research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Detection of virulence factors of Pseudomonas aeruginosa in different animals by using bacteriological and molecular methods
كشف عن عوامل الضراوة للزوائف الزنجارية في الحيوانات المختلفة باستخدام الطرق الجرثومية والجزيئية

Author: B.S. Noomi بشار صادق نومي
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894 Year: 2018 Volume: 32 Issue: 2 Pages: 205-210
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to detect the presence of virulence factors of Pseudomonas aeruginosa in different animals. For this purpose 120 samples were collected and examined to detect fourteen virulence factors by using biochemical and molecular methods. The results showed that the highest isolation rate was recorded in doges (29.6%) among studied animals, and highest isolation rate was recorded in milk samples (26.8%) among the studied samples. The virulence factors were detected in different ratio, and highest of them were capsule detected in 50% from skin isolates, amylase enzyme detected in 28.5% from milk isolates, hemolysin enzyme detected in 75% from wound isolates, protease detected in 100% from skin isolates, phospholipase enzyme detected in 56.1% from milk isolates, urease enzyme detected in 50% from skin isolates, gelatin liquefaction detected in 100% from skin and ear isolates, β -lactamase production detected in 100% from skin and wound isolates, pigments production detected in 100% from skin and ear isolates, oprI, oprL and exoT detected in 100% from skin and wound isolates, exoS detected in 100% and 85.7% from skin and milk isolates respectively. We conclude from his study that the dogs are more sensitive in compare with studied animal, while the milk sample is more susceptible to contamination by Pseudomonas aeruginosa. Regarding the virulence factors we noticed that the appearance of it basis on infection state.

هدفت هذه الدراسة الى تحديد تواجد عوامل الضراوة للزوائف الزنجارية من انواع مختلفة من الحيوانات، ولهذا الغرض جمعت 120 عينة مختلفة وفحصت لتحدد 14 عامل ضراوة باستخدام طرق جرثومية وجزيئية. اظهرت النتائج ان اعلى نسبة عزل سجلت في الكلاب (29,6%)، كما ان اعلى نسبة عزل كانت من عينات الحليب (26,8%).كما اظهرت الدراسة اختلافا في ظهور عوامل الضراوة باختلاف مصدر العزل، حيث سجلت اعلى نسب لظهور عوامل الضراوة كالاتي: ظهرت المحفظة في 50% في الجراثيم المعزولة من الجلد، كشف انزيم الامايليز بنسة 28,5% في الجراثيم المعزولة من الحليب، كشف الانزيم الحال الدموي بنسبة 75% في الجراثيم المعزولة من الجروح، كشف الانزيم المحلل للبروتين بنسبة 100% في الجراثيم المعزولة من الجلد، كشف الانزيم الحال للدهون الفوسفاتية بنسبة 56,1% في الجراثيم المعزولة من الحليب، كشف الانزيم الحال للبول بنسبة 50% في الجراثيم المعزولة من الجلد، كشف الانزيم المذيب للجيلاتين بنسبة 100% في الجراثيم المعزولة من الجلد والاذن، كشف انزيم البيتا لاكتيميز بنسبة 100% في الجراثيم المعزولة من الجلد والجروح، كشف افراز الصبغات بنسبة 100% في الجراثيم المعزولة من الجلد والجروح، ظهر الجين oprI, oprL, exoT في 100% من الجراثيم المعزولة من الجلد والجروح، ظهر الجين exoT بنسبة 100% و 85,7% في الجراثيم المعزولة من الجلد والحليب على التوالي. نستنج من هذه الدراسة ان الكلاب هي الحيوانات الاكثر حساسية من بين الحيوانات المدروسة، وعينات الحليب هي الاكثر عرضة للتلوث بالزوائف الزنجارية، وان ظهور عوامل الضراوة يعتمد على نوع الاصابة.


Article
التشخيص الجزيئي لطفيلي الاميبا الحالة للنسيج في منطقة الفرات الاوسط

Authors: صبا فاضل علي --- علي حسين مكي
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2017 Volume: 25 Issue: 1 Pages: 57-68
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

