديثاًبمرض السكر من النوع الأول

Authors: Nidhal abdul Mohymen نضال عبد المهيمن --- Eman M. Saleh إيمان مهدي صالح
Journal: IRAQI JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES المجلة العراقية للعلوم الطبية ISSN: P16816579,E22244719 Year: 2007 Volume: 5 Issue: 3 Pages: 47-56
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Viral infections are implicated in the pathogenesis of type 1 diabetes mellitus (T1DM) in a number of studies, and playing a role in the initiation of beta-cell damaging process.Objective: To evaluate the T- cell proliferation in response to enterovirus antigens including coxsackievirus B and poliovirus in addition to adenovirus in an HLA- matched population of children with T1DM and children who were healthy, in addition to screening for specific anti-viral IgG antibodies.Subjects and methods: A total of 60 Iraqi T1DM children were included in the presents study. They were newly diagnosed diabetics. For the purpose of comparisons, 50 apparently healthy children were selected. HLA typing was measured by microlymphocytotoxicity, while MTT assay was used for lymphocyte proliferation by culturing peripheral blood lymphocytes (PBLs) with Con-A, Coxsackievirus B5 (CVB5), Adenovirus 3, 4, and 7 serotypes, and Poliovaccine. Serum IgG against these viruses were detected quantitatively with an indirect ELISA.Results & conclusion: No significant differences were shown in the PBL proliferative percentage in response to Con-A mitogen and tested viruses (CVB5 and adenovirus) between T1DM and healthy controls, but PBL proliferative percentage of patients showed a significant decline in response to poliovaccine. Strong T-cell proliferation in response to the tested viral antigens were observed and was related to HLA-DR4 and HLA-DQ3 antigens, whereas the HLA-DR3 and HLA-DQ2 alleles were associated with week responsiveness to the same antigens. High significant mean proliferative percentage for all tested viruses were detected in those patients who were sero-positive IgG as compared to the sero-negative IgG diabetic children.Conclusion: In children with new- onset diabetes, responses were generally decreased, but higher in children who carried risk HLA- class II alleles and who were sero positive to anti- viral IgG antibodies.Key Words: T1DM, HLA class II alleles, Lymphocyte proliferation, Anti- CVB5 IgG, Anti- polio IgG, Anti-adeno IgG.

خلفية الدراسة: أثبتت العديد من الدراسات أن للفايروسات دورا تؤديه في إحداث أمراضية مرض السكر من النوع الأول وقد يكون لها دوراً في بدء عملية تحطيم خلايا بيتا في البنكرياس.هدف الدراسة: الهدف من الدراسة هو لتقييم الفعالية الوظيفية للخلايا اللمفية بعد تحفيزها بمستضدات الحمات المعوية والتي تشمل فايروس الكوكساكي نوعB- (CVB) وفايروس شلل الأطفال فضلاً عن ألحمة الغدية (Adenovirus) في مجموعة من الأطفال المصابين بمرض السكري من النوع الأول ومجموع من الأطفال الأصحاء المطابقين لمستضدات التطابق النسيجي (HLA) من الصنف الثاني فضلاً عن التقصي عن وجود الكلوبيولينات المناعية نوعIgG ضد هذه الفايروسات.طريقة العمل: شملت الدراسة ستون مريضاً حديثي الإصابة بمرض السكري النوع الأول (مشخصين بالإصابة خلال فترة أقل من خمسة أشهر).والذين تم اختيارهم من المركز الوطني للسكري / الجامعة المستنصرية للفترة من مايس 2004 ولغاية تشرين الأول 2005. ولغرض المقارنة تم اختيار مجموعة من الأطفال (50) طفلاً الاصحاء ظاهريا لغرض التحري عن وجود اليلات الخطورة لمستضدات التطابق النسيجي – الصنف الثاني ثم قياس الفعالية الوظيفية للخلايا اللمفية بعد حضنها مع الفايروسات المذكورة سابقاً باستخدام طريقة MTT فضلاً عن قياس المستويات المصلية للكلوبيولين المناعي IgG ضد الفايروسات الثلاثة باستخدام طريقة ELISA الغير مباشرة .النتائج: أظهرت الدراسة الحالية انخفاضاً غير معنوياً في الفعالية الوظيفية للخلايا اللمفية كاستجابة للمشطر Con-A وكذلك باستخدام فايروس CVB النوع المصلي (5) وفايروس الـ Adenoللانواع المصلية 3 ، 4 و 7 في الأطفال المرضى مقارنة بالأصحاء. ولكن هذا الانخفاض كان معنوياً فقط عند استخدام فايروس شلل الأطفال (P < 0.05). وكانت الزيادة في الفعالية الوظيفية للخلايا اللمفاوية معنوياً (P < 0.05) عند المرضى الحاملين للاليلات الخطورة من الصنف الثاني HLA-DR3 ; - DR4 ; - DQ2 ; - DQ3 مقارنة بالمرضى الحاملين للاليلات الأخرى وكذلك عند المرضى الموجبين للكلوبيولينات المناعية نوع IgG مقارنة بالمرض السالبين .الاستنتاج: انخفضت الاستجابة المناعية عموماً في الأطفال المصابين ولكنها ازدادت في الأطفال الحاملين للاليلات الخطورة HLA من الصنف الثاني و الموجبين للكلوبيولينات المناعية نوع IgG المضادة للفايروسات.مفاتيح الكلمات: مرض السكر من النوع الأول ، مستضدات التطابق النسيجي - الصنف الثاني ، الفعالية الوظيفية للخلايا اللمفية ، الكلوبيولينات المناعية نوع IgG ضد فايروس الكوكساكي B النوع المصلي 5 وشلل الأطفال والحمى الغدية.

Listing 1 - 8 of 8
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (8)


Language

English (7)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (1)

2015 (1)

2014 (2)

2013 (2)

More...