This study aimed to find the prevalence of E. histolytica parasite in Middle Euphrates region – Iraq, using one of the molecular methods. The study was conducted on the (1350) stool samples from diarrhea - suffering patients in three provinces of Middle Euphrates region: Karbala, Babel and Al- Najaf (450 in each province). Patients ranged in age (1 to more than 60) years and from both sexes and different regions who were attended to some hospitals, dispensaries and private laboratories in these governorates during the period from the first of May 2013 till the end of April 2014. All collected fresh samples were examined microscopically by wet-mounts method for E. histolytica detection. Around 0.5 g of each positive and some of negative stool samples in microscopic examination was preserved at -20Cº until use in molecular study. One third of positive samples in microscopic examination (which was selected to be representative for all positive samples) from each province and five of negative one as control group were submitted to the nucleic acid (DNA) extraction. One pairs of specific primers was designed to be used for molecular diagnosis of E. histolytica using PCR technique. Primers materials were supplied by Bioneer Co. and prepared according to its instructions. Molecular diagnosis of E. histolytica were performed using PCR reaction with amplification of the 355-bp fragments from the internal transcribed spacer region1 ITS1. The PCR was conducted using Accupower® PCR Premix kit/ Bioneer as DNA polymerase and the reaction was performed in a thermocycler. The products were submitted to 1.5 % agarose gel electrophoresis, stained with ethidium bromide and the gel images were recorded under transilluminator UV light. Based on the results of this study, microscopic examination showed that the total percentages of infection with E. histolytica were (15.1, 13.3 and 16.7) % in Karbala, Babel and Al- Najaf respectively. As infection rates are close in the three provinces and the absence of vast differences between these percentages, so the three provinces were treated as one (Middle Euphrates region). For the molecular diagnosis by using PCR technique the true prevalence of E. histolytica in Middle Euphrates region was found to be %12.8.

هدفت هذه الدراسة إلى ايجاد مدى انتشار طفيلي الاميبا الحالة للنسيج في منطقة الفرات الاوسط باستخدام إحدى الطرائق الجزيئية. اجريت الدراسة على 1350 عينة غائط طرية جمعت من المرضى الذين يعانون من الإسهال في ثلاث محافظات من محافظات منطقة الدراسة ( كربلاء و بابل و النجف) و بواقع 450 عينة لكل محافظة. تراوحت أعمار المرضى بين سنة واحدة إلى أكثر من 60 سنة ومن كلا الجنسين و مختلف المناطق الوافدين على بعض المستشفيات و المستوصفات والمختبرات الخاصة في هذه المحافظات في المدة من الأول من أيار 2013 وحتى نهاية نيسان 2014. جميع عينات الغائط الطرية فحصت مجهريا بطريقة المسحة الرطبة للكشف عن الاميبا الحالة للنسيج Entamoeba histolytica. حفظ حوالي نصف غرام من العينات ذات التشخيص الموجب و بعض العينات السالبة بدرجة حرارة ( 20 - ) م لحين استخدامها في الدراسة الجزيئية. انتخب ثلث العينات الموجبة المشخصة بالفحص ألمجهري (بحيث تكون هذه العينات ممثلة لمجتمع العينات الموجبة التشخيص) مع خمسة عينات سالبة لكل محافظة كمجموعة سيطرة لغرض استخلاص المادة الوراثية ( DNA). صمم زوج من البادئات النوعية لتشخيص طفيلي الاميبا الحالة للنسيج باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسلPCR . اعتمد التشخيص الجزيئي على نتائج تضخيم البادئات النوعية Specific primers بتقنيةPCR لمنطقة للحيز ألاستنساخي الداخلي ITS1)) الخاصة بتشخيص طفيلي الاميبا E. histolytica عند ناتج بلغ355) ) bp. حضر مزيج تفاعل البلمرة المتسلسل باستعمال عدة Accupower® PCR Premix المجهزة من قبل شركة Bioneer الكورية و تمت عملية التضخيم باستخدام جهاز المبلمر الحراري. أجريت عملية الترحيل الكهربائي باستخدام هلام الاكاروز 1.5% و صبغه بروميد الاثيديوم و صور الجل بجهاز مصور الحزم الجينية تحت الأشعة فوق البنفسجية. بالاعتماد على نتائج هذه الدراسة فان الفحص ألمجهري أظهر إن إجمالي نسب الإصابة بطفيلي الاميبا الحالة للنسيج كانت) 15.1 و 13.3 و 16.7) % في كربلاء و بابل و النجف على التوالي. و لكون نسب الخمج متقاربة في المحافظات الثلاثة و عدم وجود فروق شاسعة بين هذه النسب تم معاملة المحافظات الثلاث كمنطقة واحدة هي ( الفرات الاوسط). فيما يخص التشخيص الجزيئي بتقنية PCR تبين إن نسبة الخمج الحقيقية بطفيلي الاميبا الحالة للنسيج في منطقة الفرات الأوسط هي12.8 %.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (1)

English (1)


Year
From To Submit

2018 (1)

2017 (1)